Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A017SKA1

Protein Details
Accession A0A017SKA1    Localization Confidence Low Confidence Score 5.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
29-50VVIARIRRRHNARQQQQPEMRSHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) extr 10, plas 9, mito 4, nucl 1, cyto 1, cyto_nucl 1, pero 1, E.R. 1, cyto_pero 1
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR044675  RING1-like  
IPR018957  Znf_C3HC4_RING-type  
IPR001841  Znf_RING  
IPR013083  Znf_RING/FYVE/PHD  
Gene Ontology GO:0016020  C:membrane  
GO:0046872  F:metal ion binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00097  zf-C3HC4  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50089  ZF_RING_2  
CDD cd16448  RING-H2  
cd12087  TM_EGFR-like  
Amino Acid Sequences MTLGASGTEIVGVIVGAVILFTLVSAAPVVIARIRRRHNARQQQQPEMRSNDTYPSFRCPDNGPMPMQQVFVERWLEQQYAPSSTESYSHDICAICLSSLGLRSSRDSLPMPPEAAWIPVSHSYTGYDSHDDRRSVSPRVLEEGRPTRTNSEIRVLNSCGHAFHSACLASSFQYGRYRCPICQAAYFPS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.03
2 0.03
3 0.02
4 0.02
5 0.02
6 0.02
7 0.02
8 0.02
9 0.03
10 0.03
11 0.03
12 0.03
13 0.03
14 0.04
15 0.04
16 0.05
17 0.08
18 0.14
19 0.19
20 0.27
21 0.32
22 0.41
23 0.49
24 0.59
25 0.67
26 0.73
27 0.77
28 0.8
29 0.81
30 0.82
31 0.8
32 0.75
33 0.7
34 0.64
35 0.58
36 0.5
37 0.45
38 0.4
39 0.37
40 0.34
41 0.29
42 0.3
43 0.29
44 0.27
45 0.28
46 0.26
47 0.3
48 0.33
49 0.34
50 0.31
51 0.3
52 0.33
53 0.32
54 0.3
55 0.22
56 0.19
57 0.17
58 0.16
59 0.16
60 0.13
61 0.14
62 0.15
63 0.16
64 0.13
65 0.16
66 0.16
67 0.16
68 0.17
69 0.15
70 0.14
71 0.13
72 0.15
73 0.14
74 0.16
75 0.14
76 0.13
77 0.15
78 0.14
79 0.14
80 0.12
81 0.1
82 0.07
83 0.06
84 0.06
85 0.05
86 0.06
87 0.07
88 0.07
89 0.08
90 0.09
91 0.13
92 0.13
93 0.15
94 0.15
95 0.16
96 0.19
97 0.19
98 0.19
99 0.16
100 0.17
101 0.15
102 0.15
103 0.13
104 0.1
105 0.11
106 0.13
107 0.15
108 0.13
109 0.14
110 0.14
111 0.14
112 0.16
113 0.16
114 0.15
115 0.16
116 0.21
117 0.26
118 0.25
119 0.26
120 0.31
121 0.33
122 0.32
123 0.34
124 0.32
125 0.28
126 0.34
127 0.33
128 0.29
129 0.33
130 0.38
131 0.4
132 0.38
133 0.39
134 0.36
135 0.39
136 0.4
137 0.35
138 0.35
139 0.34
140 0.34
141 0.37
142 0.36
143 0.33
144 0.32
145 0.3
146 0.23
147 0.22
148 0.23
149 0.19
150 0.18
151 0.2
152 0.17
153 0.17
154 0.18
155 0.16
156 0.13
157 0.16
158 0.16
159 0.17
160 0.25
161 0.26
162 0.29
163 0.38
164 0.4
165 0.37
166 0.45
167 0.46
168 0.42
169 0.47