Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A010QSR0

Protein Details
Accession A0A010QSR0    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
395-414QELPRKRKAVDIFMPKKRTKBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
399-415RKRKAVDIFMPKKRTKR
Subcellular Location(s) nucl 18.5, cyto_nucl 11, mito 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR010684  RNA_pol_II_trans_fac_SIII_A  
Gene Ontology GO:0070449  C:elongin complex  
GO:0006368  P:transcription elongation by RNA polymerase II  
KEGG cfj:CFIO01_01423  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF06881  Elongin_A  
Amino Acid Sequences MAPTKSLAELCIAMCQRHITELSSVGNGDALQYHHVREILLRVTNPAQLREIELNSPFIQGETSELWLRLIKKEFPSESHEKNYAPKNPSKWYKIYERYAEERREAQQQAEAELLARVQGLQQKKDNNVSRIVDPKFARFLPKPPKTGRTFSTQPRGKRELPSSLSWAAGSRMKMTTGASVMKKARREAKEIVGIRSTMAVPTGMIRAPRLKQAPPSMAAEHRISSQPVFRPTSTSSRPPTHSTYVTPQSKATYVSDSSDGEDGDLFSDEGTPKKNKGAASSSHHHRDTAASSRPTKPSQSSAFKDRNSSTSARSTSSSQTSGLRRGGGILGNAARPKSNIRVERPLNRPEPSSSTSMDQSRTHKVLAQNNGPQSPPLPASLDEAQQARPILGNQELPRKRKAVDIFMPKKRTKR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.22
2 0.24
3 0.22
4 0.24
5 0.24
6 0.19
7 0.2
8 0.24
9 0.25
10 0.23
11 0.22
12 0.19
13 0.18
14 0.15
15 0.13
16 0.11
17 0.1
18 0.13
19 0.14
20 0.16
21 0.17
22 0.18
23 0.17
24 0.17
25 0.21
26 0.22
27 0.25
28 0.24
29 0.25
30 0.27
31 0.32
32 0.32
33 0.29
34 0.26
35 0.23
36 0.27
37 0.28
38 0.28
39 0.26
40 0.26
41 0.27
42 0.26
43 0.26
44 0.22
45 0.17
46 0.15
47 0.12
48 0.14
49 0.12
50 0.14
51 0.15
52 0.15
53 0.16
54 0.19
55 0.21
56 0.23
57 0.26
58 0.29
59 0.32
60 0.39
61 0.4
62 0.4
63 0.47
64 0.48
65 0.49
66 0.5
67 0.48
68 0.42
69 0.47
70 0.51
71 0.51
72 0.5
73 0.51
74 0.51
75 0.57
76 0.64
77 0.64
78 0.61
79 0.58
80 0.62
81 0.65
82 0.66
83 0.64
84 0.61
85 0.62
86 0.65
87 0.63
88 0.56
89 0.51
90 0.46
91 0.46
92 0.42
93 0.36
94 0.32
95 0.29
96 0.27
97 0.24
98 0.21
99 0.14
100 0.12
101 0.11
102 0.07
103 0.06
104 0.05
105 0.06
106 0.12
107 0.15
108 0.19
109 0.24
110 0.29
111 0.33
112 0.42
113 0.47
114 0.44
115 0.47
116 0.45
117 0.44
118 0.47
119 0.45
120 0.42
121 0.37
122 0.36
123 0.34
124 0.32
125 0.35
126 0.29
127 0.37
128 0.41
129 0.47
130 0.51
131 0.52
132 0.59
133 0.58
134 0.61
135 0.54
136 0.51
137 0.51
138 0.51
139 0.57
140 0.54
141 0.53
142 0.57
143 0.6
144 0.56
145 0.56
146 0.54
147 0.51
148 0.5
149 0.47
150 0.44
151 0.38
152 0.35
153 0.29
154 0.25
155 0.19
156 0.18
157 0.16
158 0.13
159 0.13
160 0.13
161 0.13
162 0.13
163 0.13
164 0.12
165 0.15
166 0.14
167 0.18
168 0.22
169 0.25
170 0.27
171 0.29
172 0.36
173 0.35
174 0.4
175 0.39
176 0.41
177 0.45
178 0.45
179 0.43
180 0.35
181 0.32
182 0.26
183 0.24
184 0.18
185 0.1
186 0.08
187 0.06
188 0.05
189 0.06
190 0.07
191 0.06
192 0.07
193 0.08
194 0.11
195 0.12
196 0.17
197 0.19
198 0.19
199 0.23
200 0.28
201 0.29
202 0.28
203 0.3
204 0.27
205 0.25
206 0.27
207 0.23
208 0.19
209 0.18
210 0.17
211 0.15
212 0.14
213 0.17
214 0.17
215 0.21
216 0.23
217 0.22
218 0.25
219 0.27
220 0.34
221 0.34
222 0.36
223 0.37
224 0.39
225 0.42
226 0.43
227 0.45
228 0.42
229 0.4
230 0.36
231 0.37
232 0.42
233 0.42
234 0.38
235 0.34
236 0.31
237 0.3
238 0.29
239 0.24
240 0.19
241 0.16
242 0.17
243 0.18
244 0.17
245 0.17
246 0.16
247 0.14
248 0.11
249 0.1
250 0.08
251 0.07
252 0.07
253 0.06
254 0.05
255 0.07
256 0.07
257 0.08
258 0.12
259 0.14
260 0.15
261 0.18
262 0.22
263 0.21
264 0.26
265 0.3
266 0.32
267 0.37
268 0.43
269 0.47
270 0.51
271 0.5
272 0.45
273 0.4
274 0.37
275 0.34
276 0.34
277 0.34
278 0.32
279 0.36
280 0.41
281 0.45
282 0.45
283 0.45
284 0.41
285 0.41
286 0.44
287 0.49
288 0.49
289 0.53
290 0.57
291 0.55
292 0.57
293 0.52
294 0.47
295 0.43
296 0.4
297 0.36
298 0.36
299 0.36
300 0.32
301 0.32
302 0.32
303 0.32
304 0.34
305 0.32
306 0.26
307 0.3
308 0.31
309 0.35
310 0.34
311 0.29
312 0.25
313 0.25
314 0.25
315 0.21
316 0.18
317 0.16
318 0.16
319 0.18
320 0.19
321 0.18
322 0.17
323 0.17
324 0.21
325 0.25
326 0.32
327 0.37
328 0.42
329 0.52
330 0.58
331 0.66
332 0.69
333 0.7
334 0.67
335 0.62
336 0.58
337 0.52
338 0.52
339 0.46
340 0.43
341 0.37
342 0.35
343 0.37
344 0.37
345 0.37
346 0.35
347 0.36
348 0.41
349 0.41
350 0.38
351 0.38
352 0.42
353 0.46
354 0.5
355 0.53
356 0.52
357 0.55
358 0.56
359 0.52
360 0.46
361 0.39
362 0.34
363 0.28
364 0.23
365 0.2
366 0.19
367 0.24
368 0.26
369 0.27
370 0.26
371 0.26
372 0.25
373 0.25
374 0.25
375 0.2
376 0.18
377 0.18
378 0.18
379 0.2
380 0.26
381 0.28
382 0.38
383 0.45
384 0.47
385 0.52
386 0.51
387 0.49
388 0.5
389 0.53
390 0.52
391 0.55
392 0.62
393 0.66
394 0.72
395 0.8