Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A017SHT5

Protein Details
Accession A0A017SHT5    Localization Confidence High Confidence Score 23.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
19-58AIQPEGKKPKHEKASKDKKEKKEKKEKKSKSRDVEEDVNGBasic
64-120KAEEVKEEKKEKKEKREKKEKKEKKEKKEKSDKKEKKEKKEKKEKKDLKKETSEEKEBasic
157-185KEETLEEKRERRKKNKKEKKEKKAQEAAEBasic
315-343DERQRTSKQMSKEKDRKTRHKNGEEEGGABasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
24-50GKKPKHEKASKDKKEKKEKKEKKSKSR
68-113VKEEKKEKKEKREKKEKKEKKEKKEKSDKKEKKEKKEKKEKKDLKK
164-180KRERRKKNKKEKKEKKA
325-333SKEKDRKTR
Subcellular Location(s) nucl 23, cyto_nucl 13.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR034228  Nop6_RRM  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12400  RRM_Nop6  
Amino Acid Sequences MGDKKRKLTQNPVEEEEPAIQPEGKKPKHEKASKDKKEKKEKKEKKSKSRDVEEDVNGKNTEEKAEEVKEEKKEKKEKREKKEKKEKKEKKEKSDKKEKKEKKEKKEKKDLKKETSEEKEEKEEGEAEDKAAPTAEELPDTMDVDVKSTEKKGDENKEETLEEKRERRKKNKKEKKEKKAQEAAENAKQQEQQSEEQQEQQNEEQQKSSRFIAFVGNLPYSANNESIKEHFVKNPPASIRVATEKDKPTRCRGFAFIEFENFDRMKTCLKLYHHSMFNDGKYPPRRINVELTAGGGGKSDYRQSKIETKNKKLNDERQRTSKQMSKEKDRKTRHKNGEEEGGAQAVANPDDNFAGVHPSRRMRLP
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.61
2 0.55
3 0.47
4 0.38
5 0.29
6 0.24
7 0.2
8 0.19
9 0.27
10 0.35
11 0.36
12 0.44
13 0.51
14 0.59
15 0.68
16 0.74
17 0.76
18 0.77
19 0.84
20 0.86
21 0.89
22 0.89
23 0.89
24 0.93
25 0.93
26 0.93
27 0.93
28 0.93
29 0.93
30 0.94
31 0.95
32 0.94
33 0.95
34 0.95
35 0.94
36 0.93
37 0.89
38 0.84
39 0.81
40 0.75
41 0.71
42 0.62
43 0.55
44 0.46
45 0.39
46 0.35
47 0.28
48 0.25
49 0.19
50 0.2
51 0.2
52 0.22
53 0.24
54 0.24
55 0.3
56 0.34
57 0.41
58 0.46
59 0.51
60 0.59
61 0.66
62 0.74
63 0.79
64 0.82
65 0.85
66 0.9
67 0.91
68 0.92
69 0.95
70 0.94
71 0.94
72 0.95
73 0.94
74 0.94
75 0.95
76 0.93
77 0.93
78 0.94
79 0.93
80 0.92
81 0.93
82 0.91
83 0.9
84 0.91
85 0.9
86 0.9
87 0.91
88 0.91
89 0.91
90 0.93
91 0.93
92 0.92
93 0.94
94 0.93
95 0.93
96 0.94
97 0.92
98 0.9
99 0.88
100 0.82
101 0.8
102 0.77
103 0.74
104 0.65
105 0.58
106 0.53
107 0.45
108 0.4
109 0.32
110 0.26
111 0.19
112 0.19
113 0.17
114 0.13
115 0.14
116 0.14
117 0.12
118 0.11
119 0.1
120 0.08
121 0.1
122 0.09
123 0.08
124 0.08
125 0.09
126 0.1
127 0.1
128 0.09
129 0.09
130 0.09
131 0.09
132 0.1
133 0.09
134 0.1
135 0.1
136 0.12
137 0.11
138 0.15
139 0.21
140 0.29
141 0.33
142 0.36
143 0.36
144 0.37
145 0.36
146 0.34
147 0.31
148 0.27
149 0.26
150 0.29
151 0.37
152 0.43
153 0.52
154 0.62
155 0.69
156 0.75
157 0.83
158 0.87
159 0.9
160 0.92
161 0.95
162 0.95
163 0.95
164 0.92
165 0.9
166 0.87
167 0.79
168 0.74
169 0.69
170 0.63
171 0.58
172 0.52
173 0.43
174 0.36
175 0.35
176 0.29
177 0.25
178 0.23
179 0.19
180 0.21
181 0.23
182 0.22
183 0.25
184 0.28
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187 0.24
188 0.25
189 0.25
190 0.25
191 0.22
192 0.21
193 0.23
194 0.23
195 0.25
196 0.2
197 0.18
198 0.18
199 0.19
200 0.18
201 0.18
202 0.18
203 0.16
204 0.15
205 0.15
206 0.14
207 0.13
208 0.14
209 0.13
210 0.11
211 0.12
212 0.14
213 0.15
214 0.17
215 0.17
216 0.18
217 0.2
218 0.24
219 0.31
220 0.3
221 0.34
222 0.32
223 0.33
224 0.32
225 0.29
226 0.27
227 0.25
228 0.27
229 0.25
230 0.31
231 0.35
232 0.42
233 0.48
234 0.49
235 0.53
236 0.57
237 0.57
238 0.53
239 0.51
240 0.49
241 0.47
242 0.48
243 0.4
244 0.35
245 0.34
246 0.31
247 0.31
248 0.25
249 0.19
250 0.16
251 0.16
252 0.17
253 0.18
254 0.19
255 0.21
256 0.25
257 0.31
258 0.37
259 0.43
260 0.45
261 0.43
262 0.47
263 0.44
264 0.42
265 0.4
266 0.34
267 0.35
268 0.36
269 0.41
270 0.4
271 0.42
272 0.45
273 0.44
274 0.5
275 0.46
276 0.46
277 0.41
278 0.37
279 0.32
280 0.28
281 0.25
282 0.17
283 0.13
284 0.09
285 0.1
286 0.15
287 0.18
288 0.21
289 0.24
290 0.28
291 0.38
292 0.47
293 0.55
294 0.59
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296 0.71
297 0.73
298 0.78
299 0.78
300 0.78
301 0.8
302 0.8
303 0.78
304 0.78
305 0.79
306 0.75
307 0.73
308 0.68
309 0.67
310 0.67
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312 0.7
313 0.73
314 0.78
315 0.82
316 0.86
317 0.88
318 0.88
319 0.9
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324 0.81
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327 0.54
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332 0.14
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334 0.13
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336 0.12
337 0.12
338 0.13
339 0.11
340 0.1
341 0.17
342 0.16
343 0.21
344 0.27
345 0.32