Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

J3K8D6

Protein Details
Accession J3K8D6    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
247-273ERDYRLSSPRTRSPKKRPSRLPLIHGGHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
259-263SPKKR
Subcellular Location(s) nucl 22.5, cyto_nucl 14, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR038609  HDA1_su2/3_sf  
IPR021006  Hda2/3  
Gene Ontology GO:0070823  C:HDA1 complex  
GO:0016575  P:histone deacetylation  
KEGG cim:CIMG_06550  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF11496  HDA2-3  
Amino Acid Sequences MGTQDPIHASPSTDIESNLSDTEYPIKCILEESRDKYLIAWERDYDPSWEPKHFVNDAAVHAWELKKNNRYQAADRYRREHPLRKSHLSYINSLSQSSPSSTLSASNSGSQISLNSGSVFAPQSTQQSYSSISDQGGSLGKNSFYQIPYSLATQSSVTFSTQHQRPLSQSGAENWISPPELANSPHQCTQAGVSSNSPENSLQPFQATGGLSRSEDPAEAPYQVIDLSQQANSLDRQSLTTSGNSLERDYRLSSPRTRSPKKRPSRLPLIHGGITQSLSLTPRSQRQNLPTTKQIRAHTFSQEVAETPLSQLWIGERIEDLLSDSGPLSTSQFDPLIPSNNTPDNLFAWKTPYRRQALSDGLSIVPETVYSNSTNAGEHLGSHPFIEESIFVSQGPSSKSRLSKTVQDSDRSRFGKSPKQLKNSPHSSEHPLYTMEESSSNGSSQPAKSVAEAARNNPGTSYLERMRYLRAAERASIKPLQSLTESETPSSAGDIEASAPPATSEGVIPLSVRHDKEPPVREDHQTDSPVSFVAPQALHYNPEQPALLGETGARLIDTASLSTPAASLELAAQQFEQEGKREEQAIEEHQGISLGPFEFVIPLSMDSRVKDDYDRTLREASKCIRRFVASASFAEGTAVEVDVGSLALQMQRMIEQLNNITTHPDLNLPDQPSSGPLDVAKEASWAEYSSSKFQFLSYFMDAVLEDPLERAIHVIVMVKPGAAVDIMRKYFLGKQLDLVPSEEPGNQQLVFVSRHLSFQIFTVEDKSPAASYKDPTVIVALDNAFSADDPLVRKLRTTGSSGRLVPAIRLIISNTAEHIALCLPKCCDFDRLRLLVQYTNSYSSIAGDLQDDALGVQENAEETLRYLMSDPDTREWPLADVETVEILTPDQASSLEPEELCKMSISRQKRWLDDEGDDAANSSKRQRTTPLQDITHINDSVKGPSQENQEASRLNVQVELDSDAMLQINELRSALADARKRLRAMETNFAKLQHRYESKNERYHKTRRELEQSAESAKKSETRIERQKGEINKLKDERSELTKELQEARDIVKAGGGLAADLEIAREEIRKLSQEKSNLERTAQQERSQSEFTRLQYQNASSAAAQSGIEVRQLKEQVEELERKCNGEAAKLKQLRAQNNEQQHLDRIRELENSLMTREKLLMMKEEEIRDLRKNRPTTRSTSTQPRSPKFAGSSRPASPAPNLGSNSNTIGRGSVLRFRVEP
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.2
2 0.2
3 0.21
4 0.21
5 0.2
6 0.18
7 0.15
8 0.15
9 0.23
10 0.22
11 0.23
12 0.23
13 0.22
14 0.21
15 0.25
16 0.28
17 0.29
18 0.36
19 0.38
20 0.44
21 0.45
22 0.45
23 0.42
24 0.47
25 0.46
26 0.43
27 0.41
28 0.35
29 0.38
30 0.41
31 0.42
32 0.38
33 0.33
34 0.37
35 0.37
36 0.37
37 0.36
38 0.37
39 0.42
40 0.39
41 0.37
42 0.35
43 0.34
44 0.34
45 0.34
46 0.3
47 0.24
48 0.25
49 0.26
50 0.24
51 0.28
52 0.33
53 0.39
54 0.44
55 0.52
56 0.58
57 0.61
58 0.63
59 0.68
60 0.71
61 0.73
62 0.73
63 0.7
64 0.67
65 0.71
66 0.73
67 0.71
68 0.7
69 0.71
70 0.74
71 0.78
72 0.78
73 0.76
74 0.76
75 0.7
76 0.65
77 0.59
78 0.58
79 0.5
80 0.45
81 0.38
82 0.31
83 0.31
84 0.28
85 0.25
86 0.19
