Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A010SM56

Protein Details
Accession A0A010SM56    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
83-102KSDNARKKFRLWRGLREDPEBasic
427-449MSPALRKHWVKRLRELHNNSRNAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
157-166PKRIMKPKRK
Subcellular Location(s) nucl 16.5, cyto_nucl 11, cyto 4.5, mito 3, pero 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR024752  Myb/SANT-like_dom  
KEGG cfj:CFIO01_06011  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF12776  Myb_DNA-bind_3  
Amino Acid Sequences MSDDEFGVPDGPPGSAGGDRDKRAPRFSWTPAYEATFFRSLCDSVQLGLRENHSFKADAWDRAATALREKHGAYPTKSHLVNKSDNARKKFRLWRGLREDPEFLYNPTTRTVTASEEAWKAHIEKEPLSRALRGRPFDHEQFMEILYPDVVGSGGAPKRIMKPKRKGPDVIQGSEDPDMPGTAVLDLQVEPPYGTPSQTGINHQVQARGSVSQSPVAQAQQPMIPQQQQQPQQQQQQQIQQQQQQHQQPQQQQQQQQQQQQQQQRPTSTAIPPRTHIAGTSALTPPEETATGRKRFPQQTSTSDTGGKAPTAPMGPPAQPAEKRRRVSGYTNPAQASGPGVSNSHSHNHSHGNDATTASMVSAGKQLMEDGLIKIADALRGRSPPRWPEQAIDIFFRDFSDEDMDLQLKIAEKALADDNKAMIFCKMSPALRKHWVKRLRELHNNSRNA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.12
2 0.12
3 0.15
4 0.22
5 0.28
6 0.3
7 0.38
8 0.46
9 0.48
10 0.52
11 0.53
12 0.52
13 0.53
14 0.57
15 0.6
16 0.54
17 0.53
18 0.5
19 0.52
20 0.46
21 0.4
22 0.39
23 0.33
24 0.31
25 0.29
26 0.28
27 0.24
28 0.22
29 0.25
30 0.21
31 0.17
32 0.23
33 0.22
34 0.23
35 0.25
36 0.27
37 0.28
38 0.29
39 0.3
40 0.27
41 0.27
42 0.24
43 0.32
44 0.34
45 0.31
46 0.33
47 0.32
48 0.3
49 0.31
50 0.33
51 0.24
52 0.26
53 0.27
54 0.25
55 0.27
56 0.28
57 0.32
58 0.36
59 0.42
60 0.38
61 0.41
62 0.45
63 0.49
64 0.5
65 0.49
66 0.49
67 0.48
68 0.51
69 0.51
70 0.55
71 0.58
72 0.64
73 0.66
74 0.66
75 0.64
76 0.67
77 0.7
78 0.7
79 0.72
80 0.7
81 0.74
82 0.75
83 0.8
84 0.76
85 0.7
86 0.63
87 0.53
88 0.52
89 0.43
90 0.34
91 0.3
92 0.26
93 0.23
94 0.23
95 0.23
96 0.18
97 0.2
98 0.2
99 0.19
100 0.19
101 0.19
102 0.21
103 0.21
104 0.21
105 0.19
106 0.19
107 0.16
108 0.18
109 0.2
110 0.19
111 0.21
112 0.27
113 0.3
114 0.33
115 0.34
116 0.34
117 0.33
118 0.39
119 0.42
120 0.4
121 0.38
122 0.4
123 0.45
124 0.44
125 0.45
126 0.37
127 0.32
128 0.3
129 0.28
130 0.22
131 0.16
132 0.13
133 0.09
134 0.08
135 0.07
136 0.05
137 0.05
138 0.04
139 0.04
140 0.09
141 0.1
142 0.1
143 0.11
144 0.13
145 0.2
146 0.29
147 0.38
148 0.43
149 0.52
150 0.61
151 0.7
152 0.74
153 0.72
154 0.68
155 0.7
156 0.66
157 0.57
158 0.5
159 0.41
160 0.37
161 0.33
162 0.28
163 0.17
164 0.12
165 0.1
166 0.07
167 0.07
168 0.05
169 0.04
170 0.04
171 0.04
172 0.05
173 0.05
174 0.06
175 0.06
176 0.06
177 0.06
178 0.07
179 0.09
180 0.09
181 0.09
182 0.08
183 0.09
184 0.13
185 0.14
186 0.16
187 0.19
188 0.21
189 0.24
190 0.24
191 0.25
192 0.22
193 0.23
194 0.21
195 0.16
196 0.14
197 0.14
198 0.14
199 0.13
200 0.13
201 0.12
202 0.12
203 0.12
204 0.13
205 0.11
206 0.11
207 0.1
208 0.11
209 0.12
210 0.13
211 0.14
212 0.14
213 0.19
214 0.25
215 0.3
216 0.35
217 0.41
218 0.45
219 0.51
220 0.54
221 0.54
222 0.51
223 0.52
224 0.52
225 0.51
226 0.49
227 0.47
228 0.47
229 0.47
230 0.51
231 0.49
232 0.49
233 0.48
234 0.49
235 0.51
236 0.56
237 0.58
238 0.58
239 0.57
240 0.6
241 0.64
242 0.65
243 0.65
244 0.63
245 0.61
246 0.62
247 0.65
248 0.64
249 0.61
250 0.58
251 0.53
252 0.48
253 0.43
254 0.4
255 0.37
256 0.39
257 0.38
258 0.36
259 0.35
260 0.36
261 0.35
262 0.31
263 0.25
264 0.2
265 0.17
266 0.16
267 0.18
268 0.16
269 0.15
270 0.15
271 0.15
272 0.12
273 0.1
274 0.1
275 0.08
276 0.14
277 0.21
278 0.25
279 0.26
280 0.3
281 0.38
282 0.44
283 0.48
284 0.49
285 0.47
286 0.5
287 0.56
288 0.54
289 0.47
290 0.42
291 0.38
292 0.33
293 0.28
294 0.22
295 0.16
296 0.13
297 0.13
298 0.12
299 0.12
300 0.12
301 0.14
302 0.15
303 0.16
304 0.19
305 0.22
306 0.26
307 0.33
308 0.41
309 0.47
310 0.48
311 0.5
312 0.53
313 0.52
314 0.54
315 0.58
316 0.57
317 0.54
318 0.57
319 0.53
320 0.48
321 0.44
322 0.37
323 0.3
324 0.21
325 0.16
326 0.12
327 0.12
328 0.12
329 0.14
330 0.16
331 0.18
332 0.19
333 0.19
334 0.21
335 0.29
336 0.29
337 0.32
338 0.32
339 0.3
340 0.3
341 0.29
342 0.26
343 0.19
344 0.18
345 0.12
346 0.12
347 0.1
348 0.09
349 0.11
350 0.11
351 0.11
352 0.11
353 0.11
354 0.08
355 0.1
356 0.1
357 0.08
358 0.1
359 0.09
360 0.09
361 0.1
362 0.11
363 0.13
364 0.13
365 0.15
366 0.16
367 0.22
368 0.25
369 0.29
370 0.35
371 0.4
372 0.45
373 0.5
374 0.49
375 0.47
376 0.52
377 0.55
378 0.51
379 0.47
380 0.42
381 0.35
382 0.33
383 0.3
384 0.24
385 0.16
386 0.16
387 0.17
388 0.15
389 0.16
390 0.19
391 0.19
392 0.17
393 0.17
394 0.16
395 0.13
396 0.13
397 0.13
398 0.12
399 0.11
400 0.14
401 0.21
402 0.22
403 0.22
404 0.24
405 0.23
406 0.24
407 0.24
408 0.22
409 0.16
410 0.15
411 0.14
412 0.19
413 0.22
414 0.26
415 0.34
416 0.39
417 0.45
418 0.53
419 0.63
420 0.64
421 0.69
422 0.74
423 0.72
424 0.77
425 0.8
426 0.79
427 0.8
428 0.82
429 0.83