Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A017SA62

Protein Details
Accession A0A017SA62    Localization Confidence High Confidence Score 16.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
20-65GDEFRTSKKDKRTIKHSSFISKIEKNSKKAPKKRRASKKLATLNSLHydrophilic
85-104VNIIKQKTLKHKPGAEKHFGHydrophilic
594-619ESQWEEKVQREKKDKEFKAKAQSKEGHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
27-58KKDKRTIKHSSFISKIEKNSKKAPKKRRASKK
Subcellular Location(s) nucl 13, cyto_nucl 10.5, mito 6, cyto 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR003593  AAA+_ATPase  
IPR003959  ATPase_AAA_core  
IPR019489  Clp_ATPase_C  
IPR027417  P-loop_NTPase  
IPR028160  Slx9-like  
Gene Ontology GO:0030686  C:90S preribosome  
GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0030688  C:preribosome, small subunit precursor  
GO:0005524  F:ATP binding  
GO:0016887  F:ATP hydrolysis activity  
GO:0008233  F:peptidase activity  
GO:0000462  P:maturation of SSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)  
GO:0006508  P:proteolysis  
Pfam View protein in Pfam  
PF07724  AAA_2  
PF10431  ClpB_D2-small  
PF15341  SLX9  
Amino Acid Sequences MQTSGRGAVPSTKSNDGLFGDEFRTSKKDKRTIKHSSFISKIEKNSKKAPKKRRASKKLATLNSLADALPDADTQEDQQDPNSQVNIIKQKTLKHKPGAEKHFGNQSWSSSYEPGLPTAGPLGATPAFGAPRITPRVLKQYLDQFVVGQDRAKKILSVAVYNHYQRVQELQRRGEEAEEEQAKRERREALEGHPVEDLPELVDTAPLQLEKSNILLMGPSGVGKTLMAKTLARVLSVPFSISDCTSITQAGYIGEDAEACVHRLLAASNYNVEQAERGIIVLDEVDKLAAAKVSHGKDVSGEGAQQALLKIIEGTTVQVQAKQERNSPHTGGTPNTYPSNSPLGNPPNSGGQPAKGEVYNVRTDNILFVFSGAFVGLHKVIMDRISRGSIGFGQPVRSATSTGDRPGEAGSGNNQPVPILPGSEEEELYKKHLPFFTPPSIASPDSEPSYFNSLDLVTPTDLQNYGFIPELVGRVPVTAALATLTQALLVRILTEPRNSLLAQYTALFSLSGIELRFTTLALHKVAANAFQMGTGARALRTEMETILSDAMFEAPGSSVKFVLVTEAVADREEKPIYLARGQGGKFHSMIATEESQWEEKVQREKKDKEFKAKAQSKEGIDFTSNYREEQSHASGS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.36
2 0.39
3 0.33
4 0.32
5 0.28
6 0.25
7 0.23
8 0.24
9 0.24
10 0.23
11 0.27
12 0.27
13 0.34
14 0.41
15 0.49
16 0.56
17 0.65
18 0.72
19 0.78
20 0.81
21 0.82
22 0.78
23 0.77
24 0.72
25 0.69
26 0.67
27 0.62
28 0.62
29 0.64
30 0.65
31 0.62
32 0.68
33 0.73
34 0.75
35 0.8
36 0.83
37 0.83
38 0.87
39 0.92
40 0.93
41 0.93
42 0.92
43 0.92
44 0.91
45 0.9
46 0.85
47 0.79
48 0.71
49 0.62
50 0.53
51 0.45
52 0.34
53 0.24
54 0.19
55 0.14
56 0.13
57 0.1
58 0.09
59 0.09
60 0.1
61 0.1
62 0.13
63 0.14
64 0.13
65 0.15
66 0.2
67 0.21
68 0.24
69 0.24
70 0.21
71 0.22
72 0.29
73 0.36
74 0.32
75 0.35
76 0.35
77 0.42
78 0.52
79 0.6
80 0.62
81 0.61
82 0.68
83 0.73
84 0.8
85 0.81
86 0.79
87 0.72
88 0.67
89 0.68
90 0.61
91 0.55
92 0.47
93 0.41
94 0.35
95 0.34
96 0.33
97 0.24
98 0.24
99 0.25
100 0.23
101 0.21
102 0.19
103 0.17
104 0.15
105 0.15
106 0.14
107 0.09
108 0.08
109 0.11
110 0.1
111 0.1
112 0.1
113 0.1
114 0.1
115 0.11
116 0.12
117 0.1
118 0.16
119 0.21
120 0.22
121 0.24
122 0.27
123 0.37
124 0.38
125 0.38
126 0.37
127 0.41
128 0.43
129 0.42
130 0.38
131 0.28
132 0.28
133 0.3
134 0.25
135 0.2
136 0.21
137 0.21
138 0.22
139 0.22
140 0.2
141 0.18
142 0.22
143 0.2
144 0.19
145 0.19
146 0.21
147 0.25
148 0.26
149 0.28
150 0.25
151 0.23
152 0.21
153 0.26
154 0.3
155 0.33
156 0.38
157 0.41
158 0.42
159 0.44
160 0.44
161 0.38
162 0.31
163 0.25
164 0.26
165 0.26
166 0.24
167 0.25
168 0.3
169 0.32
170 0.32
171 0.34
172 0.32
173 0.29
174 0.35
175 0.35
176 0.35
177 0.42
178 0.41
179 0.39
180 0.33
181 0.31
182 0.25
183 0.22
184 0.17
185 0.07
186 0.07
187 0.06
188 0.06
189 0.06
190 0.05
191 0.06
192 0.06
193 0.06
194 0.06
195 0.07
196 0.07
197 0.08
198 0.08
199 0.08
200 0.07
201 0.07
202 0.07
203 0.06
204 0.06
205 0.06
206 0.05
207 0.04
208 0.05
209 0.05
210 0.05
211 0.08
212 0.08
213 0.09
214 0.1
215 0.1
216 0.11
217 0.17
218 0.18
219 0.15
220 0.15
221 0.14
222 0.15
223 0.15
224 0.15
225 0.09
226 0.1
227 0.1
228 0.1
229 0.1
230 0.09
231 0.09
232 0.09
233 0.09
234 0.08
235 0.07
236 0.08
237 0.06
238 0.06
239 0.05
240 0.05
241 0.05
242 0.05
243 0.04
244 0.05
245 0.05
246 0.06
247 0.06
248 0.05
249 0.05
250 0.06
251 0.06
252 0.07
253 0.09
254 0.09
255 0.1
256 0.11
257 0.11
258 0.11
259 0.1
260 0.08
261 0.06
262 0.07
263 0.06
264 0.05
265 0.05
266 0.04
267 0.04
268 0.04
269 0.04
270 0.04
271 0.04
272 0.04
273 0.03
274 0.04
275 0.04
276 0.05
277 0.05
278 0.06
279 0.12
280 0.13
281 0.15
282 0.15
283 0.15
284 0.14
285 0.15
286 0.15
287 0.09
288 0.08
289 0.07
290 0.07
291 0.07
292 0.07
293 0.06
294 0.05
295 0.04
296 0.04
297 0.04
298 0.04
299 0.04
300 0.04
301 0.05
302 0.05
303 0.08
304 0.08
305 0.1
306 0.11
307 0.15
308 0.2
309 0.21
310 0.25
311 0.27
312 0.31
313 0.33
314 0.33
315 0.29
316 0.28
317 0.28
318 0.24
319 0.23
320 0.21
321 0.19
322 0.19
323 0.18
324 0.15
325 0.16
326 0.2
327 0.17
328 0.16
329 0.2
330 0.24
331 0.25
332 0.25
333 0.23
334 0.22
335 0.22
336 0.23
337 0.17
338 0.14
339 0.14
340 0.14
341 0.15
342 0.11
343 0.12
344 0.12
345 0.15
346 0.17
347 0.16
348 0.16
349 0.15
350 0.15
351 0.16
352 0.14
353 0.11
354 0.07
355 0.07
356 0.06
357 0.06
358 0.06
359 0.05
360 0.04
361 0.03
362 0.05
363 0.05
364 0.05
365 0.05
366 0.05
367 0.06
368 0.08
369 0.09
370 0.09
371 0.1
372 0.11
373 0.11
374 0.11
375 0.12
376 0.12
377 0.12
378 0.14
379 0.14
380 0.14
381 0.15
382 0.16
383 0.17
384 0.15
385 0.15
386 0.13
387 0.17
388 0.17
389 0.18
390 0.19
391 0.17
392 0.17
393 0.16
394 0.15
395 0.11
396 0.1
397 0.11
398 0.14
399 0.15
400 0.15
401 0.14
402 0.13
403 0.13
404 0.16
405 0.13
406 0.08
407 0.08
408 0.1
409 0.13
410 0.14
411 0.14
412 0.12
413 0.14
414 0.15
415 0.18
416 0.2
417 0.18
418 0.21
419 0.23
420 0.25
421 0.28
422 0.34
423 0.37
424 0.34
425 0.34
426 0.33
427 0.35
428 0.33
429 0.29
430 0.24
431 0.21
432 0.21
433 0.2
434 0.17
435 0.16
436 0.21
437 0.19
438 0.17
439 0.15
440 0.14
441 0.14
442 0.14
443 0.14
444 0.1
445 0.11
446 0.11
447 0.12
448 0.12
449 0.12
450 0.12
451 0.1
452 0.11
453 0.1
454 0.1
455 0.09
456 0.09
457 0.1
458 0.09
459 0.09
460 0.08
461 0.08
462 0.08
463 0.07
464 0.07
465 0.06
466 0.06
467 0.05
468 0.06
469 0.06
470 0.06
471 0.06
472 0.05
473 0.06
474 0.06
475 0.06
476 0.06
477 0.06
478 0.07
479 0.1
480 0.12
481 0.13
482 0.14
483 0.15
484 0.18
485 0.17
486 0.17
487 0.17
488 0.16
489 0.16
490 0.15
491 0.15
492 0.13
493 0.13
494 0.11
495 0.08
496 0.08
497 0.08
498 0.09
499 0.08
500 0.09
501 0.08
502 0.1
503 0.1
504 0.09
505 0.11
506 0.12
507 0.15
508 0.15
509 0.16
510 0.15
511 0.18
512 0.18
513 0.18
514 0.16
515 0.14
516 0.13
517 0.12
518 0.12
519 0.09
520 0.1
521 0.09
522 0.09
523 0.08
524 0.09
525 0.1
526 0.11
527 0.13
528 0.14
529 0.13
530 0.14
531 0.15
532 0.15
533 0.15
534 0.13
535 0.11
536 0.1
537 0.1
538 0.08
539 0.07
540 0.06
541 0.06
542 0.08
543 0.1
544 0.1
545 0.1
546 0.1
547 0.1
548 0.1
549 0.12
550 0.1
551 0.09
552 0.1
553 0.11
554 0.12
555 0.12
556 0.14
557 0.12
558 0.16
559 0.16
560 0.14
561 0.16
562 0.2
563 0.23
564 0.25
565 0.26
566 0.26
567 0.33
568 0.33
569 0.36
570 0.34
571 0.34
572 0.31
573 0.29
574 0.26
575 0.2
576 0.22
577 0.21
578 0.2
579 0.18
580 0.2
581 0.22
582 0.22
583 0.22
584 0.23
585 0.21
586 0.25
587 0.34
588 0.4
589 0.46
590 0.55
591 0.62
592 0.71
593 0.78
594 0.81
595 0.82
596 0.85
597 0.83
598 0.85
599 0.85
600 0.8
601 0.78
602 0.77
603 0.7
604 0.66
605 0.6
606 0.52
607 0.46
608 0.42
609 0.37
610 0.4
611 0.36
612 0.31
613 0.32
614 0.29
615 0.3
616 0.34