Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A010RUW6

Protein Details
Accession A0A010RUW6    Localization Confidence High Confidence Score 15
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-24MGKRQRTFRKKAARQEKMDKASSSHydrophilic
369-388VELHSRNWRWHKKLHFWLTKHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
5-22QRTFRKKAARQEKMDKAS
Subcellular Location(s) nucl 17.5, cyto_nucl 11.5, mito 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR038635  CCR4-NOT_su2/3/5_C_sf  
IPR040168  Not2/3/5  
IPR007282  NOT2/3/5_C  
Gene Ontology GO:0030015  C:CCR4-NOT core complex  
GO:0000289  P:nuclear-transcribed mRNA poly(A) tail shortening  
GO:0006355  P:regulation of DNA-templated transcription  
KEGG cfj:CFIO01_12543  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF04153  NOT2_3_5  
Amino Acid Sequences MGKRQRTFRKKAARQEKMDKASSSPPRENPKKGYADVLKTEFPSLSNNAQMNTTGQSNMWSSTASRNLGAGPVPRNQQSTPLSAQSGQDELFTPTSARQGAFRFGGQSSAGPAPQVQSNPVDDFPPLNRNSNGEIGGERSANLMPSLGFGGSQASGSAAAIPPARSAGAGNGLLNALSANSRTSDGRSSSIASVQDQARIQEASAERGNSFSEETGGDSASQSAETRNPPGAIGNDAVTGNGKAKEEKEGQSPDVQDPLAGMAPIDKFGMKGLRVLMNNYPSYGALMQGMDPNEFGLNVNSPDLISTQIYSLFDDTPPRPAIPSVRLPECYKVTNVQPIETKIPSFNEETLFWIFYSCTQDIKQQLAAVELHSRNWRWHKKLHFWLTKDELMMPASLGPHHERGYYIVWDTTNWRKERRELTLHYGDLETNLAQPVA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.88
2 0.89
3 0.89
4 0.85
5 0.81
6 0.72
7 0.65
8 0.64
9 0.65
10 0.63
11 0.6
12 0.6
13 0.65
14 0.72
15 0.76
16 0.73
17 0.73
18 0.72
19 0.66
20 0.67
21 0.64
22 0.62
23 0.61
24 0.58
25 0.51
26 0.46
27 0.46
28 0.37
29 0.3
30 0.27
31 0.25
32 0.24
33 0.27
34 0.28
35 0.26
36 0.27
37 0.27
38 0.24
39 0.22
40 0.2
41 0.15
42 0.14
43 0.15
44 0.16
45 0.16
46 0.15
47 0.13
48 0.14
49 0.19
50 0.25
51 0.24
52 0.23
53 0.22
54 0.22
55 0.23
56 0.24
57 0.22
58 0.2
59 0.24
60 0.27
61 0.29
62 0.32
63 0.31
64 0.37
65 0.35
66 0.37
67 0.35
68 0.34
69 0.34
70 0.32
71 0.32
72 0.26
73 0.25
74 0.2
75 0.17
76 0.15
77 0.16
78 0.15
79 0.14
80 0.13
81 0.12
82 0.15
83 0.16
84 0.15
85 0.16
86 0.17
87 0.21
88 0.22
89 0.21
90 0.21
91 0.19
92 0.21
93 0.18
94 0.16
95 0.15
96 0.15
97 0.15
98 0.12
99 0.13
100 0.12
101 0.15
102 0.15
103 0.13
104 0.14
105 0.17
106 0.19
107 0.19
108 0.18
109 0.16
110 0.17
111 0.18
112 0.23
113 0.22
114 0.24
115 0.24
116 0.26
117 0.29
118 0.29
119 0.28
120 0.21
121 0.19
122 0.17
123 0.18
124 0.16
125 0.13
126 0.12
127 0.11
128 0.1
129 0.1
130 0.08
131 0.06
132 0.07
133 0.08
134 0.06
135 0.06
136 0.05
137 0.06
138 0.06
139 0.06
140 0.05
141 0.05
