Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A017SMJ1

Protein Details
Accession A0A017SMJ1    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
772-797SPFPDRSRSHRSPEHRRHDNHPLRRSBasic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 23, cyto_nucl 14.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
Amino Acid Sequences MLKPFQIRDLHGPRPQEDSNESLKNFAQTVIDHQTQPSRSGKHHGIVQLSSSDYDEIASTHPRARLTYPDDDDGEVITVGSSLELSQRLDEAVDVPIRSQLTQQSASTNDDKPMHIFDIRRSNSVTELWKKYGLDTQSPVLRNPEVDGTKQKSEGSVSPFRDGENTVDTNHQHTSASTESPEPLLTAFETELAQLLDASHISNDGEHAQKNLSASAGQNQTAGCDGQQSAADSFTQTLHHLVSGAWTFGSDMRSRMPGIEQQVRDVQRAIPEHVESTLQLALTAMESRVRTLSDALNDTAAAARAQGGNINTPGGVAASTVNGLRTMASELGEMGQTLFEAFEAELACNTTTSQGQGHHEDARVSSQPEITPGIQQPRPNAPFDDEKESLDSNKVKEGSGNTGPPGGHENVGPSAQPQQPEQPQAPLRPGPGLQPVDLPHRGPPPHPFGPRYPFHLPPPRPHPSFPHHHAPPPPPPVPSFQTHPIHNSFWQPHHPHPWSRVPHHPPPPQSRPWQFGWAPASRPDSYNQTSASDTSGSLQNGVAAKKSLFIGNVGFNVTEKMIKDVFASQGFLVEVHLPLDWQTRKHAGFGYLYFASIHAAKAALEALQGILIDGHSINLEFNDHIPITDVHASHDNDRSASRPGSNSAGAIPSTPELPGPRQLIDDSTGPNQTSRATKKLAETSALLDRDNEDSEFSARYPSLIPECSKRSSCSNIPTSGPLPHLSMESGMSRFPPVSQLDAYMVANQRRGTESNPRRRTSNGAENTVPQRSPFPDRSRSHRSPEHRRHDNHPLRRSNTMMPAHPASRLAGPFDPMAPTETPSATRELRRRATEIHTLLSNPQNNQSAPPLGSSYRNMPGSFPAGDERQYPVLDRNLRHPSTISRVDDCVDTLVSLGYGGAEEGGPQRLQVYAAAADGKVADAIEMIEDERKVYSQRR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.55
2 0.52
3 0.47
4 0.43
5 0.4
6 0.42
7 0.45
8 0.43
9 0.39
10 0.38
11 0.35
12 0.33
13 0.28
14 0.23
15 0.17
16 0.24
17 0.29
18 0.3
19 0.28
20 0.3
21 0.36
22 0.35
23 0.39
24 0.39
25 0.36
26 0.37
27 0.44
28 0.48
29 0.46
30 0.5
31 0.5
32 0.47
33 0.44
34 0.43
35 0.37
36 0.33
37 0.29
38 0.24
39 0.19
40 0.15
41 0.14
42 0.12
43 0.1
44 0.12
45 0.15
46 0.16
47 0.2
48 0.24
49 0.24
50 0.27
51 0.29
52 0.35
53 0.37
54 0.44
55 0.44
56 0.45
57 0.45
58 0.43
59 0.41
60 0.32
61 0.27
62 0.18
63 0.13
64 0.09
65 0.07
66 0.06
67 0.06
68 0.05
69 0.04
70 0.07
71 0.09
72 0.1
73 0.11
74 0.11
75 0.12
76 0.12
77 0.12
78 0.1
79 0.12
80 0.14
81 0.14
82 0.14
83 0.17
84 0.18
85 0.18
86 0.19
87 0.21
88 0.24
89 0.27
90 0.27
91 0.28
92 0.29
93 0.34
94 0.36
95 0.32
96 0.32
97 0.31
98 0.31
99 0.3
100 0.31
101 0.29
102 0.29
103 0.29
104 0.3
105 0.39
106 0.4
107 0.4
108 0.39
109 0.37
110 0.35
111 0.38
112 0.4
113 0.37
114 0.41
115 0.41
116 0.42
117 0.41
118 0.41
119 0.42
120 0.38
121 0.35
122 0.32
123 0.35
124 0.38
125 0.39
126 0.38
127 0.36
128 0.33
129 0.29
130 0.28
131 0.3
132 0.26
133 0.28
134 0.35
135 0.36
136 0.38
137 0.39
138 0.38
139 0.31
140 0.33
141 0.34
142 0.33
143 0.36
144 0.36
145 0.38
146 0.38
147 0.37
148 0.35
149 0.32
150 0.27
151 0.24
152 0.23
153 0.2
154 0.24
155 0.24
156 0.25
157 0.25
158 0.23
159 0.17
160 0.16
161 0.2
162 0.18
163 0.19
164 0.17
165 0.18
166 0.18
167 0.18
168 0.18
169 0.14
170 0.12
171 0.11
172 0.1
173 0.1
174 0.09
175 0.09
176 0.09
177 0.08
178 0.09
179 0.08
180 0.08
181 0.06
182 0.06
183 0.06
184 0.06
185 0.06
186 0.05
187 0.06
188 0.06
189 0.06
190 0.07
191 0.1
192 0.12
193 0.12
194 0.14
195 0.14
196 0.15
197 0.16
198 0.15
199 0.13
200 0.11
201 0.12
202 0.17
203 0.19
204 0.18
205 0.19
206 0.18
207 0.18
208 0.18
209 0.17
210 0.1
211 0.1
212 0.1
213 0.1
214 0.11
215 0.13
216 0.12
217 0.12
218 0.12
219 0.11
220 0.11
221 0.11
222 0.11
223 0.09
224 0.1
225 0.1
226 0.1
227 0.1
228 0.09
229 0.11
230 0.11
231 0.1
232 0.08
233 0.08
234 0.09
235 0.1
236 0.13
237 0.11
238 0.12
239 0.13
240 0.15
241 0.16
242 0.16
243 0.16
244 0.18
245 0.24
246 0.3
247 0.29
248 0.3
249 0.36
250 0.37
251 0.36
252 0.32
253 0.27
254 0.25
255 0.27
256 0.26
257 0.22
258 0.21
259 0.21
260 0.2
261 0.19
262 0.14
263 0.14
264 0.12
265 0.09
266 0.09
267 0.08
268 0.07
269 0.07
270 0.08
271 0.06
272 0.08
273 0.08
274 0.09
275 0.1
276 0.1
277 0.1
278 0.12
279 0.14
280 0.14
281 0.17
282 0.16
283 0.16
284 0.15
285 0.15
286 0.13
287 0.11
288 0.08
289 0.05
290 0.06
291 0.06
292 0.06
293 0.09
294 0.09
295 0.1
296 0.11
297 0.11
298 0.1
299 0.09
300 0.09
301 0.07
302 0.06
303 0.04
304 0.04
305 0.04
306 0.05
307 0.05
308 0.05
309 0.05
310 0.06
311 0.05
312 0.06
313 0.07
314 0.07
315 0.08
316 0.07
317 0.07
318 0.08
319 0.08
320 0.07
321 0.05
322 0.05
323 0.04
324 0.04
325 0.04
326 0.03
327 0.04
328 0.04
329 0.05
330 0.06
331 0.06
332 0.06
333 0.07
334 0.07
335 0.07
336 0.07
337 0.07
338 0.07
339 0.08
340 0.09
341 0.11
342 0.14
343 0.17
344 0.19
345 0.2
346 0.21
347 0.2
348 0.19
349 0.2
350 0.18
351 0.16
352 0.15
353 0.14
354 0.13
355 0.14
356 0.16
357 0.14
358 0.15
359 0.17
360 0.22
361 0.23
362 0.25
363 0.27
364 0.33
365 0.34
366 0.33
367 0.31
368 0.29
369 0.32
370 0.34
371 0.37
372 0.29
373 0.28
374 0.28
375 0.28
376 0.25
377 0.23
378 0.22
379 0.16
380 0.19
381 0.19
382 0.17
383 0.18
384 0.19
385 0.21
386 0.22
387 0.22
388 0.18
389 0.2
390 0.2
391 0.18
392 0.2
393 0.15
394 0.13
395 0.12
396 0.13
397 0.12
398 0.12
399 0.11
400 0.08
401 0.13
402 0.14
403 0.15
404 0.15
405 0.2
406 0.22
407 0.26
408 0.26
409 0.26
410 0.27
411 0.27
412 0.3
413 0.25
414 0.23
415 0.21
416 0.21
417 0.17
418 0.21
419 0.21
420 0.18
421 0.18
422 0.19
423 0.22
424 0.23
425 0.22
426 0.18
427 0.22
428 0.22
429 0.22
430 0.25
431 0.28
432 0.33
433 0.35
434 0.35
435 0.35
436 0.41
437 0.41
438 0.43
439 0.39
440 0.35
441 0.39
442 0.46
443 0.44
444 0.44
445 0.5
446 0.5
447 0.48
448 0.48
449 0.47
450 0.42
451 0.48
452 0.47
453 0.48
454 0.42
455 0.44
456 0.47
457 0.46
458 0.48
459 0.47
460 0.43
461 0.35
462 0.35
463 0.35
464 0.33
465 0.31
466 0.28
467 0.29
468 0.3
469 0.3
470 0.32
471 0.31
472 0.3
473 0.29
474 0.3
475 0.24
476 0.23
477 0.3
478 0.3
479 0.3
480 0.37
481 0.39
482 0.38
483 0.4
484 0.47
485 0.45
486 0.46
487 0.52
488 0.5
489 0.56
490 0.62
491 0.62
492 0.61
493 0.64
494 0.67
495 0.62
496 0.64
497 0.6
498 0.54
499 0.52
500 0.51
501 0.43
502 0.41
503 0.4
504 0.34
505 0.31
506 0.31
507 0.33
508 0.26
509 0.27
510 0.24
511 0.26
512 0.26
513 0.27
514 0.24
515 0.21
516 0.21
517 0.2
518 0.2
519 0.14
520 0.11
521 0.11
522 0.13
523 0.11
524 0.11
525 0.11
526 0.12
527 0.13
528 0.14
529 0.12
530 0.1
531 0.1
532 0.11
533 0.11
534 0.1
535 0.08
536 0.09
537 0.1
538 0.1
539 0.11
540 0.1
541 0.1
542 0.09
543 0.09
544 0.09
545 0.09
546 0.08
547 0.1
548 0.1
549 0.1
550 0.11
551 0.12
552 0.14
553 0.13
554 0.14
555 0.11
556 0.11
557 0.11
558 0.1
559 0.09
560 0.07
561 0.07
562 0.06
563 0.06
564 0.05
565 0.06
566 0.13
567 0.13
568 0.14
569 0.17
570 0.22
571 0.23
572 0.24
573 0.25
574 0.21
575 0.22
576 0.22
577 0.23
578 0.18
579 0.18
580 0.16
581 0.14
582 0.13
583 0.11
584 0.1
585 0.06
586 0.06
587 0.06
588 0.06
589 0.06
590 0.05
591 0.05
592 0.05
593 0.04
594 0.04
595 0.04
596 0.04
597 0.03
598 0.03
599 0.04
600 0.04
601 0.04
602 0.04
603 0.04
604 0.04
605 0.04
606 0.05
607 0.05
608 0.06
609 0.08
610 0.08
611 0.08
612 0.1
613 0.1
614 0.13
615 0.16
616 0.15
617 0.15
618 0.21
619 0.22
620 0.23
621 0.27
622 0.24
623 0.22
624 0.22
625 0.22
626 0.2
627 0.21
628 0.2
629 0.17
630 0.19
631 0.22
632 0.22
633 0.2
634 0.17
635 0.17
636 0.15
637 0.13
638 0.12
639 0.09
640 0.09
641 0.09
642 0.09
643 0.1
644 0.12
645 0.17
646 0.18
647 0.19
648 0.2
649 0.2
650 0.2
651 0.21
652 0.2
653 0.17
654 0.18
655 0.19
656 0.18
657 0.18
658 0.17
659 0.17
660 0.22
661 0.24
662 0.26
663 0.27
664 0.3
665 0.35
666 0.41
667 0.4
668 0.34
669 0.31
670 0.3
671 0.34
672 0.32
673 0.27
674 0.2
675 0.2
676 0.2
677 0.21
678 0.17
679 0.12
680 0.12
681 0.13
682 0.14
683 0.12
684 0.12
685 0.11
686 0.12
687 0.12
688 0.14
689 0.16
690 0.18
691 0.2
692 0.24
693 0.29
694 0.33
695 0.34
696 0.34
697 0.35
698 0.39
699 0.42
700 0.44
701 0.45
702 0.43
703 0.43
704 0.44
705 0.41
706 0.37
707 0.33
708 0.27
709 0.23
710 0.2
711 0.2
712 0.16
713 0.15
714 0.14
715 0.14
716 0.13
717 0.12
718 0.12
719 0.12
720 0.12
721 0.11
722 0.15
723 0.14
724 0.17
725 0.17
726 0.18
727 0.18
728 0.2
729 0.2
730 0.2
731 0.23
732 0.21
733 0.24
734 0.23
735 0.23
736 0.25
737 0.26
738 0.26
739 0.32
740 0.41
741 0.49
742 0.57
743 0.58
744 0.57
745 0.58
746 0.62
747 0.59
748 0.6
749 0.55
750 0.52
751 0.51
752 0.54
753 0.55
754 0.51
755 0.42
756 0.33
757 0.3
758 0.28
759 0.35
760 0.38
761 0.41
762 0.48
763 0.52
764 0.59
765 0.66
766 0.67
767 0.68
768 0.68
769 0.71
770 0.72
771 0.79
772 0.81
773 0.8
774 0.8
775 0.79
776 0.81
777 0.82
778 0.81
779 0.8
780 0.78
781 0.72
782 0.72
783 0.69
784 0.63
785 0.62
786 0.56
787 0.49
788 0.46
789 0.46
790 0.42
791 0.39
792 0.35
793 0.28
794 0.27
795 0.26
796 0.24
797 0.21
798 0.22
799 0.21
800 0.21
801 0.21
802 0.16
803 0.19
804 0.16
805 0.16
806 0.17
807 0.17
808 0.19
809 0.19
810 0.23
811 0.24
812 0.31
813 0.37
814 0.44
815 0.51
816 0.53
817 0.55
818 0.55
819 0.57
820 0.59
821 0.54
822 0.48
823 0.42
824 0.38
825 0.4
826 0.42
827 0.4
828 0.33
829 0.36
830 0.37
831 0.36
832 0.37
833 0.37
834 0.33
835 0.29
836 0.29
837 0.27
838 0.24
839 0.27
840 0.28
841 0.29
842 0.32
843 0.34
844 0.32
845 0.31
846 0.32
847 0.33
848 0.3
849 0.27
850 0.24
851 0.23
852 0.25
853 0.25
854 0.25
855 0.25
856 0.25
857 0.25
858 0.25
859 0.32
860 0.38
861 0.38
862 0.42
863 0.49
864 0.49
865 0.49
866 0.47
867 0.44
868 0.46
869 0.52
870 0.48
871 0.41
872 0.42
873 0.42
874 0.4
875 0.35
876 0.28
877 0.2
878 0.15
879 0.13
880 0.11
881 0.09
882 0.08
883 0.07
884 0.05
885 0.05
886 0.05
887 0.05
888 0.04
889 0.06
890 0.08
891 0.11
892 0.11
893 0.11
894 0.12
895 0.12
896 0.13
897 0.12
898 0.13
899 0.11
900 0.13
901 0.14
902 0.13
903 0.13
904 0.13
905 0.12
906 0.09
907 0.08
908 0.07
909 0.05
910 0.06
911 0.06
912 0.07
913 0.07
914 0.1
915 0.1
916 0.11
917 0.12
918 0.13