FuNGI

J3K5K8

Protein Details

Accession

J3K5K8

Localization Confidence

High

Confidence Score

17.2

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
20-50	GPFIKVRRPKPADPLVRPKKRPIPRSQGLAP	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
12-45	RVPPAGRAGPFIKVRRPKPADPLVRPKKRPIPRS
419-430	KEFGKKVRKALQ
568-570	KKR

Subcellular Location(s)

nucl 13, mito 12

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR008851 TFIIF-alpha IPR011039 TFIIF_interaction
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003677 F:DNA binding GO:0032968 P:positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II GO:0006367 P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter
KEGG	cim:CIMG_08480 -
Pfam	View protein in Pfam PF05793 TFIIF_alpha

Amino Acid Sequences

MSSVPPNGPPGRVPPAGRAGPFIKVRRPKPADPLVRPKKRPIPRSQGLAPGGAPVANGQPRPSPQLPPKPQSNTSTPKPPPIPSADDMTVNGFSGPLLCQNYVDFALVTTKRALKEGLKHHVAKFLSKKNIDPRDESQFTRPVRLQRRDPRATTEPPPIERQQNAQKGREGNLTEAEREALEAKKAARAKEREENLAQIAPSASGGPKRTNVPKQRIQQVFKSEMTPEEIAKARVKYEEALPWHLEDFDNKNTWVGKYEAAMSETYAMFVLEKNGKLRLVPIDKWYKFSGKNPFKALTIEEAEKYMSKKIKDPRWFMEKEQERKQERELADFAKQRKVYTGRVVSSGVGEGGEGDDMDFEEDRFADDEEHVVVEEDEEAKLAEKRIKKDQLKANVFNLRDERDYEAEENQERREKEALKEFGKKVRKALQRREKNYDYSSGSDANPWSEDESTDESEAERIRAEDEKKEGEKSSAPQTKGTSTPSDRGKFTDALKKGPTQQMKKRPGSPNVSDASGTDTPRKKAKNKHIAQPLSTTASKPGSRPMSPAPSTTTSATQRKQDATKPAGKKRMRSGTGGAGSGSDAERGAASGAEVSDSAVAKKLKINPPGVSSKRGTPAGSRAGSPPVRPSTPATATTVAPVGSFPTHAEVHAAIPPTGISSGDLLKLFRHRLGDMKTNYPKFIAIVKEVGVFAKEDKLLRPAPNFKPSGS

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.39
2	0.45
3	0.48
4	0.46
5	0.45
6	0.39
7	0.41
8	0.47
9	0.46
10	0.47
11	0.53
12	0.57
13	0.62
14	0.68
15	0.67
16	0.69
17	0.74
18	0.75
19	0.75
20	0.82
21	0.82
22	0.84
23	0.83
24	0.83
25	0.83
26	0.82
27	0.83
28	0.82
29	0.81
30	0.79
31	0.82
32	0.77
33	0.75
34	0.67
35	0.59
36	0.49
37	0.4
38	0.33
39	0.25
40	0.2
41	0.12
42	0.17
43	0.19
44	0.2
45	0.2
46	0.24
47	0.27
48	0.36
49	0.37
50	0.4
51	0.46
52	0.56
53	0.63
54	0.65
55	0.71
56	0.7
57	0.74
58	0.71
59	0.7
60	0.67
61	0.64
62	0.68
63	0.61
64	0.63
65	0.62
66	0.59
67	0.56
68	0.54
69	0.55
70	0.46
71	0.5
72	0.43
73	0.39
74	0.37
75	0.34
76	0.28
77	0.21
78	0.19
79	0.12
80	0.1
81	0.1
82	0.09
83	0.12
84	0.14
85	0.14
86	0.15
87	0.15
88	0.18
89	0.18
90	0.18
91	0.13
92	0.1
93	0.17
94	0.17
95	0.19
96	0.2
97	0.23
98	0.23
99	0.24
100	0.27
101	0.25
102	0.33
103	0.4
104	0.46
105	0.49
106	0.53
107	0.52
108	0.56
109	0.52
110	0.51
111	0.51
112	0.51
113	0.53
114	0.51
115	0.56
116	0.6
117	0.68
118	0.64
119	0.61
120	0.57
121	0.58
122	0.59
123	0.55
124	0.5
125	0.49
126	0.46
127	0.46
128	0.45
129	0.45
130	0.52
131	0.57
132	0.62
133	0.65
134	0.74
135	0.75
136	0.73
137	0.72
138	0.69
139	0.67
140	0.61
141	0.61
142	0.56
143	0.51
144	0.55
145	0.51
146	0.5
147	0.46
148	0.48
149	0.48
150	0.52
151	0.54
152	0.52
153	0.53
154	0.5
155	0.51
156	0.5
157	0.42
158	0.35
159	0.35
160	0.34
161	0.29
162	0.27
163	0.24
164	0.18
165	0.17
166	0.17
167	0.11
168	0.11
169	0.12
170	0.12
171	0.18
172	0.21
173	0.24
174	0.3
175	0.34
176	0.39
177	0.46
178	0.49
179	0.49
180	0.47
181	0.46
182	0.4
183	0.37
184	0.3
185	0.22
186	0.19
187	0.13
188	0.12
189	0.1
190	0.09
191	0.11
192	0.13
193	0.15
194	0.17
195	0.23
196	0.31
197	0.39
198	0.48
199	0.53
200	0.59
201	0.64
202	0.71
203	0.74
204	0.7
205	0.67
206	0.65
207	0.61
208	0.54
209	0.48
210	0.39
211	0.32
212	0.32
213	0.27
214	0.2
215	0.18
216	0.19
217	0.19
218	0.22
219	0.22
220	0.18
221	0.19
222	0.2
223	0.18
224	0.19
225	0.22
226	0.22
227	0.25
228	0.24
229	0.23
230	0.23
231	0.22
232	0.19
233	0.17
234	0.18
235	0.18
236	0.19
237	0.18
238	0.2
239	0.2
240	0.2
241	0.2
242	0.17
243	0.14
244	0.13
245	0.15
246	0.15
247	0.15
248	0.14
249	0.12
250	0.12
251	0.11
252	0.11
253	0.08
254	0.07
255	0.06
256	0.06
257	0.1
258	0.11
259	0.12
260	0.13
261	0.14
262	0.15
263	0.14
264	0.16
265	0.2
266	0.22
267	0.23
268	0.28
269	0.37
270	0.37
271	0.4
272	0.4
273	0.38
274	0.35
275	0.4
276	0.45
277	0.43
278	0.47
279	0.48
280	0.47
281	0.43
282	0.42
283	0.37
284	0.3
285	0.24
286	0.21
287	0.17
288	0.16
289	0.16
290	0.16
291	0.16
292	0.16
293	0.17
294	0.17
295	0.23
296	0.31
297	0.4
298	0.47
299	0.51
300	0.52
301	0.57
302	0.58
303	0.53
304	0.55
305	0.55
306	0.53
307	0.56
308	0.59
309	0.55
310	0.54
311	0.55
312	0.53
313	0.45
314	0.42
315	0.36
316	0.3
317	0.32
318	0.34
319	0.34
320	0.33
321	0.32
322	0.28
323	0.31
324	0.33
325	0.3
326	0.33
327	0.36
328	0.31
329	0.31
330	0.32
331	0.27
332	0.23
333	0.2
334	0.12
335	0.07
336	0.06
337	0.04
338	0.04
339	0.03
340	0.03
341	0.02
342	0.02
343	0.02
344	0.03
345	0.03
346	0.03
347	0.04
348	0.04
349	0.04
350	0.05
351	0.05
352	0.05
353	0.05
354	0.06
355	0.06
356	0.06
357	0.05
358	0.05
359	0.05
360	0.04
361	0.04
362	0.04
363	0.04
364	0.04
365	0.04
366	0.05
367	0.06
368	0.07
369	0.12
370	0.15
371	0.19
372	0.28
373	0.37
374	0.4
375	0.48
376	0.54
377	0.59
378	0.63
379	0.62
380	0.59
381	0.56
382	0.52
383	0.47
384	0.42
385	0.33
386	0.27
387	0.26
388	0.23
389	0.18
390	0.2
391	0.18
392	0.18
393	0.18
394	0.2
395	0.2
396	0.19
397	0.23
398	0.21
399	0.23
400	0.26
401	0.25
402	0.27
403	0.34
404	0.38
405	0.37
406	0.44
407	0.43
408	0.47
409	0.52
410	0.5
411	0.46
412	0.5
413	0.55
414	0.56
415	0.65
416	0.68
417	0.71
418	0.76
419	0.79
420	0.74
421	0.7
422	0.63
423	0.58
424	0.5
425	0.42
426	0.37
427	0.31
428	0.27
429	0.24
430	0.22
431	0.18
432	0.15
433	0.13
434	0.13
435	0.11
436	0.11
437	0.12
438	0.15
439	0.15
440	0.15
441	0.14
442	0.13
443	0.15
444	0.15
445	0.12
446	0.09
447	0.08
448	0.09
449	0.14
450	0.16
451	0.17
452	0.2
453	0.25
454	0.26
455	0.29
456	0.28
457	0.25
458	0.26
459	0.25
460	0.33
461	0.34
462	0.33
463	0.34
464	0.35
465	0.36
466	0.36
467	0.36
468	0.32
469	0.29
470	0.34
471	0.39
472	0.4
473	0.38
474	0.38
475	0.39
476	0.35
477	0.36
478	0.39
479	0.33
480	0.34
481	0.36
482	0.36
483	0.38
484	0.43
485	0.48
486	0.48
487	0.56
488	0.62
489	0.69
490	0.72
491	0.76
492	0.76
493	0.76
494	0.75
495	0.69
496	0.65
497	0.57
498	0.52
499	0.43
500	0.35
501	0.33
502	0.28
503	0.26
504	0.27
505	0.29
506	0.31
507	0.38
508	0.44
509	0.45
510	0.53
511	0.62
512	0.66
513	0.68
514	0.75
515	0.78
516	0.76
517	0.71
518	0.65
519	0.57
520	0.51
521	0.45
522	0.36
523	0.29
524	0.3
525	0.3
526	0.26
527	0.31
528	0.32
529	0.32
530	0.35
531	0.38
532	0.41
533	0.41
534	0.42
535	0.4
536	0.37
537	0.39
538	0.37
539	0.36
540	0.34
541	0.41
542	0.42
543	0.42
544	0.43
545	0.45
546	0.48
547	0.49
548	0.51
549	0.51
550	0.57
551	0.6
552	0.64
553	0.69
554	0.69
555	0.69
556	0.7
557	0.73
558	0.67
559	0.62
560	0.58
561	0.57
562	0.56
563	0.49
564	0.39
565	0.29
566	0.26
567	0.23
568	0.19
569	0.1
570	0.07
571	0.07
572	0.07
573	0.07
574	0.07
575	0.05
576	0.05
577	0.06
578	0.06
579	0.06
580	0.06
581	0.06
582	0.08
583	0.09
584	0.09
585	0.13
586	0.14
587	0.15
588	0.2
589	0.29
590	0.35
591	0.42
592	0.47
593	0.45
594	0.5
595	0.59
596	0.57
597	0.54
598	0.49
599	0.48
600	0.48
601	0.48
602	0.44
603	0.37
604	0.41
605	0.44
606	0.43
607	0.38
608	0.34
609	0.4
610	0.41
611	0.38
612	0.39
613	0.37
614	0.37
615	0.38
616	0.4
617	0.4
618	0.42
619	0.43
620	0.39
621	0.36
622	0.34
623	0.34
624	0.3
625	0.22
626	0.17
627	0.15
628	0.13
629	0.11
630	0.12
631	0.11
632	0.14
633	0.15
634	0.15
635	0.17
636	0.15
637	0.16
638	0.19
639	0.2
640	0.16
641	0.15
642	0.15
643	0.14
644	0.14
645	0.12
646	0.1
647	0.1
648	0.12
649	0.14
650	0.16
651	0.15
652	0.18
653	0.24
654	0.26
655	0.27
656	0.29
657	0.28
658	0.35
659	0.41
660	0.47
661	0.45
662	0.52
663	0.59
664	0.59
665	0.58
666	0.52
667	0.46
668	0.38
669	0.39
670	0.34
671	0.28
672	0.27
673	0.27
674	0.27
675	0.27
676	0.26
677	0.21
678	0.17
679	0.15
680	0.18
681	0.2
682	0.19
683	0.21
684	0.27
685	0.32
686	0.37
687	0.44
688	0.48
689	0.53
690	0.6

J3K5K8

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer