FuNGI

A0A010R5W9

Protein Details

Accession

A0A010R5W9

Localization Confidence

High

Confidence Score

19.5

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
23-48	QHGQARPPPIKRRPKGDPLVARKRPG	Basic
210-234	LKDPSLDKKPKPKEKEKDVQFHRQP	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
27-58	ARPPPIKRRPKGDPLVARKRPGAPRPAASRPP
216-239	DKKPKPKEKEKDVQFHRQPRSEKE
431-450	KAEEERRKEGKRTTKALIKR
528-538	LKKGKSLKRPG
551-557	SRKKLKK

Subcellular Location(s)

nucl 22.5, cyto_nucl 14, cyto 4.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR008851 TFIIF-alpha IPR011039 TFIIF_interaction
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003677 F:DNA binding GO:0003743 F:translation initiation factor activity GO:0032968 P:positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II GO:0006367 P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter
KEGG	cfj:CFIO01_09060 -
Pfam	View protein in Pfam PF05793 TFIIF_alpha

Amino Acid Sequences

MSAPPPGLPNGQNPNGLPGQPGQHGQARPPPIKRRPKGDPLVARKRPGAPRPAASRPPPGSLQTASGARPSAGGTGHHGLQRPETEEDIRAKRAANGGWLDPAPQNVREFKIVTTKKALKDGVRHHVMKLSSAKAELERNGIDPTNQDEFTRPVTLQRRDPRQPPPGREVKHEEPEPQPVDEKEAERLAQLKAEREAVRAVELAKSAPSLKDPSLDKKPKPKEKEKDVQFHRQPRSEKEKKQQGLRYEEALPWHLEDADGKNVWVGSYVAPLSETTVCFVATRDGKFAAIPLEKWYKFTAKPHFNTMRLEEAEALMSKKTDIGRWYMRDKQKKSEQEEWEATRHALYGPARIKTESSTFRAASREEKQDHDEIDMEGDEFQDDDENPGLDVDNDEDTKEATDRIRRDQMGANLFGEADERRVEKELNEMRKAEEERRKEGKRTTKALIKREKETIYQSDSSGYDPFESSSSDDDSDEEKKKEEEKDKDKDEENKDKDKDGDSKDKTALGVSSKGNTTPSGRQKHTDALKKGKSLKRPGSPNLSESSGNESSRKKLKKHAAASVHQSRSSTPSGGLKSHLKGAMSDGEATGGEMSDGQLRKKKIKLVGSGARGTPVGSRAGSPVPAASGSKPGSPVPEGSPAPRGPIQAHEIVDALPELPGGISIGNLMRRFQGRIGDGPGQMDRKEWIKLVKENCAYGSDKILRRRP

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.43
2	0.41
3	0.39
4	0.33
5	0.27
6	0.28
7	0.27
8	0.29
9	0.27
10	0.31
11	0.32
12	0.35
13	0.39
14	0.44
15	0.48
16	0.55
17	0.62
18	0.65
19	0.75
20	0.78
21	0.79
22	0.8
23	0.83
24	0.83
25	0.83
26	0.83
27	0.83
28	0.87
29	0.84
30	0.79
31	0.73
32	0.72
33	0.71
34	0.69
35	0.68
36	0.63
37	0.65
38	0.69
39	0.73
40	0.72
41	0.68
42	0.7
43	0.64
44	0.62
45	0.57
46	0.52
47	0.48
48	0.41
49	0.39
50	0.34
51	0.33
52	0.29
53	0.28
54	0.26
55	0.21
56	0.2
57	0.18
58	0.15
59	0.14
60	0.14
61	0.17
62	0.2
63	0.23
64	0.25
65	0.26
66	0.25
67	0.29
68	0.31
69	0.29
70	0.29
71	0.29
72	0.29
73	0.31
74	0.37
75	0.37
76	0.37
77	0.34
78	0.32
79	0.32
80	0.35
81	0.31
82	0.3
83	0.28
84	0.27
85	0.29
86	0.28
87	0.27
88	0.23
89	0.26
90	0.23
91	0.23
92	0.25
93	0.25
94	0.28
95	0.29
96	0.29
97	0.27
98	0.35
99	0.35
100	0.36
101	0.41
102	0.45
103	0.45
104	0.51
105	0.53
106	0.48
107	0.54
108	0.58
109	0.58
110	0.6
111	0.57
112	0.52
113	0.53
114	0.47
115	0.44
116	0.41
117	0.35
118	0.28
119	0.28
120	0.29
121	0.26
122	0.3
123	0.26
124	0.25
125	0.23
126	0.23
127	0.24
128	0.23
129	0.2
130	0.18
131	0.21
132	0.22
133	0.21
134	0.2
135	0.2
136	0.22
137	0.25
138	0.26
139	0.2
140	0.24
141	0.32
142	0.37
143	0.44
144	0.51
145	0.57
146	0.61
147	0.68
148	0.69
149	0.71
150	0.74
151	0.71
152	0.71
153	0.7
154	0.66
155	0.67
156	0.66
157	0.63
158	0.63
159	0.59
160	0.55
161	0.48
162	0.54
163	0.49
164	0.41
165	0.37
166	0.29
167	0.32
168	0.3
169	0.28
170	0.23
171	0.23
172	0.22
173	0.2
174	0.22
175	0.17
176	0.19
177	0.19
178	0.18
179	0.18
180	0.24
181	0.24
182	0.23
183	0.24
184	0.21
185	0.2
186	0.18
187	0.17
188	0.13
189	0.12
190	0.11
191	0.1
192	0.11
193	0.1
194	0.1
195	0.12
196	0.14
197	0.14
198	0.19
199	0.22
200	0.28
201	0.37
202	0.45
203	0.48
204	0.55
205	0.65
206	0.7
207	0.76
208	0.8
209	0.79
210	0.81
211	0.86
212	0.84
213	0.84
214	0.8
215	0.82
216	0.79
217	0.78
218	0.75
219	0.71
220	0.67
221	0.65
222	0.69
223	0.68
224	0.68
225	0.69
226	0.73
227	0.71
228	0.76
229	0.74
230	0.71
231	0.69
232	0.63
233	0.56
234	0.47
235	0.43
236	0.36
237	0.32
238	0.25
239	0.18
240	0.16
241	0.12
242	0.1
243	0.1
244	0.11
245	0.13
246	0.13
247	0.12
248	0.12
249	0.12
250	0.12
251	0.11
252	0.09
253	0.06
254	0.08
255	0.08
256	0.07
257	0.08
258	0.08
259	0.09
260	0.1
261	0.09
262	0.08
263	0.09
264	0.09
265	0.09
266	0.09
267	0.12
268	0.14
269	0.15
270	0.15
271	0.15
272	0.15
273	0.15
274	0.15
275	0.15
276	0.13
277	0.12
278	0.15
279	0.23
280	0.22
281	0.24
282	0.26
283	0.25
284	0.27
285	0.33
286	0.39
287	0.4
288	0.42
289	0.5
290	0.53
291	0.51
292	0.51
293	0.46
294	0.42
295	0.34
296	0.32
297	0.23
298	0.18
299	0.17
300	0.15
301	0.13
302	0.07
303	0.07
304	0.06
305	0.08
306	0.09
307	0.1
308	0.11
309	0.16
310	0.21
311	0.25
312	0.3
313	0.36
314	0.43
315	0.5
316	0.52
317	0.55
318	0.59
319	0.63
320	0.66
321	0.67
322	0.62
323	0.6
324	0.61
325	0.55
326	0.48
327	0.41
328	0.34
329	0.24
330	0.2
331	0.14
332	0.13
333	0.11
334	0.16
335	0.18
336	0.19
337	0.2
338	0.2
339	0.21
340	0.18
341	0.23
342	0.2
343	0.21
344	0.22
345	0.22
346	0.24
347	0.25
348	0.24
349	0.24
350	0.25
351	0.29
352	0.27
353	0.29
354	0.31
355	0.31
356	0.31
357	0.27
358	0.23
359	0.16
360	0.14
361	0.12
362	0.09
363	0.07
364	0.06
365	0.05
366	0.04
367	0.04
368	0.04
369	0.04
370	0.05
371	0.06
372	0.06
373	0.06
374	0.06
375	0.06
376	0.05
377	0.05
378	0.05
379	0.06
380	0.06
381	0.07
382	0.07
383	0.07
384	0.07
385	0.07
386	0.08
387	0.08
388	0.14
389	0.16
390	0.21
391	0.27
392	0.27
393	0.29
394	0.32
395	0.35
396	0.33
397	0.32
398	0.27
399	0.21
400	0.21
401	0.18
402	0.15
403	0.1
404	0.07
405	0.07
406	0.08
407	0.09
408	0.1
409	0.11
410	0.1
411	0.19
412	0.25
413	0.3
414	0.32
415	0.32
416	0.31
417	0.36
418	0.38
419	0.38
420	0.39
421	0.37
422	0.42
423	0.5
424	0.53
425	0.52
426	0.58
427	0.59
428	0.59
429	0.6
430	0.58
431	0.57
432	0.61
433	0.65
434	0.67
435	0.61
436	0.57
437	0.58
438	0.55
439	0.5
440	0.48
441	0.43
442	0.39
443	0.36
444	0.32
445	0.28
446	0.27
447	0.25
448	0.21
449	0.17
450	0.12
451	0.11
452	0.12
453	0.1
454	0.1
455	0.1
456	0.11
457	0.12
458	0.12
459	0.12
460	0.12
461	0.14
462	0.19
463	0.22
464	0.21
465	0.2
466	0.21
467	0.26
468	0.33
469	0.39
470	0.44
471	0.48
472	0.56
473	0.59
474	0.62
475	0.63
476	0.64
477	0.63
478	0.64
479	0.61
480	0.62
481	0.58
482	0.56
483	0.53
484	0.49
485	0.48
486	0.44
487	0.49
488	0.43
489	0.46
490	0.45
491	0.43
492	0.39
493	0.32
494	0.28
495	0.2
496	0.21
497	0.18
498	0.19
499	0.18
500	0.19
501	0.19
502	0.19
503	0.21
504	0.25
505	0.33
506	0.39
507	0.41
508	0.43
509	0.45
510	0.52
511	0.56
512	0.56
513	0.55
514	0.57
515	0.59
516	0.62
517	0.69
518	0.67
519	0.67
520	0.68
521	0.7
522	0.68
523	0.71
524	0.71
525	0.72
526	0.68
527	0.62
528	0.55
529	0.49
530	0.41
531	0.34
532	0.36
533	0.3
534	0.28
535	0.3
536	0.28
537	0.31
538	0.4
539	0.45
540	0.41
541	0.47
542	0.56
543	0.62
544	0.67
545	0.71
546	0.69
547	0.68
548	0.74
549	0.74
550	0.67
551	0.59
552	0.52
553	0.44
554	0.41
555	0.39
556	0.3
557	0.23
558	0.26
559	0.27
560	0.28
561	0.31
562	0.31
563	0.3
564	0.34
565	0.34
566	0.28
567	0.25
568	0.27
569	0.28
570	0.24
571	0.23
572	0.17
573	0.16
574	0.16
575	0.15
576	0.12
577	0.07
578	0.06
579	0.05
580	0.06
581	0.11
582	0.13
583	0.16
584	0.22
585	0.26
586	0.33
587	0.38
588	0.44
589	0.46
590	0.53
591	0.57
592	0.61
593	0.65
594	0.65
595	0.64
596	0.57
597	0.51
598	0.43
599	0.35
600	0.28
601	0.21
602	0.18
603	0.15
604	0.15
605	0.16
606	0.18
607	0.19
608	0.17
609	0.16
610	0.14
611	0.15
612	0.16
613	0.14
614	0.19
615	0.2
616	0.21
617	0.23
618	0.23
619	0.25
620	0.25
621	0.27
622	0.24
623	0.3
624	0.29
625	0.3
626	0.35
627	0.32
628	0.35
629	0.35
630	0.33
631	0.27
632	0.31
633	0.34
634	0.32
635	0.33
636	0.28
637	0.26
638	0.24
639	0.23
640	0.18
641	0.13
642	0.08
643	0.07
644	0.06
645	0.05
646	0.05
647	0.05
648	0.05
649	0.04
650	0.06
651	0.09
652	0.14
653	0.15
654	0.16
655	0.2
656	0.23
657	0.26
658	0.27
659	0.31
660	0.3
661	0.33
662	0.39
663	0.4
664	0.38
665	0.39
666	0.41
667	0.37
668	0.33
669	0.3
670	0.27
671	0.25
672	0.27
673	0.28
674	0.31
675	0.35
676	0.42
677	0.46
678	0.53
679	0.53
680	0.52
681	0.5
682	0.47
683	0.43
684	0.37
685	0.4
686	0.39
687	0.42

A0A010R5W9

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer