Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A010RTW3

Protein Details
Accession A0A010RTW3    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-21MPSHPSSRRRRRDIEDDDSEPBasic
25-44GSEGTKRPRLSRRANDSEDDHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 23.5, cyto_nucl 13.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR027417  P-loop_NTPase  
IPR003395  RecF/RecN/SMC_N  
IPR027131  SMC5  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0030915  C:Smc5-Smc6 complex  
GO:0005524  F:ATP binding  
GO:0016887  F:ATP hydrolysis activity  
GO:0000724  P:double-strand break repair via homologous recombination  
KEGG cfj:CFIO01_10322  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF02463  SMC_N  
Amino Acid Sequences MPSHPSSRRRRRDIEDDDSEPRSDGSEGTKRPRLSRRANDSEDDDDHELPNGSRTNGSKSTSSRGDEDSFSPGAIRRVKVENFVTYELAEFFPGPNLNMVIGPNGTGKSSLVCAICLGLGFSPKHLGRAGNVKEFVKHGKPSAVIEIELQRRPEDRSHHVIRVQIDRERNSQKWWLNGKDSSHKAIQGLMRDLKIQVDNLCQFLPQDRVVEFASATPIDLLHETLRAAAPQQMLDWQRSLQDLHKDRKELQRGTDSAGDHLKQLEDRQNYMQHDVDRLREREEALQKIVDLTDARAVADYLESKALYKEKRQQEKLAQKNLRKLEHEAAPSLQAVNQKQVYHEKVSAVVRSRKEALRRTEAAADASLSKIEDIDEQVKTIEGNIESSKKGFESKKQELGKIRSKIGLLENQKKNKPAEFNATEHNTQIREKEHQLRELEAESRQAEGKLRDIKEQGHAKTHMKQALNRELEGLHSQQGQMLSFIQKKWPDVAKGYAWLQENADKFEKEVFGPPALCCSVKDERYSDQIQALLHNDDFLCFTAQTREDHKKLSHYLYKVMSLSVNVRSILKPLHEFRPKMSRDEANALGLDTFALDMITGPEPVLAMLCNEKKIDASGIALKDINDAQYDRIVQGEVINNWSTGRQLYRVSRRKDLGPGAVSTMTRGIQQGMFWTDQPVDEAEKSEIKRKISEVEAEFDALKAQNTEVRGQMAGFNDRRNEIHDDLKTLKERKNELQRAHNAYQAIPVKLESEKRALDQKKAEVEEARSAIQQLGFDIDKAAILKAKTTLQHHAAIAGVRAAQEALLEAQIREIEAKSDVQGLKARNNELVQMLEDEKRNIAALTQDSQRTRQRAEDAQGKVIEIFAQDETRKDLLESLAKDKSVEDVENEIAAEQHTIEQIHVANPGALREFEMRAREIEKLRSKMESTTAKLDHLNRQITKIREKWEPQLDALISKINDAFSYNFEQINCAGEIRVHKDEDFDQWALDIMVKFRENETLQQLNQHRQSGGERAVSTIFYLMALQSMAQSPFRVVDEINQGMDPRNERMVHERMVEIACREHTSQYFLITPKLLTGLRYDPRMRVLCIASGTHMPKEGKKLDFARCLKRHKQLTAGA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.84
2 0.81
3 0.75
4 0.71
5 0.65
6 0.57
7 0.46
8 0.37
9 0.29
10 0.22
11 0.18
12 0.21
13 0.27
14 0.32
15 0.4
16 0.47
17 0.49
18 0.56
19 0.64
20 0.67
21 0.69
22 0.73
23 0.76
24 0.79
25 0.8
26 0.77
27 0.72
28 0.69
29 0.6
30 0.54
31 0.47
32 0.39
33 0.34
34 0.31
35 0.27
36 0.21
37 0.24
38 0.21
39 0.19
40 0.22
41 0.24
42 0.3
43 0.34
44 0.37
45 0.38
46 0.39
47 0.46
48 0.47
49 0.48
50 0.44
51 0.43
52 0.44
53 0.41
54 0.39
55 0.36
56 0.3
57 0.27
58 0.25
59 0.22
60 0.26
61 0.29
62 0.28
63 0.27
64 0.34
65 0.36
66 0.42
67 0.43
68 0.42
69 0.41
70 0.42
71 0.39
72 0.32
73 0.31
74 0.26
75 0.22
76 0.17
77 0.13
78 0.11
79 0.14
80 0.15
81 0.14
82 0.14
83 0.14
84 0.14
85 0.14
86 0.14
87 0.13
88 0.12
89 0.12
90 0.13
91 0.13
92 0.12
93 0.12
94 0.12
95 0.11
96 0.13
97 0.16
98 0.14
99 0.14
100 0.14
101 0.14
102 0.13
103 0.12
104 0.11
105 0.08
106 0.12
107 0.12
108 0.13
109 0.2
110 0.2
111 0.23
112 0.24
113 0.24
114 0.23
115 0.33
116 0.38
117 0.38
118 0.41
119 0.4
120 0.39
121 0.41
122 0.44
123 0.4
124 0.39
125 0.34
126 0.35
127 0.36
128 0.37
129 0.41
130 0.35
131 0.3
132 0.29
133 0.34
134 0.35
135 0.36
136 0.34
137 0.29
138 0.3
139 0.33
140 0.36
141 0.35
142 0.37
143 0.43
144 0.48
145 0.51
146 0.52
147 0.53
148 0.52
149 0.53
150 0.5
151 0.47
152 0.48
153 0.46
154 0.51
155 0.55
156 0.52
157 0.49
158 0.53
159 0.51
160 0.53
161 0.58
162 0.56
163 0.55
164 0.57
165 0.58
166 0.59
167 0.59
168 0.55
169 0.49
170 0.45
171 0.39
172 0.39
173 0.37
174 0.32
175 0.34
176 0.33
177 0.31
178 0.3
179 0.3
180 0.29
181 0.27
182 0.24
183 0.2
184 0.23
185 0.24
186 0.25
187 0.24
188 0.21
189 0.2
190 0.21
191 0.23
192 0.17
193 0.18
194 0.16
195 0.19
196 0.2
197 0.2
198 0.17
199 0.14
200 0.15
201 0.12
202 0.12
203 0.1
204 0.09
205 0.09
206 0.1
207 0.11
208 0.08
209 0.09
210 0.09
211 0.1
212 0.11
213 0.1
214 0.1
215 0.13
216 0.13
217 0.12
218 0.13
219 0.18
220 0.19
221 0.21
222 0.21
223 0.18
224 0.18
225 0.19
226 0.21
227 0.2
228 0.28
229 0.33
230 0.41
231 0.45
232 0.47
233 0.51
234 0.59
235 0.63
236 0.57
237 0.55
238 0.55
239 0.51
240 0.52
241 0.52
242 0.42
243 0.36
244 0.37
245 0.31
246 0.23
247 0.23
248 0.2
249 0.16
250 0.2
251 0.25
252 0.24
253 0.27
254 0.3
255 0.35
256 0.36
257 0.39
258 0.37
259 0.3
260 0.33
261 0.32
262 0.34
263 0.35
264 0.35
265 0.34
266 0.33
267 0.33
268 0.36
269 0.4
270 0.37
271 0.32
272 0.31
273 0.28
274 0.27
275 0.25
276 0.19
277 0.13
278 0.11
279 0.12
280 0.12
281 0.12
282 0.11
283 0.11
284 0.09
285 0.1
286 0.1
287 0.08
288 0.09
289 0.09
290 0.09
291 0.12
292 0.17
293 0.19
294 0.25
295 0.34
296 0.42
297 0.53
298 0.57
299 0.62
300 0.67
301 0.74
302 0.76
303 0.78
304 0.76
305 0.71
306 0.74
307 0.74
308 0.68
309 0.6
310 0.57
311 0.52
312 0.5
313 0.47
314 0.4
315 0.34
316 0.31
317 0.28
318 0.23
319 0.19
320 0.18
321 0.17
322 0.2
323 0.23
324 0.22
325 0.24
326 0.31
327 0.32
328 0.31
329 0.32
330 0.27
331 0.29
332 0.3
333 0.32
334 0.32
335 0.34
336 0.32
337 0.34
338 0.37
339 0.36
340 0.42
341 0.45
342 0.46
343 0.47
344 0.48
345 0.47
346 0.47
347 0.43
348 0.37
349 0.3
350 0.24
351 0.16
352 0.14
353 0.12
354 0.08
355 0.07
356 0.06
357 0.06
358 0.06
359 0.09
360 0.12
361 0.11
362 0.12
363 0.12
364 0.12
365 0.11
366 0.11
367 0.11
368 0.07
369 0.1
370 0.11
371 0.13
372 0.14
373 0.14
374 0.14
375 0.12
376 0.18
377 0.19
378 0.25
379 0.32
380 0.38
381 0.47
382 0.49
383 0.54
384 0.55
385 0.6
386 0.61
387 0.56
388 0.51
389 0.45
390 0.42
391 0.4
392 0.35
393 0.36
394 0.34
395 0.41
396 0.46
397 0.51
398 0.53
399 0.55
400 0.53
401 0.5
402 0.48
403 0.42
404 0.44
405 0.41
406 0.4
407 0.42
408 0.44
409 0.4
410 0.35
411 0.33
412 0.25
413 0.22
414 0.22
415 0.19
416 0.19
417 0.24
418 0.33
419 0.35
420 0.38
421 0.39
422 0.37
423 0.36
424 0.34
425 0.3
426 0.21
427 0.21
428 0.15
429 0.15
430 0.14
431 0.13
432 0.15
433 0.14
434 0.19
435 0.24
436 0.25
437 0.27
438 0.28
439 0.29
440 0.34
441 0.4
442 0.35
443 0.33
444 0.35
445 0.35
446 0.39
447 0.43
448 0.4
449 0.36
450 0.37
451 0.4
452 0.46
453 0.44
454 0.39
455 0.34
456 0.29
457 0.28
458 0.27
459 0.21
460 0.13
461 0.11
462 0.11
463 0.12
464 0.13
465 0.11
466 0.09
467 0.09
468 0.12
469 0.13
470 0.14
471 0.17
472 0.18
473 0.18
474 0.22
475 0.24
476 0.23
477 0.23
478 0.26
479 0.23
480 0.24
481 0.24
482 0.24
483 0.22
484 0.2
485 0.19
486 0.19
487 0.19
488 0.2
489 0.21
490 0.16
491 0.16
492 0.17
493 0.17
494 0.13
495 0.16
496 0.14
497 0.14
498 0.15
499 0.14
500 0.15
501 0.15
502 0.15
503 0.11
504 0.15
505 0.19
506 0.2
507 0.22
508 0.22
509 0.23
510 0.28
511 0.29
512 0.24
513 0.2
514 0.2
515 0.18
516 0.17
517 0.16
518 0.13
519 0.11
520 0.11
521 0.1
522 0.08
523 0.09
524 0.08
525 0.07
526 0.06
527 0.07
528 0.09
529 0.1
530 0.12
531 0.17
532 0.22
533 0.23
534 0.26
535 0.27
536 0.28
537 0.3
538 0.34
539 0.34
540 0.29
541 0.32
542 0.3
543 0.31
544 0.27
545 0.24
546 0.19
547 0.14
548 0.15
549 0.12
550 0.12
551 0.11
552 0.12
553 0.11
554 0.12
555 0.13
556 0.12
557 0.14
558 0.16
559 0.24
560 0.28
561 0.29
562 0.3
563 0.39
564 0.39
565 0.38
566 0.39
567 0.33
568 0.31
569 0.35
570 0.33
571 0.24
572 0.23
573 0.2
574 0.16
575 0.13
576 0.1
577 0.05
578 0.04
579 0.03
580 0.02
581 0.02
582 0.02
583 0.04
584 0.05
585 0.05
586 0.05
587 0.05
588 0.05
589 0.05
590 0.05
591 0.03
592 0.04
593 0.07
594 0.08
595 0.09
596 0.1
597 0.1
598 0.1
599 0.1
600 0.11
601 0.07
602 0.08
603 0.11
604 0.11
605 0.12
606 0.12
607 0.12
608 0.12
609 0.12
610 0.11
611 0.08
612 0.08
613 0.08
614 0.09
615 0.09
616 0.08
617 0.08
618 0.08
619 0.07
620 0.09
621 0.11
622 0.1
623 0.12
624 0.12
625 0.12
626 0.12
627 0.12
628 0.1
629 0.09
630 0.09
631 0.09
632 0.13
633 0.2
634 0.31
635 0.39
636 0.43
637 0.48
638 0.49
639 0.49
640 0.51
641 0.47
642 0.42
643 0.35
644 0.31
645 0.27
646 0.27
647 0.24
648 0.19
649 0.16
650 0.12
651 0.1
652 0.1
653 0.09
654 0.08
655 0.08
656 0.1
657 0.11
658 0.12
659 0.11
660 0.12
661 0.11
662 0.11
663 0.12
664 0.1
665 0.1
666 0.09
667 0.11
668 0.11
669 0.15
670 0.16
671 0.23
672 0.26
673 0.25
674 0.27
675 0.27
676 0.29
677 0.27
678 0.32
679 0.26
680 0.26
681 0.25
682 0.24
683 0.22
684 0.19
685 0.17
686 0.11
687 0.1
688 0.07
689 0.07
690 0.08
691 0.1
692 0.11
693 0.11
694 0.12
695 0.12
696 0.12
697 0.14
698 0.14
699 0.18
700 0.18
701 0.2
702 0.2
703 0.22
704 0.22
705 0.23
706 0.26
707 0.23
708 0.28
709 0.26
710 0.28
711 0.29
712 0.33
713 0.35
714 0.34
715 0.35
716 0.35
717 0.39
718 0.44
719 0.53
720 0.56
721 0.55
722 0.6
723 0.64
724 0.67
725 0.63
726 0.58
727 0.47
728 0.4
729 0.42
730 0.36
731 0.29
732 0.21
733 0.19
734 0.18
735 0.2
736 0.23
737 0.18
738 0.19
739 0.19
740 0.21
741 0.3
742 0.31
743 0.34
744 0.36
745 0.38
746 0.4
747 0.41
748 0.41
749 0.35
750 0.35
751 0.34
752 0.31
753 0.27
754 0.21
755 0.2
756 0.19
757 0.17
758 0.14
759 0.09
760 0.11
761 0.1
762 0.1
763 0.1
764 0.09
765 0.08
766 0.09
767 0.09
768 0.09
769 0.09
770 0.1
771 0.11
772 0.14
773 0.18
774 0.21
775 0.26
776 0.27
777 0.3
778 0.29
779 0.27
780 0.25
781 0.22
782 0.19
783 0.14
784 0.11
785 0.08
786 0.08
787 0.07
788 0.06
789 0.05
790 0.05
791 0.05
792 0.06
793 0.06
794 0.06
795 0.07
796 0.07
797 0.07
798 0.08
799 0.07
800 0.07
801 0.08
802 0.09
803 0.09
804 0.15
805 0.15
806 0.17
807 0.21
808 0.22
809 0.26
810 0.29
811 0.3
812 0.28
813 0.28
814 0.27
815 0.24
816 0.23
817 0.18
818 0.17
819 0.18
820 0.17
821 0.18
822 0.17
823 0.16
824 0.15
825 0.15
826 0.12
827 0.11
828 0.11
829 0.13
830 0.15
831 0.19
832 0.23
833 0.25
834 0.3
835 0.36
836 0.36
837 0.36
838 0.37
839 0.39
840 0.4
841 0.45
842 0.48
843 0.44
844 0.45
845 0.44
846 0.39
847 0.33
848 0.27
849 0.22
850 0.14
851 0.13
852 0.09
853 0.12
854 0.12
855 0.13
856 0.17
857 0.17
858 0.17
859 0.16
860 0.17
861 0.16
862 0.22
863 0.24
864 0.24
865 0.26
866 0.26
867 0.26
868 0.24
869 0.24
870 0.21
871 0.19
872 0.16
873 0.17
874 0.17
875 0.17
876 0.17
877 0.14
878 0.11
879 0.11
880 0.09
881 0.06
882 0.06
883 0.07
884 0.08
885 0.08
886 0.1
887 0.1
888 0.11
889 0.12
890 0.11
891 0.11
892 0.11
893 0.13
894 0.12
895 0.11
896 0.13
897 0.14
898 0.16
899 0.17
900 0.2
901 0.2
902 0.21
903 0.23
904 0.26
905 0.27
906 0.34
907 0.39
908 0.41
909 0.42
910 0.43
911 0.43
912 0.4
913 0.44
914 0.42
915 0.38
916 0.42
917 0.41
918 0.39
919 0.42
920 0.44
921 0.44
922 0.45
923 0.49
924 0.42
925 0.47
926 0.51
927 0.52
928 0.57
929 0.54
930 0.51
931 0.52
932 0.55
933 0.59
934 0.61
935 0.59
936 0.51
937 0.51
938 0.47
939 0.39
940 0.35
941 0.31
942 0.22
943 0.2
944 0.2
945 0.14
946 0.14
947 0.15
948 0.16
949 0.14
950 0.2
951 0.21
952 0.22
953 0.21
954 0.23
955 0.21
956 0.23
957 0.2
958 0.15
959 0.13
960 0.14
961 0.18
962 0.23
963 0.26
964 0.25
965 0.25
966 0.27
967 0.29
968 0.31
969 0.33
970 0.27
971 0.23
972 0.21
973 0.21
974 0.18
975 0.19
976 0.15
977 0.1
978 0.15
979 0.16
980 0.17
981 0.17
982 0.24
983 0.23
984 0.27
985 0.33
986 0.34
987 0.34
988 0.41
989 0.46
990 0.48
991 0.51
992 0.49
993 0.42
994 0.39
995 0.42
996 0.4
997 0.4
998 0.36
999 0.31
1000 0.3
1001 0.31
1002 0.28
1003 0.25
1004 0.19
1005 0.14
1006 0.09
1007 0.1
1008 0.08
1009 0.07
1010 0.07
1011 0.07
1012 0.07
1013 0.1
1014 0.12
1015 0.12
1016 0.13
1017 0.13
1018 0.15
1019 0.17
1020 0.17
1021 0.14
1022 0.18
1023 0.25
1024 0.26
1025 0.26
1026 0.25
1027 0.24
1028 0.26
1029 0.3
1030 0.27
1031 0.23
1032 0.28
1033 0.27
1034 0.3
1035 0.36
1036 0.38
1037 0.38
1038 0.37
1039 0.34
1040 0.31
1041 0.33
1042 0.32
1043 0.26
1044 0.25
1045 0.23
1046 0.24
1047 0.25
1048 0.26
1049 0.26
1050 0.3
1051 0.29
1052 0.28
1053 0.31
1054 0.29
1055 0.3
1056 0.27
1057 0.26
1058 0.21
1059 0.24
1060 0.22
1061 0.18
1062 0.22
1063 0.27
1064 0.3
1065 0.37
1066 0.39
1067 0.38
1068 0.45
1069 0.48
1070 0.45
1071 0.42
1072 0.4
1073 0.36
1074 0.36
1075 0.34
1076 0.29
1077 0.32
1078 0.33
1079 0.29
1080 0.33
1081 0.32
1082 0.34
1083 0.42
1084 0.46
1085 0.42
1086 0.47
1087 0.53
1088 0.55
1089 0.63
1090 0.66
1091 0.68
1092 0.69
1093 0.76
1094 0.77
1095 0.79
1096 0.79
1097 0.75