FuNGI

A0A010QLK4

Protein Details

Accession

A0A010QLK4

Localization Confidence

High

Confidence Score

19.4

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
5-37	DSPATNGHKSDKRSKKDKKEKKRLREEGDDAAE	Basic
77-132	NTNGEPSSAKKKSKKDKHRKSVGESAEQDGSDAERKEKKDKKKKRKSEQKESAEAV	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
13-45	KSDKRSKKDKKEKKRLREEGDDAAEERKHKRTK
85-99	AKKKSKKDKHRKSVG
109-124	AERKEKKDKKKKRKSE
418-426	RRRRAGKSG

Subcellular Location(s)

nucl 20.5, cyto_nucl 13, cyto 4.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR036898 RNA_pol_Rpb7-like_N_sf IPR041901 RNAP_I_Rpa43_N IPR041178 RPA43_OB IPR045113 Rpb7-like
Gene Ontology	GO:0000428 C:DNA-directed RNA polymerase complex GO:0005730 C:nucleolus GO:0003677 F:DNA binding GO:0006352 P:DNA-templated transcription initiation
KEGG	cfj:CFIO01_11672 -
Pfam	View protein in Pfam PF17875 RPA43_OB
CDD	cd04328 RNAP_I_Rpa43_N

Amino Acid Sequences

MASTDSPATNGHKSDKRSKKDKKEKKRLREEGDDAAEERKHKRTKSLGVAKNDANDEEEESPQASQDLSMDAIATSNTNGEPSSAKKKSKKDKHRKSVGESAEQDGSDAERKEKKDKKKKRKSEQKESAEAVEDTAEPPASEKKSKKAADREPAVDADADAMDVDSPAKTKSTGRVHQPPDAPSKPQFPFYTQTVSLYLPIYPIGWDTPCTAAATQHLEPLVNRYVPDLKGVLLAFRNVAVSEQPGRRYAAKSDLEHCDLVSVDEYAVGFGYVTVDVDLFIPRRGAWMEGSINLENEGHVGVVCWGKFNASIESSRLPPEWRWVHAGSAEAASYVADPFDVENTEAAAEDEHGAVRQIHTTGFWVDGAGDKVKGRVRFRIKAFDVGVSGDHGYLSLEGTMLDAAGEKAAIQRDAEQERRRRAGKSGGILSKERRAMPEFSVTKFGEVEDEEDKALRNDVWKTTEPVTDNEAGEGGEKEAFTGISAEEA

