Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A015LYW4

Protein Details
Accession A0A015LYW4    Localization Confidence High Confidence Score 21.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
143-162VTDIKNQNAKHKNNKLNKTLHydrophilic
247-273QHINQINKTKKSRKRKLEKALVSIRKKHydrophilic
610-629NTITGPRKKAKQDYEERIESHydrophilic
665-701MMVIHKKNVLHKKKMSLREKQIQLTNRVNNKRKSRKKHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
254-277KTKKSRKRKLEKALVSIRKKELQK
631-701KAGREGREKYGSSKGKKVEGASTTNKEKARNKAFMMVIHKKNVLHKKKMSLREKQIQLTNRVNNKRKSRKK
Subcellular Location(s) nucl 24.5, cyto_nucl 13.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR016024  ARM-type_fold  
IPR027312  Sda1  
IPR007949  SDA1_C  
IPR012977  SDA1_N  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0015031  P:protein transport  
GO:0042273  P:ribosomal large subunit biogenesis  
GO:0000055  P:ribosomal large subunit export from nucleus  
Pfam View protein in Pfam  
PF08158  NUC130_3NT  
PF05285  SDA1  
Amino Acid Sequences MGKRNRTALLPNNLPQLQNLIKRDPISYKRDFLQQYRHYESQLDIFKLKPDEEAEEFGSLITFISQVAQCYVQETSSFPQQIISLLSENYQILHPNLRKTMVQTLVLLRNKDIIPSVTLLSLFFTLFRTRDKQLRELLYSYIVTDIKNQNAKHKNNKLNKTLQSFIINSEMSENSIAAKKSLDVCIELYRKGIWNDAKTTNVIAEACFHQVTKIRVTAIQFFLGSNQDQDDDSSEEEKQLPNVKKLQHINQINKTKKSRKRKLEKALVSIRKKELQKHKAENFNFSALHLLNDPQGFSEKLFSTLTNSQFNDRFEIKILSLNLISRIIGIHKLVLLNFYSYLQRYLQPHQRDVTLVLVILAQACHELVPPDVLEPVIRVVANNFVSDHCASEVMTAGLNAIREICTRQPLAMDATLLQDLTEYGKDKNKGVMMAARSLIGLFREINPELLKRKDRGKIASMNLKDFKPLQYGEVRAMERIEGIELLEEYKKQSSLGDDEHKDEWAEWEIASDDSSGEEGWIDVPSDDDQDIVVSDSSDEEIDKNNVDVNEKNVNEEKVSTLATTQLLTPADFAKLNELKLEHKTEQIVDGGKRKRSSTQQNEPSDIIDVNTITGPRKKAKQDYEERIESIKAGREGREKYGSSKGKKVEGASTTNKEKARNKAFMMVIHKKNVLHKKKMSLREKQIQLTNRVNNKRKSRKK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.54
2 0.46
3 0.44
4 0.41
5 0.42
6 0.43
7 0.39
8 0.41
9 0.43
10 0.46
11 0.48
12 0.49
13 0.49
14 0.51
15 0.51
16 0.5
17 0.57
18 0.58
19 0.56
20 0.59
21 0.59
22 0.62
23 0.65
24 0.64
25 0.57
26 0.53
27 0.48
28 0.45
29 0.44
30 0.38
31 0.32
32 0.31
33 0.34
34 0.35
35 0.34
36 0.29
37 0.25
38 0.28
39 0.29
40 0.32
41 0.28
42 0.26
43 0.25
44 0.22
45 0.19
46 0.14
47 0.11
48 0.07
49 0.05
50 0.05
51 0.08
52 0.09
53 0.1
54 0.12
55 0.14
56 0.13
57 0.15
58 0.16
59 0.13
60 0.13
61 0.15
62 0.17
63 0.23
64 0.24
65 0.22
66 0.22
67 0.22
68 0.23
69 0.22
70 0.21
71 0.15
72 0.14
73 0.15
74 0.16
75 0.15
76 0.15
77 0.14
78 0.13
79 0.14
80 0.22
81 0.25
82 0.28
83 0.31
84 0.33
85 0.33
86 0.35
87 0.41
88 0.36
89 0.35
90 0.32
91 0.35
92 0.41
93 0.44
94 0.41
95 0.33
96 0.34
97 0.32
98 0.31
99 0.27
100 0.2
101 0.18
102 0.19
103 0.19
