Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A015JYT4

Protein Details
Accession A0A015JYT4    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1200-1234FNDRNSKDPKDSKNFRDPRDPKNPKDPKDPKNSKDBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
542-578KESKGNASDARGGRGGRGGRGRGSGRNGTRQRGRGGG
Subcellular Location(s) nucl 12.5, cyto_nucl 8, E.R. 6, cyto 2.5, mito 2, pero 2, vacu 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011545  DEAD/DEAH_box_helicase_dom  
IPR014001  Helicase_ATP-bd  
IPR001650  Helicase_C  
IPR027417  P-loop_NTPase  
IPR025696  rRNA_proc-arch_dom  
IPR016438  SKI2-like  
IPR012961  Ski2/MTR4_C  
IPR040801  Ski2_N  
Gene Ontology GO:0005524  F:ATP binding  
GO:0016787  F:hydrolase activity  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0003724  F:RNA helicase activity  
GO:0006401  P:RNA catabolic process  
Pfam View protein in Pfam  
PF00270  DEAD  
PF08148  DSHCT  
PF00271  Helicase_C  
PF13234  rRNA_proc-arch  
PF17911  Ski2_N  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51192  HELICASE_ATP_BIND_1  
PS51194  HELICASE_CTER  
CDD cd18795  SF2_C_Ski2  
Amino Acid Sequences MGGLKSKTIIFSSVLLTRIKQMDDIAVSVSTNDILNEELLVLPVGLGRPLSREEVQRDIEERYLIPRTSFPTSWLFKCQQLLEREPDFISLTVLEPSKPRTTLEIARDGPDGKIIGYKEVVVTDLNLTVKNSTSLLREPGSINHFVRGASSQFPFTPGGLEPEVMVDAEVINDIIDKEIPLSFEDVEILSIPPGFDRGLIFEDEKDRQIRSTNKYVGLNITDMITHDEDELTEFLEPLYETEDVRDNKDIELVKVEKNEETEVTSKDIKDEDSVDNLLPTQPPPLEGSSVASKVSKANSRKQEWAHEVKMDMENFKELVPELAYEFKFELDIFQKQAIYHLENGDSVFVAAHTSAGKTAVAEYAISLASKHMTRTIYTSPIKALSNQKYSDFKTKFDDVGILTGDIQIRPEASCLIMTTEILRSMLYKGADLIRDVEFVIFDEVHYINDSERGVVWEEVIIMLPAHVNLVLLSATVPNTKEFADWIGRTKKKEIYVISTYKRPVPLEHYLYAENELYKIVDAKKVFSDQEWKKAQNALNKEKESKGNASDARGGRGGRGGRGRGSGRNGTRQRGRGGGGGDPRAQQQQNKNLWTNIINLLKKRDLLPVINFTFSKKRCDDFAAALSNLDLCTNSEKSEIHVFIEKSLTRLNESDKSLPQVLRIRELLKRGIAVHHGGLLPIIKEMVEILFGRKLVKVLFATETFAMGINMPARTVVFSEIRKHDGKNFRDLLPGEYTQMSGRAGRRDIDKFGYVIITPKNGEVPNPSLLDEMILGKPTKLESKFRLTYNMILNLLRVEALQVEDMIKRSFSENKSQKMLPMHEKSFAESENRLSTFQKLECSICTRDINDYYDVSADIVRLTSSLYNKLMNSSNSHLVYKALSPGRIVIINNGAYRNVAAGILRQPPKNKTLLASAGSKIVPDDKTYKVFTLLDKDNNMSERESSPLPVTKLSIPNPNSYTHKIDSIPYRDIAFITKSSIKINSDNIDKGDKGEISRISQELLRYADTTQKGRIIEYDWSRISELDFRINLEERDKLMEKLILFQCIMCTEFIEHYKNIHKERLLKRNLDDLKNTISEQNLELYPDFEQRIGVLQKLNYIDEDRILQLKGRVACGINSADELIVTELIFENVLADYEAEEIVALLSCFIFQEKNKSVAPPNLTPRLKKGLKTIYDIACRVDNVQLEFGISPSEDEDFRDFNDRNSKDPKDSKNFRDPRDPKNPKDPKDPKNSKDVDDEIKNIRHKHIKYGLVEVVHEWAKKTEFIKIKELTDVSEGSIVRCITRLDETCREVKSAARIIGDSSLFNKMEEAQQRIKRDIVFAKSLYF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.25