142 0.05
143 0.05
144 0.06
145 0.05
146 0.06
147 0.07
148 0.08
149 0.07
150 0.08
151 0.08
152 0.07
153 0.07
154 0.07
155 0.09
156 0.09
157 0.09
158 0.09
159 0.09
160 0.09
161 0.08
162 0.07
163 0.04
164 0.04
165 0.04
166 0.04
167 0.05
168 0.07
169 0.07
170 0.09
171 0.12
172 0.13
173 0.15
174 0.15
175 0.16
176 0.16
177 0.18
178 0.17
179 0.15
180 0.17
181 0.16
182 0.18
183 0.16
184 0.16
185 0.15
186 0.14
187 0.13
188 0.14
189 0.14
190 0.14
191 0.15
192 0.15
193 0.14
194 0.15
195 0.15
196 0.11
197 0.11
198 0.07
199 0.07
200 0.07
201 0.07
202 0.07
203 0.07
204 0.06
205 0.06
206 0.06
207 0.05
208 0.05
209 0.05
210 0.05
211 0.08
212 0.09
213 0.11
214 0.12
215 0.12
216 0.12
217 0.13
218 0.13
219 0.12
220 0.11
221 0.1
222 0.1
223 0.09
224 0.09
225 0.08
226 0.08
227 0.08
228 0.09
229 0.09
230 0.09
231 0.1
232 0.16
233 0.19
234 0.21
235 0.25
236 0.26
237 0.27
238 0.29
239 0.3
240 0.26
241 0.24
242 0.21
243 0.15
244 0.12
245 0.12
246 0.09
247 0.07
248 0.06
249 0.06
250 0.06
251 0.07
252 0.07
253 0.06
254 0.06
255 0.08
256 0.11
257 0.09
258 0.11
259 0.12
260 0.17
261 0.17
262 0.2
263 0.22
264 0.24
265 0.24
266 0.22
267 0.21
268 0.16
269 0.17
270 0.15
271 0.12
272 0.08
273 0.08
274 0.08
275 0.1
276 0.11
277 0.09
278 0.09
279 0.09
280 0.08
281 0.08
282 0.08
283 0.07
284 0.08
285 0.08
286 0.09
287 0.08
288 0.08
289 0.08
290 0.08
291 0.09
292 0.08
293 0.08
294 0.08
295 0.1
296 0.11
297 0.11
298 0.12
299 0.11
300 0.12
301 0.16
302 0.16
303 0.2
304 0.21
305 0.2
306 0.19
307 0.2
308 0.24
309 0.25
310 0.32
311 0.32
312 0.34
313 0.37
314 0.39
315 0.42
316 0.41
317 0.37
318 0.31
319 0.3
320 0.3
321 0.35
322 0.33
323 0.31
324 0.32
325 0.33
326 0.36
327 0.33
328 0.31
329 0.25
330 0.27
331 0.26
332 0.26
333 0.24
334 0.22
335 0.21
336 0.24
337 0.23
338 0.22
339 0.19
340 0.17
341 0.15
342 0.15
343 0.21
344 0.18
345 0.19
346 0.19
347 0.25
348 0.27
349 0.3
350 0.29
351 0.24
352 0.24
353 0.24
354 0.23
355 0.2
356 0.25
357 0.22
358 0.24
359 0.27
360 0.28
361 0.33
362 0.44
363 0.52
364 0.49
365 0.57
366 0.64
367 0.69
368 0.78
369 0.81
370 0.8
371 0.73
372 0.76
373 0.74
374 0.67
375 0.58
376 0.48
377 0.39
378 0.31
379 0.28
380 0.2
381 0.15
382 0.13
383 0.12
384 0.15
385 0.17
386 0.2
387 0.21
388 0.22
389 0.21
390 0.24
391 0.27
392 0.26
393 0.24
394 0.23
395 0.22
396 0.23
397 0.27
398 0.34
399 0.38
400 0.39
401 0.44
402 0.47
403 0.55
404 0.63
405 0.66
406 0.66
407 0.64
408 0.69
409 0.7
410 0.66
411 0.59
412 0.52
413 0.43
414 0.34
415 0.3
416 0.21
417 0.14