87 0.19
88 0.19
89 0.21
90 0.22
91 0.23
92 0.22
93 0.22
94 0.22
95 0.21
96 0.2
97 0.17
98 0.15
99 0.15
100 0.15
101 0.13
102 0.13
103 0.13
104 0.13
105 0.15
106 0.16
107 0.12
108 0.13
109 0.14
110 0.18
111 0.2
112 0.22
113 0.21
114 0.21
115 0.24
116 0.25
117 0.25
118 0.23
119 0.21
120 0.19
121 0.18
122 0.18
123 0.17
124 0.15
125 0.14
126 0.15
127 0.15
128 0.15
129 0.17
130 0.19
131 0.18
132 0.2
133 0.2
134 0.21
135 0.22
136 0.22
137 0.22
138 0.18
139 0.19
140 0.17
141 0.16
142 0.16
143 0.15
144 0.14
145 0.14
146 0.16
147 0.24
148 0.27
149 0.34
150 0.33
151 0.35
152 0.37
153 0.42
154 0.42
155 0.36
156 0.35
157 0.3
158 0.34
159 0.32
160 0.3
161 0.25
162 0.24
163 0.21
164 0.19
165 0.17
166 0.15
167 0.17
168 0.18
169 0.26
170 0.3
171 0.33
172 0.37
173 0.37
174 0.34
175 0.32
176 0.32
177 0.3
178 0.28
179 0.25
180 0.23
181 0.25
182 0.28
183 0.28
184 0.27
185 0.21
186 0.2
187 0.24
188 0.24
189 0.21
190 0.19
191 0.19
192 0.18
193 0.21
194 0.19
195 0.15
196 0.16
197 0.16
198 0.16
199 0.17
200 0.18
201 0.15
202 0.14
203 0.14
204 0.15
205 0.15
206 0.14
207 0.13
208 0.12
209 0.11
210 0.11
211 0.1
212 0.08
213 0.08
214 0.09
215 0.09
216 0.1
217 0.1
218 0.12
219 0.13
220 0.15
221 0.15
222 0.14
223 0.15
224 0.16
225 0.19
226 0.19
227 0.18
228 0.17
229 0.17
230 0.2
231 0.19
232 0.2
233 0.2
234 0.19
235 0.21
236 0.23
237 0.26
238 0.28
239 0.33
240 0.38
241 0.42
242 0.49
243 0.57
244 0.64
245 0.69
246 0.75
247 0.81
248 0.84
249 0.88
250 0.89
251 0.88
252 0.9
253 0.86
254 0.81
255 0.79
256 0.73
257 0.64
258 0.55
259 0.46
260 0.36
261 0.3
262 0.23
263 0.15
264 0.11
265 0.11
266 0.12
267 0.14
268 0.16
269 0.23
270 0.3
271 0.35
272 0.39
273 0.45
274 0.54
275 0.57
276 0.6
277 0.61
278 0.6
279 0.61
280 0.62
281 0.59
282 0.56
283 0.54
284 0.51
285 0.48
286 0.44
287 0.39
288 0.34
289 0.3
290 0.24
291 0.22
292 0.19
293 0.14
294 0.13
295 0.12
296 0.11
297 0.1
298 0.1
299 0.08
300 0.11
301 0.11
302 0.11
303 0.1
304 0.11
305 0.11
306 0.11
307 0.12
308 0.08
309 0.08
310 0.08
311 0.08
312 0.07
313 0.07
314 0.08
315 0.07
316 0.08
317 0.09
318 0.11
319 0.11
320 0.11
321 0.13
322 0.15
323 0.19
324 0.19
325 0.2
326 0.22
327 0.24
328 0.25
329 0.23
330 0.23
331 0.19
332 0.21
333 0.2
334 0.17
335 0.19
336 0.24
337 0.27
338 0.33
339 0.39
340 0.4
341 0.41
342 0.44
343 0.44
344 0.45
345 0.44
346 0.38
347 0.32
348 0.27
349 0.25
350 0.22
351 0.16
352 0.1
353 0.07
354 0.07
355 0.06
356 0.08
357 0.08
358 0.09
359 0.1
360 0.1
361 0.1
362 0.1
363 0.11
364 0.09
365 0.09
366 0.11
367 0.12
368 0.11
369 0.11
370 0.11
371 0.09
372 0.09
