Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A010QSM9

Protein Details
Accession A0A010QSM9    Localization Confidence High Confidence Score 22.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
81-105DFEESPRTSRKNPRKTPNKASDGRGHydrophilic
119-143ARDSAHKRGRGRPRKVEAAPRKAKHBasic
159-187SDAKRTPKTTPAKPRGRPSKKKADIDMNTHydrophilic
643-668PSPLVVSKRKSKKPIAEPSRRSKRVVHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
89-142SRKNPRKTPNKASDGRGASRAGTKRKSTTTARDSAHKRGRGRPRKVEAAPRKAK
163-180RTPKTTPAKPRGRPSKKK
650-666KRKSKKPIAEPSRRSKR
Subcellular Location(s) nucl 20.5, cyto_nucl 11.5, mito 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR017956  AT_hook_DNA-bd_motif  
IPR000116  HMGA  
IPR000637  HMGI/Y_DNA-bd_CS  
IPR032675  LRR_dom_sf  
Gene Ontology GO:0000785  C:chromatin  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0006355  P:regulation of DNA-templated transcription  
KEGG cfj:CFIO01_10703  -  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00354  HMGI_Y  
Amino Acid Sequences MASKRQATASRPRRNSAIATGSQSTANDRMRVTKAGARTSPNKLADGLQSKTRSSTRSHIQSYVGMESTDKEDSVADESEDFEESPRTSRKNPRKTPNKASDGRGASRAGTKRKSTTTARDSAHKRGRGRPRKVEAAPRKAKHDSSGESEDNGFEDEFSDAKRTPKTTPAKPRGRPSKKKADIDMNTTSPVIPNWLDPQIAHSIWVQIFQFAAVSGDEQDTLDVNWILHTARTCRQFADPALTVLYKCPPVRDETKAYGLAELLEKPPSQTTFNYRAKIEALHIDVRLVSLRGLTSPLKLMQNLPRLKEVLLVHGYDQAPFRKLKESIKWTYPDELFEAFEVSPTADGEAGEKTAITRLQSWQWSSRLMDKNWEASLARLQEVHQMPSFVSLRKLKFVNYQMPSIRLDKDPETNPELLAEDQKSVSLLANSILALPNLDDLVFESSTIITTSLFPLLPARLRRLELVNCAEVIADDFSLFLVTKGHQLQSLVLNHNRSLNLSFLTVLGTACPHLKELRMNLQYFSLLESSNDRLPSYDTLLLPNEVPSWPASLQVVHLENLRHWSSGAADTAAAEAFLQSLIDSAKELPDLRHISIKAMLSISWRSRVELRKSWQEKFERIFLRQSPDPKPHFTLQKPLPVEPSPLVVSKRKSKKPIAEPSRRSKRVVSHASGTSSRASSTSRGLRGQQLQPKSYAEPDSDEFDSDGDVDMEEPEEDSNECETDEATEGMAADRFVQGMCNVVDIHIDNQKPREHQYSMDDFLNDEQDFEVDDEWDSDMDYA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.64
2 0.62
3 0.59
4 0.56
5 0.49
6 0.49
7 0.47
8 0.43
9 0.4
10 0.36
11 0.32
12 0.32
13 0.32
14 0.29
15 0.28
16 0.33
17 0.35
18 0.38
19 0.38
20 0.36
21 0.38
22 0.43
23 0.46
24 0.47
25 0.5
26 0.55
27 0.59
28 0.56
29 0.51
30 0.45
31 0.43
32 0.45
33 0.45
34 0.4
35 0.39
36 0.39
37 0.39
38 0.43
39 0.43
40 0.37
41 0.37
42 0.42
43 0.44
44 0.51
45 0.54
46 0.52
47 0.51
48 0.52
49 0.5
50 0.46
51 0.37
52 0.27
53 0.23
54 0.22
55 0.23
56 0.2
57 0.16
58 0.13
59 0.12
60 0.14
61 0.17
62 0.16
63 0.13
64 0.12
65 0.14
66 0.14
67 0.15
68 0.14
69 0.11
70 0.13
71 0.13
72 0.18
73 0.22
74 0.26
75 0.33
76 0.44
77 0.54
78 0.63
79 0.72
80 0.78
81 0.83
82 0.88
83 0.91
84 0.91
85 0.9
86 0.85
87 0.8
88 0.78
89 0.73
90 0.66
91 0.59
92 0.49
93 0.41
94 0.43
95 0.45
96 0.44
97 0.44
98 0.46
99 0.49
100 0.53
101 0.58
102 0.58
103 0.61
104 0.6
105 0.62
106 0.59
107 0.62
108 0.62
109 0.66
110 0.68
111 0.64
112 0.62
113 0.63
114 0.72
115 0.74
116 0.79
117 0.79
118 0.77
119 0.8
120 0.81
121 0.82
122 0.81
123 0.82
124 0.82
125 0.74
126 0.74
127 0.69
128 0.65
129 0.59
130 0.56
131 0.49
132 0.46
133 0.5
134 0.44
135 0.4
136 0.39
137 0.34
138 0.27
139 0.24
140 0.17
141 0.09
142 0.09
143 0.09
144 0.08
145 0.09
146 0.12
147 0.12
148 0.16
149 0.2
150 0.22
151 0.24
152 0.33
153 0.41
154 0.48
155 0.57
156 0.64
157 0.71
158 0.75
159 0.83
160 0.85
161 0.87
162 0.88
163 0.86
164 0.87
165 0.86
166 0.85
167 0.81
168 0.81
169 0.74
170 0.7
171 0.67
172 0.57
173 0.49
174 0.42
175 0.35
176 0.25
177 0.21
178 0.17
179 0.12
180 0.12
181 0.14
182 0.15
183 0.16
184 0.15
185 0.18
186 0.2
187 0.19
188 0.19
189 0.16
190 0.18
191 0.17
192 0.2
193 0.17
194 0.12
195 0.12
196 0.11
197 0.11
198 0.07
199 0.08
200 0.05
201 0.06
202 0.06
203 0.07
204 0.07
205 0.07
206 0.07
207 0.07
208 0.07
209 0.08
210 0.07
211 0.07
212 0.07
213 0.07
214 0.07
215 0.08
216 0.1
217 0.12
218 0.17
219 0.22
220 0.23
221 0.24
222 0.26
223 0.28
224 0.28
225 0.31
226 0.26
227 0.23
228 0.23
229 0.22
230 0.2
231 0.17
232 0.19
233 0.17
234 0.16
235 0.17
236 0.16
237 0.22
238 0.26
239 0.3
240 0.34
241 0.33
242 0.37
243 0.37
244 0.36
245 0.31
246 0.26
247 0.22
248 0.17
249 0.14
250 0.11
251 0.11
252 0.11
253 0.11
254 0.13
255 0.14
256 0.15
257 0.16
258 0.22
259 0.3
260 0.36
261 0.38
262 0.36
263 0.36
264 0.34
265 0.33
266 0.28
267 0.21
268 0.19
269 0.19
270 0.18
271 0.17
272 0.16
273 0.15
274 0.14
275 0.11
276 0.07
277 0.06
278 0.06
279 0.06
280 0.09
281 0.09
282 0.09
283 0.11
284 0.14
285 0.15
286 0.15
287 0.19
288 0.23
289 0.31
290 0.33
291 0.33
292 0.32
293 0.32
294 0.31
295 0.33
296 0.27
297 0.23
298 0.22
299 0.2
300 0.19
301 0.23
302 0.23
303 0.18
304 0.2
305 0.16
306 0.17
307 0.17
308 0.18
309 0.18
310 0.21
311 0.26
312 0.32
313 0.38
314 0.41
315 0.45
316 0.47
317 0.44
318 0.46
319 0.4
320 0.33
321 0.27
322 0.23
323 0.18
324 0.15
325 0.15
326 0.1
327 0.1
328 0.09
329 0.07
330 0.06
331 0.06
332 0.06
333 0.04
334 0.04
335 0.05
336 0.05
337 0.05
338 0.05
339 0.05
340 0.05
341 0.06
342 0.07
343 0.07
344 0.08
345 0.1
346 0.14
347 0.17
348 0.19
349 0.21
350 0.22
351 0.23
352 0.22
353 0.29
354 0.31
355 0.29
356 0.33
357 0.3
358 0.32
359 0.29
360 0.3
361 0.21
362 0.16
363 0.19
364 0.15
365 0.14
366 0.11
367 0.12
368 0.18
369 0.19
370 0.2
371 0.16
372 0.16
373 0.15
374 0.19
375 0.19
376 0.13
377 0.16
378 0.19
379 0.19
380 0.22
381 0.23
382 0.21
383 0.26
384 0.3
385 0.34
386 0.32
387 0.35
388 0.33
389 0.34
390 0.35
391 0.3
392 0.27
393 0.2
394 0.21
395 0.18
396 0.22
397 0.22
398 0.24
399 0.25
400 0.23
401 0.22
402 0.2
403 0.19
404 0.15
405 0.15
406 0.12
407 0.1
408 0.09
409 0.09
410 0.09
411 0.08
412 0.08
413 0.06
414 0.06
415 0.05
416 0.06
417 0.06
418 0.06
419 0.06
420 0.05
421 0.05
422 0.05
423 0.05
424 0.04
425 0.04
426 0.04
427 0.04
428 0.07
429 0.07
430 0.07
431 0.07
432 0.07
433 0.07
434 0.08
435 0.07
436 0.04
437 0.05
438 0.06
439 0.07
440 0.07
441 0.07
442 0.08