104 0.15
105 0.15
106 0.14
107 0.13
108 0.12
109 0.1
110 0.09
111 0.1
112 0.12
113 0.13
114 0.18
115 0.21
116 0.24
117 0.31
118 0.35
119 0.39
120 0.44
121 0.48
122 0.48
123 0.45
124 0.43
125 0.39
126 0.35
127 0.29
128 0.24
129 0.19
130 0.16
131 0.21
132 0.23
133 0.26
134 0.32
135 0.33
136 0.39
137 0.48
138 0.56
139 0.6
140 0.66
141 0.7
142 0.74
143 0.82
144 0.8
145 0.8
146 0.79
147 0.75
148 0.67
149 0.61
150 0.55
151 0.47
152 0.41
153 0.37
154 0.29
155 0.23
156 0.22
157 0.19
158 0.16
159 0.15
160 0.13
161 0.1
162 0.14
163 0.14
164 0.12
165 0.12
166 0.13
167 0.16
168 0.18
169 0.17
170 0.15
171 0.17
172 0.24
173 0.26
174 0.24
175 0.22
176 0.21
177 0.23
178 0.22
179 0.27
180 0.25
181 0.26
182 0.31
183 0.33
184 0.33
185 0.31
186 0.3
187 0.24
188 0.21
189 0.17
190 0.12
191 0.12
192 0.12
193 0.13
194 0.13
195 0.12
196 0.12
197 0.17
198 0.19
199 0.2
200 0.2
201 0.19
202 0.21
203 0.24
204 0.28
205 0.25
206 0.24
207 0.2
208 0.19
209 0.19
210 0.19
211 0.17
212 0.12
213 0.1
214 0.1
215 0.1
216 0.1
217 0.11
218 0.11
219 0.12
220 0.12
221 0.12
222 0.13
223 0.14
224 0.13
225 0.14
226 0.21
227 0.23
228 0.25
229 0.31
230 0.32
231 0.38
232 0.43
233 0.47
234 0.48
235 0.53
236 0.57
237 0.61
238 0.68
239 0.67
240 0.69
241 0.7
242 0.71
243 0.72
244 0.76
245 0.77
246 0.78
247 0.83
248 0.86
249 0.89
250 0.9
251 0.86
252 0.83
253 0.83
254 0.81
255 0.75
256 0.69
257 0.61
258 0.57
259 0.54
260 0.54
261 0.55
262 0.55
263 0.6
264 0.65
265 0.68
266 0.71
267 0.69
268 0.66
269 0.58
270 0.51
271 0.42
272 0.33
273 0.29
274 0.19
275 0.19
276 0.13
277 0.11
278 0.11
279 0.11
280 0.11
281 0.08
282 0.1
283 0.09
284 0.09
285 0.12
286 0.1
287 0.12
288 0.13
289 0.12
290 0.16
291 0.2
292 0.23
293 0.24
294 0.25
295 0.25
296 0.28
297 0.28
298 0.28
299 0.24
300 0.21
301 0.18
302 0.19
303 0.16
304 0.17
305 0.17
306 0.13
307 0.13
308 0.13
309 0.12
310 0.11
311 0.1
312 0.07
313 0.07
314 0.06
315 0.07
316 0.07
317 0.06
318 0.07
319 0.07
320 0.07
321 0.08
322 0.07
323 0.07
324 0.07
325 0.08
326 0.08
327 0.08
328 0.1
329 0.1
330 0.13
331 0.15
332 0.2
333 0.27
334 0.29
335 0.31
336 0.3
337 0.3
338 0.28
339 0.26
340 0.22
341 0.14
342 0.11
343 0.08
344 0.07
345 0.07
346 0.06
347 0.05
348 0.03
349 0.03
350 0.03
351 0.03
352 0.03
353 0.04
354 0.04
355 0.05
356 0.05
357 0.05
358 0.05
359 0.05
360 0.05
361 0.05
362 0.05
363 0.05
364 0.05
365 0.05
366 0.05
367 0.1
368 0.1
369 0.1
370 0.1
371 0.1
372 0.13
373 0.13
374 0.13
375 0.09
376 0.08
377 0.08
378 0.08
379 0.08
380 0.06
381 0.06
382 0.05
383 0.05
384 0.05
385 0.05
386 0.05
387 0.05
388 0.05
389 0.06
390 0.08
391 0.09
392 0.12
393 0.12
394 0.12
395 0.12
396 0.13
397 0.15
398 0.13
399 0.12
400 0.09
401 0.1
402 0.1
403 0.09
404 0.08
405 0.06
406 0.05
407 0.06
408 0.07
409 0.07
410 0.09
411 0.14
412 0.16
413 0.17
414 0.2
415 0.2
416 0.19
417 0.19
418 0.22
419 0.19
420 0.2
421 0.19
422 0.16
423 0.14
424 0.14
425 0.13
426 0.09
427 0.08
428 0.07
429 0.08
430 0.11
431 0.11
432 0.13
433 0.14
434 0.16
435 0.19
436 0.24
437 0.27
438 0.26
439 0.33
440 0.37
441 0.41
442 0.43
443 0.46
444 0.48
445 0.49
446 0.55
447 0.5
448 0.5
449 0.48
450 0.43
451 0.39
452 0.33
453 0.29
454 0.25
455 0.23
456 0.21
457 0.22
458 0.23
459 0.24
460 0.28
461 0.26
462 0.23
463 0.23
464 0.19
465 0.15
466 0.14
467 0.11
468 0.06
469 0.06
470 0.06
471 0.06
472 0.07
473 0.07
474 0.08
475 0.09
476 0.1
477 0.1
478 0.1
479 0.11
480 0.12
481 0.16
482 0.21
483 0.27
484 0.27
485 0.3
486 0.31
487 0.3
488 0.28
489 0.24
490 0.2
491 0.16
492 0.15
493 0.11
494 0.11
495 0.12
496 0.12
497 0.12
498 0.1
499 0.07
500 0.06
501 0.07
502 0.06
503 0.05
504 0.05
505 0.05
506 0.05
507 0.05
508 0.06
509 0.05
510 0.07
511 0.07
512 0.09
513 0.09
514 0.08
515 0.08
516 0.07
517 0.08
518 0.07
519 0.07
520 0.05
521 0.06
522 0.06
523 0.07
524 0.07
525 0.07
526 0.06
527 0.09
528 0.1
529 0.11
530 0.11
531 0.13
532 0.14
533 0.16
534 0.17
535 0.19
536 0.26
537 0.25
538 0.29
539 0.29
540 0.3
541 0.28
542 0.28
543 0.24
544 0.18
545 0.19
546 0.15
547 0.12
548 0.13
549 0.13
550 0.12
551 0.11
552 0.13
553 0.13
554 0.13
555 0.14
556 0.12
557 0.14
558 0.14
559 0.14
560 0.19
561 0.21
562 0.21
563 0.22
564 0.23
565 0.24
566 0.29
567 0.35
568 0.28
569 0.29
570 0.31
571 0.29
572 0.29
573 0.29
574 0.29
575 0.26
576 0.33
577 0.36
578 0.4
579 0.42
580 0.42
581 0.46
582 0.52
583 0.59
584 0.61
585 0.66
586 0.69
587 0.72
588 0.74
589 0.68
590 0.59
591 0.5
592 0.4
593 0.29
594 0.21
595 0.15
596 0.12
597 0.13
598 0.13
599 0.14
600 0.19
601 0.23
602 0.28
603 0.36
604 0.43
605 0.52
606 0.6
607 0.67
608 0.73
609 0.78
610 0.8
611 0.76
612 0.7
613 0.62
614 0.53
615 0.44
616 0.37
617 0.33
618 0.29
619 0.28
620 0.31
621 0.36
622 0.39
623 0.45
624 0.49
625 0.44
626 0.44
627 0.51
628 0.56
629 0.54
630 0.58
631 0.56
632 0.55
633 0.58
634 0.57
635 0.54
636 0.5
637 0.52
638 0.52
639 0.54
640 0.53
641 0.56
642 0.56
643 0.56
644 0.58
645 0.61
646 0.62
647 0.62
648 0.6
649 0.62
650 0.62
651 0.6
652 0.62
653 0.62
654 0.58
655 0.56
656 0.56
657 0.5
658 0.57
659 0.62
660 0.62
661 0.62
662 0.64
663 0.7
664 0.76
665 0.84
666 0.83
667 0.83
668 0.84
669 0.84
670 0.84
671 0.81
672 0.8
673 0.76
674 0.75
675 0.74
676 0.73
677 0.73
678 0.76
679 0.78
680 0.79
681 0.83