373 0.09
374 0.07
375 0.07
376 0.08
377 0.08
378 0.08
379 0.08
380 0.09
381 0.11
382 0.13
383 0.13
384 0.15
385 0.2
386 0.24
387 0.26
388 0.31
389 0.31
390 0.37
391 0.42
392 0.48
393 0.47
394 0.49
395 0.51
396 0.5
397 0.56
398 0.48
399 0.44
400 0.39
401 0.4
402 0.43
403 0.47
404 0.53
405 0.53
406 0.6
407 0.64
408 0.66
409 0.71
410 0.7
411 0.66
412 0.61
413 0.56
414 0.56
415 0.52
416 0.47
417 0.39
418 0.32
419 0.28
420 0.25
421 0.21
422 0.14
423 0.12
424 0.12
425 0.13
426 0.12
427 0.11
428 0.1
429 0.11
430 0.13
431 0.12
432 0.14
433 0.13
434 0.13
435 0.13
436 0.18
437 0.18
438 0.24
439 0.24
440 0.24
441 0.3
442 0.3
443 0.3
444 0.25
445 0.25
446 0.2
447 0.2
448 0.24
449 0.2
450 0.23
451 0.24
452 0.25
453 0.25
454 0.24
455 0.25
456 0.24
457 0.25
458 0.23
459 0.24
460 0.29
461 0.28
462 0.3
463 0.31
464 0.27
465 0.24
466 0.23
467 0.22
468 0.18
469 0.18
470 0.18
471 0.21
472 0.22
473 0.2
474 0.19
475 0.18
476 0.17
477 0.16
478 0.11
479 0.05
480 0.05
481 0.05
482 0.06
483 0.06
484 0.07
485 0.07
486 0.06
487 0.06
488 0.06
489 0.06
490 0.05
491 0.05
492 0.05
493 0.05
494 0.06
495 0.06
496 0.06
497 0.09
498 0.12
499 0.13
500 0.14
501 0.16
502 0.21
503 0.29
504 0.34
505 0.34
506 0.37
507 0.39
508 0.4
509 0.41
510 0.4
511 0.37
512 0.33
513 0.3
514 0.24
515 0.21
516 0.18
517 0.15
518 0.11
519 0.07
520 0.08
521 0.08
522 0.08
523 0.11
524 0.11
525 0.13
526 0.13
527 0.16
528 0.14
529 0.15
530 0.14
531 0.11
532 0.11
533 0.11
534 0.11
535 0.07
536 0.06
537 0.06
538 0.06
539 0.06
540 0.05
541 0.03
542 0.03
543 0.05
544 0.05
545 0.05
546 0.05
547 0.06
548 0.06
549 0.06
550 0.06
551 0.05
552 0.05
553 0.04
554 0.04
555 0.04
556 0.06
557 0.06
558 0.06
559 0.06
560 0.06
561 0.07
562 0.08
563 0.08
564 0.07
565 0.1
566 0.11
567 0.12
568 0.13
569 0.13
570 0.13
571 0.15
572 0.15
573 0.15
574 0.14
575 0.13
576 0.12
577 0.12
578 0.1
579 0.08
580 0.08
581 0.06
582 0.05
583 0.05
584 0.05
585 0.05
586 0.05
587 0.06
588 0.05
589 0.05
590 0.06
591 0.07
592 0.08
593 0.08
594 0.1
595 0.1
596 0.11
597 0.11
598 0.12
599 0.17
600 0.22
601 0.23
602 0.23
603 0.26
604 0.28
605 0.28
606 0.32
607 0.3
608 0.35
609 0.36
610 0.35
611 0.33
612 0.31
613 0.31
614 0.29
615 0.32
616 0.24
617 0.21
618 0.22
619 0.21
620 0.2
621 0.19
622 0.15
623 0.08
624 0.07
625 0.06
626 0.04
627 0.03
628 0.03
629 0.03
630 0.03
631 0.02
632 0.02
633 0.02
634 0.03
635 0.03
636 0.04
637 0.04
638 0.04
639 0.05
640 0.05
641 0.06
642 0.06
643 0.07
644 0.09
645 0.09
646 0.09
647 0.1
648 0.09
649 0.09
650 0.09
651 0.1
652 0.09
653 0.11
654 0.15
655 0.16
656 0.16
657 0.16
658 0.15
659 0.15
660 0.16
661 0.14
662 0.1
663 0.08
664 0.1
665 0.1
666 0.11
667 0.09
668 0.08
669 0.08
670 0.08
671 0.08
672 0.06
673 0.07
674 0.1
675 0.12
676 0.15
677 0.16
678 0.17
679 0.16
680 0.16
681 0.17
682 0.15
683 0.18
684 0.15
685 0.14
686 0.13
687 0.14
688 0.13
689 0.12
690 0.11
691 0.06
692 0.05
693 0.04
694 0.05
695 0.05
696 0.05
697 0.04
698 0.04
699 0.04
700 0.05
701 0.07
702 0.07
703 0.08
704 0.08
705 0.07
706 0.07
707 0.07
708 0.07
709 0.05
710 0.05
711 0.06
712 0.1
713 0.11
714 0.11
715 0.11
716 0.13
717 0.16
718 0.22
719 0.23
720 0.19
721 0.21
722 0.26
723 0.28
724 0.27
725 0.26
726 0.19
727 0.16
728 0.17
729 0.16
730 0.11
731 0.1
732 0.11
733 0.1
734 0.1
735 0.09
736 0.11
737 0.11
738 0.11
739 0.12
740 0.11
741 0.12
742 0.13
743 0.13
744 0.11
745 0.1
746 0.13
747 0.11
748 0.11
749 0.14
750 0.14
751 0.14
752 0.14
753 0.14
754 0.11
755 0.12
756 0.15
757 0.13
758 0.14
759 0.16
760 0.18
761 0.18
762 0.17
763 0.17
764 0.14
765 0.12
766 0.12
767 0.09
768 0.07
769 0.07
770 0.07
771 0.06
772 0.05
773 0.06
774 0.05
775 0.06
776 0.07
777 0.11
778 0.14
779 0.14
780 0.14
781 0.16
782 0.2
783 0.21
784 0.25
785 0.27
786 0.29
787 0.34
788 0.34
789 0.33
790 0.3
791 0.28
792 0.23
793 0.2
794 0.16
795 0.11
796 0.11
797 0.11
798 0.12
799 0.13
800 0.13
801 0.11
802 0.12
803 0.11
804 0.11
805 0.11
806 0.08
807 0.1
808 0.1
809 0.12
810 0.12
811 0.16
812 0.18
813 0.19
814 0.25
815 0.24
816 0.3
817 0.36
818 0.37
819 0.35
820 0.35
821 0.35
822 0.31
823 0.3
824 0.27
825 0.21
826 0.21
827 0.2
828 0.19
829 0.17
830 0.15
831 0.14
832 0.11
833 0.1
834 0.08
835 0.08
836 0.07
837 0.07
838 0.06
839 0.05
840 0.05
841 0.05
842 0.04
843 0.04
844 0.04
845 0.04
846 0.05
847 0.05
848 0.05
849 0.05
850 0.07
851 0.07
852 0.07
853 0.08
854 0.09
855 0.12
856 0.16
857 0.18
858 0.19
859 0.21
860 0.22
861 0.22
862 0.2
863 0.18
864 0.16
865 0.14
866 0.11
867 0.1
868 0.09
869 0.09
870 0.08
871 0.07
872 0.06
873 0.05
874 0.05
875 0.05
876 0.05
877 0.05
878 0.05
879 0.05
880 0.07
881 0.09
882 0.11
883 0.1
884 0.12
885 0.14
886 0.14
887 0.14
888 0.13
889 0.11
890 0.16
891 0.24
892 0.29
893 0.34
894 0.43
895 0.47
896 0.5
897 0.55
898 0.54
899 0.51
900 0.46
901 0.42
902 0.36
903 0.32
904 0.28
905 0.24
906 0.19
907 0.17
908 0.16
909 0.18
910 0.19
911 0.21
912 0.23
913 0.29
914 0.37
915 0.44
916 0.53
917 0.55
918 0.52
919 0.54
920 0.55
921 0.53
922 0.49
923 0.4
924 0.31
925 0.27
926 0.26
927 0.26
928 0.27
929 0.24
930 0.21
931 0.24
932 0.31
933 0.32
934 0.33
935 0.33
936 0.32
937 0.31
938 0.31
939 0.33
940 0.27
941 0.23