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.54
2	0.61
3	0.66
4	0.73
5	0.8
6	0.83
7	0.89
8	0.93
9	0.93
10	0.95
11	0.96
12	0.96
13	0.96
14	0.95
15	0.92
16	0.91
17	0.85
18	0.82
19	0.76
20	0.67
21	0.57
22	0.5
23	0.44
24	0.38
25	0.37
26	0.37
27	0.39
28	0.4
29	0.48
30	0.53
31	0.6
32	0.68
33	0.74
34	0.72
35	0.73
36	0.76
37	0.7
38	0.65
39	0.57
40	0.46
41	0.38
42	0.31
43	0.28
44	0.24
45	0.22
46	0.19
47	0.18
48	0.17
49	0.15
50	0.14
51	0.1
52	0.08
53	0.08
54	0.08
55	0.08
56	0.08
57	0.08
58	0.07
59	0.08
60	0.07
61	0.07
62	0.06
63	0.07
64	0.07
65	0.07
66	0.08
67	0.08
68	0.11
69	0.16
70	0.26
71	0.31
72	0.4
73	0.47
74	0.57
75	0.67
76	0.76
77	0.82
78	0.84
79	0.88
80	0.91
81	0.94
82	0.92
83	0.88
84	0.87
85	0.81
86	0.78
87	0.69
88	0.62
89	0.53
90	0.45
91	0.37
92	0.27
93	0.23
94	0.19
95	0.18
96	0.19
97	0.23
98	0.26
99	0.37
100	0.45
101	0.54
102	0.61
103	0.72
104	0.78
105	0.84
106	0.92
107	0.93
108	0.96
109	0.95
110	0.96
111	0.95
112	0.92
113	0.88
114	0.79
115	0.7
116	0.61
117	0.5
118	0.39
119	0.29
120	0.21
121	0.13
122	0.12
123	0.1
124	0.07
125	0.08
126	0.13
127	0.16
128	0.23
129	0.25
130	0.31
131	0.41
132	0.45
133	0.52
134	0.57
135	0.63
136	0.65
137	0.68
138	0.64
139	0.57
140	0.52
141	0.45
142	0.35
143	0.25
144	0.17
145	0.11
146	0.08
147	0.06
148	0.05
149	0.04
150	0.04
151	0.05
152	0.04
153	0.04
154	0.05
155	0.06
156	0.07
157	0.09
158	0.18
159	0.26
160	0.31
161	0.39
162	0.48
163	0.51
164	0.56
165	0.58
166	0.53
167	0.53
168	0.5
169	0.45
170	0.39
171	0.42
172	0.37
173	0.39
174	0.36
175	0.31
176	0.33
177	0.32
178	0.35
179	0.27
180	0.28
181	0.24
182	0.23
183	0.21
184	0.17
185	0.15
186	0.1
187	0.1
188	0.08
189	0.07
190	0.07
191	0.07
192	0.06
193	0.07
194	0.08
195	0.09
196	0.1
197	0.11
198	0.1
199	0.1
200	0.11
201	0.15
202	0.14
203	0.14
204	0.14
205	0.13
206	0.13
207	0.16
208	0.17
209	0.12
210	0.12
211	0.12
212	0.15
213	0.15
214	0.17
215	0.13
216	0.11
217	0.13
218	0.13
219	0.12
220	0.09
221	0.1
222	0.08
223	0.08
224	0.08
225	0.06
226	0.06
227	0.05
228	0.06
229	0.11
230	0.13
231	0.14
232	0.15
233	0.17
234	0.18
235	0.2
236	0.2
237	0.23
238	0.26
239	0.26
240	0.28
241	0.31
242	0.31
243	0.29
244	0.27
245	0.2
246	0.15
247	0.14
248	0.11
249	0.07
250	0.05
251	0.05
252	0.05
253	0.05
254	0.04
255	0.04
256	0.03
257	0.03
258	0.04
259	0.03
260	0.03
261	0.03
262	0.03
263	0.04
264	0.05
265	0.06
266	0.06
267	0.06
268	0.07
269	0.07
270	0.08
271	0.08
272	0.09
273	0.08
274	0.11
275	0.12
276	0.13
277	0.17
278	0.15
279	0.15
280	0.14
281	0.14
282	0.1
283	0.09
284	0.08
285	0.04
286	0.04
287	0.04
288	0.05
289	0.07
290	0.07
291	0.08
292	0.07
293	0.08
294	0.09
295	0.11
296	0.11
297	0.11
298	0.13
299	0.14
300	0.16
301	0.17
302	0.18
303	0.17
304	0.17
305	0.16
306	0.24
307	0.25
308	0.25
309	0.29
310	0.28
311	0.28
312	0.27
313	0.27
314	0.19
315	0.17
316	0.14
317	0.09
318	0.09
319	0.07
320	0.07
321	0.05
322	0.04
323	0.04
324	0.04
325	0.04
326	0.05
327	0.06
328	0.06
329	0.06
330	0.07
331	0.07
332	0.07
333	0.07
334	0.06
335	0.06
336	0.06
337	0.06
338	0.06
339	0.06
340	0.07
341	0.07
342	0.08
343	0.09
344	0.08
345	0.08
346	0.09
347	0.1
348	0.1
349	0.11
350	0.1
351	0.09
352	0.08
353	0.1
354	0.12
355	0.11
356	0.12
357	0.11
358	0.16
359	0.2
360	0.27
361	0.28
362	0.35
363	0.43
364	0.49
365	0.53
366	0.59
367	0.57
368	0.58
369	0.56
370	0.49
371	0.41
372	0.34
373	0.3
374	0.21
375	0.19
376	0.12
377	0.1
378	0.08
379	0.08
380	0.07
381	0.07
382	0.05
383	0.05
384	0.05
385	0.05
386	0.05
387	0.05
388	0.04
389	0.04
390	0.04
391	0.04
392	0.04
393	0.04
394	0.07
395	0.09
396	0.1
397	0.1
398	0.14
399	0.21
400	0.27
401	0.36
402	0.41
403	0.48
404	0.55
405	0.62
406	0.62
407	0.58
408	0.57
409	0.59
410	0.57
411	0.57
412	0.58
413	0.56
414	0.57
415	0.59
416	0.57
417	0.54
418	0.52
419	0.46
420	0.42
421	0.4
422	0.4
423	0.39
424	0.45
425	0.4
426	0.38
427	0.43
428	0.39
429	0.36
430	0.33
431	0.3
432	0.23
433	0.21
434	0.22
435	0.16
436	0.17
437	0.16
438	0.17
439	0.17
440	0.15
441	0.16
442	0.14
443	0.17
444	0.2
445	0.24
446	0.3
447	0.32
448	0.35
449	0.37
450	0.41
451	0.39
452	0.37
453	0.38
454	0.37
455	0.34
456	0.3
457	0.27
458	0.21
459	0.21
460	0.19
461	0.14
462	0.11
463	0.11
464	0.11
465	0.11
466	0.11
467	0.1
468	0.1

A0A010QLK4

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer