Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A010QZ28

Protein Details
Accession A0A010QZ28    Localization Confidence High Confidence Score 21
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
503-528RETKVVPKQGRGRPKKEAPKPAPAKABasic
550-575PSPSQENPPKRARGRPRKETAATSRSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
117-135KPKGIRRIGIVARHNMKKR
445-479PRRSARIAGTKRPAESAPIEAAPSKRPRGRKASGA
489-581PTKKRSAPTRLPAGRETKVVPKQGRGRPKKEAPKPAPAKAITKGQTRRGPARGRPSKGDPGPSPSQENPPKRARGRPRKETAATSRSAVSKKK
Subcellular Location(s) nucl 19, cyto 5, mito 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR017956  AT_hook_DNA-bd_motif  
IPR000116  HMGA  
Gene Ontology GO:0000785  C:chromatin  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0006355  P:regulation of DNA-templated transcription  
KEGG cfj:CFIO01_05606  -  
Amino Acid Sequences MPRYLDQVALGRALQERANPLLEAIAANDALHTHYLKRFESDEPPQYDSDSSSEYDEDDAPSEDPNTIIERPLDEDEIRRIALALGPQISPGQLYLSESKREEKRIIENCRGPVFHKPKGIRRIGIVARHNMKKRWEKLGIWNPAWGFAGRNVQPNDNFYEWRWKWDQETSESSMSHVNNWEESLIKRTLHLRKNLLRGEHVQVEPQPALVQDATASQAESYFSSRPWFMFELEVTAEKQRLSRVSFKDQHKLPQTSSIGQIIERWKERGDWKDEYDQEGVTSWKWKDESPTPEPEDLTPIQNMDDFDSMDATVMDFTPSELDELETNELPWEEQPENYWVISKGMEDTPAFPGQMPEGHSHDHHSDPMPIARSAPAGAFDSRKEAPESADDKKPLSADAPEQKTLEPQECALSHTPQEARRGRLRHLKNETRIPHDIIQSSPAPRRSARIAGTKRPAESAPIEAAPSKRPRGRKASGASQPTVSESMPTKKRSAPTRLPAGRETKVVPKQGRGRPKKEAPKPAPAKAITKGQTRRGPARGRPSKGDPGPSPSQENPPKRARGRPRKETAATSRSAVSKKK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.21
2 0.19
3 0.22
4 0.23
5 0.25
6 0.23
7 0.21
8 0.19
9 0.19
10 0.16
11 0.13
12 0.11
13 0.1
14 0.09
15 0.09
16 0.09
17 0.1
18 0.11
19 0.12
20 0.14
21 0.18
22 0.23
23 0.24
24 0.27
25 0.29
26 0.31
27 0.38
28 0.43
29 0.48
30 0.47
31 0.49
32 0.46
33 0.45
34 0.42
35 0.36
36 0.3
37 0.23
38 0.2
39 0.18
40 0.18
41 0.17
42 0.18
43 0.17
44 0.15
45 0.14
46 0.15
47 0.13
48 0.14
49 0.14
50 0.12
51 0.11
52 0.12
53 0.14
54 0.13
55 0.15
56 0.15
57 0.15
58 0.19
59 0.21
60 0.23
61 0.2
62 0.22
63 0.25
64 0.26
65 0.25
66 0.21
67 0.19
68 0.16
69 0.17
70 0.16
71 0.15
72 0.15
73 0.14
74 0.15
75 0.15
76 0.14
77 0.13
78 0.11
79 0.09
80 0.08
81 0.11
82 0.17
83 0.2
84 0.24
85 0.26
86 0.33
87 0.37
88 0.41
89 0.42
90 0.41
91 0.47
92 0.52
93 0.59
94 0.61
95 0.61
96 0.61
97 0.62
98 0.58
99 0.5
100 0.51
101 0.5
102 0.47
103 0.5
104 0.51
105 0.56
106 0.65
107 0.69
108 0.6
109 0.56
110 0.59
111 0.55
112 0.57
113 0.53
114 0.51
115 0.53
116 0.58
117 0.6
118 0.56
119 0.6
120 0.62
121 0.62
122 0.63
123 0.62
124 0.59
125 0.65
126 0.7
127 0.69
128 0.6
129 0.58
130 0.49
131 0.44
132 0.41
133 0.3
134 0.22
135 0.16
136 0.23
137 0.22
138 0.29
139 0.29
140 0.32
141 0.33
142 0.34
143 0.36
144 0.3
145 0.3
146 0.24
147 0.33
148 0.3
149 0.35
150 0.36
151 0.32
152 0.33
153 0.38
154 0.4
155 0.34
156 0.39
157 0.38
158 0.37
159 0.35
160 0.33
161 0.32
162 0.28
163 0.25
164 0.23
165 0.19
166 0.17
167 0.18
168 0.17
169 0.14
170 0.14
171 0.17
172 0.15
173 0.15
174 0.16
175 0.23
176 0.32
177 0.37
178 0.42
179 0.46
180 0.5
181 0.59
182 0.61
183 0.55
184 0.5
185 0.47
186 0.45
187 0.42
188 0.36
189 0.3
190 0.27
191 0.28
192 0.24
193 0.21
194 0.16
195 0.11
196 0.12
197 0.1
198 0.09
199 0.06
200 0.07
201 0.08
202 0.08
203 0.08
204 0.06
205 0.06
206 0.07
207 0.08
208 0.1
209 0.09
210 0.09
211 0.11
212 0.12
213 0.12
214 0.14
215 0.15
216 0.13
217 0.14
218 0.14
219 0.14
220 0.14
221 0.15
222 0.12
223 0.12
224 0.12
225 0.11
226 0.12
227 0.12
228 0.14
229 0.17
230 0.24
231 0.28
232 0.36
233 0.44
234 0.47
235 0.53
236 0.52
237 0.55
238 0.55
239 0.53
240 0.44
241 0.44
242 0.43
243 0.37
244 0.36
245 0.31
246 0.23
247 0.21
248 0.24
249 0.19
250 0.2
251 0.2
252 0.19
253 0.18
254 0.21
255 0.25
256 0.28
257 0.31
258 0.3
259 0.32
260 0.38
261 0.39
262 0.39
263 0.35
264 0.28
265 0.23
266 0.2
267 0.17
268 0.11
269 0.14
270 0.1
271 0.12
272 0.13
273 0.13
274 0.17
275 0.23
276 0.3
277 0.3
278 0.36
279 0.36
280 0.36
281 0.36
282 0.32
283 0.3
284 0.23
285 0.21
286 0.15
287 0.12
288 0.11
289 0.12
290 0.12
291 0.1
292 0.09
293 0.08
294 0.08
295 0.08
296 0.08
297 0.06
298 0.06
299 0.04
300 0.04
301 0.04
302 0.04
303 0.04
304 0.04
305 0.04
306 0.04
307 0.05
308 0.05
309 0.05
310 0.05
311 0.07
312 0.09
313 0.08
314 0.08
315 0.08
316 0.08
317 0.07
318 0.07
319 0.1
320 0.09
321 0.09
322 0.1
323 0.12
324 0.13
325 0.13
326 0.14
327 0.1
328 0.11
329 0.11
330 0.1
331 0.1
332 0.09
333 0.11
334 0.1
335 0.12
336 0.14
337 0.15
338 0.15
339 0.12
340 0.12
341 0.11
342 0.13
343 0.13
344 0.13
345 0.14
346 0.15
347 0.16
348 0.19
349 0.2
350 0.19
351 0.19
352 0.17
353 0.17
354 0.17
355 0.2
356 0.19
357 0.17
358 0.17
359 0.15
360 0.15
361 0.13
362 0.12
363 0.11
364 0.1
365 0.12
366 0.12
367 0.12
368 0.16
369 0.16
370 0.17
371 0.18
372 0.16
373 0.16
374 0.22
375 0.26
376 0.26
377 0.31
378 0.3
379 0.29
380 0.3
381 0.29
382 0.22
383 0.19
384 0.17
385 0.19
386 0.26
387 0.3
388 0.3
389 0.31
390 0.3
391 0.32
392 0.33
393 0.29
394 0.21
395 0.17
396 0.19
397 0.19
398 0.22
399 0.22
400 0.21
401 0.19
402 0.23
403 0.26
404 0.25
405 0.34
406 0.35
407 0.38
408 0.44
409 0.46
410 0.48
411 0.55
412 0.58
413 0.59
414 0.65
415 0.68
416 0.68
417 0.74
418 0.71
419 0.69
420 0.65
421 0.6
422 0.54
423 0.49
424 0.44
425 0.35
426 0.34
427 0.3
428 0.31
429 0.32
430 0.31
431 0.31
432 0.3
433 0.33
434 0.34
435 0.37
436 0.39
437 0.44
438 0.47
439 0.52
440 0.6
441 0.6
442 0.56
443 0.52
444 0.47
445 0.41
446 0.36
447 0.31
448 0.25
449 0.22
450 0.22
451 0.22
452 0.23
453 0.26
454 0.3
455 0.34
456 0.37
457 0.44
458 0.51
459 0.58
460 0.62
461 0.64
462 0.65
463 0.68
464 0.7
465 0.69
466 0.63
467 0.55
468 0.5
469 0.43
470 0.38
471 0.28
472 0.22
473 0.2
474 0.27
475 0.32
476 0.35
477 0.37
478 0.4
479 0.47
480 0.53
481 0.59
482 0.6
483 0.61
484 0.69
485 0.71
486 0.7
487 0.69
488 0.67
489 0.6
490 0.53
491 0.48
492 0.46
493 0.48
494 0.52
495 0.49
496 0.51
497 0.58
498 0.64
499 0.72
500 0.72
501 0.72
502 0.74
503 0.81
504 0.83
505 0.83
506 0.86
507 0.81
508 0.83
509 0.83
510 0.79
511 0.77
512 0.7
513 0.65
514 0.59
515 0.61
516 0.56
517 0.58
518 0.58
519 0.59
520 0.63
521 0.65
522 0.68
523 0.68
524 0.71
525 0.7
526 0.74
527 0.75
528 0.74
529 0.74
530 0.74
531 0.75
532 0.72
533 0.72
534 0.64
535 0.62
536 0.63
537 0.6
538 0.59
539 0.52
540 0.57
541 0.59
542 0.62
543 0.62
544 0.63
545 0.69
546 0.69
547 0.76
548 0.77
549 0.79
550 0.82
551 0.85
552 0.86
553 0.86
554 0.85
555 0.84
556 0.82
557 0.78
558 0.69
559 0.61
560 0.56
561 0.52