Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A015JTV2

Protein Details
Accession A0A015JTV2    Localization Confidence High Confidence Score 19.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-35MSKYKQKRRLNKSPAYKRNKKKYPPDPNKPDEDIIHydrophilic
47-68DKLLINSKKTRRYERLSRKGITHydrophilic
140-169YGDNYKFEKKKSQPKDRKNKNKKGSLISSHHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
5-23KQKRRLNKSPAYKRNKKKY
147-163EKKKSQPKDRKNKNKKG
Subcellular Location(s) nucl 18, cyto_nucl 12, mito 5, cyto 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009071  HMG_box_dom  
IPR036910  HMG_box_dom_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50118  HMG_BOX_2  
Amino Acid Sequences MSKYKQKRRLNKSPAYKRNKKKYPPDPNKPDEDIIKESIHLLYLDIDKLLINSKKTRRYERLSRKGITEFEKPPRPQNIFILYRRNKSASPEFKNKLKVDKKVKLTSKEIGILWNNETEEVIKFFCALERIAEKKHREIYGDNYKFEKKKSQPKDRKNKNKKGSLISSHSPPIETLPIPLPYDQQYDGQINTSNPSSNPNPNPNPNPNSNSNPNSNLNFNPNFGNTNEPTIPQIYEGINIPQEYEGTELANIPQEYKGIELANIPQTYNDFELANIPQAYEEIELANILQTYNDFELETIPQTNNNFELANIPQTYNDIELETIPQTNNNFELANIPQAKHSNNFELDNNFELDNNFELENIPQTYNDFELANIPQTYNNFELDNNFGLENIPQTYNDFELANIPQTYNNFELDNNFGLENIPQTYNDFELANIPQTYNNFELDNNFGLENIPQTYNDFELANIPQTYNDFELANIPQTYNDFELKNIPQTYNDFELENIPQIYNDVDRKYSSNI
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.92
2 0.93
3 0.93
4 0.92
5 0.93
6 0.93
7 0.92
8 0.92
9 0.92
10 0.93
11 0.94
12 0.94
13 0.93
14 0.9
15 0.87
16 0.81
17 0.74
18 0.68
19 0.63
20 0.56
21 0.5
22 0.43
23 0.36
24 0.32
25 0.28
26 0.24
27 0.18
28 0.13
29 0.13
30 0.14
31 0.14
32 0.12
33 0.12
34 0.11
35 0.12
36 0.19
37 0.19
38 0.22
39 0.3
40 0.39
41 0.48
42 0.56
43 0.65
44 0.67
45 0.72
46 0.79
47 0.82
48 0.85
49 0.83
50 0.79
51 0.74
52 0.7
53 0.66
54 0.6
55 0.57
56 0.53
57 0.54
58 0.61
59 0.58
60 0.61
61 0.64
62 0.64
63 0.59
64 0.59
65 0.59
66 0.57
67 0.6
68 0.63
69 0.6
70 0.6
71 0.6
72 0.56
73 0.49
74 0.49
75 0.55
76 0.54
77 0.56
78 0.61
79 0.62
80 0.65
81 0.72
82 0.68
83 0.68
84 0.65
85 0.67
86 0.67
87 0.71
88 0.73
89 0.74
90 0.79
91 0.75
92 0.73
93 0.68
94 0.62
95 0.57
96 0.49
97 0.45
98 0.4
99 0.36
100 0.31
101 0.29
102 0.25
103 0.2
104 0.2
105 0.16
106 0.14
107 0.13
108 0.12
109 0.09
110 0.09
111 0.09
112 0.1
113 0.11
114 0.1
115 0.12
116 0.16
117 0.19
118 0.24
119 0.32
120 0.34
121 0.39
122 0.45
123 0.43
124 0.41
125 0.41
126 0.45
127 0.49
128 0.49
129 0.45
130 0.42
131 0.47
132 0.46
133 0.46
134 0.47
135 0.44
136 0.51
137 0.6
138 0.67
139 0.72
140 0.81
141 0.9
142 0.91
143 0.94
144 0.95
145 0.95
146 0.93
147 0.91
148 0.87
149 0.84
150 0.81
151 0.76
152 0.72
153 0.64
154 0.58
155 0.52
156 0.45
157 0.37
158 0.29
159 0.23
160 0.2
161 0.17
162 0.15
163 0.15
164 0.17
165 0.18
166 0.18
167 0.18
168 0.16
169 0.19
170 0.18
171 0.17
172 0.17
173 0.18
174 0.17
175 0.17
176 0.17
177 0.14
178 0.15
179 0.14
180 0.13
181 0.11
182 0.16
183 0.18
184 0.24
185 0.28
186 0.35
187 0.39
188 0.44
189 0.51
190 0.53
191 0.54
192 0.52
193 0.52
194 0.48
195 0.49
196 0.5
197 0.47
198 0.43
199 0.42
200 0.41
201 0.38
202 0.35
203 0.31
204 0.3
205 0.28
206 0.25
207 0.22
208 0.2
209 0.2
210 0.18
211 0.21
212 0.16
213 0.19
214 0.18
215 0.17
216 0.18
217 0.17
218 0.16
219 0.12
220 0.13
221 0.09
222 0.1
223 0.1
224 0.1
225 0.1
226 0.09
227 0.09
228 0.08
229 0.07
230 0.07
231 0.07
232 0.07
233 0.06
234 0.06
235 0.06
236 0.06
237 0.09
238 0.08
239 0.08
240 0.08
241 0.08
242 0.08
243 0.08
244 0.09
245 0.06
246 0.07
247 0.07
248 0.09
249 0.13
250 0.13
251 0.13
252 0.11
253 0.12
254 0.13
255 0.13
256 0.12
257 0.08
258 0.07
259 0.09
260 0.1
261 0.11
262 0.1
263 0.09
264 0.08
265 0.08
266 0.08
267 0.07
268 0.07
269 0.05
270 0.05
271 0.05
272 0.05
273 0.05
274 0.04
275 0.04
276 0.03
277 0.03
278 0.06
279 0.06
280 0.07
281 0.06
282 0.06
283 0.07
284 0.08
285 0.09
286 0.09
287 0.08
288 0.1
289 0.11
290 0.12
291 0.12
292 0.12
293 0.11
294 0.09
295 0.12
296 0.11
297 0.13
298 0.13
299 0.13
300 0.12
301 0.13
302 0.13
303 0.12
304 0.11
305 0.08
306 0.07
307 0.07
308 0.09
309 0.09
310 0.09
311 0.08
312 0.1
313 0.1
314 0.11
315 0.12
316 0.11
317 0.1
318 0.09
319 0.12
320 0.1
321 0.17
322 0.17
323 0.17
324 0.18
325 0.21
326 0.22
327 0.23
328 0.26
329 0.24
330 0.25
331 0.27
332 0.26
333 0.26
334 0.26
335 0.24
336 0.22
337 0.18
338 0.16
339 0.14
340 0.13
341 0.12
342 0.11
343 0.1
344 0.08
345 0.09
346 0.09
347 0.12
348 0.12
349 0.12
350 0.11
351 0.12
352 0.13
353 0.13
354 0.14
355 0.1
356 0.08
357 0.1
358 0.11
359 0.13
360 0.12
361 0.12
362 0.13
363 0.14
364 0.18
365 0.17
366 0.17
367 0.15
368 0.15
369 0.16
370 0.18
371 0.18
372 0.15
373 0.14
374 0.13
375 0.12
376 0.12
377 0.12
378 0.11
379 0.11
380 0.1
381 0.12
382 0.13
383 0.13
384 0.14
385 0.12
386 0.09
387 0.11
388 0.11
389 0.13
390 0.12
391 0.12
392 0.13
393 0.14
394 0.18
395 0.17
396 0.17
397 0.15
398 0.15
399 0.16
400 0.18
401 0.18
402 0.15
403 0.14
404 0.13
405 0.12
406 0.12
407 0.12
408 0.11
409 0.11
410 0.1
411 0.12
412 0.13
413 0.13
414 0.14
415 0.12
416 0.09
417 0.11
418 0.11
419 0.13
420 0.12
421 0.12
422 0.13
423 0.14
424 0.18
425 0.17
426 0.17
427 0.15
428 0.15
429 0.16
430 0.18
431 0.18
432 0.15
433 0.14
434 0.13
435 0.12
436 0.12
437 0.12
438 0.11
439 0.11
440 0.1
441 0.12
442 0.13
443 0.13
444 0.14
445 0.12
446 0.09
447 0.11
448 0.11
449 0.13
450 0.12
451 0.11
452 0.12
453 0.12
454 0.14
455 0.13
456 0.13
457 0.09
458 0.09
459 0.11
460 0.1
461 0.13
462 0.12
463 0.11
464 0.12
465 0.12
466 0.14
467 0.15
468 0.18
469 0.15
470 0.16
471 0.23
472 0.25
473 0.32
474 0.34
475 0.31
476 0.31
477 0.35
478 0.4
479 0.38
480 0.36
481 0.29
482 0.27
483 0.29
484 0.28
485 0.28
486 0.24
487 0.19
488 0.18
489 0.18
490 0.2
491 0.22
492 0.25
493 0.23
494 0.24
495 0.27