Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A010RJ85

Protein Details
Accession A0A010RJ85    Localization Confidence High Confidence Score 22.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
27-50TTQPDKMAKVKKSEKKVKAEATSTHydrophilic
339-364TYRANNRGGKKEKKEPNKPFSRIPDVHydrophilic
389-416LIVTKGKGFTKEKNKKKRGAYRGGLIDIHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
168-179PKPKAKQSLKRK
295-299KKAKK
345-355RGGKKEKKEPN
395-410KGFTKEKNKKKRGAYR
Subcellular Location(s) nucl 22.5, cyto_nucl 14.5, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007718  Srp40_C  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
KEGG cfj:CFIO01_10257  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF05022  SRP40_C  
Amino Acid Sequences MSAPPSWLFSNNFTKPNNTSTPTASATTQPDKMAKVKKSEKKVKAEATSTKQAPPAQLMDLVDSFLSENAFTSAHEAFQKQRAKSGWKPSKKEAAQTNLVTVFQTWQTSSTAPTTSESSSDSSSSEDVDMADAAAAADSDSDSSSSSSSSSSSDSDSSSDSESEDEKPKPKAKQSLKRKAPESDSSSSDSSSSSDSDSSSDDSSSEDEAPKAKKQRVKKDDSSSSSDSSSDSSSDSSSESDSSSDSDSSDSDSDSDSDGSEAAKVPLPESGSDSDSDSSSSSSDSDSDSDADTKKKAKKEKASADSASLSSATLEKTSPELKPATSTAADPPLPPDPMTYRANNRGGKKEKKEPNKPFSRIPDVVYVDPRFASNEYVPNDYSQRAHEDLIVTKGKGFTKEKNKKKRGAYRGGLIDISSKKGIKFD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.49
2 0.48
3 0.52
4 0.52
5 0.47
6 0.44
7 0.42
8 0.46
9 0.43
10 0.42
11 0.36
12 0.34
13 0.37
14 0.39
15 0.37
16 0.35
17 0.35
18 0.36
19 0.43
20 0.47
21 0.45
22 0.5
23 0.58
24 0.64
25 0.72
26 0.79
27 0.8
28 0.81
29 0.85
30 0.84
31 0.8
32 0.79
33 0.77
34 0.74
35 0.74
36 0.67
37 0.6
38 0.56
39 0.51
40 0.46
41 0.41
42 0.36
43 0.28
44 0.29
45 0.26
46 0.24
47 0.22
48 0.2
49 0.16
50 0.13
51 0.12
52 0.09
53 0.09
54 0.06
55 0.07
56 0.07
57 0.08
58 0.07
59 0.11
60 0.1
61 0.12
62 0.14
63 0.15
64 0.18
65 0.26
66 0.33
67 0.3
68 0.36
69 0.39
70 0.45
71 0.51
72 0.59
73 0.62
74 0.64
75 0.7
76 0.71
77 0.77
78 0.71
79 0.71
80 0.68
81 0.64
82 0.62
83 0.56
84 0.53
85 0.43
86 0.41
87 0.33
88 0.26
89 0.2
90 0.14
91 0.14
92 0.11
93 0.11
94 0.13
95 0.13
96 0.15
97 0.15
98 0.15
99 0.15
100 0.16
101 0.17
102 0.16
103 0.17
104 0.17
105 0.16
106 0.16
107 0.16
108 0.15
109 0.13
110 0.13
111 0.13
112 0.11
113 0.1
114 0.08
115 0.08
116 0.08
117 0.06
118 0.06
119 0.05
120 0.04
121 0.04
122 0.03
123 0.03
124 0.03
125 0.03
126 0.03
127 0.04
128 0.04
129 0.05
130 0.05
131 0.06
132 0.06
133 0.07
134 0.07
135 0.07
136 0.08
137 0.09
138 0.1
139 0.11
140 0.12
141 0.12
142 0.12
143 0.13
144 0.13
145 0.12
146 0.12
147 0.1
148 0.1
149 0.11
150 0.14
151 0.17
152 0.19
153 0.21
154 0.27
155 0.32
156 0.36
157 0.4
158 0.47
159 0.53
160 0.61
161 0.69
162 0.75
163 0.78
164 0.8
165 0.78
166 0.73
167 0.68
168 0.65
169 0.6
170 0.52
171 0.46
172 0.42
173 0.39
174 0.34
175 0.28
176 0.21
177 0.15
178 0.13
179 0.11
180 0.08
181 0.08
182 0.08
183 0.09
184 0.1
185 0.1
186 0.1
187 0.09
188 0.08
189 0.09
190 0.09
191 0.1
192 0.1
193 0.09
194 0.09
195 0.12
196 0.14
197 0.17
198 0.22
199 0.25
200 0.3
201 0.38
202 0.49
203 0.55
204 0.62
205 0.65
206 0.69
207 0.72
208 0.71
209 0.69
210 0.61
211 0.53
212 0.45
213 0.37
214 0.29
215 0.22
216 0.18
217 0.11
218 0.09
219 0.08
220 0.08
221 0.08
222 0.09
223 0.08
224 0.08
225 0.08
226 0.08
227 0.08
228 0.08
229 0.08
230 0.09
231 0.09
232 0.08
233 0.08
234 0.08
235 0.1
236 0.1
237 0.09
238 0.08
239 0.08
240 0.09
241 0.09
242 0.09
243 0.07
244 0.07
245 0.07
246 0.06
247 0.06
248 0.07
249 0.07
250 0.08
251 0.08
252 0.08
253 0.1
254 0.11
255 0.11
256 0.13
257 0.14
258 0.13
259 0.14
260 0.15
261 0.14
262 0.13
263 0.13
264 0.11
265 0.09
266 0.09
267 0.09
268 0.07
269 0.07
270 0.08
271 0.08
272 0.09
273 0.09
274 0.1
275 0.1
276 0.13
277 0.14
278 0.15
279 0.16
280 0.23
281 0.28
282 0.34
283 0.42
284 0.49
285 0.58
286 0.67
287 0.75
288 0.75
289 0.76
290 0.7
291 0.64
292 0.57
293 0.46
294 0.36
295 0.26
296 0.19
297 0.12
298 0.12
299 0.09
300 0.08
301 0.08
302 0.08
303 0.11
304 0.15
305 0.14
306 0.17
307 0.18
308 0.18
309 0.21
310 0.21
311 0.22
312 0.2
313 0.21
314 0.2
315 0.24
316 0.24
317 0.21
318 0.23
319 0.23
320 0.23
321 0.22
322 0.22
323 0.2
324 0.25
325 0.29
326 0.3
327 0.34
328 0.41
329 0.49
330 0.52
331 0.54
332 0.59
333 0.65
334 0.7
335 0.7
336 0.73
337 0.74
338 0.79
339 0.85
340 0.85
341 0.87
342 0.87
343 0.84
344 0.82
345 0.8
346 0.78
347 0.7
348 0.62
349 0.6
350 0.53
351 0.52
352 0.5
353 0.43
354 0.35
355 0.33
356 0.31
357 0.25
358 0.21
359 0.23
360 0.19
361 0.25
362 0.27
363 0.3
364 0.3
365 0.31
366 0.32
367 0.3
368 0.28
369 0.24
370 0.27
371 0.25
372 0.26
373 0.25
374 0.26
375 0.26
376 0.31
377 0.32
378 0.26
379 0.26
380 0.3
381 0.3
382 0.35
383 0.37
384 0.4
385 0.48
386 0.59
387 0.68
388 0.75
389 0.81
390 0.83
391 0.89
392 0.9
393 0.89
394 0.89
395 0.86
396 0.83
397 0.81
398 0.75
399 0.64
400 0.54
401 0.51
402 0.42
403 0.39
404 0.34
405 0.29