Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

A0A0E1RXM9

Protein Details
Accession A0A0E1RXM9    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
53-79GTSHGNVSQRHKRQRLKPRRLALRAAAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
63-72HKRQRLKPRR
Subcellular Location(s) nucl 18.5, cyto_nucl 13, cyto 6.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009057  Homeobox-like_sf  
IPR039601  Rrn5  
IPR001005  SANT/Myb  
Gene Ontology GO:0000500  C:RNA polymerase I upstream activating factor complex  
GO:0042790  P:nucleolar large rRNA transcription by RNA polymerase I  
KEGG cim:CIMG_05262  -  
CDD cd00167  SANT  
Amino Acid Sequences MSDSSMSYEPEEEEEGEEQEEDTTQHGNPSGASGHSVPPHQNVLHDSKPLHNGTSHGNVSQRHKRQRLKPRRLALRAAATLPVGKYSDLYKEVVDDMLGGPEYGDGPRLFGTQYGIISWSPQEKNAFFTALARKGKDAIPEIAAFIGTKSQMEVRHYLDLLHRNFELHNVTEETVKNITLSDVPAAYEVSKECCLALENVASALSLRDEQAHNVAGRRKHGDFWLIDNEVAAYVEEVLEPEEESESEKDPEPESLEPGVIPASEFEVELQPETESKSLAEGDRNGQVNTVKMHSISATAKLLKISNWIRLSERVFMNAGERRLEDNWTQICFEDETPALTCDAFSDFYALTISITRRIVHSSIFFALSRIRAIERSHVNPKKVVKKEDIFAALDILKMEPNSRKFWASAPRRCALDIRHDSGENYKTVLLSYDELDALLGPKSDIDPEYIKTAPQAMSSASEGSSYSGEGFESDTSGRIPSTAQDSMDAEDDLSDAQEKHANALDQEASRAEESKLWRWIGKPDPQSLDHNVKPEVKEEEIEHTLFAKRKMPQEISNWRSRILYQAEWETFGQSTVAIDEEMGGNGSRKRLKID
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.18
2 0.18
3 0.17
4 0.16
5 0.14
6 0.12
7 0.12
8 0.1
9 0.1
10 0.11
11 0.1
12 0.13
13 0.14
14 0.14
15 0.13
16 0.15
17 0.16
18 0.14
19 0.17
20 0.17
21 0.19
22 0.22
23 0.25
24 0.26
25 0.27
26 0.32
27 0.3
28 0.31
29 0.32
30 0.37
31 0.37
32 0.39
33 0.37
34 0.37
35 0.43
36 0.42
37 0.39
38 0.33
39 0.31
40 0.32
41 0.38
42 0.35
43 0.3
44 0.33
45 0.36
46 0.43
47 0.52
48 0.56
49 0.58
50 0.67
51 0.74
52 0.8
53 0.86
54 0.89
55 0.9
56 0.9
57 0.9
58 0.91
59 0.87
60 0.84
61 0.8
62 0.77
63 0.68
64 0.59
65 0.5
66 0.4
67 0.36
68 0.3
69 0.24
70 0.17
71 0.14
72 0.14
73 0.14
74 0.19
75 0.18
76 0.19
77 0.17
78 0.18
79 0.19
80 0.18
81 0.16
82 0.11
83 0.1
84 0.1
85 0.1
86 0.08
87 0.07
88 0.07
89 0.08
90 0.07
91 0.1
92 0.08
93 0.1
94 0.11
95 0.12
96 0.11
97 0.11
98 0.14
99 0.13
100 0.14
101 0.13
102 0.14
103 0.13
104 0.14
105 0.15
106 0.19
107 0.18
108 0.21
109 0.25
110 0.24
111 0.28
112 0.29
113 0.28
114 0.21
115 0.26
116 0.3
117 0.33
118 0.36
119 0.33
120 0.32
121 0.33
122 0.35
123 0.35
124 0.31
125 0.26
126 0.25
127 0.24
128 0.24
129 0.21
130 0.19
131 0.14
132 0.11
133 0.1
134 0.07
135 0.07
136 0.07
137 0.11
138 0.14
139 0.17
140 0.2
141 0.22
142 0.25
143 0.25
144 0.26
145 0.28
146 0.32
147 0.31
148 0.3
149 0.27
150 0.24
151 0.24
152 0.26
153 0.23
154 0.17
155 0.18
156 0.17
157 0.17
158 0.2
159 0.2
160 0.2
161 0.18
162 0.17
163 0.14
164 0.12
165 0.13
166 0.1
167 0.11
168 0.09
169 0.08
170 0.08
171 0.09
172 0.09
173 0.08
174 0.08
175 0.08
176 0.1
177 0.11
178 0.11
179 0.1
180 0.1
181 0.11
182 0.11
183 0.12
184 0.1
185 0.09
186 0.09
187 0.09
188 0.08
189 0.07
190 0.06
191 0.05
192 0.05
193 0.05
194 0.08
195 0.08
196 0.1
197 0.12
198 0.14
199 0.14
200 0.17
201 0.22
202 0.21
203 0.25
204 0.28
205 0.27
206 0.27
207 0.28
208 0.3
209 0.26
210 0.28
211 0.29
212 0.26
213 0.24
214 0.22
215 0.2
216 0.15
217 0.14
218 0.1
219 0.04
220 0.04
221 0.04
222 0.04
223 0.04
224 0.04
225 0.04
226 0.04
227 0.04
228 0.05
229 0.05
230 0.07
231 0.08
232 0.09
233 0.1
234 0.11
235 0.12
236 0.12
237 0.13
238 0.14
239 0.13
240 0.14
241 0.13
242 0.12
243 0.11
244 0.11
245 0.1
246 0.07
247 0.06
248 0.04
249 0.05
250 0.05
251 0.05
252 0.06
253 0.07
254 0.07
255 0.07
256 0.08
257 0.06
258 0.06
259 0.08
260 0.08
261 0.07
262 0.06
263 0.07
264 0.08
265 0.09
266 0.1
267 0.1
268 0.12
269 0.16
270 0.17
271 0.16
272 0.16
273 0.15
274 0.15
275 0.15
276 0.14
277 0.1
278 0.09
279 0.1
280 0.09
281 0.11
282 0.1
283 0.11
284 0.12
285 0.12
286 0.12
287 0.13
288 0.13
289 0.11
290 0.17
291 0.17
292 0.22
293 0.23
294 0.24
295 0.24
296 0.27
297 0.29
298 0.27
299 0.26
300 0.2
301 0.19
302 0.18
303 0.21
304 0.2
305 0.19
306 0.15
307 0.16
308 0.16
309 0.17
310 0.19
311 0.16
312 0.18
313 0.19
314 0.19
315 0.19
316 0.16
317 0.17
318 0.15
319 0.15
320 0.12
321 0.1
322 0.1
323 0.11
324 0.11
325 0.1
326 0.09
327 0.08
328 0.07
329 0.08
330 0.08
331 0.07
332 0.08
333 0.07
334 0.08
335 0.08
336 0.08
337 0.07
338 0.08
339 0.09
340 0.11
341 0.12
342 0.12
343 0.12
344 0.15
345 0.15
346 0.15
347 0.16
348 0.14
349 0.15
350 0.16
351 0.15
352 0.13
353 0.14
354 0.13
355 0.12
356 0.11
357 0.11
358 0.12
359 0.13
360 0.19
361 0.22
362 0.27
363 0.37
364 0.41
365 0.42
366 0.44
367 0.51
368 0.54
369 0.55
370 0.55
371 0.52
372 0.5
373 0.51
374 0.51
375 0.46
376 0.37
377 0.31
378 0.28
379 0.2
380 0.17
381 0.15
382 0.11
383 0.09
384 0.08
385 0.11
386 0.15
387 0.18
388 0.21
389 0.23
390 0.24
391 0.24
392 0.3
393 0.37
394 0.42
395 0.47
396 0.49
397 0.5
398 0.5
399 0.5
400 0.48
401 0.41
402 0.41
403 0.39
404 0.38
405 0.37
406 0.36
407 0.36
408 0.38
409 0.38
410 0.27
411 0.22
412 0.18
413 0.16
414 0.15
415 0.16
416 0.12
417 0.11
418 0.11
419 0.11
420 0.1
421 0.1
422 0.1
423 0.09
424 0.08
425 0.07
426 0.06
427 0.05
428 0.05
429 0.06
430 0.08
431 0.08
432 0.11
433 0.12
434 0.14
435 0.18
436 0.18
437 0.17
438 0.16
439 0.2
440 0.17
441 0.16
442 0.15
443 0.12
444 0.14
445 0.15
446 0.15
447 0.12
448 0.12
449 0.11
450 0.11
451 0.11
452 0.09
453 0.08
454 0.08
455 0.07
456 0.07
457 0.08
458 0.07
459 0.08
460 0.08
461 0.09
462 0.09
463 0.1
464 0.09
465 0.08
466 0.09
467 0.09
468 0.15
469 0.16
470 0.16
471 0.17
472 0.19
473 0.2
474 0.21
475 0.19
476 0.12
477 0.11
478 0.1
479 0.08
480 0.08
481 0.08
482 0.07
483 0.08
484 0.12
485 0.12
486 0.15
487 0.18
488 0.18
489 0.16
490 0.2
491 0.22
492 0.18
493 0.2
494 0.18
495 0.17
496 0.17
497 0.19
498 0.16
499 0.17
500 0.22
501 0.27
502 0.32
503 0.32
504 0.34
505 0.34
506 0.42
507 0.45
508 0.49
509 0.49
510 0.5
511 0.53
512 0.54
513 0.57
514 0.56
515 0.57
516 0.5
517 0.48
518 0.46
519 0.46
520 0.43
521 0.42
522 0.4
523 0.33
524 0.33
525 0.31
526 0.34
527 0.32
528 0.31
529 0.27
530 0.25
531 0.28
532 0.28
533 0.29
534 0.28
535 0.3
536 0.37
537 0.46
538 0.49
539 0.51
540 0.58
541 0.66
542 0.66
543 0.7
544 0.64
545 0.57
546 0.53
547 0.47
548 0.45
549 0.4
550 0.38
551 0.34
552 0.41
553 0.4
554 0.42
555 0.41
556 0.35
557 0.29
558 0.26
559 0.2
560 0.12
561 0.12
562 0.09
563 0.1
564 0.07
565 0.07
566 0.08
567 0.08
568 0.08
569 0.09
570 0.09
571 0.11
572 0.13
573 0.2
574 0.25