Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

A0A0D8JTP0

Protein Details
Accession A0A0D8JTP0    Localization Confidence High Confidence Score 15.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
290-309AGSARRSKRGNKYHHPNSKQHydrophilic
418-449SLESNKKSGHKGPRKSKRKGKSRTNADHKTGTBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
423-440KKSGHKGPRKSKRKGKSR
Subcellular Location(s) nucl 19.5, cyto_nucl 12.5, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR023797  RNA3'_phos_cyclase_dom  
IPR037136  RNA3'_phos_cyclase_dom_sf  
IPR000228  RNA3'_term_phos_cyc  
IPR013792  RNA3'P_cycl/enolpyr_Trfase_a/b  
Gene Ontology GO:0003963  F:RNA-3'-phosphate cyclase activity  
GO:0006396  P:RNA processing  
KEGG cim:CIMG_11683  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF01137  RTC  
Amino Acid Sequences MIHLDGSTLEGGGQLLRNAVALSALTSRPVKITRIRANRQGPGLRPSHAVAIQCLRDVCGGTAVNATVGSSEITFYPRGQLREDGDVASEEEANDGDEGLAAPLEAMIKLESMNDVLPIQSEYNIRLKTPGSAFLIFQALYPYLLYAGACHNARVTERNANLRESSIKLSVTGGTNVSFSLSHDYFSQVLIPNFAKLGLPQLSVNLKHRGWSAGQTNLGSVSFLITPLKLRETREESNEGAASGDNHESMSDSGAFSPIFPRIDLHVLRRGRITQIDITVLAPDMSLDEAGSARRSKRGNKYHHPNSKQSHITDSKDRSQEEDLGLDSDSDGSPEMQQPGKRFAPNSVREFIENYTFEKVSHEFGAKRKGNSSFQPPKIELHWSESTHHRSRIYVLLVAHTSTGFRLGRDALLGSPSSLESNKKSGHKGPRKSKRKGKSRTNADHKTGTDLERMIGDLVDQCVEDLMYELADGSGTRDLKKILGDGFSNRFLDSFMRDQVVVFQALGKLGAGDADMPLNQDEERDLSLHTRTAMWVCEQMLGVKF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.08
2 0.09
3 0.09
4 0.1
5 0.09
6 0.09
7 0.08
8 0.07
9 0.08
10 0.11
11 0.11
12 0.14
13 0.16
14 0.16
15 0.2
16 0.23
17 0.27
18 0.31
19 0.42
20 0.49
21 0.58
22 0.65
23 0.7
24 0.76
25 0.76
26 0.77
27 0.73
28 0.67
29 0.64
30 0.59
31 0.52
32 0.47
33 0.42
34 0.39
35 0.35
36 0.32
37 0.28
38 0.32
39 0.31
40 0.3
41 0.29
42 0.24
43 0.23
44 0.23
45 0.19
46 0.18
47 0.17
48 0.15
49 0.17
50 0.15
51 0.15
52 0.13
53 0.12
54 0.07
55 0.08
56 0.07
57 0.06
58 0.07
59 0.07
60 0.1
61 0.11
62 0.11
63 0.18
64 0.22
65 0.24
66 0.26
67 0.3
68 0.31
69 0.36
70 0.37
71 0.3
72 0.26
73 0.25
74 0.23
75 0.19
76 0.16
77 0.1
78 0.09
79 0.09
80 0.09
81 0.07
82 0.07
83 0.05
84 0.05
85 0.05
86 0.05
87 0.05
88 0.04
89 0.04
90 0.04
91 0.05
92 0.04
93 0.05
94 0.05
95 0.05
96 0.06
97 0.06
98 0.06
99 0.07
100 0.07
101 0.07
102 0.07
103 0.07
104 0.08
105 0.09
106 0.09
107 0.11
108 0.11
109 0.14
110 0.2
111 0.21
112 0.2
113 0.21
114 0.21
115 0.24
116 0.25
117 0.27
118 0.24
119 0.25
120 0.25
121 0.24
122 0.25
123 0.2
124 0.18
125 0.15
126 0.11
127 0.1
128 0.1
129 0.09
130 0.07
131 0.07
132 0.07
133 0.06
134 0.08
135 0.12
136 0.12
137 0.12
138 0.12
139 0.13
140 0.15
141 0.18
142 0.2
143 0.24
144 0.27
145 0.35
146 0.36
147 0.37
148 0.36
149 0.34
150 0.33
151 0.28
152 0.28
153 0.22
154 0.2
155 0.18
156 0.18
157 0.19
158 0.17
159 0.16
160 0.13
161 0.12
162 0.12
163 0.11
164 0.11
165 0.09
166 0.08
167 0.13
168 0.13
169 0.13
170 0.13
171 0.15
172 0.15
173 0.15
174 0.17
175 0.14
176 0.14
177 0.16
178 0.16
179 0.14
180 0.14
181 0.14
182 0.11
183 0.08
184 0.13
185 0.11
186 0.12
187 0.12
188 0.14
189 0.17
190 0.19
191 0.23
192 0.24
193 0.22
194 0.23
195 0.24
196 0.23
197 0.21
198 0.24
199 0.24
200 0.22
201 0.24
202 0.22
203 0.21
204 0.2
205 0.19
206 0.13
207 0.1
208 0.07
209 0.05
210 0.06
211 0.06
212 0.06
213 0.07
214 0.08
215 0.12
216 0.13
217 0.15
218 0.21
219 0.28
220 0.3
221 0.33
222 0.35
223 0.32
224 0.32
225 0.3
226 0.24
227 0.17
228 0.14
229 0.11
230 0.09
231 0.09
232 0.07
233 0.07
234 0.06
235 0.07
236 0.07
237 0.07
238 0.06
239 0.06
240 0.06
241 0.07
242 0.07
243 0.06
244 0.07
245 0.08
246 0.08
247 0.08
248 0.09
249 0.1
250 0.15
251 0.16
252 0.18
253 0.23
254 0.23
255 0.24
256 0.25
257 0.24
258 0.21
259 0.21
260 0.21
261 0.15
262 0.15
263 0.15
264 0.14
265 0.14
266 0.12
267 0.1
268 0.08
269 0.05
270 0.04
271 0.04
272 0.04
273 0.03
274 0.03
275 0.03
276 0.04
277 0.04
278 0.06
279 0.08
280 0.08
281 0.14
282 0.17
283 0.24
284 0.34
285 0.43
286 0.51
287 0.59
288 0.69
289 0.75
290 0.82
291 0.79
292 0.77
293 0.72
294 0.7
295 0.64
296 0.55
297 0.52
298 0.47
299 0.45
300 0.45
301 0.46
302 0.45
303 0.44
304 0.43
305 0.38
306 0.36
307 0.35
308 0.28
309 0.25
310 0.18
311 0.15
312 0.15
313 0.12
314 0.09
315 0.07
316 0.06
317 0.06
318 0.06
319 0.05
320 0.06
321 0.08
322 0.11
323 0.13
324 0.15
325 0.17
326 0.23
327 0.26
328 0.27
329 0.26
330 0.31
331 0.38
332 0.42
333 0.45
334 0.41
335 0.39
336 0.37
337 0.39
338 0.33
339 0.28
340 0.22
341 0.2
342 0.2
343 0.2
344 0.19
345 0.2
346 0.2
347 0.17
348 0.18
349 0.19
350 0.18
351 0.22
352 0.32
353 0.33
354 0.34
355 0.36
356 0.39
357 0.41
358 0.43
359 0.49
360 0.49
361 0.5
362 0.55
363 0.51
364 0.48
365 0.46
366 0.47
367 0.38
368 0.35
369 0.35
370 0.31
371 0.33
372 0.38
373 0.43
374 0.42
375 0.44
376 0.38
377 0.34
378 0.36
379 0.38
380 0.33
381 0.29
382 0.24
383 0.24
384 0.23
385 0.23
386 0.2
387 0.14
388 0.12
389 0.09
390 0.14
391 0.11
392 0.11
393 0.13
394 0.13
395 0.14
396 0.14
397 0.15
398 0.1
399 0.12
400 0.12
401 0.1
402 0.09
403 0.1
404 0.1
405 0.11
406 0.14
407 0.15
408 0.21
409 0.26
410 0.29
411 0.34
412 0.41
413 0.51
414 0.58
415 0.65
416 0.71
417 0.77
418 0.83
419 0.88
420 0.9
421 0.89
422 0.9
423 0.9
424 0.9
425 0.9
426 0.91
427 0.91
428 0.92
429 0.9
430 0.84
431 0.8
432 0.69
433 0.65
434 0.57
435 0.48
436 0.41
437 0.33
438 0.28
439 0.23
440 0.22
441 0.16
442 0.13
443 0.11
444 0.09
445 0.09
446 0.09
447 0.09
448 0.08
449 0.08
450 0.08
451 0.07
452 0.06
453 0.06
454 0.05
455 0.05
456 0.05
457 0.05
458 0.05
459 0.05
460 0.06
461 0.11
462 0.12
463 0.14
464 0.16
465 0.17
466 0.18
467 0.2
468 0.21
469 0.19
470 0.21
471 0.22
472 0.26
473 0.3
474 0.32
475 0.32
476 0.29
477 0.26
478 0.24
479 0.24
480 0.23
481 0.22
482 0.21
483 0.22
484 0.22
485 0.22
486 0.26
487 0.26
488 0.21
489 0.18
490 0.16
491 0.15
492 0.15
493 0.16
494 0.11
495 0.08
496 0.07
497 0.07
498 0.06
499 0.06
500 0.06
501 0.07
502 0.07
503 0.09
504 0.09
505 0.1
506 0.1
507 0.1
508 0.11
509 0.12
510 0.14
511 0.13
512 0.14
513 0.16
514 0.18
515 0.19
516 0.19
517 0.18
518 0.19
519 0.2
520 0.21
521 0.21
522 0.23
523 0.22
524 0.23
525 0.22