Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A017SHS3

Protein Details
Accession A0A017SHS3    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
11-30DDGRQAKRPRLQTGRGRASNHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
16-39AKRPRLQTGRGRASNSGRGRGRRV
Subcellular Location(s) nucl 19.5, cyto_nucl 13, cyto 3.5, mito 1, pero 1, cysk 1, vacu 1
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR019786  Zinc_finger_PHD-type_CS  
IPR011011  Znf_FYVE_PHD  
IPR019787  Znf_PHD-finger  
IPR013083  Znf_RING/FYVE/PHD  
Gene Ontology GO:0046872  F:metal ion binding  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS01359  ZF_PHD_1  
PS50016  ZF_PHD_2  
Amino Acid Sequences MTCTRESDNHDDGRQAKRPRLQTGRGRASNSGRGRGRRVRVPTDPPPAENQGEHTIPIQAQSNDTGNTPALAMPEPISVDLTRYKTWRGAGSPHDNICFECYQPLNLIPCDTCKRSYHDFCKPKDSFLREDDAHSWYCPVCVDRGWHLAPPAITPPASPRTGTPNTTAINLASHAPTRANSEAVHHEDMANRAQRTTAPRELTAPSAPSAPRKSRFNTLPEEVDSALWVVYRELESVPLLRQNISDLQFQLSSLRQELSIRRNELALTKRVVEKGRAAEIELQKYREEAVNRQASTEDTEATRARNRELESELKNTRNELEYANKTLQSWKQKLSKLIDD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.53
2 0.51
3 0.52
4 0.55
5 0.61
6 0.66
7 0.7
8 0.72
9 0.73
10 0.78
11 0.81
12 0.78
13 0.74
14 0.71
15 0.68
16 0.68
17 0.63
18 0.61
19 0.57
20 0.57
21 0.62
22 0.65
23 0.66
24 0.64
25 0.67
26 0.66
27 0.67
28 0.7
29 0.7
30 0.72
31 0.67
32 0.61
33 0.59
34 0.56
35 0.5
36 0.42
37 0.38
38 0.33
39 0.31
40 0.3
41 0.25
42 0.22
43 0.2
44 0.21
45 0.21
46 0.16
47 0.17
48 0.18
49 0.2
50 0.18
51 0.19
52 0.19
53 0.14
54 0.14
55 0.13
56 0.11
57 0.1
58 0.1
59 0.1
60 0.1
61 0.11
62 0.11
63 0.11
64 0.12
65 0.1
66 0.12
67 0.16
68 0.19
69 0.2
70 0.21
71 0.23
72 0.25
73 0.28
74 0.3
75 0.27
76 0.29
77 0.35
78 0.41
79 0.44
80 0.43
81 0.42
82 0.38
83 0.36
84 0.35
85 0.27
86 0.19
87 0.18
88 0.16
89 0.15
90 0.16
91 0.18
92 0.17
93 0.17
94 0.18
95 0.15
96 0.19
97 0.23
98 0.24
99 0.25
100 0.24
101 0.3
102 0.37
103 0.45
104 0.48
105 0.54
106 0.6
107 0.59
108 0.67
109 0.61
110 0.58
111 0.57
112 0.54
113 0.48
114 0.42
115 0.46
116 0.36
117 0.38
118 0.35
119 0.3
120 0.27
121 0.22
122 0.2
123 0.14
124 0.14
125 0.12
126 0.1
127 0.08
128 0.09
129 0.11
130 0.13
131 0.18
132 0.18
133 0.18
134 0.18
135 0.19
136 0.18
137 0.17
138 0.15
139 0.12
140 0.11
141 0.1
142 0.13
143 0.16
144 0.16
145 0.16
146 0.15
147 0.22
148 0.25
149 0.26
150 0.25
151 0.25
152 0.25
153 0.25
154 0.25
155 0.17
156 0.14
157 0.13
158 0.12
159 0.08
160 0.08
161 0.07
162 0.08
163 0.08
164 0.12
165 0.12
166 0.12
167 0.11
168 0.14
169 0.18
170 0.21
171 0.22
172 0.18
173 0.18
174 0.18
175 0.19
176 0.21
177 0.2
178 0.16
179 0.15
180 0.16
181 0.18
182 0.22
183 0.27
184 0.29
185 0.27
186 0.27
187 0.3
188 0.31
189 0.31
190 0.27
191 0.21
192 0.16
193 0.17
194 0.17
195 0.2
196 0.24
197 0.28
198 0.32
199 0.35
200 0.38
201 0.43
202 0.48
203 0.47
204 0.48
205 0.45
206 0.43
207 0.39
208 0.38
209 0.3
210 0.25
211 0.21
212 0.14
213 0.11
214 0.08
215 0.07
216 0.05
217 0.06
218 0.06
219 0.07
220 0.07
221 0.08
222 0.08
223 0.09
224 0.1
225 0.13
226 0.13
227 0.13
228 0.13
229 0.14
230 0.19
231 0.2
232 0.21
233 0.19
234 0.2
235 0.2
236 0.2
237 0.2
238 0.16
239 0.16
240 0.15
241 0.14
242 0.13
243 0.16
244 0.22
245 0.26
246 0.32
247 0.33
248 0.32
249 0.32
250 0.32
251 0.36
252 0.35
253 0.32
254 0.27
255 0.28
256 0.31
257 0.34
258 0.36
259 0.33
260 0.34
261 0.34
262 0.37
263 0.34
264 0.33
265 0.37
266 0.39
267 0.44
268 0.41
269 0.38
270 0.33
271 0.33
272 0.33
273 0.3
274 0.28
275 0.25
276 0.32
277 0.38
278 0.38
279 0.38
280 0.37
281 0.34
282 0.35
283 0.32
284 0.24
285 0.16
286 0.21
287 0.21
288 0.24
289 0.29
290 0.26
291 0.28
292 0.31
293 0.33
294 0.34
295 0.38
296 0.42
297 0.4
298 0.46
299 0.49
300 0.48
301 0.47
302 0.44
303 0.42
304 0.37
305 0.34
306 0.3
307 0.34
308 0.35
309 0.39
310 0.41
311 0.39
312 0.37
313 0.42
314 0.46
315 0.47
316 0.48
317 0.51
318 0.56
319 0.6
320 0.68