Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A015JVX9

Protein Details
Accession A0A015JVX9    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
2-23SENCPEGRSKRQKIEDSSKYSIHydrophilic
433-458SFNSPSKSTSSKKRNRPEEKNTLIIPHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 17.5, cyto_nucl 12.333, mito_nucl 10.666, cyto 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR010347  Tdp1  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0008081  F:phosphoric diester hydrolase activity  
GO:0006281  P:DNA repair  
Pfam View protein in Pfam  
PF06087  Tyr-DNA_phospho  
Amino Acid Sequences MSENCPEGRSKRQKIEDSSKYSIEVSNNQPNVAYEDSGIKLTTVEALPASENIDCVSLSSILSSENLIEMVQFNYMVELEFLMTNLPKSKQKIIPTTIVHGLSGESEKYLKVKLNRTHHTKAMLLFYANSTMRLIIHTANAIRRDWANKTQGVYMSPFLLKKRNIASSSEFESDFMEYLESYGDKLNIIRNKVKEYDFSTIKAILIASIPGYHVNEKLELFGHMRLRNILSRVTVPLSCKLDSTIICQFSSIGSLGKDEKWLIEEFAESLKYAKNQNQCSEPDIKLVYPTVENVSNSLEGWAAGNSLPFDHKNYLKQKHYMQKYLHKWKAIEAGRERAMPHIKTYSRMTMIPNSNNDNNLESKSSAEIAWLLLTSSNLSKAAWGALQKKDKQLMIRSYELGILTFPELFQNDEYTSVHMLNSTPQNLKPLLPSFNSPSKSTSSKKRNRPEEKNTLIIPIRLPYDLPLTPYNFKDGDECWTWNIPRTETDCLGLKKF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.79
2 0.85
3 0.84
4 0.82
5 0.78
6 0.69
7 0.61
8 0.54
9 0.48
10 0.42
11 0.39
12 0.38
13 0.43
14 0.43
15 0.41
16 0.4
17 0.37
18 0.37
19 0.32
20 0.25
21 0.16
22 0.19
23 0.2
24 0.21
25 0.2
26 0.15
27 0.13
28 0.12
29 0.15
30 0.11
31 0.11
32 0.1
33 0.11
34 0.12
35 0.12
36 0.14
37 0.1
38 0.1
39 0.1
40 0.11
41 0.09
42 0.09
43 0.11
44 0.09
45 0.09
46 0.09
47 0.09
48 0.09
49 0.09
50 0.09
51 0.07
52 0.07
53 0.07
54 0.07
55 0.07
56 0.07
57 0.08
58 0.08
59 0.07
60 0.07
61 0.07
62 0.08
63 0.07
64 0.06
65 0.06
66 0.06
67 0.06
68 0.07
69 0.07
70 0.08
71 0.09
72 0.13
73 0.16
74 0.2
75 0.25
76 0.33
77 0.38
78 0.46
79 0.53
80 0.54
81 0.59
82 0.56
83 0.57
84 0.53
85 0.47
86 0.39
87 0.31
88 0.26
89 0.19
90 0.18
91 0.14
92 0.09
93 0.1
94 0.1
95 0.11
96 0.14
97 0.17
98 0.23
99 0.32
100 0.4
101 0.49
102 0.57
103 0.64
104 0.67
105 0.66
106 0.63
107 0.56
108 0.5
109 0.45
110 0.38
111 0.3
112 0.25
113 0.22
114 0.24
115 0.21
116 0.19
117 0.14
118 0.13
119 0.13
120 0.13
121 0.14
122 0.1
123 0.11
124 0.12
125 0.14
126 0.18
127 0.2
128 0.19
129 0.19
130 0.2
131 0.23
132 0.26
133 0.3
134 0.31
135 0.32
136 0.33
137 0.35
138 0.34
139 0.32
140 0.29
141 0.23
142 0.2
143 0.2
144 0.2
145 0.19
146 0.24
147 0.23
148 0.26
149 0.3
150 0.34
151 0.34
152 0.36
153 0.39
154 0.36
155 0.4
156 0.37
157 0.32
158 0.26
159 0.25
160 0.22
161 0.17
162 0.13
163 0.08
164 0.06
165 0.06
166 0.06
167 0.05
168 0.06
169 0.06
170 0.06
171 0.06
172 0.08
173 0.13
174 0.16
175 0.21
176 0.25
177 0.26
178 0.3
179 0.34
180 0.34
181 0.32
182 0.33
183 0.35
184 0.31
185 0.31
186 0.28
187 0.25
188 0.24
189 0.21
190 0.16
191 0.1
192 0.08
193 0.07
194 0.05
195 0.05
196 0.05
197 0.06
198 0.07
199 0.08
200 0.09
201 0.09
202 0.11
203 0.1
204 0.11
205 0.1
206 0.1
207 0.11
208 0.13
209 0.18
210 0.17
211 0.18
212 0.18
213 0.2
214 0.2
215 0.2
216 0.18
217 0.14
218 0.14
219 0.15
220 0.16
221 0.15
222 0.15
223 0.18
224 0.2
225 0.19
226 0.18
227 0.18
228 0.19
229 0.18
230 0.2
231 0.2
232 0.18
233 0.18
234 0.18
235 0.17
236 0.14
237 0.15
238 0.11
239 0.07
240 0.06
241 0.07
242 0.08
243 0.09
244 0.1
245 0.09
246 0.08
247 0.1
248 0.1
249 0.09
250 0.08
251 0.08
252 0.08
253 0.08
254 0.08
255 0.06
256 0.07
257 0.08
258 0.09
259 0.12
260 0.17
261 0.23
262 0.27
263 0.29
264 0.33
265 0.33
266 0.35
267 0.37
268 0.32
269 0.28
270 0.25
271 0.22
272 0.19
273 0.18
274 0.15
275 0.1
276 0.11
277 0.1
278 0.11
279 0.11
280 0.11
281 0.12
282 0.12
283 0.11
284 0.11
285 0.09
286 0.07
287 0.07
288 0.06
289 0.05
290 0.05
291 0.06
292 0.05
293 0.06
294 0.08
295 0.08
296 0.11
297 0.14
298 0.16
299 0.24
300 0.33
301 0.4
302 0.43
303 0.47
304 0.52
305 0.58
306 0.62
307 0.61
308 0.58
309 0.61
310 0.66
311 0.73
312 0.69
313 0.64
314 0.58
315 0.54
316 0.57
317 0.51
318 0.49
319 0.42
320 0.44
321 0.41
322 0.43
323 0.39
324 0.36
325 0.38
326 0.31
327 0.29
328 0.31
329 0.3
330 0.32
331 0.35
332 0.34
333 0.31
334 0.32
335 0.32
336 0.33
337 0.38
338 0.39
339 0.39
340 0.4
341 0.39
342 0.39
343 0.37
344 0.31
345 0.27
346 0.24
347 0.22
348 0.17
349 0.17
350 0.16
351 0.16
352 0.14
353 0.12
354 0.11
355 0.09
356 0.09
357 0.08
358 0.07
359 0.06
360 0.06
361 0.07
362 0.08
363 0.09
364 0.09
365 0.09
366 0.09
367 0.09
368 0.1
369 0.11
370 0.15
371 0.19
372 0.27
373 0.35
374 0.38
375 0.43
376 0.47
377 0.48
378 0.49
379 0.52
380 0.52
381 0.5
382 0.5
383 0.45
384 0.41
385 0.4
386 0.34
387 0.26
388 0.18
389 0.13
390 0.11
391 0.1
392 0.09
393 0.09
394 0.1
395 0.11
396 0.12
397 0.13
398 0.13
399 0.15
400 0.15
401 0.16
402 0.17
403 0.16
404 0.15
405 0.13
406 0.13
407 0.16
408 0.21
409 0.23
410 0.24
411 0.25
412 0.29
413 0.3
414 0.31
415 0.31
416 0.3
417 0.31
418 0.3
419 0.33
420 0.36
421 0.42
422 0.44
423 0.4
424 0.38
425 0.39
426 0.44
427 0.46
428 0.5
429 0.53
430 0.6
431 0.69
432 0.77
433 0.83
434 0.87
435 0.91
436 0.9
437 0.9
438 0.87
439 0.83
440 0.73
441 0.69
442 0.6
443 0.52
444 0.43
445 0.35
446 0.31
447 0.25
448 0.25
449 0.19
450 0.23
451 0.22
452 0.24
453 0.26
454 0.29
455 0.33
456 0.34
457 0.36
458 0.31
459 0.31
460 0.3
461 0.26
462 0.27
463 0.27
464 0.28
465 0.27
466 0.33
467 0.34
468 0.38
469 0.41
470 0.37
471 0.39
472 0.42
473 0.45
474 0.4
475 0.42
476 0.42