Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A017SJK1

Protein Details
Accession A0A017SJK1    Localization Confidence High Confidence Score 15.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
92-119EKDEEQDKRREQKQRRGRPDEERKRGQRBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
99-117KRREQKQRRGRPDEERKRG
162-175KKKRREERLVIRKK
Subcellular Location(s) nucl 21, cyto_nucl 13.5, cyto 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039853  Pinin  
IPR006786  Pinin_SDK_MemA  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0006397  P:mRNA processing  
GO:0008380  P:RNA splicing  
Pfam View protein in Pfam  
PF04696  Pinin_SDK_memA  
Amino Acid Sequences MTEGLASAVSLPDQDTVSSPPAEPTLKRKSSITDPDAKRRRLSSHDNPSNDVNPNDHEKENFESSANEKERRPSAGVGTTETETVTDKPAPEKDEEQDKRREQKQRRGRPDEERKRGQRLFGALLGTLSQSSNSTAQRRRADIERRQQDKLKVQDEEYDELKKKRREERLVIRKKEQKLYEEEAMRTRHSNLTAMARFLKTRTEPVLYYKPWELRREDEDIIQDQIEDTENTVAREVAEFEARYPPPQQTEEENPPETKPKPQVGKEVEEDKPADHPAPVPEVESEHKNETREPQETTHEASDRVDAETNRDQSFEDNNQHARTDHEPQPDPSEADHPDDGGEVVEEDNEDTVIY
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.1
2 0.11
3 0.14
4 0.17
5 0.18
6 0.18
7 0.18
8 0.21
9 0.24
10 0.25
11 0.3
12 0.38
13 0.4
14 0.42
15 0.42
16 0.44
17 0.5
18 0.58
19 0.56
20 0.56
21 0.58
22 0.67
23 0.75
24 0.73
25 0.68
26 0.62
27 0.62
28 0.59
29 0.63
30 0.63
31 0.65
32 0.7
33 0.68
34 0.66
35 0.65
36 0.61
37 0.55
38 0.46
39 0.37
40 0.32
41 0.36
42 0.37
43 0.34
44 0.3
45 0.3
46 0.34
47 0.35
48 0.32
49 0.25
50 0.23
51 0.24
52 0.33
53 0.35
54 0.33
55 0.31
56 0.36
57 0.38
58 0.4
59 0.41
60 0.33
61 0.34
62 0.36
63 0.36
64 0.33
65 0.32
66 0.28
67 0.26
68 0.23
69 0.19
70 0.14
71 0.14
72 0.14
73 0.14
74 0.14
75 0.18
76 0.21
77 0.23
78 0.25
79 0.27
80 0.28
81 0.37
82 0.42
83 0.43
84 0.49
85 0.53
86 0.58
87 0.63
88 0.69
89 0.67
90 0.72
91 0.78
92 0.8
93 0.84
94 0.85
95 0.83
96 0.84
97 0.86
98 0.87
99 0.85
100 0.84
101 0.78
102 0.79
103 0.74
104 0.65
105 0.58
106 0.51
107 0.44
108 0.36
109 0.32
110 0.22
111 0.2
112 0.18
113 0.14
114 0.1
115 0.08
116 0.06
117 0.05
118 0.07
119 0.11
120 0.14
121 0.2
122 0.25
123 0.33
124 0.36
125 0.38
126 0.4
127 0.44
128 0.5
129 0.53
130 0.58
131 0.6
132 0.6
133 0.62
134 0.63
135 0.61
136 0.6
137 0.58
138 0.52
139 0.44
140 0.4
141 0.42
142 0.4
143 0.37
144 0.31
145 0.28
146 0.26
147 0.28
148 0.34
149 0.33
150 0.37
151 0.42
152 0.5
153 0.54
154 0.6
155 0.68
156 0.72
157 0.78
158 0.76
159 0.75
160 0.73
161 0.69
162 0.67
163 0.59
164 0.51
165 0.47
166 0.48
167 0.46
168 0.41
169 0.38
170 0.35
171 0.34
172 0.31
173 0.26
174 0.23
175 0.2
176 0.18
177 0.18
178 0.15
179 0.21
180 0.21
181 0.21
182 0.21
183 0.19
184 0.19
185 0.18
186 0.2
187 0.15
188 0.17
189 0.19
190 0.19
191 0.19
192 0.25
193 0.32
194 0.28
195 0.3
196 0.3
197 0.33
198 0.35
199 0.39
200 0.35
201 0.32
202 0.35
203 0.38
204 0.35
205 0.31
206 0.29
207 0.27
208 0.25
209 0.21
210 0.17
211 0.11
212 0.11
213 0.1
214 0.07
215 0.07
216 0.09
217 0.09
218 0.1
219 0.1
220 0.1
221 0.09
222 0.09
223 0.1
224 0.08
225 0.1
226 0.1
227 0.11
228 0.18
229 0.18
230 0.19
231 0.19
232 0.2
233 0.22
234 0.24
235 0.25
236 0.24
237 0.31
238 0.37
239 0.41
240 0.41
241 0.39
242 0.38
243 0.42
244 0.37
245 0.37
246 0.35
247 0.38
248 0.44
249 0.46
250 0.54
251 0.54
252 0.58
253 0.56
254 0.56
255 0.49
256 0.45
257 0.42
258 0.33
259 0.3
260 0.26
261 0.22
262 0.17
263 0.17
264 0.16
265 0.19
266 0.19
267 0.17
268 0.16
269 0.18
270 0.21
271 0.22
272 0.24
273 0.26
274 0.28
275 0.28
276 0.3
277 0.35
278 0.38
279 0.38
280 0.38
281 0.35
282 0.39
283 0.4
284 0.42
285 0.39
286 0.34
287 0.32
288 0.3
289 0.3
290 0.24
291 0.24
292 0.24
293 0.19
294 0.24
295 0.31
296 0.34
297 0.31
298 0.31
299 0.29
300 0.28
301 0.34
302 0.34
303 0.33
304 0.35
305 0.39
306 0.4
307 0.41
308 0.38
309 0.36
310 0.35
311 0.36
312 0.37
313 0.41
314 0.44
315 0.45
316 0.51
317 0.49
318 0.46
319 0.4
320 0.39
321 0.33
322 0.34
323 0.32
324 0.26
325 0.23
326 0.22
327 0.2
328 0.14
329 0.12
330 0.08
331 0.07
332 0.07
333 0.07
334 0.07
335 0.07