Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0D8JTT5

Protein Details
Accession A0A0D8JTT5    Localization Confidence High Confidence Score 23.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
8-85SRSISPSRSRSPPPRDRSRSVSSGRSRSASPRRSPSPRARSRSRSRSRTPRSRTRSLTPRSRSPSPRRNGRGRGRSLSHydrophilic
224-250VYPAPSRYRSPPRRRFRAPRGMDRHDLHydrophilic
273-307PLYSSRSPTPPPRRRGRRDSYDSPRRRRRGSSYDSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
13-90PSRSRSPPPRDRSRSVSSGRSRSASPRRSPSPRARSRSRSRSRTPRSRTRSLTPRSRSPSPRRNGRGRGRSLSRTDSR
99-106SRDRHGGR
210-303PPARISTRPEPRRPVYPAPSRYRSPPRRRFRAPRGMDRHDLYRPRSVSRSRSRTRSPPPPARSPLYSSRSPTPPPRRRGRRDSYDSPRRRRRGS
Subcellular Location(s) nucl 24.5, cyto_nucl 13.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR034201  RNPS1_RRM  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003723  F:RNA binding  
KEGG cim:CIMG_12189  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12365  RRM_RNPS1  
Amino Acid Sequences MPTRRSISRSISPSRSRSPPPRDRSRSVSSGRSRSASPRRSPSPRARSRSRSRSRTPRSRTRSLTPRSRSPSPRRNGRGRGRSLSRTDSRSPYSSRTPSRDRHGGRYRDRSYSRSPSPPRRSTKIVVEKLTKNVNEDHLREIFGAYGDIQSIDLPMNRQFMTNRGTAYICYYDAADAESAIAHMHEGQLDGAVLSVSIVLPRRTFSRSPPPARISTRPEPRRPVYPAPSRYRSPPRRRFRAPRGMDRHDLYRPRSVSRSRSRTRSPPPPARSPLYSSRSPTPPPRRRGRRDSYDSPRRRRRGSSYDSLSNRSRSPSRSRYSRR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.69
2 0.69
3 0.69
4 0.72
5 0.74
6 0.75
7 0.77
8 0.82
9 0.83
10 0.82
11 0.81
12 0.78
13 0.76
14 0.71
15 0.71
16 0.69
17 0.68
18 0.65
19 0.6
20 0.54
21 0.56
22 0.61
23 0.6
24 0.6
25 0.61
26 0.66
27 0.72
28 0.78
29 0.79
30 0.8
31 0.81
32 0.81
33 0.82
34 0.83
35 0.86
36 0.88
37 0.88
38 0.86
39 0.86
40 0.89
41 0.9
42 0.9
43 0.89
44 0.88
45 0.86
46 0.86
47 0.83
48 0.81
49 0.8
50 0.78
51 0.8
52 0.75
53 0.77
54 0.74
55 0.77
56 0.77
57 0.77
58 0.78
59 0.77
60 0.81
61 0.8
62 0.82
63 0.84
64 0.84
65 0.83
66 0.81
67 0.8
68 0.76
69 0.74
70 0.69
71 0.67
72 0.62
73 0.58
74 0.55
75 0.52
76 0.5
77 0.48
78 0.46
79 0.43
80 0.45
81 0.47
82 0.49
83 0.51
84 0.53
85 0.55
86 0.59
87 0.64
88 0.59
89 0.62
90 0.65
91 0.67
92 0.68
93 0.73
94 0.69
95 0.68
96 0.68
97 0.62
98 0.6
99 0.6
100 0.57
101 0.56
102 0.61
103 0.63
104 0.7
105 0.74
106 0.73
107 0.7
108 0.71
109 0.65
110 0.67
111 0.66
112 0.62
113 0.58
114 0.57
115 0.54
116 0.52
117 0.54
118 0.43
119 0.35
120 0.31
121 0.32
122 0.31
123 0.3
124 0.29
125 0.24
126 0.25
127 0.23
128 0.21
129 0.15
130 0.1
131 0.09
132 0.06
133 0.05
134 0.05
135 0.05
136 0.05
137 0.04
138 0.05
139 0.05
140 0.05
141 0.06
142 0.08
143 0.1
144 0.1
145 0.11
146 0.11
147 0.13
148 0.16
149 0.16
150 0.15
151 0.14
152 0.14
153 0.14
154 0.16
155 0.14
156 0.11
157 0.09
158 0.09
159 0.08
160 0.08
161 0.08
162 0.06
163 0.04
164 0.04
165 0.04
166 0.04
167 0.04
168 0.03
169 0.03
170 0.03
171 0.03
172 0.03
173 0.04
174 0.04
175 0.04
176 0.04
177 0.04
178 0.04
179 0.03
180 0.03
181 0.02
182 0.03
183 0.02
184 0.04
185 0.06
186 0.07
187 0.07
188 0.09
189 0.11
190 0.16
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192 0.22
193 0.32
194 0.41
195 0.46
196 0.53
197 0.55
198 0.57
199 0.61
200 0.61
201 0.58
202 0.58
203 0.63
204 0.63
205 0.65
206 0.66
207 0.64
208 0.65
209 0.64
210 0.63
211 0.61
212 0.62
213 0.65
214 0.65
215 0.68
216 0.63
217 0.64
218 0.67
219 0.69
220 0.71
221 0.72
222 0.75
223 0.79
224 0.87
225 0.89
226 0.88
227 0.89
228 0.85
229 0.86
230 0.84
231 0.81
232 0.77
233 0.69
234 0.64
235 0.6
236 0.58
237 0.51
238 0.5
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240 0.44
241 0.49
242 0.5
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245 0.64
246 0.63
247 0.69
248 0.72
249 0.75
250 0.78
251 0.79
252 0.79
253 0.79
254 0.79
255 0.8
256 0.79
257 0.74
258 0.69
259 0.65
260 0.64
261 0.59
262 0.57
263 0.52
264 0.53
265 0.53
266 0.54
267 0.59
268 0.61
269 0.64
270 0.69
271 0.75
272 0.79
273 0.84
274 0.89
275 0.88
276 0.88
277 0.87
278 0.88
279 0.88
280 0.88
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282 0.89
283 0.89
284 0.87
285 0.84
286 0.82
287 0.81
288 0.8
289 0.79
290 0.78
291 0.76
292 0.77
293 0.75
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295 0.68
296 0.61
297 0.55
298 0.52
299 0.49
300 0.46
301 0.52
302 0.56
303 0.61