942 0.22
943 0.2
944 0.17
945 0.17
946 0.18
947 0.12
948 0.11
949 0.11
950 0.09
951 0.09
952 0.08
953 0.07
954 0.07
955 0.08
956 0.08
957 0.08
958 0.08
959 0.08
960 0.09
961 0.13
962 0.16
963 0.2
964 0.25
965 0.31
966 0.35
967 0.35
968 0.36
969 0.39
970 0.41
971 0.43
972 0.48
973 0.46
974 0.47
975 0.48
976 0.48
977 0.45
978 0.39
979 0.38
980 0.36
981 0.38
982 0.37
983 0.45
984 0.53
985 0.59
986 0.66
987 0.69
988 0.68
989 0.71
990 0.76
991 0.77
992 0.75
993 0.75
994 0.74
995 0.76
996 0.72
997 0.7
998 0.67
999 0.6
1000 0.57
1001 0.51
1002 0.43
1003 0.35
1004 0.32
1005 0.32
1006 0.27
1007 0.32
1008 0.34
1009 0.42
1010 0.52
1011 0.58
1012 0.61
1013 0.61
1014 0.67
1015 0.65
1016 0.67
1017 0.65
1018 0.59
1019 0.6
1020 0.6
1021 0.58
1022 0.54
1023 0.52
1024 0.46
1025 0.45
1026 0.46
1027 0.38
1028 0.39
1029 0.38
1030 0.39
1031 0.4
1032 0.37
1033 0.32
1034 0.29
1035 0.29
1036 0.28
1037 0.26
1038 0.23
1039 0.18
1040 0.17
1041 0.15
1042 0.14
1043 0.12
1044 0.08
1045 0.07
1046 0.07
1047 0.05
1048 0.05
1049 0.05
1050 0.04
1051 0.05
1052 0.05
1053 0.07
1054 0.08
1055 0.1
1056 0.13
1057 0.18
1058 0.21
1059 0.26
1060 0.32
1061 0.38
1062 0.43
1063 0.47
1064 0.53
1065 0.5
1066 0.49
1067 0.49
1068 0.48
1069 0.52
1070 0.5
1071 0.48
1072 0.45
1073 0.47
1074 0.51
1075 0.49
1076 0.46
1077 0.42
1078 0.44
1079 0.42
1080 0.46
1081 0.44
1082 0.41
1083 0.41
1084 0.41
1085 0.39
1086 0.34
1087 0.34
1088 0.23
1089 0.24
1090 0.21
1091 0.17
1092 0.15
1093 0.12
1094 0.14
1095 0.12
1096 0.17
1097 0.17
1098 0.18
1099 0.24
1100 0.26
1101 0.26
1102 0.25
1103 0.27
1104 0.27
1105 0.32
1106 0.38
1107 0.33
1108 0.4
1109 0.4
1110 0.4
1111 0.38
1112 0.37
1113 0.31
1114 0.32
1115 0.38
1116 0.36
1117 0.46
1118 0.49
1119 0.5
1120 0.51
1121 0.57
1122 0.57
1123 0.57
1124 0.6
1125 0.57
1126 0.62
1127 0.67
1128 0.65
1129 0.6
1130 0.59
1131 0.56
1132 0.49
1133 0.44
1134 0.37
1135 0.34
1136 0.34
1137 0.33
1138 0.29
1139 0.29
1140 0.28
1141 0.27
1142 0.28
1143 0.26
1144 0.24
1145 0.25
1146 0.24
1147 0.23
1148 0.23
1149 0.27
1150 0.27
1151 0.31
1152 0.35
1153 0.36
1154 0.37
1155 0.37
1156 0.39
1157 0.42
1158 0.44
1159 0.47
1160 0.51
1161 0.58
1162 0.62
1163 0.68
1164 0.7
1165 0.69
1166 0.71
1167 0.71
1168 0.69
1169 0.71
1170 0.7
1171 0.68
1172 0.73
1173 0.7
1174 0.7
1175 0.65
1176 0.64
1177 0.6
1178 0.6
1179 0.61
1180 0.59
1181 0.6
1182 0.55
1183 0.58
1184 0.52
1185 0.48
1186 0.44
1187 0.43
1188 0.39
1189 0.4
1190 0.39
1191 0.35
1192 0.36
1193 0.36
1194 0.37
1195 0.33
1196 0.29
1197 0.22
1198 0.21
1199 0.21
1200 0.23
1201 0.24
1202 0.27
1203 0.27