2 0.24
3 0.23
4 0.27
5 0.29
6 0.27
7 0.25
8 0.23
9 0.25
10 0.25
11 0.25
12 0.21
13 0.18
14 0.17
15 0.15
16 0.15
17 0.11
18 0.09
19 0.09
20 0.07
21 0.08
22 0.08
23 0.08
24 0.08
25 0.08
26 0.08
27 0.08
28 0.07
29 0.06
30 0.07
31 0.07
32 0.07
33 0.08
34 0.08
35 0.1
36 0.13
37 0.19
38 0.21
39 0.27
40 0.32
41 0.38
42 0.41
43 0.42
44 0.42
45 0.4
46 0.39
47 0.34
48 0.3
49 0.28
50 0.3
51 0.27
52 0.27
53 0.27
54 0.3
55 0.35
56 0.34
57 0.33
58 0.36
59 0.4
60 0.42
61 0.46
62 0.44
63 0.41
64 0.46
65 0.47
66 0.46
67 0.47
68 0.5
69 0.49
70 0.48
71 0.47
72 0.42
73 0.39
74 0.34
75 0.27
76 0.22
77 0.16
78 0.15
79 0.16
80 0.16
81 0.16
82 0.16
83 0.21
84 0.25
85 0.25
86 0.26
87 0.27
88 0.33
89 0.39
90 0.44
91 0.47
92 0.44
93 0.46
94 0.46
95 0.42
96 0.36
97 0.31
98 0.25
99 0.16
100 0.19
101 0.17
102 0.18
103 0.17
104 0.18
105 0.16
106 0.16
107 0.16
108 0.12
109 0.13
110 0.11
111 0.14
112 0.14
113 0.14
114 0.15
115 0.15
116 0.15
117 0.15
118 0.15
119 0.14
120 0.17
121 0.19
122 0.23
123 0.23
124 0.24
125 0.25
126 0.29
127 0.32
128 0.35
129 0.32
130 0.3
131 0.3
132 0.27
133 0.28
134 0.25
135 0.22
136 0.2
137 0.21
138 0.21
139 0.2
140 0.23
141 0.23
142 0.2
143 0.2
144 0.16
145 0.2
146 0.18
147 0.18
148 0.15
149 0.15
150 0.15
151 0.12
152 0.12
153 0.07
154 0.06
155 0.06
156 0.06
157 0.05
158 0.04
159 0.05
160 0.05
161 0.06
162 0.06
163 0.06
164 0.07
165 0.08
166 0.09
167 0.1
168 0.12
169 0.11
170 0.11
171 0.12
172 0.11
173 0.1
174 0.1
175 0.1
176 0.08
177 0.08
178 0.08
179 0.07
180 0.08
181 0.08
182 0.08
183 0.08
184 0.1
185 0.12
186 0.15
187 0.15
188 0.16
189 0.21
190 0.22
191 0.25
192 0.25
193 0.24
194 0.23
195 0.3
196 0.35
197 0.38
198 0.45
199 0.47
200 0.51
201 0.52
202 0.52
203 0.49
204 0.43
205 0.36
206 0.27
207 0.22
208 0.17
209 0.15
210 0.17
211 0.14
212 0.12
213 0.12
214 0.11
215 0.11
216 0.13
217 0.12
218 0.09
219 0.08
220 0.08
221 0.07
222 0.08
223 0.08
224 0.06
225 0.09
226 0.09
227 0.09
228 0.11
229 0.18
230 0.19
231 0.22
232 0.25
233 0.23
234 0.23
235 0.28
236 0.27
237 0.21
238 0.27
239 0.26
240 0.25
241 0.28
242 0.29
243 0.25
244 0.26
245 0.27
246 0.21
247 0.22
248 0.22
249 0.2
250 0.23
251 0.24
252 0.22
253 0.22
254 0.23
255 0.2
256 0.19
257 0.21
258 0.19
259 0.2
260 0.21
261 0.19
262 0.18
263 0.18
264 0.17
265 0.14
266 0.12
267 0.13
268 0.11
269 0.13
270 0.15
271 0.16
272 0.17
273 0.16
274 0.19
275 0.19
276 0.2
277 0.2
278 0.17
279 0.16
280 0.17
281 0.22
282 0.27
283 0.28
284 0.37
285 0.46
286 0.5
287 0.57
288 0.58
289 0.62
290 0.62
291 0.64
292 0.58
293 0.51
294 0.47
295 0.43
296 0.43
297 0.36
298 0.29
299 0.22
300 0.2
301 0.19
302 0.18
303 0.15
304 0.11
305 0.11
306 0.1
307 0.1
308 0.09
309 0.14
310 0.14
311 0.15
312 0.15
313 0.14
314 0.14
315 0.13
316 0.15
317 0.13
318 0.16
319 0.16
320 0.17
321 0.19
322 0.18
323 0.22
324 0.21
325 0.2
326 0.2
327 0.2
328 0.19
329 0.19
330 0.19
331 0.16
332 0.12
333 0.1
334 0.07
335 0.06
336 0.05
337 0.05
338 0.05
339 0.05
340 0.06
341 0.06
342 0.07
343 0.07
344 0.06
345 0.07
346 0.07
347 0.07
348 0.07
349 0.07
350 0.07
351 0.07
352 0.07
353 0.06
354 0.06
355 0.08
356 0.09
357 0.09
358 0.12
359 0.14
360 0.14
361 0.19
362 0.22
363 0.28
364 0.29
365 0.29
366 0.27
367 0.29
368 0.29
369 0.29
370 0.35
371 0.34
372 0.39
373 0.39
374 0.41
375 0.43
376 0.47
377 0.52
378 0.44
379 0.39
380 0.39
381 0.4
382 0.37
383 0.33
384 0.31
385 0.21
386 0.21
387 0.2
388 0.14
389 0.11
390 0.12
391 0.12
392 0.1
393 0.1
394 0.08
395 0.08
396 0.08
397 0.08
398 0.07
399 0.07
400 0.07
401 0.07
402 0.09
403 0.08
404 0.08
405 0.09
406 0.09
407 0.09
408 0.09
409 0.09
410 0.08
411 0.09
412 0.12
413 0.11
414 0.1
415 0.11
416 0.13
417 0.14
418 0.13
419 0.15
420 0.12
421 0.12
422 0.13
423 0.11
424 0.09
425 0.09
426 0.1
427 0.07
428 0.06
429 0.08
430 0.08
431 0.09
432 0.1
433 0.09
434 0.08
435 0.1
436 0.11
437 0.08
438 0.08
439 0.09
440 0.11
441 0.1
442 0.1
443 0.08
444 0.08
445 0.08
446 0.07
447 0.06
448 0.04
449 0.04
450 0.04
451 0.04
452 0.04
453 0.04
454 0.03
455 0.03
456 0.04
457 0.04
458 0.04
459 0.04
460 0.04
461 0.05
462 0.07
463 0.07
464 0.07
465 0.09
466 0.09
467 0.09
468 0.09
469 0.11
470 0.15
471 0.15
472 0.21
473 0.29
474 0.32
475 0.34
476 0.38
477 0.4
478 0.39
479 0.43
480 0.4
481 0.37
482 0.41
483 0.46
484 0.45
485 0.44
486 0.42
487 0.39
488 0.4
489 0.33
490 0.28
491 0.28
492 0.32
493 0.33
494 0.33
495 0.32
496 0.3
497 0.3
498 0.3
499 0.24
500 0.16
501 0.12
502 0.1
503 0.08
504 0.07
505 0.09
506 0.09
507 0.12
508 0.13
509 0.14
510 0.16
511 0.18
512 0.18
513 0.17
514 0.26
515 0.24
516 0.33
517 0.36
518 0.35
519 0.35
520 0.4
521 0.43
522 0.39
523 0.45
524 0.45
525 0.48
526 0.5
527 0.51
528 0.48
529 0.48
530 0.45
531 0.39
532 0.32
533 0.31
534 0.3
535 0.29
536 0.33
537 0.3
538 0.28
539 0.27
540 0.25
541 0.19
542 0.22
543 0.21
544 0.18
545 0.21
546 0.2
547 0.19
548 0.23
549 0.25
550 0.24
551 0.28
552 0.31
553 0.3
554 0.39
555 0.41
556 0.42
557 0.46
558 0.46
559 0.43
560 0.39
561 0.38
562 0.31
563 0.29
564 0.27
565 0.25
566 0.24
567 0.24
568 0.22
569 0.22
570 0.23
571 0.23
572 0.24
573 0.27
574 0.34
575 0.38
576 0.42
577 0.42
578 0.38
579 0.39
580 0.35
581 0.31
582 0.27
583 0.27
584 0.25
585 0.25
586 0.28
587 0.27
588 0.27
589 0.26
590 0.24
591 0.2
592 0.21
593 0.22
594 0.26
595 0.26
596 0.26
597 0.25
598 0.23
599 0.28
600 0.27
601 0.3
602 0.25
603 0.26
604 0.26
605 0.3
606 0.3
607 0.26
608 0.28
609 0.25
610 0.23
611 0.22
612 0.19
613 0.15
614 0.13
615 0.1
616 0.07
617 0.04
618 0.07
619 0.08
620 0.09
621 0.1
622 0.1
623 0.12
624 0.16
625 0.16
626 0.14
627 0.18
628 0.17
629 0.17
630 0.2
631 0.17
632 0.15
633 0.16
634 0.16
635 0.13
636 0.14
637 0.17
638 0.18
639 0.21
640 0.23
641 0.21
642 0.23
643 0.24
644 0.23
645 0.24
646 0.25
647 0.23
648 0.23
649 0.24
650 0.24
651 0.23
652 0.26
653 0.23
654 0.18
655 0.18
656 0.16
657 0.16
658 0.15
659 0.14
660 0.12
661 0.12
662 0.11
663 0.1
664 0.1
665 0.09
666 0.07
667 0.06
668 0.06
669 0.04
670 0.03
671 0.04
672 0.03
673 0.04
674 0.04
675 0.06
676 0.07
677 0.07
678 0.08
679 0.08
680 0.09
681 0.08
682 0.1
683 0.09
684 0.1
685 0.12
686 0.12
687 0.13
688 0.12
689 0.12
690 0.1
691 0.09
692 0.08
693 0.06
694 0.06
695 0.06
696 0.06
697 0.06
698 0.06
699 0.05
700 0.06
701 0.06
702 0.08
703 0.1
704 0.12
705 0.17
706 0.19
707 0.23
708 0.24
709 0.24
710 0.3
711 0.36
712 0.36
713 0.4
714 0.41
715 0.37
716 0.4
717 0.4
718 0.35
719 0.3
720 0.28
721 0.21
722 0.18
723 0.18
724 0.14
725 0.14
726 0.12
727 0.11
728 0.13
729 0.14
730 0.15
731 0.16
732 0.2
733 0.22
734 0.24
735 0.23
736 0.22
737 0.19
738 0.18
739 0.17
740 0.13
741 0.14
742 0.12
743 0.11
744 0.1
745 0.11
746 0.14
747 0.13
748 0.14
749 0.14
750 0.17
751 0.18
752 0.19
753 0.19
754 0.16
755 0.15
756 0.15
757 0.12
758 0.11
759 0.08
760 0.09
761 0.08
762 0.08
763 0.09
764 0.09
765 0.15
766 0.15
767 0.2
768 0.23
769 0.31
770 0.35
771 0.36
772 0.4
773 0.36
774 0.38
775 0.37
776 0.36
777 0.28
778 0.24
779 0.24
780 0.18
781 0.17
782 0.12
783 0.08
784 0.05
785 0.04
786 0.05
787 0.05
788 0.05
789 0.06
790 0.07
791 0.08
792 0.08
793 0.08
794 0.08
795 0.1
796 0.16
797 0.18
798 0.28
799 0.33
800 0.37
801 0.41
802 0.41
803 0.42
804 0.41
