Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

J3K2D9

Protein Details
Accession J3K2D9    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
407-439PDVVLVKKYYARKKKHKSRNWRLKRLDREEEDHBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
417-431ARKKKHKSRNWRLKR
Subcellular Location(s) nucl 20.5, cyto_nucl 13, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039768  Nmd3  
IPR007064  Nmd3_N  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0043023  F:ribosomal large subunit binding  
GO:0015031  P:protein transport  
KEGG cim:CIMG_09450  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF04981  NMD3  
Amino Acid Sequences MSMDLDAPVSFEPVSFQPQQQAATILCCNCGAPIDGTTAAGALCEDCIKLTIDISEGIQREATLHMCKDCERWLQPPSQWISAALESRELLALCLRKLRGLSKVRIIDASFLWTEPHSKRIKVKITIQQEVFQGTILQQTFEVEYVVASQQCPECAKSYTANTWRASVQVRQKVPHKRTFLHLEQLILKHGAHKDTINIKEVKDGLDFFFSQRNHAERLVDFLSSVAPVRVKKSQQLISMDVHTSTKSYKISFSVELIPICKDDLVALPIKLARSLGNISPLTLCYRVGTSVNLLDPNTLQIADIPSPIYWRSPFKNLADVQELVEFIVMDIEPIGHSSGRFYLAEATVARASDLGVNDTTYFTRTHLGGVLHPGDSVMGYHLTGTNFNDENFEALEQSGTYSSTIPDVVLVKKYYARKKKHKSRNWRLKRLDREEEDHPSASSRQQGKDRLEEDFEMFLRDIEEDTELRSTLALYKAQQKPRAHADQMDGVEMNVDDDSDDDDVPKINMDELLDEFEELNMEDGQ
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.19
2 0.21
3 0.22
4 0.26
5 0.29
6 0.31
7 0.29
8 0.3
9 0.25
10 0.26
11 0.29
12 0.23
13 0.22
14 0.21
15 0.2
16 0.17
17 0.17
18 0.15
19 0.13
20 0.14
21 0.16
22 0.16
23 0.16
24 0.15
25 0.14
26 0.12
27 0.1
28 0.09
29 0.05
30 0.06
31 0.06
32 0.06
33 0.06
34 0.08
35 0.1
36 0.1
37 0.11
38 0.1
39 0.11
40 0.12
41 0.13
42 0.17
43 0.16
44 0.16
45 0.16
46 0.15
47 0.15
48 0.16
49 0.18
50 0.17
51 0.18
52 0.2
53 0.21
54 0.23
55 0.25
56 0.28
57 0.33
58 0.32
59 0.36
60 0.39
61 0.44
62 0.44
63 0.49
64 0.49
65 0.43
66 0.4
67 0.36
68 0.36
69 0.32
70 0.33
71 0.25
72 0.22
73 0.19
74 0.19
75 0.19
76 0.15
77 0.12
78 0.14
79 0.16
80 0.15
81 0.2
82 0.2
83 0.2
84 0.23
85 0.26
86 0.31
87 0.36
88 0.4
89 0.44
90 0.48
91 0.47
92 0.48
93 0.45
94 0.38
95 0.3
96 0.29
97 0.21
98 0.17
99 0.17
100 0.14
101 0.2
102 0.18
103 0.26
104 0.26
105 0.3
106 0.37
107 0.45
108 0.53
109 0.53
110 0.61
111 0.61
112 0.66
113 0.68
114 0.63
115 0.57
116 0.5
117 0.45
118 0.36
119 0.27
120 0.2
121 0.13
122 0.16
123 0.12
124 0.12
125 0.1
126 0.11
127 0.11
128 0.11
129 0.11
130 0.06
131 0.06
132 0.07
133 0.09
134 0.08
135 0.08
136 0.1
137 0.1
138 0.12
139 0.14
140 0.14
141 0.15
142 0.17
143 0.19
144 0.2
145 0.23
146 0.3
147 0.35
148 0.4
149 0.38
150 0.37
151 0.35
152 0.35
153 0.34
154 0.32
155 0.34
156 0.36
157 0.38
158 0.4
159 0.48
160 0.56
161 0.6
162 0.62
163 0.59
164 0.53
165 0.56
166 0.6
167 0.56
168 0.53
169 0.47
170 0.41
171 0.38
172 0.37
173 0.32
174 0.25
175 0.22
176 0.18
177 0.19
178 0.18
179 0.16
180 0.16
181 0.19
182 0.25
183 0.27
184 0.28
185 0.28
186 0.27
187 0.29
188 0.29
189 0.26
190 0.2
191 0.18
192 0.14
193 0.15
194 0.15
195 0.13
196 0.18
197 0.17
198 0.18
199 0.2
200 0.21
201 0.21
202 0.22
203 0.23
204 0.17
205 0.21
206 0.2
207 0.17
208 0.14
209 0.12
210 0.11
211 0.1
212 0.1
213 0.06
214 0.07
215 0.08
216 0.11
217 0.16
218 0.17
219 0.21
220 0.28
221 0.32
222 0.34
223 0.37
224 0.37
225 0.34
226 0.34
227 0.3
228 0.24
229 0.2
230 0.15
231 0.12
232 0.1
233 0.11
234 0.11
235 0.11
236 0.12
237 0.13
238 0.16
239 0.16
240 0.18
241 0.18
242 0.18
243 0.18
244 0.17
245 0.15
246 0.13
247 0.12
248 0.1
249 0.07
250 0.06
251 0.06
252 0.07
253 0.08
254 0.08
255 0.08
256 0.09
257 0.09
258 0.09
259 0.09
260 0.07
261 0.08
262 0.1
263 0.1
264 0.15
265 0.14
266 0.15
267 0.15
268 0.15
269 0.15
270 0.14
271 0.13
272 0.08
273 0.09
274 0.09
275 0.09
276 0.09
277 0.09
278 0.1
279 0.1
280 0.11
281 0.1
282 0.1
283 0.09
284 0.09
285 0.09
286 0.07
287 0.06
288 0.06
289 0.08
290 0.08
291 0.08
292 0.08
293 0.08
294 0.09
295 0.1
296 0.1
297 0.11
298 0.15
299 0.17
300 0.22
301 0.26
302 0.26
303 0.33
304 0.33
305 0.34
306 0.34
307 0.31
308 0.27
309 0.23
310 0.22
311 0.14
312 0.13
313 0.09
314 0.06
315 0.06
316 0.05
317 0.04
318 0.04
319 0.04
320 0.04
321 0.04
322 0.05
323 0.05
324 0.05
325 0.06
326 0.07
327 0.09
328 0.1
329 0.09
330 0.12
331 0.12
332 0.14
333 0.13
334 0.14
335 0.13
336 0.13
337 0.12
338 0.09
339 0.09
340 0.1
341 0.1
342 0.09
343 0.09
344 0.1
345 0.1
346 0.11
347 0.11
348 0.1
349 0.1
350 0.09
351 0.11
352 0.11
353 0.11
354 0.14
355 0.14
356 0.14
357 0.18
358 0.19
359 0.16
360 0.16
361 0.15
362 0.12
363 0.11
364 0.1
365 0.07
366 0.06
367 0.05
368 0.06
369 0.08
370 0.09
371 0.11
372 0.12
373 0.15
374 0.15
375 0.15
376 0.17
377 0.15
378 0.15
379 0.14
380 0.13
381 0.09
382 0.09
383 0.09
384 0.07
385 0.08
386 0.07
387 0.07
388 0.07
389 0.07
390 0.08
391 0.08
392 0.09
393 0.08
394 0.09
395 0.11
396 0.12
397 0.16
398 0.16
399 0.17
400 0.22
401 0.31
402 0.39
403 0.46
404 0.55
405 0.62
406 0.73
407 0.82
408 0.88
409 0.91
410 0.92
411 0.94
412 0.95
413 0.95
414 0.94
415 0.94
416 0.93
417 0.93
418 0.91
419 0.9
420 0.83
421 0.77
422 0.72
423 0.7
424 0.63
425 0.53
426 0.44
427 0.37
428 0.33
429 0.31
430 0.33
431 0.31
432 0.33
433 0.39
434 0.47
435 0.49
436 0.56
437 0.55
438 0.5
439 0.48
440 0.44
441 0.4
442 0.35
443 0.3
444 0.24
445 0.22
446 0.19
447 0.16
448 0.14
449 0.12
450 0.1
451 0.13
452 0.1
453 0.12
454 0.13
455 0.13
456 0.12
457 0.12
458 0.11
459 0.13
460 0.16
461 0.17
462 0.19
463 0.29
464 0.38
465 0.46
466 0.53
467 0.52
468 0.56
469 0.63
470 0.68
471 0.62
472 0.57
473 0.54
474 0.54
475 0.51
476 0.47
477 0.37
478 0.29
479 0.26
480 0.22
481 0.17
482 0.1
483 0.08
484 0.06
485 0.06
486 0.08
487 0.09
488 0.09
489 0.09
490 0.1
491 0.11
492 0.11
493 0.13
494 0.11
495 0.11
496 0.12
497 0.12
498 0.14
499 0.14
500 0.18
501 0.16
502 0.16
503 0.16
504 0.14
505 0.14
506 0.12