FuNGI

A0A010RTN4

Protein Details

Accession

A0A010RTN4

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

14.5

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
128-147	VTANRREERRQMKWERAKTE	Hydrophilic
464-486	EIPSTPKSAKRRKSVRFSPKVES	Hydrophilic
666-686	HQWWKDSDRKIPRKTWHWLHG	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
473-475	KRR

Subcellular Location(s)

mito 20, nucl 4, cyto 3

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR011856 tRNA_endonuc-like_dom_sf IPR036167 tRNA_intron_Endo_cat-like_sf IPR006677 tRNA_intron_Endonuc_cat-like IPR006676 tRNA_splic
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003676 F:nucleic acid binding GO:0000213 F:tRNA-intron endonuclease activity GO:0006388 P:tRNA splicing, via endonucleolytic cleavage and ligation
KEGG	cfj:CFIO01_01056 -
Pfam	View protein in Pfam PF01974 tRNA_int_endo
CDD	cd22363 tRNA-intron_lyase_C

Amino Acid Sequences

MPAQSFSKSPTTSRPRGPPLHKIYELPAPIRTFPLPSFYPNNPISLFHVLFAWTKQALFPPPAEPSIVHEGIWSPESKSVNIIDEKSMRALWEQGFYGKGNLSRSEPNWLKREHVRRGLVPGQVSELVTANRREERRQMKWERAKTEQEAIRQLRIQEAQLATQVSGDGVVNSAALVAEAAAILDAANNDDPEREASTDADNLLEPLVSHKSALVATSKHLQANGVDTITVAPVAEPEAVSQISTETSIFQEASTPIEPAKIVKPSDFLHSVQDPEVVVESEKALTVDQMPLAPVPVAWSAPVGPLELLCLPNSHILSATADSTEIEKLNGGARQVNGLHEPRVPKGVGLDSFELQAEEPFVNGISAIFQIASPVGPLELLSLPNAEPVTNGTMNGDHATVPNVNDSPVVDTTPSETLKLSTIHEDVGLNGHLINDLITNTNGDKMLHQNGLNGVAKSAVSSTEIPSTPKSAKRRKSVRFSPKVESATYQLSDPPSPSLALFNGNNGKATPPVNGTPLGPSVLETDTEEATKLEDVKKLEKLSEILAEPVEVVNKEHLQLTSEEAFFLVFGMGALRVLDPATKTPIPTPELFNLFRQYSYFPRRPTEELQPDDGFLVNYAVYHHFRSLGWVPRAGIKFGVDWMLYAKGPVFDHAEFGAILLPSYSHQWWKDSDRKIPRKTWHWLHGIVRVLSHVQKSLVLVYVDIPPPPQLEEAMKKGPAEVFKLYKIREVMVKRWSSNRNR

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.64
2	0.66
3	0.74
4	0.78
5	0.78
6	0.77
7	0.79
8	0.73
9	0.65
10	0.6
11	0.58
12	0.55
13	0.47
14	0.43
15	0.37
16	0.36
17	0.38
18	0.35
19	0.31
20	0.28
21	0.32
22	0.28
23	0.3
24	0.36
25	0.34
26	0.41
27	0.38
28	0.41
29	0.35
30	0.35
31	0.35
32	0.36
33	0.34
34	0.26
35	0.26
36	0.24
37	0.25
38	0.24
39	0.22
40	0.16
41	0.15
42	0.16
43	0.2
44	0.23
45	0.24
46	0.25
47	0.25
48	0.28
49	0.28
50	0.29
51	0.24
52	0.26
53	0.31
54	0.3
55	0.26
56	0.23
57	0.23
58	0.24
59	0.25
60	0.2
61	0.14
62	0.18
63	0.2
64	0.2
65	0.22
66	0.21
67	0.25
68	0.28
69	0.28
70	0.28
71	0.29
72	0.3
73	0.29
74	0.28
75	0.23
76	0.2
77	0.23
78	0.2
79	0.21
80	0.2
81	0.2
82	0.21
83	0.21
84	0.22
85	0.2
86	0.21
87	0.21
88	0.22
89	0.25
90	0.28
91	0.29
92	0.37
93	0.41
94	0.44
95	0.48
96	0.47
97	0.49
98	0.53
99	0.61
100	0.6
101	0.63
102	0.62
103	0.58
104	0.65
105	0.65
106	0.59
107	0.51
108	0.42
109	0.36
110	0.32
111	0.29
112	0.22
113	0.18
114	0.16
115	0.18
116	0.2
117	0.2
118	0.25
119	0.28
120	0.31
121	0.39
122	0.46
123	0.51
124	0.6
125	0.64
126	0.68
127	0.76
128	0.8
129	0.77
130	0.74
131	0.73
132	0.66
133	0.67
134	0.6
135	0.55
136	0.56
137	0.53
138	0.5
139	0.45
140	0.41
141	0.38
142	0.35
143	0.31
144	0.28
145	0.26
146	0.23
147	0.23
148	0.23
149	0.18
150	0.16
151	0.15
152	0.09
153	0.09
154	0.08
155	0.06
156	0.05
157	0.05
158	0.05
159	0.05
160	0.05
161	0.04
162	0.03
163	0.03
164	0.03
165	0.03
166	0.03
167	0.03
168	0.02
169	0.03
170	0.02
171	0.03
172	0.03
173	0.05
174	0.06
175	0.06
176	0.06
177	0.07
178	0.08
179	0.1
180	0.12
181	0.11
182	0.11
183	0.12
184	0.14
185	0.15
186	0.14
187	0.13
188	0.1
189	0.1
190	0.09
191	0.08
192	0.06
193	0.08
194	0.1
195	0.1
196	0.1
197	0.1
198	0.11
199	0.11
200	0.12
201	0.13
202	0.11
203	0.13
204	0.18
205	0.2
206	0.19
207	0.19
208	0.19
209	0.17
210	0.2
211	0.19
212	0.14
213	0.12
214	0.11
215	0.11
216	0.1
217	0.09
218	0.05
219	0.04
220	0.04
221	0.05
222	0.05
223	0.05
224	0.05
225	0.07
226	0.07
227	0.07
228	0.07
229	0.06
230	0.06
231	0.07
232	0.07
233	0.06
234	0.07
235	0.08
236	0.08
237	0.07
238	0.09
239	0.09
240	0.12
241	0.12
242	0.12
243	0.11
244	0.11
245	0.12
246	0.11
247	0.14
248	0.16
249	0.16
250	0.16
251	0.19
252	0.2
253	0.25
254	0.25
255	0.23
256	0.23
257	0.23
258	0.24
259	0.21
260	0.2
261	0.16
262	0.13
263	0.13
264	0.09
265	0.08
266	0.07
267	0.07
268	0.06
269	0.06
270	0.06
271	0.05
272	0.06
273	0.06
274	0.07
275	0.07
276	0.07
277	0.07
278	0.06
279	0.07
280	0.06
281	0.05
282	0.06
283	0.07
284	0.06
285	0.06
286	0.07
287	0.06
288	0.07
289	0.08
290	0.06
291	0.06
292	0.05
293	0.07
294	0.07
295	0.08
296	0.07
297	0.07
298	0.08
299	0.11
300	0.11
301	0.1
302	0.09
303	0.09
304	0.1
305	0.11
306	0.1
307	0.07
308	0.07
309	0.07
310	0.08
311	0.08
312	0.07
313	0.06
314	0.06
315	0.07
316	0.09
317	0.09
318	0.09
319	0.1
320	0.1
321	0.12
322	0.12
323	0.13
324	0.14
325	0.14
326	0.15
327	0.15
328	0.17
329	0.16
330	0.18
331	0.17
332	0.14
333	0.14
334	0.15
335	0.14
336	0.15
337	0.16
338	0.13
339	0.13
340	0.13
341	0.12
342	0.09
343	0.08
344	0.07
345	0.05
346	0.05
347	0.04
348	0.05
349	0.04
350	0.04
351	0.04
352	0.03
353	0.03
354	0.04
355	0.04
356	0.03
357	0.04
358	0.04
359	0.04
360	0.03
361	0.03
362	0.03
363	0.03
364	0.03
365	0.04
366	0.05
367	0.05
368	0.05
369	0.06
370	0.06
371	0.08
372	0.08
373	0.06
374	0.05
375	0.06
376	0.1
377	0.1
378	0.1
379	0.09
380	0.09
381	0.1
382	0.1
383	0.1
384	0.06
385	0.06
386	0.08
387	0.08
388	0.08
389	0.09
390	0.08
391	0.08
392	0.08
393	0.08
394	0.09
395	0.09
396	0.09
397	0.08
398	0.08
399	0.1
400	0.12
401	0.12
402	0.1
403	0.1
404	0.11
405	0.12
406	0.13
407	0.12
408	0.12
409	0.12
410	0.12
411	0.12
412	0.12
413	0.1
414	0.1
415	0.09
416	0.07
417	0.06
418	0.06
419	0.05
420	0.05
421	0.05
422	0.04
423	0.04
424	0.05
425	0.05
426	0.06
427	0.06
428	0.08
429	0.08
430	0.08
431	0.09
432	0.11
433	0.15
434	0.17
435	0.17
436	0.17
437	0.17
438	0.21
439	0.22
440	0.18
441	0.15
442	0.13
443	0.12
444	0.11
445	0.11
446	0.06
447	0.07
448	0.08
449	0.09
450	0.13
451	0.14
452	0.15
453	0.16
454	0.19
455	0.21
456	0.27
457	0.35
458	0.41
459	0.49
460	0.57
461	0.67
462	0.72
463	0.78
464	0.82
465	0.83
466	0.84
467	0.81
468	0.77
469	0.73
470	0.67
471	0.58
472	0.49
473	0.41
474	0.34
475	0.29
476	0.24
477	0.19
478	0.19
479	0.18
480	0.17
481	0.16
482	0.13
483	0.13
484	0.13
485	0.12
486	0.11
487	0.14
488	0.13
489	0.16
490	0.2
491	0.2
492	0.2
493	0.19
494	0.19
495	0.17
496	0.18
497	0.16
498	0.14
499	0.15
500	0.17
501	0.17
502	0.17
503	0.17
504	0.17
505	0.15
506	0.12
507	0.11
508	0.12
509	0.12
510	0.12
511	0.1
512	0.11
513	0.11
514	0.11
515	0.11
516	0.08
517	0.09
518	0.09
519	0.11
520	0.12
521	0.15
522	0.17
523	0.21
524	0.26
525	0.26
526	0.26
527	0.26
528	0.24
529	0.23
530	0.24
531	0.2
532	0.16
533	0.15
534	0.14
535	0.13
536	0.12
537	0.11
538	0.08
539	0.08
540	0.1
541	0.11
542	0.12
543	0.14
544	0.13
545	0.14
546	0.14
547	0.18
548	0.19
549	0.18
550	0.17
551	0.15
552	0.15
553	0.13
554	0.12
555	0.07
556	0.04
557	0.03
558	0.04
559	0.04
560	0.04
561	0.05
562	0.04
563	0.05
564	0.05
565	0.07
566	0.07
567	0.09
568	0.16
569	0.16
570	0.17
571	0.2
572	0.25
573	0.28
574	0.29
575	0.31
576	0.3
577	0.35
578	0.36
579	0.36
580	0.36
581	0.33
582	0.31
583	0.28
584	0.26
585	0.3
586	0.37
587	0.41
588	0.39
589	0.44
590	0.48
591	0.52
592	0.54
593	0.56
594	0.56
595	0.53
596	0.56
597	0.51
598	0.47
599	0.42
600	0.37
601	0.26
602	0.17
603	0.14
604	0.08
605	0.07
606	0.09
607	0.12
608	0.14
609	0.15
610	0.16
611	0.16
612	0.17
613	0.23
614	0.27
615	0.33
616	0.33
617	0.34
618	0.34
619	0.4
620	0.42
621	0.37
622	0.32
623	0.24
624	0.22
625	0.21
626	0.23
627	0.15
628	0.14
629	0.15
630	0.15
631	0.14
632	0.14
633	0.13
634	0.13
635	0.14
636	0.16
637	0.19
638	0.17
639	0.19
640	0.18
641	0.19
642	0.15
643	0.15
644	0.15
645	0.1
646	0.1
647	0.08
648	0.08
649	0.08
650	0.12
651	0.14
652	0.17
653	0.19
654	0.22
655	0.27
656	0.35
657	0.44
658	0.47
659	0.55
660	0.6
661	0.69
662	0.74
663	0.78
664	0.78
665	0.78
666	0.81
667	0.8
668	0.78
669	0.74
670	0.73
671	0.69
672	0.66
673	0.64
674	0.55
675	0.46
676	0.39
677	0.36
678	0.33
679	0.31
680	0.26
681	0.2
682	0.21
683	0.22
684	0.22
685	0.22
686	0.18
687	0.17
688	0.16
689	0.21
690	0.21
691	0.2
692	0.19
693	0.17
694	0.18
695	0.19
696	0.19
697	0.16
698	0.21
699	0.27
700	0.33
701	0.36
702	0.37
703	0.35
704	0.36
705	0.38
706	0.35
707	0.34
708	0.34
709	0.33
710	0.38
711	0.44
712	0.43
713	0.45
714	0.43
715	0.41
716	0.42
717	0.44
718	0.44
719	0.47
720	0.53
721	0.51
722	0.58

A0A010RTN4

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer