Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A010RCQ6

Protein Details
Accession A0A010RCQ6    Localization Confidence High Confidence Score 25.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
2-42ATPTKPPAKGSGKKQQPKVLKRDSRLEKRKQQQQTIEQLEKHydrophilic
525-544AAGPKKPKKPEVRTKYDRMFBasic
627-652VDSKRREKALQSKKKMLKFKGRGEKLBasic
699-727DDKLAAKGRLKEKRLKRKQREAEERGEGIBasic
768-809YSGSEDERPKKKTKKWFQDDSDEEREKKKKAKKGGKVLEIDHBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
7-31PPAKGSGKKQQPKVLKRDSRLEKRK
502-505KKVK
529-533KKPKK
630-649KRREKALQSKKKMLKFKGRG
704-722AKGRLKEKRLKRKQREAEE
776-782PKKKTKK
791-803EREKKKKAKKGGK
Subcellular Location(s) nucl 23, cyto 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011545  DEAD/DEAH_box_helicase_dom  
IPR025313  DUF4217  
IPR014001  Helicase_ATP-bd  
IPR001650  Helicase_C  
IPR027417  P-loop_NTPase  
IPR000629  RNA-helicase_DEAD-box_CS  
IPR014014  RNA_helicase_DEAD_Q_motif  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0005524  F:ATP binding  
GO:0016887  F:ATP hydrolysis activity  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0003724  F:RNA helicase activity  
GO:0006364  P:rRNA processing  
KEGG cfj:CFIO01_00112  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00270  DEAD  
PF13959  DUF4217  
PF00271  Helicase_C  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00039  DEAD_ATP_HELICASE  
PS51192  HELICASE_ATP_BIND_1  
PS51194  HELICASE_CTER  
PS51195  Q_MOTIF  
CDD cd17941  DEADc_DDX10  
cd18787  SF2_C_DEAD  
Amino Acid Sequences MATPTKPPAKGSGKKQQPKVLKRDSRLEKRKQQQQTIEQLEKAVADFDPKSEYTSFSELPLCETTRKGLEKSHFETLTDIQSRAVPLALKGSDILGAAKTGSGKTLAFIIPVLEKLYRAQWTEFDGLGALIISPTRELAAQIFEVLRKVGRYHNFSAGLVIGGKSLKEEAERLSKMNILVCTPGRMLQHLDQTAGFDVDNLQILVLDEADRIMDMGFQHAVDALVDHLPSTRQTLLFSATQSKKISDLARLSLKDPEYVSVHEESTPKNLQQHYIVTPLHEKLDTLFGFIKANLKSKIIVFFSSGKQVRFAYEGMRHLQPGVPLLHLLGKQKQLQRMEITKRFADANASVLFATDVVARGVDFPAVDWVVQVDCPEDVDTYIHRVGRTARYERDGKAVLFLEPSEEAGMLKRLELKKVPINKITVKESKKKSIKDQLQSMCFSNPDLKYLGQKAFISYVRSIYLQKDKEVFKFNKLDLDAYAASLGLPGAPQIKMRKGEDIKKVKNAPRKGMSSDEDEEDSDDAAAGPKKPKKPEVRTKYDRMFERTNQDVLSGHYTKLVANGDEATGDATDPTAAAAGTTGADGDGEEDFLSVKRVLGDDELDAESNLAPGAKPKVISYGGQDFIVDSKRREKALQSKKKMLKFKGRGEKLVFDEDGNAHQIYELQNEDDFEKEGPAEELRQKFVEGEAARVKEADVDDKLAAKGRLKEKRLKRKQREAEERGEGIPKSAEGPQVAGGGGGADDGEDEDPLALLRSLPIAGEGGGEYSGSEDERPKKKTKKWFQDDSDEEREKKKKAKKGGKVLEIDHEPETLEDLEALASGLLN
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.76
2 0.83
3 0.82
4 0.83
5 0.84
6 0.85
7 0.85
8 0.84
9 0.82
10 0.84
11 0.85
12 0.86
13 0.86
14 0.87
15 0.86
16 0.87
17 0.9
18 0.89
19 0.88
20 0.87
21 0.86
22 0.86
23 0.85
24 0.79
25 0.7
26 0.61
27 0.52
28 0.42
29 0.33
30 0.23
31 0.14
32 0.14
33 0.14
34 0.14
35 0.18
36 0.18
37 0.21
38 0.2
39 0.23
40 0.24
41 0.29
42 0.28
43 0.26
44 0.3
45 0.26
46 0.3
47 0.31
48 0.28
49 0.25
50 0.25
51 0.27
52 0.3
53 0.34
54 0.32
55 0.36
56 0.41
57 0.48
58 0.52
59 0.57
60 0.5
61 0.47
62 0.48
63 0.43
64 0.44
65 0.38
66 0.33
67 0.25
68 0.26
69 0.26
70 0.23
71 0.22
72 0.14
73 0.12
74 0.18
75 0.17
76 0.16
77 0.15
78 0.15
79 0.15
80 0.14
81 0.14
82 0.09
83 0.09
84 0.08
85 0.09
86 0.1
87 0.09
88 0.1
89 0.1
90 0.1
91 0.1
92 0.14
93 0.13
94 0.12
95 0.12
96 0.13
97 0.12
98 0.13
99 0.15
100 0.11
101 0.12
102 0.13
103 0.18
104 0.2
105 0.22
106 0.22
107 0.22
108 0.27
109 0.29
110 0.28
111 0.23
112 0.19
113 0.16
114 0.15
115 0.13
116 0.07
117 0.04
118 0.05
119 0.05
120 0.05
121 0.05
122 0.05
123 0.06
124 0.07
125 0.08
126 0.1
127 0.1
128 0.12
129 0.12
130 0.12
131 0.13
132 0.13
133 0.13
134 0.12
135 0.13
136 0.2
137 0.26
138 0.32
139 0.36
140 0.42
141 0.43
142 0.41
143 0.41
144 0.33
145 0.27
146 0.21
147 0.17
148 0.11
149 0.09
150 0.09
151 0.08
152 0.09
153 0.09
154 0.09
155 0.11
156 0.14
157 0.22
158 0.23
159 0.24
160 0.25
161 0.26
162 0.26
163 0.28
164 0.25
165 0.18
166 0.2
167 0.2
168 0.21
169 0.19
170 0.22
171 0.19
172 0.19
173 0.23
174 0.23
175 0.3
176 0.28
177 0.28
178 0.25
179 0.25
180 0.24
181 0.2
182 0.16
183 0.09
184 0.09
185 0.09
186 0.09
187 0.08
188 0.07
189 0.06
190 0.07
191 0.07
192 0.06
193 0.06
194 0.05
195 0.05
196 0.05
197 0.04
198 0.04
199 0.04
200 0.05
201 0.05
202 0.07
203 0.07
204 0.07
205 0.07
206 0.08
207 0.08
208 0.06
209 0.06
210 0.06
211 0.06
212 0.06
213 0.06
214 0.06
215 0.07
216 0.08
217 0.11
218 0.12
219 0.11
220 0.13
221 0.14
222 0.17
223 0.17
224 0.18
225 0.24
226 0.24
227 0.29
228 0.29
229 0.28
230 0.26
231 0.29
232 0.3
233 0.27
234 0.28
235 0.28
236 0.33
237 0.33
238 0.33
239 0.34
240 0.32
241 0.28
242 0.26
243 0.24
244 0.2
245 0.2
246 0.21
247 0.17
248 0.17
249 0.18
250 0.19
251 0.17
252 0.21
253 0.22
254 0.21
255 0.24
256 0.25
257 0.24
258 0.26
259 0.28
260 0.25
261 0.28
262 0.27
263 0.23
264 0.25
265 0.24
266 0.23
267 0.19
268 0.17
269 0.12
270 0.19
271 0.17
272 0.17
273 0.17
274 0.16
275 0.17
276 0.17
277 0.21
278 0.16
279 0.21
280 0.2
281 0.2
282 0.2
283 0.21
284 0.25
285 0.21
286 0.2
287 0.18
288 0.2
289 0.21
290 0.28
291 0.29
292 0.24
293 0.25
294 0.25
295 0.23
296 0.22
297 0.21
298 0.17
299 0.19
300 0.22
301 0.23
302 0.23
303 0.22
304 0.2
305 0.21
306 0.17
307 0.16
308 0.14
309 0.11
310 0.1
311 0.11
312 0.13
313 0.14
314 0.16
315 0.16
316 0.19
317 0.24
318 0.28
319 0.34
320 0.33
321 0.34
322 0.37
323 0.41
324 0.46
325 0.46
326 0.46
327 0.4
328 0.39
329 0.36
330 0.31
331 0.27
332 0.19
333 0.16
334 0.13
335 0.14
336 0.12
337 0.11
338 0.11
339 0.08
340 0.08
341 0.05
342 0.05
343 0.04
344 0.05
345 0.04
346 0.05
347 0.05
348 0.05
349 0.05
350 0.04
351 0.06
352 0.06
353 0.06
354 0.05
355 0.05
356 0.05
357 0.06
358 0.06
359 0.05
360 0.04
361 0.05
362 0.06
363 0.05
364 0.05
365 0.06
366 0.06
367 0.09
368 0.11
369 0.12
370 0.11
371 0.12
372 0.15
373 0.21
374 0.26
375 0.26
376 0.26
377 0.3
378 0.33
379 0.33
380 0.34
381 0.3
382 0.24
383 0.23
384 0.21
385 0.17
386 0.15
387 0.14
388 0.1
389 0.09
390 0.09
391 0.06
392 0.05
393 0.05
394 0.05
395 0.07
396 0.06
397 0.06
398 0.12
399 0.12
400 0.15
401 0.16
402 0.19
403 0.23
404 0.31
405 0.35
406 0.33
407 0.36
408 0.38
409 0.4
410 0.42
411 0.44
412 0.41
413 0.46
414 0.47
415 0.53
416 0.55
417 0.55
418 0.58
419 0.6
420 0.63
421 0.61
422 0.65
423 0.61
424 0.58
425 0.56
426 0.49
427 0.39
428 0.31
429 0.26
430 0.23
431 0.18
432 0.16
433 0.16
434 0.15
435 0.17
436 0.21
437 0.21
438 0.18
439 0.18
440 0.17
441 0.19
442 0.2
443 0.2
444 0.17
445 0.17
446 0.15
447 0.16
448 0.17
449 0.17
450 0.23
451 0.21
452 0.23
453 0.26
454 0.28
455 0.3
456 0.38
457 0.35
458 0.33
459 0.37
460 0.35
461 0.35
462 0.34
463 0.31
464 0.22
465 0.25
466 0.19
467 0.15
468 0.15
469 0.1
470 0.09
471 0.08
472 0.07
473 0.03
474 0.03
475 0.03
476 0.05
477 0.05
478 0.08
479 0.11
480 0.16
481 0.2
482 0.21
483 0.29
484 0.33
485 0.4
486 0.47
487 0.55
488 0.54
489 0.58
490 0.64
491 0.62
492 0.66
493 0.64
494 0.62
495 0.58
496 0.57
497 0.53
498 0.51
499 0.47
500 0.44
501 0.4
502 0.34
503 0.29
504 0.25
505 0.23
506 0.18
507 0.15
508 0.09
509 0.07
510 0.06
511 0.07
512 0.08
513 0.1
514 0.16
515 0.22
516 0.27
517 0.32
518 0.41
519 0.49
520 0.58
521 0.68
522 0.71
523 0.76
524 0.78
525 0.81
526 0.8
527 0.76
528 0.7
529 0.65
530 0.61
531 0.54
532 0.53
533 0.49
534 0.43
535 0.36
536 0.32
537 0.27
538 0.23
539 0.26
540 0.21
541 0.17
542 0.17
543 0.18
544 0.17
545 0.2
546 0.19
547 0.12
548 0.12
549 0.12
550 0.11
551 0.1
552 0.1
553 0.08
554 0.06
555 0.06
556 0.05
557 0.04
558 0.04
559 0.04
560 0.04
561 0.03
562 0.03
563 0.03
564 0.03
565 0.03
566 0.04
567 0.04
568 0.04
569 0.03
570 0.03
571 0.03
572 0.04
573 0.04
574 0.04
575 0.04
576 0.04
577 0.05
578 0.05
579 0.08
580 0.07
581 0.07
582 0.08
583 0.08
584 0.09
585 0.1
586 0.11
587 0.09
588 0.12
589 0.12
590 0.11
591 0.11
592 0.1
593 0.09
594 0.08
595 0.08
596 0.05
597 0.04
598 0.07
599 0.11
600 0.12
601 0.12
602 0.13
603 0.18
604 0.19
605 0.21
606 0.23
607 0.26
608 0.25
609 0.25
610 0.24
611 0.19
612 0.2
613 0.25
614 0.22
615 0.18
616 0.25
617 0.28
618 0.31
619 0.32
620 0.38
621 0.43
622 0.52
623 0.61
624 0.62
625 0.69
626 0.74
627 0.8
628 0.81
629 0.79
630 0.79
631 0.77
632 0.8
633 0.8
634 0.77
635 0.76
636 0.72
637 0.69
638 0.61
639 0.57
640 0.47
641 0.36
642 0.34
643 0.28
644 0.25
645 0.22
646 0.18
647 0.13
648 0.12
649 0.14
650 0.13
651 0.14
652 0.14
653 0.12
654 0.13
655 0.14
656 0.15
657 0.14
658 0.14
659 0.11
660 0.11
661 0.1
662 0.1
663 0.11
664 0.11
665 0.15
666 0.21
667 0.23
668 0.25
669 0.26
670 0.25
671 0.24
672 0.24
673 0.27
674 0.21
675 0.24
676 0.27
677 0.28
678 0.27
679 0.27
680 0.26
681 0.22
682 0.22
683 0.21
684 0.16
685 0.18
686 0.19
687 0.2
688 0.21
689 0.22
690 0.23
691 0.23
692 0.3
693 0.36
694 0.45
695 0.49
696 0.58
697 0.65
698 0.74
699 0.81
700 0.85
701 0.86
702 0.88
703 0.93
704 0.94
705 0.94
706 0.9
707 0.87
708 0.83
709 0.74
710 0.65
711 0.59
712 0.48
713 0.38
714 0.32
715 0.23
716 0.19
717 0.19
718 0.2
719 0.16
720 0.18
721 0.18
722 0.18
723 0.17
724 0.14
725 0.11
726 0.08
727 0.08
728 0.06
729 0.04
730 0.03
731 0.03
732 0.04
733 0.05
734 0.05
735 0.05
736 0.05
737 0.05
738 0.06
739 0.07
740 0.06
741 0.06
742 0.06
743 0.07
744 0.07
745 0.07
746 0.08
747 0.07
748 0.07
749 0.08
750 0.08
751 0.07
752 0.07
753 0.07
754 0.06
755 0.07
756 0.08
757 0.08
758 0.09
759 0.15
760 0.25
761 0.33
762 0.39
763 0.47
764 0.57
765 0.65
766 0.74
767 0.79
768 0.81
769 0.84
770 0.88
771 0.86
772 0.87
773 0.85
774 0.83
775 0.81
776 0.76
777 0.68
778 0.66
779 0.65
780 0.6
781 0.63
782 0.63
783 0.63
784 0.68
785 0.76
786 0.79
787 0.84
788 0.88
789 0.87
790 0.84
791 0.78
792 0.75
793 0.68
794 0.61
795 0.5
796 0.4
797 0.31
798 0.25
799 0.25
800 0.18
801 0.14
802 0.11
803 0.1
804 0.09
805 0.09
806 0.09