FuNGI

A0A017SRD9

Protein Details

Accession

A0A017SRD9

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

14.8

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
4-26	VITKPASHPPKMKRPPPPLGGQS	Hydrophilic
382-401	SPMHRDPPPSPKRRKRTVAE	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
392-396	PKRRK

Subcellular Location(s)

nucl 15, mito 9.5, cyto_mito 6.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR021950 Spt20 IPR046468 Spt20-like_SEP
Gene Ontology	GO:0000124 C:SAGA complex GO:0003712 F:transcription coregulator activity
Pfam	View protein in Pfam PF12090 Spt20
CDD	cd22249 UDM1_RNF168_RNF169-like

Amino Acid Sequences

MATVITKPASHPPKMKRPPPPLGGQSGLNGIRAPQQSPSSSSPSSASKRLPGSGQLDAANATGGQMANGVNGASFLNVSNNKGPLNRPRRDAQRIADHPTRVQRSLSKTMPTDNDRRVGKCPEPYVKTTPYILKKYAKNPPSLIVHLHPTHFRFEQQDGSFPYNSEMKVIIEHIRAGTVPHDMMEELLRANVRFYEGCLIVRVVDHKSATAQARKATATQSNDNNSPFSIHNYNEHITPSPFVPYPKHNQLASEQTASKTETATNGTPNQNKEVVKDASAKEAQAPLKPKVFTTVLHPTTRSLQAELTLLATTPDPRAARQQAEPSNDQTNGHVAKRQKMLVEPQHLLECEAKLTRALAPPLFLEPVDSLGAVQDLLKFMESPMHRDPPPSPKRRKRTVAELEADEALAAEEERFMLIMDERLESSVSNGAGGTKSAVDETSGGAPFEPRFSRFKTLENIRMQHEEKAKREHEIKLKQEMAKRQQQDMERERRRVLEQRQAEEHAREEARRQQLAAQQAQAQLAAQQQQSRLAQANGVSQGQQSSPVVRNQTPLNVSSPMVANTMATQGAVPMSITSSAQGGAGSPPRPPSALQHAHPSVIGHPMAPSRSQQGGQSRHGTPQMTQGTPAMSHATPIMRNATPRMSHGSPSHSGISQTPVMNQSMMTTPQMGSGGMGLTPQQQQLLLHQRQQAMIAAQQGNLGHSGLTPQQFSQLQANAHAQQNIQQYQQHLLQQQQQNQQQQQQQRIPNQHAYQAQLMRAQLTQMQMAQNQQQQHAQHPQPQNQQVQAQQNGGHQGSPQMTPQQQQQQILMAAAQANGGHLPQNFQGINMAQRYTQLYHQRLLRLRQEMAHRFTGQYGPPSQYPPHIAQQYGLGLERSAKVWVNELMKRERESVQQQRASQVAAVQAQVMQQQQQQQQNMMRNA

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.72
2	0.79
3	0.79
4	0.82
5	0.84
6	0.82
7	0.82
8	0.76
9	0.72
10	0.67
11	0.57
12	0.49
13	0.47
14	0.41
15	0.32
16	0.26
17	0.21
18	0.26
19	0.26
20	0.25
21	0.24
22	0.28
23	0.3
24	0.35
25	0.39
26	0.38
27	0.37
28	0.38
29	0.36
30	0.39
31	0.42
32	0.42
33	0.41
34	0.41
35	0.44
36	0.45
37	0.44
38	0.43
39	0.43
40	0.4
41	0.39
42	0.33
43	0.3
44	0.28
45	0.25
46	0.19
47	0.14
48	0.1
49	0.09
50	0.08
51	0.08
52	0.08
53	0.08
54	0.08
55	0.08
56	0.08
57	0.06
58	0.07
59	0.07
60	0.06
61	0.06
62	0.06
63	0.13
64	0.15
65	0.19
66	0.23
67	0.25
68	0.27
69	0.29
70	0.35
71	0.39
72	0.47
73	0.49
74	0.5
75	0.57
76	0.65
77	0.7
78	0.71
79	0.68
80	0.69
81	0.69
82	0.72
83	0.69
84	0.62
85	0.59
86	0.61
87	0.58
88	0.49
89	0.48
90	0.47
91	0.48
92	0.54
93	0.53
94	0.5
95	0.46
96	0.51
97	0.54
98	0.54
99	0.54
100	0.51
101	0.54
102	0.52
103	0.53
104	0.52
105	0.52
106	0.51
107	0.5
108	0.53
109	0.55
110	0.56
111	0.59
112	0.6
113	0.57
114	0.54
115	0.51
116	0.52
117	0.51
118	0.51
119	0.52
120	0.53
121	0.56
122	0.61
123	0.67
124	0.64
125	0.62
126	0.59
127	0.59
128	0.57
129	0.52
130	0.48
131	0.41
132	0.43
133	0.39
134	0.39
135	0.37
136	0.33
137	0.36
138	0.32
139	0.32
140	0.29
141	0.3
142	0.36
143	0.32
144	0.37
145	0.36
146	0.39
147	0.37
148	0.33
149	0.33
150	0.28
151	0.26
152	0.22
153	0.18
154	0.14
155	0.15
156	0.17
157	0.19
158	0.16
159	0.17
160	0.16
161	0.16
162	0.15
163	0.15
164	0.13
165	0.12
166	0.11
167	0.1
168	0.1
169	0.1
170	0.1
171	0.11
172	0.1
173	0.08
174	0.09
175	0.1
176	0.1
177	0.1
178	0.1
179	0.12
180	0.11
181	0.12
182	0.16
183	0.16
184	0.17
185	0.17
186	0.17
187	0.15
188	0.16
189	0.17
190	0.14
191	0.16
192	0.16
193	0.15
194	0.16
195	0.21
196	0.25
197	0.29
198	0.29
199	0.29
200	0.31
201	0.32
202	0.32
203	0.31
204	0.32
205	0.32
206	0.35
207	0.38
208	0.4
209	0.43
210	0.42
211	0.39
212	0.33
213	0.3
214	0.25
215	0.24
216	0.23
217	0.21
218	0.23
219	0.27
220	0.28
221	0.27
222	0.28
223	0.24
224	0.21
225	0.22
226	0.18
227	0.17
228	0.17
229	0.18
230	0.2
231	0.24
232	0.31
233	0.38
234	0.42
235	0.39
236	0.4
237	0.42
238	0.46
239	0.43
240	0.39
241	0.32
242	0.28
243	0.29
244	0.29
245	0.25
246	0.18
247	0.16
248	0.14
249	0.17
250	0.17
251	0.2
252	0.24
253	0.29
254	0.33
255	0.34
256	0.35
257	0.36
258	0.35
259	0.33
260	0.34
261	0.29
262	0.28
263	0.32
264	0.29
265	0.3
266	0.3
267	0.29
268	0.24
269	0.28
270	0.27
271	0.25
272	0.29
273	0.27
274	0.31
275	0.31
276	0.29
277	0.29
278	0.29
279	0.25
280	0.27
281	0.34
282	0.33
283	0.34
284	0.35
285	0.31
286	0.34
287	0.38
288	0.32
289	0.23
290	0.19
291	0.19
292	0.19
293	0.17
294	0.14
295	0.1
296	0.09
297	0.08
298	0.08
299	0.08
300	0.08
301	0.12
302	0.11
303	0.12
304	0.19
305	0.23
306	0.26
307	0.28
308	0.35
309	0.37
310	0.41
311	0.42
312	0.39
313	0.38
314	0.36
315	0.33
316	0.26
317	0.26
318	0.23
319	0.22
320	0.23
321	0.22
322	0.27
323	0.3
324	0.31
325	0.27
326	0.28
327	0.35
328	0.38
329	0.41
330	0.36
331	0.34
332	0.34
333	0.33
334	0.31
335	0.25
336	0.17
337	0.13
338	0.12
339	0.11
340	0.1
341	0.11
342	0.12
343	0.13
344	0.15
345	0.14
346	0.14
347	0.15
348	0.16
349	0.15
350	0.12
351	0.1
352	0.08
353	0.1
354	0.09
355	0.08
356	0.07
357	0.06
358	0.07
359	0.05
360	0.05
361	0.04
362	0.05
363	0.05
364	0.05
365	0.05
366	0.05
367	0.11
368	0.11
369	0.16
370	0.2
371	0.24
372	0.24
373	0.26
374	0.29
375	0.34
376	0.44
377	0.48
378	0.55
379	0.61
380	0.69
381	0.77
382	0.82
383	0.76
384	0.77
385	0.77
386	0.75
387	0.68
388	0.6
389	0.52
390	0.44
391	0.38
392	0.27
393	0.17
394	0.09
395	0.05
396	0.04
397	0.03
398	0.03
399	0.03
400	0.03
401	0.03
402	0.03
403	0.03
404	0.04
405	0.05
406	0.06
407	0.06
408	0.07
409	0.07
410	0.07
411	0.07
412	0.07
413	0.08
414	0.07
415	0.07
416	0.07
417	0.07
418	0.07
419	0.07
420	0.06
421	0.04
422	0.05
423	0.05
424	0.05
425	0.05
426	0.05
427	0.06
428	0.08
429	0.08
430	0.07
431	0.07
432	0.08
433	0.08
434	0.1
435	0.1
436	0.11
437	0.14
438	0.17
439	0.23
440	0.23
441	0.26
442	0.31
443	0.35
444	0.41
445	0.43
446	0.42
447	0.38
448	0.41
449	0.39
450	0.37
451	0.39
452	0.36
453	0.34
454	0.39
455	0.38
456	0.37
457	0.39
458	0.4
459	0.42
460	0.45
461	0.45
462	0.45
463	0.48
464	0.48
465	0.49
466	0.51
467	0.48
468	0.48
469	0.47
470	0.43
471	0.43
472	0.44
473	0.48
474	0.49
475	0.53
476	0.51
477	0.52
478	0.51
479	0.48
480	0.48
481	0.47
482	0.45
483	0.43
484	0.42
485	0.43
486	0.44
487	0.45
488	0.43
489	0.35
490	0.3
491	0.25
492	0.22
493	0.18
494	0.19
495	0.23
496	0.26
497	0.25
498	0.24
499	0.24
500	0.27
501	0.32
502	0.31
503	0.26
504	0.23
505	0.24
506	0.24
507	0.2
508	0.16
509	0.12
510	0.11
511	0.13
512	0.12
513	0.12
514	0.13
515	0.17
516	0.17
517	0.17
518	0.17
519	0.14
520	0.15
521	0.14
522	0.16
523	0.14
524	0.14
525	0.12
526	0.11
527	0.11
528	0.1
529	0.11
530	0.09
531	0.11
532	0.13
533	0.15
534	0.19
535	0.19
536	0.21
537	0.2
538	0.24
539	0.22
540	0.21
541	0.2
542	0.18
543	0.18
544	0.17
545	0.16
546	0.13
547	0.13
548	0.11
549	0.09
550	0.08
551	0.08
552	0.07
553	0.06
554	0.05
555	0.05
556	0.05
557	0.05
558	0.04
559	0.03
560	0.04
561	0.04
562	0.05
563	0.05
564	0.05
565	0.05
566	0.05
567	0.05
568	0.05
569	0.07
570	0.1
571	0.11
572	0.12
573	0.13
574	0.14
575	0.15
576	0.15
577	0.18
578	0.25
579	0.3
580	0.3
581	0.36
582	0.36
583	0.36
584	0.35
585	0.31
586	0.22
587	0.2
588	0.19
589	0.11
590	0.11
591	0.12
592	0.13
593	0.14
594	0.14
595	0.14
596	0.16
597	0.17
598	0.21
599	0.27
600	0.32
601	0.35
602	0.4
603	0.37
604	0.38
605	0.4
606	0.36
607	0.28
608	0.32
609	0.32
610	0.27
611	0.27
612	0.25
613	0.23
614	0.22
615	0.22
616	0.16
617	0.11
618	0.11
619	0.12
620	0.13
621	0.13
622	0.14
623	0.18
624	0.15
625	0.17
626	0.19
627	0.22
628	0.21
629	0.23
630	0.28
631	0.25
632	0.28
633	0.29
634	0.32
635	0.29
636	0.32
637	0.31
638	0.25
639	0.25
640	0.22
641	0.23
642	0.21
643	0.2
644	0.19
645	0.19
646	0.19
647	0.18
648	0.17
649	0.14
650	0.13
651	0.14
652	0.13
653	0.12
654	0.11
655	0.12
656	0.13
657	0.11
658	0.09
659	0.08
660	0.08
661	0.06
662	0.06
663	0.06
664	0.08
665	0.09
666	0.1
667	0.1
668	0.1
669	0.1
670	0.17
671	0.27
672	0.27
673	0.31
674	0.35
675	0.36
676	0.36
677	0.37
678	0.32
679	0.23
680	0.22
681	0.23
682	0.19
683	0.18
684	0.19
685	0.18
686	0.17
687	0.16
688	0.14
689	0.08
690	0.07
691	0.09
692	0.11
693	0.13
694	0.13
695	0.12
696	0.17
697	0.18
698	0.2
699	0.23
700	0.23
701	0.22
702	0.25
703	0.29
704	0.28
705	0.29
706	0.29
707	0.24
708	0.26
709	0.32
710	0.31
711	0.29
712	0.27
713	0.27
714	0.29
715	0.33
716	0.31
717	0.27
718	0.29
719	0.35
720	0.39
721	0.46
722	0.5
723	0.53
724	0.57
725	0.59
726	0.62
727	0.6
728	0.61
729	0.62
730	0.61
731	0.62
732	0.62
733	0.65
734	0.64
735	0.66
736	0.61
737	0.58
738	0.53
739	0.49
740	0.47
741	0.42
742	0.38
743	0.32
744	0.31
745	0.26
746	0.24
747	0.22
748	0.18
749	0.17
750	0.16
751	0.16
752	0.18
753	0.18
754	0.21
755	0.26
756	0.27
757	0.28
758	0.29
759	0.31
760	0.3
761	0.35
762	0.42
763	0.4
764	0.45
765	0.5
766	0.56
767	0.61
768	0.66
769	0.65
770	0.59
771	0.6
772	0.57
773	0.57
774	0.52
775	0.45
776	0.4
777	0.38
778	0.4
779	0.36
780	0.3
781	0.22
782	0.23
783	0.23
784	0.22
785	0.22
786	0.23
787	0.25
788	0.27
789	0.34
790	0.39
791	0.42
792	0.42
793	0.41
794	0.38
795	0.37
796	0.35
797	0.27
798	0.19
799	0.15
800	0.13
801	0.12
802	0.08
803	0.08
804	0.08
805	0.08
806	0.1
807	0.09
808	0.12
809	0.13
810	0.19
811	0.18
812	0.18
813	0.21
814	0.2
815	0.24
816	0.24
817	0.24
818	0.18
819	0.21
820	0.24
821	0.24
822	0.3
823	0.34
824	0.35
825	0.4
826	0.44
827	0.5
828	0.53
829	0.57
830	0.58
831	0.54
832	0.53
833	0.53
834	0.58
835	0.58
836	0.57
837	0.56
838	0.5
839	0.45
840	0.45
841	0.45
842	0.38
843	0.36
844	0.34
845	0.32
846	0.33
847	0.36
848	0.36
849	0.35
850	0.38
851	0.37
852	0.42
853	0.41
854	0.39
855	0.36
856	0.38
857	0.35
858	0.32
859	0.28
860	0.2
861	0.17
862	0.19
863	0.19
864	0.16
865	0.16
866	0.17
867	0.17
868	0.2
869	0.26
870	0.3
871	0.32
872	0.37
873	0.42
874	0.45
875	0.47
876	0.47
877	0.45
878	0.46
879	0.53
880	0.58
881	0.6
882	0.62
883	0.61
884	0.61
885	0.59
886	0.53
887	0.43
888	0.35
889	0.3
890	0.25
891	0.23
892	0.19
893	0.18
894	0.18
895	0.2
896	0.2
897	0.18
898	0.2
899	0.27
900	0.34
901	0.41
902	0.43
903	0.46
904	0.51

A0A017SRD9

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer