Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A010RR93

Protein Details
Accession A0A010RR93    Localization Confidence High Confidence Score 17.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
38-61PYNVAMPRRKVNKGKKPIKLTAPVHydrophilic
216-236FEEKTKAKTTKKRGRPSASSSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
45-54RRKVNKGKKP
219-250KTKAKTTKKRGRPSASSSTPPASSKRGKRNGH
Subcellular Location(s) nucl 21.5, cyto_nucl 12, mito 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR016197  Chromo-like_dom_sf  
IPR000953  Chromo/chromo_shadow_dom  
IPR023780  Chromo_domain  
IPR008251  Chromo_shadow_dom  
IPR023779  Chromodomain_CS  
Gene Ontology GO:0000792  C:heterochromatin  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:1901363  F:heterocyclic compound binding  
GO:0097159  F:organic cyclic compound binding  
GO:0006338  P:chromatin remodeling  
KEGG cfj:CFIO01_08234  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00385  Chromo  
PF01393  Chromo_shadow  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00598  CHROMO_1  
PS50013  CHROMO_2  
CDD cd00024  CD_CSD  
cd18657  CSD_Swi6  
Amino Acid Sequences MPPGKLSPLQNFTPRATSQVASRLRQYTSRRESSTNSPYNVAMPRRKVNKGKKPIKLTAPVAISDDEMSDAGGEIAIPLKEKRAKSRSAEYRDDVSEAKSEEDIPIISGDLNGSAIKPAKAAKPDSVVADEEDEEGDEDDDLEADEYVVEKILDHLASDDASAPLPLAGTVNFRVKWEGYSKKSDQTWEPEDSLKEGASEILEEYLRKLGGREALFEEKTKAKTTKKRGRPSASSSTPPASSKRGKRNGHPAESTPPVSAKEAKAKAWTLPSGSWEDDVESIDACEDEESGSIIIYLNWRNGQKTKHPKEVVYKRCPQKMLQFYEKHIRIIKAGPDADLPDLDAAPEAKM
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.44
2 0.41
3 0.39
4 0.35
5 0.31
6 0.37
7 0.41
8 0.37
9 0.43
10 0.42
11 0.41
12 0.48
13 0.51
14 0.52
15 0.55
16 0.6
17 0.58
18 0.58
19 0.61
20 0.62
21 0.66
22 0.62
23 0.55
24 0.49
25 0.46
26 0.47
27 0.48
28 0.47
29 0.43
30 0.43
31 0.5
32 0.55
33 0.63
34 0.69
35 0.73
36 0.76
37 0.8
38 0.83
39 0.84
40 0.85
41 0.85
42 0.83
43 0.8
44 0.72
45 0.68
46 0.6
47 0.51
48 0.44
49 0.37
50 0.29
51 0.21
52 0.18
53 0.12
54 0.1
55 0.09
56 0.07
57 0.06
58 0.05
59 0.05
60 0.04
61 0.03
62 0.05
63 0.06
64 0.07
65 0.07
66 0.14
67 0.2
68 0.23
69 0.33
70 0.37
71 0.44
72 0.48
73 0.59
74 0.63
75 0.64
76 0.68
77 0.61
78 0.6
79 0.54
80 0.5
81 0.4
82 0.31
83 0.26
84 0.21
85 0.18
86 0.15
87 0.14
88 0.12
89 0.12
90 0.11
91 0.09
92 0.08
93 0.07
94 0.07
95 0.06
96 0.06
97 0.05
98 0.06
99 0.05
100 0.05
101 0.07
102 0.08
103 0.08
104 0.09
105 0.12
106 0.15
107 0.19
108 0.22
109 0.22
110 0.25
111 0.26
112 0.26
113 0.26
114 0.23
115 0.19
116 0.17
117 0.15
118 0.12
119 0.1
120 0.09
121 0.07
122 0.07
123 0.06
124 0.05
125 0.04
126 0.04
127 0.04
128 0.04
129 0.04
130 0.03
131 0.03
132 0.03
133 0.04
134 0.04
135 0.04
136 0.04
137 0.03
138 0.04
139 0.06
140 0.06
141 0.05
142 0.06
143 0.06
144 0.06
145 0.06
146 0.06
147 0.05
148 0.05
149 0.05
150 0.05
151 0.04
152 0.04
153 0.04
154 0.04
155 0.04
156 0.05
157 0.08
158 0.11
159 0.11
160 0.11
161 0.13
162 0.13
163 0.14
164 0.19
165 0.24
166 0.25
167 0.31
168 0.33
169 0.36
170 0.37
171 0.37
172 0.34
173 0.34
174 0.34
175 0.3
176 0.3
177 0.27
178 0.26
179 0.25
180 0.23
181 0.16
182 0.12
183 0.09
184 0.08
185 0.06
186 0.06
187 0.05
188 0.05
189 0.06
190 0.06
191 0.06
192 0.07
193 0.07
194 0.07
195 0.07
196 0.08
197 0.14
198 0.14
199 0.16
200 0.19
201 0.23
202 0.24
203 0.24
204 0.25
205 0.23
206 0.24
207 0.27
208 0.28
209 0.32
210 0.41
211 0.51
212 0.59
213 0.65
214 0.73
215 0.79
216 0.82
217 0.81
218 0.79
219 0.78
220 0.72
221 0.66
222 0.59
223 0.52
224 0.45
225 0.4
226 0.35
227 0.32
228 0.36
229 0.41
230 0.49
231 0.56
232 0.58
233 0.64
234 0.72
235 0.74
236 0.73
237 0.67
238 0.6
239 0.56
240 0.56
241 0.5
242 0.4
243 0.32
244 0.27
245 0.26
246 0.27
247 0.24
248 0.29
249 0.3
250 0.31
251 0.34
252 0.34
253 0.34
254 0.35
255 0.34
256 0.27
257 0.25
258 0.26
259 0.26
260 0.25
261 0.23
262 0.19
263 0.18
264 0.16
265 0.17
266 0.14
267 0.1
268 0.09
269 0.08
270 0.08
271 0.07
272 0.06
273 0.05
274 0.05
275 0.05
276 0.06
277 0.06
278 0.06
279 0.06
280 0.06
281 0.06
282 0.1
283 0.12
284 0.14
285 0.18
286 0.2
287 0.24
288 0.29
289 0.35
290 0.42
291 0.51
292 0.57
293 0.63
294 0.65
295 0.67
296 0.73
297 0.78
298 0.78
299 0.76
300 0.77
301 0.75
302 0.79
303 0.76
304 0.7
305 0.7
306 0.69
307 0.69
308 0.69
309 0.64
310 0.63
311 0.71
312 0.68
313 0.63
314 0.58
315 0.51
316 0.45
317 0.46
318 0.45
319 0.42
320 0.41
321 0.37
322 0.34
323 0.34
324 0.32
325 0.27
326 0.23
327 0.16
328 0.15
329 0.13
330 0.13