805 0.44
806 0.42
807 0.42
808 0.39
809 0.4
810 0.4
811 0.38
812 0.34
813 0.3
814 0.24
815 0.19
816 0.2
817 0.19
818 0.2
819 0.2
820 0.19
821 0.2
822 0.21
823 0.21
824 0.21
825 0.19
826 0.19
827 0.2
828 0.24
829 0.23
830 0.23
831 0.24
832 0.22
833 0.24
834 0.25
835 0.26
836 0.23
837 0.22
838 0.18
839 0.17
840 0.16
841 0.13
842 0.1
843 0.08
844 0.06
845 0.06
846 0.05
847 0.05
848 0.06
849 0.08
850 0.09
851 0.12
852 0.14
853 0.16
854 0.16
855 0.19
856 0.21
857 0.2
858 0.22
859 0.23
860 0.27
861 0.27
862 0.27
863 0.24
864 0.21
865 0.21
866 0.18
867 0.21
868 0.17
869 0.16
870 0.16
871 0.17
872 0.17
873 0.18
874 0.17
875 0.13
876 0.15
877 0.17
878 0.18
879 0.18
880 0.16
881 0.14
882 0.14
883 0.13
884 0.09
885 0.07
886 0.06
887 0.07
888 0.11
889 0.18
890 0.22
891 0.24
892 0.28
893 0.31
894 0.34
895 0.36
896 0.33
897 0.27
898 0.29
899 0.31
900 0.29
901 0.29
902 0.26
903 0.26
904 0.24
905 0.22
906 0.17
907 0.17
908 0.15
909 0.15
910 0.18
911 0.19
912 0.23
913 0.24
914 0.24
915 0.23
916 0.24
917 0.23
918 0.26
919 0.28
920 0.28
921 0.28
922 0.29
923 0.28
924 0.28
925 0.28
926 0.22
927 0.2
928 0.17
929 0.18
930 0.17
931 0.16
932 0.17
933 0.2
934 0.2
935 0.19
936 0.2
937 0.22
938 0.27
939 0.29
940 0.35
941 0.33
942 0.38
943 0.39
944 0.4
945 0.41
946 0.39
947 0.42
948 0.35
949 0.36
950 0.31
951 0.34
952 0.37
953 0.37
954 0.35
955 0.31
956 0.3
957 0.27
958 0.27
959 0.25
960 0.2
961 0.15
962 0.17
963 0.19
964 0.19
965 0.21
966 0.24
967 0.24
968 0.25
969 0.28
970 0.28
971 0.29
972 0.3
973 0.3
974 0.3
975 0.27
976 0.26
977 0.24
978 0.21
979 0.18
980 0.22
981 0.22
982 0.21
983 0.24
984 0.22
985 0.2
986 0.21
987 0.21
988 0.19
989 0.19
990 0.17
991 0.15
992 0.16
993 0.21
994 0.23
995 0.24
996 0.24
997 0.26
998 0.25
999 0.25
1000 0.25
1001 0.21
1002 0.26
1003 0.27
1004 0.31
1005 0.28
1006 0.29
1007 0.29
1008 0.28
1009 0.27
1010 0.25
1011 0.23
1012 0.23
1013 0.22
1014 0.22
1015 0.25
1016 0.27
1017 0.26
1018 0.22
1019 0.23
1020 0.18
1021 0.24
1022 0.24
1023 0.21
1024 0.22
1025 0.23
1026 0.21
1027 0.27
1028 0.28
1029 0.24
1030 0.23
1031 0.22
1032 0.21
1033 0.19
1034 0.2
1035 0.12
1036 0.11
1037 0.1
1038 0.13
1039 0.17
1040 0.19
1041 0.19
1042 0.21
1043 0.29
1044 0.35
1045 0.37
1046 0.4
1047 0.4
1048 0.47
1049 0.55
1050 0.62
1051 0.61
1052 0.6
1053 0.59
1054 0.63
1055 0.66
1056 0.61
1057 0.55
1058 0.48
1059 0.46
1060 0.42
1061 0.41
1062 0.33
1063 0.27
1064 0.24
1065 0.21
1066 0.21
1067 0.17
1068 0.17
1069 0.16
1070 0.15
1071 0.15
1072 0.17
1073 0.17
1074 0.14
1075 0.13
1076 0.12
1077 0.18
1078 0.18
1079 0.18
1080 0.19
1081 0.18
1082 0.22
1083 0.24
1084 0.25
1085 0.2
1086 0.21
1087 0.2
1088 0.18
1089 0.19
1090 0.17
1091 0.17
1092 0.17
1093 0.17
1094 0.18
1095 0.22
1096 0.23
1097 0.22
1098 0.23
1099 0.22
1100 0.22
1101 0.24
1102 0.23
1103 0.18
1104 0.17
1105 0.16
1106 0.13
1107 0.12
1108 0.12
1109 0.09
1110 0.08
1111 0.07
1112 0.07
1113 0.06
1114 0.07
1115 0.07
1116 0.06
1117 0.06
1118 0.05
1119 0.06
1120 0.05
1121 0.05
1122 0.05
1123 0.06
1124 0.06
1125 0.05
1126 0.05
1127 0.05
1128 0.05
1129 0.05
1130 0.05
1131 0.04
1132 0.04
1133 0.04
1134 0.05
1135 0.06
1136 0.09
1137 0.1
1138 0.2
1139 0.24
1140 0.28
1141 0.3
1142 0.34
1143 0.39
1144 0.42
1145 0.47
1146 0.45
1147 0.49
1148 0.55
1149 0.57
1150 0.56
1151 0.56
1152 0.59
1153 0.57
1154 0.53
1155 0.55
1156 0.54
1157 0.55
1158 0.59
1159 0.61
1160 0.58
1161 0.59
1162 0.57
1163 0.5
1164 0.42
1165 0.38
1166 0.33
1167 0.3
1168 0.25
1169 0.22
1170 0.22
1171 0.2
1172 0.19
1173 0.18
1174 0.17
1175 0.14
1176 0.11
1177 0.09
1178 0.09
1179 0.11
1180 0.09
1181 0.12
1182 0.15
1183 0.15
1184 0.17
1185 0.24
1186 0.23
1187 0.27
1188 0.37
1189 0.36
1190 0.38
1191 0.46
1192 0.49
1193 0.51
1194 0.59
1195 0.64
1196 0.64
1197 0.72
1198 0.75
1199 0.77
1200 0.81
1201 0.77
1202 0.8
1203 0.76
1204 0.75
1205 0.78
1206 0.78
1207 0.74
1208 0.77
1209 0.82
1210 0.77
1211 0.82
1212 0.82
1213 0.8
1214 0.83
1215 0.86
1216 0.78
1217 0.79
1218 0.77
1219 0.69
1220 0.66
1221 0.62
1222 0.59
1223 0.53
1224 0.54
1225 0.5
1226 0.53
1227 0.55
1228 0.5
1229 0.53
1230 0.54
1231 0.51
1232 0.57
1233 0.59
1234 0.6
1235 0.56
1236 0.6
1237 0.57
1238 0.49
1239 0.48
1240 0.38
1241 0.34
1242 0.3
1243 0.28
1244 0.22
1245 0.21
1246 0.22
1247 0.26
1248 0.26
1249 0.3
1250 0.35
1251 0.39
1252 0.46
1253 0.47
1254 0.47
1255 0.49
1256 0.48
1257 0.42
1258 0.37
1259 0.33
1260 0.26
1261 0.26
1262 0.24
1263 0.19
1264 0.23
1265 0.2
1266 0.18
1267 0.18
1268 0.18
1269 0.16
1270 0.24
1271 0.28
1272 0.31
1273 0.38
1274 0.42
1275 0.46
1276 0.47
1277 0.46
1278 0.39
1279 0.38
1280 0.39
1281 0.38
1282 0.37
1283 0.34
1284 0.33
1285 0.33
1286 0.37
1287 0.34
1288 0.27
1289 0.22
1290 0.25
1291 0.24
1292 0.23
1293 0.23
1294 0.2
1295 0.26
1296 0.31
1297 0.36
1298 0.39
1299 0.45
1300 0.5
1301 0.52
1302 0.54
1303 0.48
1304 0.49
1305 0.5
1306 0.47
1307 0.46