Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

A0A0E1RVI9

Protein Details
Accession A0A0E1RVI9    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
159-185VYEQMKRDSRKKANKKKWEPYTRKTIPHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
165-177RDSRKKANKKKWE
Subcellular Location(s) nucl 14.5, cyto_nucl 10, cyto 4.5, pero 4, mito 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR003196  TFIIF_beta  
IPR040450  TFIIF_beta_HTH  
IPR040504  TFIIF_beta_N  
IPR011039  TFIIF_interaction  
IPR036388  WH-like_DNA-bd_sf  
IPR036390  WH_DNA-bd_sf  
Gene Ontology GO:0005674  C:transcription factor TFIIF complex  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0006367  P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter  
KEGG cim:CIMG_08713  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF02270  TFIIF_beta  
PF17683  TFIIF_beta_N  
CDD cd07980  TFIIF_beta  
Amino Acid Sequences MSNIGASAVKPEPSPGPAIKSEPDTKDNDIAMLSDEDIYEDTGDLDFANAAQDVWLTRIPKILWENWSKLDDDEEIQIGTVRVEGPPTDIKRISLRLLDIPQNEGVPKDYNLKRQNINADRTAYAVQNTFIFTEKDLPGYKDRAHLLFNENQPHGRSYVYEQMKRDSRKKANKKKWEPYTRKTIPKQTAIAARVHDEFNCLPVENEEYHRIAEKRALEALKPKRETKFIERVTGKMLQPKTAQAADKSNFIQVTKPPKIRTQDNKTARMPQNELLDLIYACFRRYRYWPFKSLKAELKQPEAYLKQTLEMVAHLVKSGDFAMTWELKPEAREASYANAMAYKDAKQELAPSAMDEGSEAEPTASGIGTDNDDDENIKFENVV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.27
2 0.24
3 0.28
4 0.3
5 0.33
6 0.34
7 0.38
8 0.43
9 0.42
10 0.45
11 0.44
12 0.45
13 0.46
14 0.43
15 0.37
16 0.3
17 0.25
18 0.23
19 0.19
20 0.16
21 0.11
22 0.11
23 0.1
24 0.11
25 0.11
26 0.09
27 0.08
28 0.08
29 0.07
30 0.07
31 0.06
32 0.06
33 0.06
34 0.05
35 0.06
36 0.06
37 0.06
38 0.05
39 0.06
40 0.06
41 0.09
42 0.12
43 0.13
44 0.13
45 0.18
46 0.18
47 0.24
48 0.28
49 0.3
50 0.34
51 0.39
52 0.42
53 0.42
54 0.44
55 0.38
56 0.34
57 0.31
58 0.26
59 0.21
60 0.19
61 0.15
62 0.14
63 0.13
64 0.13
65 0.11
66 0.09
67 0.08
68 0.07
69 0.06
70 0.08
71 0.08
72 0.11
73 0.18
74 0.21
75 0.25
76 0.25
77 0.27
78 0.31
79 0.34
80 0.33
81 0.28
82 0.27
83 0.27
84 0.3
85 0.34
86 0.3
87 0.3
88 0.28
89 0.26
90 0.24
91 0.2
92 0.18
93 0.15
94 0.15
95 0.22
96 0.25
97 0.33
98 0.4
99 0.44
100 0.45
101 0.47
102 0.56
103 0.54
104 0.55
105 0.5
106 0.46
107 0.41
108 0.4
109 0.37
110 0.27
111 0.22
112 0.18
113 0.14
114 0.12
115 0.13
116 0.11
117 0.11
118 0.11
119 0.1
120 0.15
121 0.14
122 0.17
123 0.17
124 0.19
125 0.21
126 0.24
127 0.25
128 0.24
129 0.26
130 0.24
131 0.24
132 0.23
133 0.25
134 0.27
135 0.3
136 0.31
137 0.29
138 0.3
139 0.3
140 0.28
141 0.24
142 0.19
143 0.16
144 0.14
145 0.23
146 0.27
147 0.29
148 0.29
149 0.34
150 0.41
151 0.45
152 0.48
153 0.48
154 0.52
155 0.6
156 0.7
157 0.76
158 0.8
159 0.86
160 0.9
161 0.9
162 0.91
163 0.91
164 0.88
165 0.82
166 0.82
167 0.78
168 0.77
169 0.72
170 0.7
171 0.65
172 0.61
173 0.57
174 0.5
175 0.48
176 0.41
177 0.38
178 0.3
179 0.26
180 0.23
181 0.22
182 0.18
183 0.15
184 0.13
185 0.13
186 0.12
187 0.1
188 0.09
189 0.09
190 0.12
191 0.1
192 0.12
193 0.13
194 0.13
195 0.14
196 0.16
197 0.16
198 0.15
199 0.17
200 0.17
201 0.16
202 0.19
203 0.19
204 0.17
205 0.26
206 0.34
207 0.38
208 0.4
209 0.42
210 0.41
211 0.45
212 0.5
213 0.49
214 0.51
215 0.45
216 0.51
217 0.48
218 0.46
219 0.46
220 0.45
221 0.38
222 0.35
223 0.33
224 0.28
225 0.28
226 0.29
227 0.29
228 0.27
229 0.27
230 0.22
231 0.29
232 0.26
233 0.28
234 0.27
235 0.26
236 0.23
237 0.22
238 0.23
239 0.21
240 0.29
241 0.34
242 0.38
243 0.38
244 0.44
245 0.49
246 0.56
247 0.61
248 0.61
249 0.64
250 0.67
251 0.72
252 0.68
253 0.73
254 0.69
255 0.64
256 0.58
257 0.52
258 0.49
259 0.42
260 0.4
261 0.3
262 0.25
263 0.2
264 0.16
265 0.15
266 0.11
267 0.11
268 0.13
269 0.14
270 0.16
271 0.23
272 0.33
273 0.4
274 0.46
275 0.55
276 0.57
277 0.65
278 0.67
279 0.68
280 0.66
281 0.61
282 0.63
283 0.57
284 0.59
285 0.53
286 0.47
287 0.47
288 0.4
289 0.38
290 0.34
291 0.3
292 0.25
293 0.24
294 0.23
295 0.17
296 0.15
297 0.15
298 0.12
299 0.12
300 0.11
301 0.1
302 0.09
303 0.1
304 0.1
305 0.08
306 0.06
307 0.07
308 0.12
309 0.14
310 0.15
311 0.16
312 0.17
313 0.18
314 0.19
315 0.2
316 0.19
317 0.17
318 0.19
319 0.18
320 0.21
321 0.23
322 0.23
323 0.21
324 0.2
325 0.19
326 0.2
327 0.2
328 0.18
329 0.18
330 0.19
331 0.2
332 0.18
333 0.22
334 0.23
335 0.24
336 0.22
337 0.19
338 0.2
339 0.19
340 0.19
341 0.15
342 0.14
343 0.12
344 0.13
345 0.12
346 0.09
347 0.09
348 0.1
349 0.1
350 0.07
351 0.06
352 0.07
353 0.08
354 0.1
355 0.11
356 0.12
357 0.12
358 0.12
359 0.14
360 0.13
361 0.14
362 0.13