Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A010RS27

Protein Details
Accession A0A010RS27    Localization Confidence Medium Confidence Score 10
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
340-361GPRHKHLVRKGLKPDQRRKMGWBasic
400-419AVVAVKRYRNRKYTRLQAEDHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
339-357TGPRHKHLVRKGLKPDQRR
Subcellular Location(s) plas 18, E.R. 2, golg 2, mito 1, cyto 1, extr 1, pero 1, vacu 1, cyto_mito 1, cyto_pero 1
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009291  Vps62  
Gene Ontology GO:0016020  C:membrane  
KEGG cfj:CFIO01_01205  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF06101  Vps62  
Amino Acid Sequences MAAFAPAFKQAISPQRCCLLIGFLICSTIAGPAIGADLRCPDYVIQHAPLIWLHSEDPYMPSDLLTHIQHTSPALDGKPIPDISTLDLDNLETLNNFGDEVALTSNDDPLSYPEWIHGETPDADGRINNATPCVVVLVEKGERDLDAFYFYFYSFNEGMNISQVLEPFNRMVKGEKAQSGMHFGDHVGDWEHNMIRFRDGKPTGIYYSQHVDGASFSWDNSALTKTDGRPIVYSARGSHANYPTRGNQIHNSVLVDYCDEGRRWDPILSAYFYHFDQESFTVTRLDPPAKSSPTPPPSSNLTSFFYYSGRWGDIAYPASDPRQEIVPKFGLKRIESGPTGPRHKHLVRKGLKPDQRRKMGWMEWGVGIYMFLYPCCLRGWRRWVFMGLIITVLSVAVIGAVVAVKRYRNRKYTRLQAEDIPLDDWALEDEALLSSSDEEDVDKPSKFTKRH
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.39
2 0.42
3 0.43
4 0.42
5 0.37
6 0.31
7 0.27
8 0.25
9 0.24
10 0.2
11 0.2
12 0.19
13 0.17
14 0.13
15 0.11
16 0.09
17 0.06
18 0.06
19 0.06
20 0.07
21 0.08
22 0.08
23 0.08
24 0.11
25 0.14
26 0.14
27 0.15
28 0.14
29 0.16
30 0.21
31 0.25
32 0.24
33 0.22
34 0.22
35 0.23
36 0.23
37 0.22
38 0.18
39 0.15
40 0.14
41 0.14
42 0.15
43 0.14
44 0.15
45 0.15
46 0.16
47 0.14
48 0.13
49 0.13
50 0.14
51 0.17
52 0.16
53 0.17
54 0.16
55 0.16
56 0.18
57 0.18
58 0.17
59 0.15
60 0.17
61 0.15
62 0.16
63 0.17
64 0.17
65 0.21
66 0.2
67 0.2
68 0.18
69 0.19
70 0.18
71 0.21
72 0.2
73 0.15
74 0.15
75 0.14
76 0.13
77 0.12
78 0.1
79 0.06
80 0.07
81 0.06
82 0.06
83 0.06
84 0.05
85 0.06
86 0.05
87 0.06
88 0.07
89 0.06
90 0.07
91 0.08
92 0.1
93 0.09
94 0.09
95 0.09
96 0.1
97 0.13
98 0.13
99 0.13
100 0.13
101 0.15
102 0.16
103 0.16
104 0.13
105 0.13
106 0.14
107 0.16
108 0.16
109 0.14
110 0.14
111 0.13
112 0.15
113 0.15
114 0.15
115 0.13
116 0.12
117 0.12
118 0.11
119 0.11
120 0.1
121 0.07
122 0.06
123 0.06
124 0.09
125 0.1
126 0.1
127 0.11
128 0.1
129 0.1
130 0.11
131 0.11
132 0.08
133 0.1
134 0.1
135 0.1
136 0.1
137 0.1
138 0.1
139 0.09
140 0.14
141 0.12
142 0.12
143 0.13
144 0.12
145 0.12
146 0.13
147 0.13
148 0.09
149 0.09
150 0.09
151 0.1
152 0.1
153 0.11
154 0.1
155 0.12
156 0.11
157 0.11
158 0.13
159 0.15
160 0.19
161 0.22
162 0.23
163 0.24
164 0.24
165 0.24
166 0.27
167 0.23
168 0.2
169 0.16
170 0.14
171 0.12
172 0.11
173 0.11
174 0.07
175 0.07
176 0.07
177 0.08
178 0.09
179 0.09
180 0.11
181 0.11
182 0.13
183 0.17
184 0.18
185 0.25
186 0.25
187 0.26
188 0.26
189 0.28
190 0.26
191 0.25
192 0.25
193 0.18
194 0.2
195 0.19
196 0.18
197 0.15
198 0.13
199 0.11
200 0.11
201 0.1
202 0.07
203 0.07
204 0.06
205 0.07
206 0.07
207 0.07
208 0.08
209 0.06
210 0.08
211 0.1
212 0.1
213 0.15
214 0.16
215 0.16
216 0.16
217 0.17
218 0.19
219 0.18
220 0.19
221 0.15
222 0.16
223 0.18
224 0.18
225 0.22
226 0.25
227 0.27
228 0.28
229 0.3
230 0.29
231 0.32
232 0.32
233 0.29
234 0.26
235 0.26
236 0.26
237 0.24
238 0.22
239 0.18
240 0.17
241 0.15
242 0.12
243 0.08
244 0.08
245 0.09
246 0.09
247 0.1
248 0.11
249 0.12
250 0.13
251 0.14
252 0.13
253 0.14
254 0.17
255 0.16
256 0.16
257 0.16
258 0.15
259 0.15
260 0.15
261 0.12
262 0.1
263 0.1
264 0.1
265 0.12
266 0.11
267 0.12
268 0.13
269 0.12
270 0.16
271 0.17
272 0.19
273 0.16
274 0.2
275 0.26
276 0.27
277 0.28
278 0.28
279 0.35
280 0.39
281 0.43
282 0.39
283 0.37
284 0.39
285 0.43
286 0.42
287 0.36
288 0.33
289 0.3
290 0.3
291 0.28
292 0.23
293 0.18
294 0.18
295 0.16
296 0.13
297 0.12
298 0.12
299 0.12
300 0.15
301 0.16
302 0.15
303 0.14
304 0.14
305 0.16
306 0.16
307 0.16
308 0.13
309 0.17
310 0.19
311 0.19
312 0.23
313 0.27
314 0.29
315 0.31
316 0.33
317 0.33
318 0.31
319 0.34
320 0.32
321 0.32
322 0.29
323 0.31
324 0.34
325 0.37
326 0.42
327 0.4
328 0.4
329 0.43
330 0.47
331 0.53
332 0.54
333 0.57
334 0.58
335 0.66
336 0.72
337 0.74
338 0.76
339 0.78
340 0.8
341 0.8
342 0.81
343 0.74
344 0.7
345 0.68
346 0.64
347 0.61
348 0.54
349 0.47
350 0.39
351 0.37
352 0.32
353 0.23
354 0.19
355 0.12
356 0.1
357 0.07
358 0.06
359 0.09
360 0.09
361 0.1
362 0.12
363 0.17
364 0.19
365 0.27
366 0.38
367 0.42
368 0.46
369 0.47
370 0.48
371 0.46
372 0.46
373 0.4
374 0.3
375 0.23
376 0.18
377 0.16
378 0.13
379 0.11
380 0.06
381 0.04
382 0.03
383 0.02
384 0.02
385 0.02
386 0.02
387 0.03
388 0.04
389 0.06
390 0.08
391 0.13
392 0.2
393 0.29
394 0.38
395 0.47
396 0.55
397 0.63
398 0.71
399 0.78
400 0.81
401 0.8
402 0.75
403 0.71
404 0.71
405 0.64
406 0.56
407 0.45
408 0.35
409 0.27
410 0.23
411 0.17
412 0.11
413 0.09
414 0.08
415 0.07
416 0.08
417 0.08
418 0.09
419 0.09
420 0.07
421 0.07
422 0.08
423 0.08
424 0.08
425 0.09
426 0.1
427 0.15
428 0.18
429 0.18
430 0.19
431 0.26