Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A010R961

Protein Details
Accession A0A010R961    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
104-124DGVAPRAKMNQQRSRRFRSAQHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
412-429RRKETEDRREASFKRRKL
Subcellular Location(s) cyto 9.5, cyto_nucl 9, nucl 7.5, mito 7
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR027073  5_3_exoribonuclease  
IPR041412  Xrn1_helical  
IPR004859  Xrn1_N  
IPR017151  Xrn2/3/4  
IPR001878  Znf_CCHC  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0004534  F:5'-3' RNA exonuclease activity  
GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
GO:0006353  P:DNA-templated transcription termination  
GO:0006397  P:mRNA processing  
KEGG cfj:CFIO01_12490  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF17846  XRN_M  
PF03159  XRN_N  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50158  ZF_CCHC  
CDD cd18673  PIN_XRN1-2-like  
Amino Acid Sequences MGIPAAFRWLSNKYPKIISPVIEEQPVKMDDGSEIPVDTTGPNPNGEELDNLYLDMNGIVHPCSHPEDRPAPKDEEEMMLEVFRYTDRVVNMVRPRKLLMIAVDGVAPRAKMNQQRSRRFRSAQEAQEKEEDKQELLKLLKQQNGGAVPDDTLEGVTKKAFDSNSITPGTPFMDILASSLRYWCAYKLNTDPAWAKLKIIISDATVPGEGEHKIMSFVRSQRISPDYDPNTRHVIYGLDADLIMLGLATHEPHFRVLREDVFFQDSKAKMCKLCGQKGHEARACRGQAKEKVGEFDEQEKSPTLKPFIWLHVPILREYLAVELNVPGLPFRFDLERALDDWVFMCCFVGNDFLPHLPALEIRENGIDTLTAIWKDNLPFMGGYVTKDGHVDLGRAQYILNGLAKQEDAIFKRRKETEDRREASFKRRKLQEEQRNPRFAKPKQVDDASAGLSLFAVAGGPNGITHDKVVGRSSNMNANTANKSAASAIRDQLKGLTPRNEISQEDDSAKVTKDEVPKPADENTILGKRKAEDETATTADSAAASAKGPGTSSAAEEAAVDHVRMWEEGYADRYYEQKFHVDRSDLEFRHKVAQAYVEGLSWVLLYYFQGCPSWEWYYPYHYAPFAADFVDLDKMDVHFEKGRISKPFEQLMSVLPAASRHALPEVFHELMLNEDSDVIDFYPSDFEIDLNGKKMAWQGVALLPFIEMPRLLAAIETKYPLLSEADQARNGVGRDVLLLSDAHHELYDEITTVFYSKKQGAPTLKLSPRTSDGLAGNIEKIPDYLPHGELVYPLERGGMPNLDYDRSLRVWYTFPESSHPHKSMLLRGAKPPAPALDRNDIETLKGKSARGGRGYGGAPFQRGGGHHNGGRRGGQFSYAPDGGQGRQDRGPPSYGSSGGHGRQGFQSSGPPPIQSSWQPPPPGHPGFGMGLPPPPPPSGYGNDGRASNGSHRGGGYNQHQNYGPPAPGPHSQYSYPDGGRQGGRGGYQGRGGYGGGRGSGGGGGSGKYGGGRNYY
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.46
2 0.48
3 0.52
4 0.52
5 0.47
6 0.44
7 0.46
8 0.45
9 0.47
10 0.45
11 0.37
12 0.38
13 0.37
14 0.31
15 0.23
16 0.21
17 0.16
18 0.18
19 0.2
20 0.15
21 0.15
22 0.13
23 0.13
24 0.13
25 0.13
26 0.13
27 0.17
28 0.18
29 0.19
30 0.19
31 0.21
32 0.22
33 0.22
34 0.21
35 0.18
36 0.2
37 0.19
38 0.18
39 0.17
40 0.15
41 0.14
42 0.12
43 0.09
44 0.07
45 0.08
46 0.08
47 0.09
48 0.1
49 0.12
50 0.18
51 0.21
52 0.23
53 0.29
54 0.38
55 0.46
56 0.51
57 0.53
58 0.53
59 0.51
60 0.52
61 0.47
62 0.41
63 0.35
64 0.31
65 0.26
66 0.21
67 0.19
68 0.16
69 0.14
70 0.1
71 0.1
72 0.1
73 0.13
74 0.13
75 0.17
76 0.19
77 0.27
78 0.37
79 0.43
80 0.45
81 0.44
82 0.45
83 0.44
84 0.44
85 0.39
86 0.32
87 0.29
88 0.26
89 0.25
90 0.24
91 0.21
92 0.2
93 0.18
94 0.15
95 0.1
96 0.13
97 0.19
98 0.26
99 0.36
100 0.45
101 0.55
102 0.66
103 0.74
104 0.8
105 0.82
106 0.78
107 0.76
108 0.76
109 0.75
110 0.74
111 0.75
112 0.68
113 0.64
114 0.67
115 0.61
116 0.53
117 0.49
118 0.41
119 0.31
120 0.33
121 0.31
122 0.29
123 0.29
124 0.31
125 0.34
126 0.39
127 0.43
128 0.4
129 0.4
130 0.39
131 0.4
132 0.37
133 0.3
134 0.24
135 0.2
136 0.18
137 0.18
138 0.12
139 0.1
140 0.1
141 0.08
142 0.09
143 0.09
144 0.09
145 0.1
146 0.14
147 0.14
148 0.16
149 0.22
150 0.25
151 0.29
152 0.3
153 0.3
154 0.26
155 0.28
156 0.26
157 0.19
158 0.16
159 0.11
160 0.1
161 0.1
162 0.11
163 0.12
164 0.12
165 0.11
166 0.13
167 0.13
168 0.13
169 0.14
170 0.15
171 0.19
172 0.19
173 0.24
174 0.28
175 0.36
176 0.35
177 0.38
178 0.38
179 0.36
180 0.41
181 0.36
182 0.31
183 0.27
184 0.29
185 0.26
186 0.26
187 0.22
188 0.18
189 0.21
190 0.21
191 0.18
192 0.15
193 0.14
194 0.12
195 0.13
196 0.12
197 0.09
198 0.09
199 0.08
200 0.1
201 0.11
202 0.12
203 0.16
204 0.2
205 0.26
206 0.28
207 0.28
208 0.32
209 0.34
210 0.37
211 0.35
212 0.4
213 0.39
214 0.44
215 0.45
216 0.43
217 0.46
218 0.42
219 0.38
220 0.29
221 0.25
222 0.19
223 0.2
224 0.17
225 0.11
226 0.1
227 0.1
228 0.09
229 0.08
230 0.06
231 0.03
232 0.03
233 0.03
234 0.03
235 0.04
236 0.05
237 0.07
238 0.08
239 0.11
240 0.13
241 0.13
242 0.18
243 0.2
244 0.24
245 0.25
246 0.26
247 0.25
248 0.28
249 0.27
250 0.24
251 0.27
252 0.23
253 0.24
254 0.26
255 0.27
256 0.24
257 0.27
258 0.34
259 0.36
260 0.43
261 0.46
262 0.49
263 0.56
264 0.6
265 0.66
266 0.62
267 0.56
268 0.51
269 0.53
270 0.5
271 0.44
272 0.41
273 0.4
274 0.43
275 0.46
276 0.48
277 0.41
278 0.41
279 0.4
280 0.39
281 0.33
282 0.33
283 0.3
284 0.25
285 0.25
286 0.24
287 0.24
288 0.25
289 0.27
290 0.24
291 0.21
292 0.25
293 0.27
294 0.29
295 0.32
296 0.29
297 0.28
298 0.28
299 0.28
300 0.25
301 0.23
302 0.19
303 0.14
304 0.13
305 0.12
306 0.1
307 0.09
308 0.09
309 0.07
310 0.08
311 0.08
312 0.08
313 0.06
314 0.06
315 0.07
316 0.07
317 0.08
318 0.09
319 0.09
320 0.12
321 0.14
322 0.15
323 0.15
324 0.18
325 0.16
326 0.14
327 0.14
328 0.13
329 0.1
330 0.09
331 0.08
332 0.05
333 0.05
334 0.06
335 0.08
336 0.07
337 0.08
338 0.1
339 0.1
340 0.1
341 0.1
342 0.1
343 0.07
344 0.08
345 0.11
346 0.13
347 0.13
348 0.13
349 0.14
350 0.14
351 0.13
352 0.12
353 0.08
354 0.06
355 0.07
356 0.07
357 0.07
358 0.08
359 0.08
360 0.1
361 0.11
362 0.12
363 0.1
364 0.1
365 0.09
366 0.09
367 0.11
368 0.1
369 0.1
370 0.11
371 0.11
372 0.1
373 0.11
374 0.1
375 0.1
376 0.1
377 0.1
378 0.1
379 0.11
380 0.11
381 0.11
382 0.11
383 0.09
384 0.09
385 0.1
386 0.1
387 0.08
388 0.07
389 0.08
390 0.08
391 0.08
392 0.08
393 0.11
394 0.12
395 0.21
396 0.26
397 0.26
398 0.33
399 0.35
400 0.38
401 0.44
402 0.52
403 0.54
404 0.6
405 0.62
406 0.6
407 0.64
408 0.62
409 0.63
410 0.6
411 0.55
412 0.52
413 0.56
414 0.56
415 0.59
416 0.68
417 0.68
418 0.71
419 0.77
420 0.77
421 0.78
422 0.75
423 0.72
424 0.69
425 0.6
426 0.6
427 0.54
428 0.51
429 0.49
430 0.49
431 0.44
432 0.37
433 0.37
434 0.27
435 0.23
436 0.16
437 0.11
438 0.09
439 0.08
440 0.05
441 0.04
442 0.03
443 0.02
444 0.02
445 0.02
446 0.03
447 0.03
448 0.04
449 0.05
450 0.05
451 0.05
452 0.07
453 0.08
454 0.09
455 0.11
456 0.1
457 0.12
458 0.14
459 0.15
460 0.18
461 0.18
462 0.18
463 0.17
464 0.19
465 0.2
466 0.18
467 0.18
468 0.12
469 0.12
470 0.12
471 0.13
472 0.11
473 0.11
474 0.12
475 0.17
476 0.17
477 0.17
478 0.17
479 0.19
480 0.21
481 0.23
482 0.25
483 0.22
484 0.23
485 0.25
486 0.25
487 0.22
488 0.23
489 0.22
490 0.18
491 0.18
492 0.18
493 0.17
494 0.16
495 0.16
496 0.11
497 0.1
498 0.13
499 0.18
500 0.2
501 0.24
502 0.25
503 0.26
504 0.27
505 0.28
506 0.25
507 0.19
508 0.17
509 0.16
510 0.21
511 0.21
512 0.19
513 0.19
514 0.18
515 0.21
516 0.21
517 0.19
518 0.13
519 0.15
520 0.18
521 0.18
522 0.18
523 0.15
524 0.14
525 0.12
526 0.11
527 0.08
528 0.05
529 0.04
530 0.04
531 0.05
532 0.05
533 0.05
534 0.05
535 0.06
536 0.07
537 0.07
538 0.07
539 0.08
540 0.08
541 0.08
542 0.07
543 0.07
544 0.07
545 0.07
546 0.07
547 0.06
548 0.06
549 0.07
550 0.07
551 0.07
552 0.06
553 0.06
554 0.07
555 0.1
556 0.1
557 0.1
558 0.1
559 0.12
560 0.12
561 0.14
562 0.14
563 0.17
564 0.18
565 0.21
566 0.23
567 0.23
568 0.23
569 0.28
570 0.35
571 0.29
572 0.33
573 0.32
574 0.3
575 0.33
576 0.34
577 0.28
578 0.2
579 0.22
580 0.18
581 0.19
582 0.18
583 0.12
584 0.1
585 0.1
586 0.09
587 0.06
588 0.06
589 0.03
590 0.03
591 0.03
592 0.06
593 0.06
594 0.07
595 0.08
596 0.08
597 0.09
598 0.13
599 0.17
600 0.15
601 0.18
602 0.19
603 0.23
604 0.25
605 0.25
606 0.23
607 0.2
608 0.19
609 0.17
610 0.17
611 0.12
612 0.1
613 0.09
614 0.07
615 0.08
616 0.1
617 0.09
618 0.08
619 0.08
620 0.08
621 0.1
622 0.1
623 0.11
624 0.12
625 0.12
626 0.17
627 0.19
628 0.23
629 0.26
630 0.32
631 0.36
632 0.38
633 0.41
634 0.37
635 0.35
636 0.31
637 0.29
638 0.26
639 0.19
640 0.15
641 0.11
642 0.11
643 0.11
644 0.12
645 0.1
646 0.07
647 0.09
648 0.1
649 0.1
650 0.13
651 0.17
652 0.17
653 0.16
654 0.16
655 0.14
656 0.15
657 0.15
658 0.11
659 0.06
660 0.06
661 0.06
662 0.06
663 0.06
664 0.05
665 0.05
666 0.04
667 0.05
668 0.06
669 0.06
670 0.07
671 0.06
672 0.06
673 0.08
674 0.11
675 0.12
676 0.13
677 0.13
678 0.12
679 0.13
680 0.15
681 0.15
682 0.12
683 0.12
684 0.12
685 0.14
686 0.16
687 0.14
688 0.12
689 0.1
690 0.1
691 0.1
692 0.09
693 0.06
694 0.05
695 0.06
696 0.06
697 0.06
698 0.06
699 0.07
700 0.08
701 0.1
702 0.1
703 0.1
704 0.09
705 0.09
706 0.1
707 0.11
708 0.1
709 0.14
710 0.19
711 0.22
712 0.23
713 0.23
714 0.22
715 0.22
716 0.22
717 0.18
718 0.11
719 0.08
720 0.09
721 0.09
722 0.09
723 0.07
724 0.07
725 0.07
726 0.1
727 0.11
728 0.1
729 0.09
730 0.1
731 0.09
732 0.1
733 0.09
734 0.07
735 0.06
736 0.06
737 0.06
738 0.07
739 0.08
740 0.08
741 0.11
742 0.14
743 0.17
744 0.19
745 0.26
746 0.31
747 0.36
748 0.41
749 0.47
750 0.49
751 0.52
752 0.51
753 0.47
754 0.45
755 0.43
756 0.38
757 0.33
758 0.29
759 0.25
760 0.25
761 0.22
762 0.2
763 0.17
764 0.17
765 0.12
766 0.12
767 0.1
768 0.1
769 0.13
770 0.15
771 0.15
772 0.16
773 0.16
774 0.16
775 0.16
776 0.18
777 0.15
778 0.12
779 0.11
780 0.12
781 0.11
782 0.12
783 0.14
784 0.13
785 0.12
786 0.15
787 0.17
788 0.17
789 0.17
790 0.18
791 0.19
792 0.18
793 0.18
794 0.16
795 0.16
796 0.17
797 0.19
798 0.25
799 0.24
800 0.23
801 0.28
802 0.32
803 0.37
804 0.43
805 0.42
806 0.37
807 0.39
808 0.41
809 0.42
810 0.45
811 0.47
812 0.42
813 0.44
814 0.5
815 0.48
816 0.46
817 0.42
818 0.38
819 0.35
820 0.36
821 0.38
822 0.39
823 0.38
824 0.39
825 0.41
826 0.36
827 0.32
828 0.34
829 0.31
830 0.28
831 0.3
832 0.27
833 0.3
834 0.36
835 0.41
836 0.39
837 0.39
838 0.34
839 0.36
840 0.36
841 0.32
842 0.31
843 0.26
844 0.24
845 0.21
846 0.21
847 0.18
848 0.18
849 0.21
850 0.23
851 0.26
852 0.27
853 0.32
854 0.35
855 0.35
856 0.38
857 0.35
858 0.31
859 0.27
860 0.28
861 0.25
862 0.24
863 0.29
864 0.25
865 0.23
866 0.22
867 0.24
868 0.21
869 0.27
870 0.27
871 0.24
872 0.27
873 0.31
874 0.32
875 0.33
876 0.35
877 0.29
878 0.32
879 0.31
880 0.3
881 0.26
882 0.27
883 0.3
884 0.28
885 0.33
886 0.28
887 0.27
888 0.29
889 0.31
890 0.28
891 0.23
892 0.29
893 0.25
894 0.31
895 0.3
896 0.27
897 0.25
898 0.26
899 0.31
900 0.28
901 0.35
902 0.37
903 0.42
904 0.45
905 0.44
906 0.48
907 0.52
908 0.5
909 0.44
910 0.37
911 0.33
912 0.32
913 0.32
914 0.28
915 0.2
916 0.2
917 0.2
918 0.21
919 0.2
920 0.2
921 0.19
922 0.21
923 0.25
924 0.26
925 0.31
926 0.35
927 0.36
928 0.38
929 0.38
930 0.36
931 0.32
932 0.31
933 0.29
934 0.31
935 0.29
936 0.28
937 0.28
938 0.29
939 0.29
940 0.33
941 0.37
942 0.39
943 0.38
944 0.4
945 0.4
946 0.38
947 0.42
948 0.39
949 0.32
950 0.24
951 0.26
952 0.27
953 0.32
954 0.37
955 0.36
956 0.37
957 0.38
958 0.39
959 0.42
960 0.43
961 0.39
962 0.37
963 0.34
964 0.35
965 0.35
966 0.32
967 0.3
968 0.27
969 0.26
970 0.27
971 0.27
972 0.24
973 0.27
974 0.26
975 0.23
976 0.22
977 0.22
978 0.18
979 0.19
980 0.18
981 0.14
982 0.13
983 0.12
984 0.12
985 0.12
986 0.1
987 0.09
988 0.08
989 0.08
990 0.09
991 0.09
992 0.09
993 0.1
994 0.12