443 0.09
444 0.13
445 0.14
446 0.17
447 0.18
448 0.2
449 0.21
450 0.24
451 0.25
452 0.26
453 0.28
454 0.24
455 0.22
456 0.21
457 0.19
458 0.15
459 0.13
460 0.09
461 0.05
462 0.04
463 0.04
464 0.04
465 0.05
466 0.05
467 0.04
468 0.05
469 0.05
470 0.09
471 0.11
472 0.12
473 0.12
474 0.13
475 0.14
476 0.18
477 0.22
478 0.23
479 0.24
480 0.25
481 0.25
482 0.27
483 0.25
484 0.21
485 0.18
486 0.15
487 0.13
488 0.12
489 0.12
490 0.09
491 0.1
492 0.09
493 0.08
494 0.07
495 0.06
496 0.06
497 0.07
498 0.07
499 0.08
500 0.09
501 0.11
502 0.14
503 0.18
504 0.27
505 0.3
506 0.31
507 0.3
508 0.3
509 0.29
510 0.26
511 0.23
512 0.15
513 0.1
514 0.1
515 0.12
516 0.14
517 0.16
518 0.16
519 0.15
520 0.14
521 0.16
522 0.18
523 0.19
524 0.2
525 0.18
526 0.19
527 0.21
528 0.21
529 0.18
530 0.17
531 0.14
532 0.11
533 0.11
534 0.09
535 0.11
536 0.11
537 0.11
538 0.11
539 0.1
540 0.11
541 0.15
542 0.16
543 0.13
544 0.15
545 0.15
546 0.15
547 0.2
548 0.2
549 0.16
550 0.15
551 0.15
552 0.15
553 0.16
554 0.16
555 0.11
556 0.1
557 0.1
558 0.11
559 0.1
560 0.07
561 0.05
562 0.04
563 0.04
564 0.04
565 0.04
566 0.03
567 0.04
568 0.04
569 0.04
570 0.05
571 0.06
572 0.07
573 0.08
574 0.09
575 0.09
576 0.17
577 0.2
578 0.21
579 0.26
580 0.26
581 0.26
582 0.3
583 0.3
584 0.23
585 0.21
586 0.2
587 0.17
588 0.23
589 0.23
590 0.25
591 0.24
592 0.25
593 0.31
594 0.39
595 0.44
596 0.47
597 0.51
598 0.56
599 0.62
600 0.64
601 0.65
602 0.63
603 0.62
604 0.57
605 0.6
606 0.54
607 0.51
608 0.53
609 0.49
610 0.5
611 0.47
612 0.5
613 0.48
614 0.52
615 0.54
616 0.53
617 0.54
618 0.54
619 0.58
620 0.54
621 0.57
622 0.53
623 0.57
624 0.55
625 0.51
626 0.51
627 0.43
628 0.44
629 0.35
630 0.34
631 0.27
632 0.27
633 0.3
634 0.3
635 0.34
636 0.4
637 0.5
638 0.55
639 0.61
640 0.67
641 0.73
642 0.78
643 0.83
644 0.84
645 0.85
646 0.85
647 0.88
648 0.9
649 0.83
650 0.76
651 0.71
652 0.69
653 0.68
654 0.69
655 0.63
656 0.58
657 0.58
658 0.6
659 0.55
660 0.48
661 0.4
662 0.32
663 0.27
664 0.22
665 0.21
666 0.18
667 0.25
668 0.3
669 0.32
670 0.34
671 0.37
672 0.44
673 0.49
674 0.55
675 0.55
676 0.55
677 0.53
678 0.52
679 0.52
680 0.47
681 0.44
682 0.39
683 0.32
684 0.3
685 0.3
686 0.32
687 0.3
688 0.28
689 0.24
690 0.21
691 0.19
692 0.15
693 0.13
694 0.08
695 0.08
696 0.07
697 0.07
698 0.08
699 0.07
700 0.08
701 0.07
702 0.08
703 0.08
704 0.1
705 0.11
706 0.1
707 0.1
708 0.1
709 0.1
710 0.11
711 0.12
712 0.11
713 0.09
714 0.1
715 0.1
716 0.11
717 0.11
718 0.09
719 0.08
720 0.08
721 0.09
722 0.08
723 0.09
724 0.09
725 0.12
726 0.12
727 0.12
728 0.12
729 0.12
730 0.14
731 0.14
732 0.18
733 0.2
734 0.22
735 0.24
736 0.29
737 0.35
738 0.36
739 0.41
740 0.45
741 0.41
742 0.43
743 0.48
744 0.5
745 0.49
746 0.48
747 0.42
748 0.36
749 0.36
750 0.37
751 0.28
752 0.21
753 0.17
754 0.15
755 0.16
756 0.16
757 0.14
758 0.09
759 0.1
760 0.1
761 0.11
762 0.11