Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A017SHS4

Protein Details
Accession A0A017SHS4    Localization Confidence High Confidence Score 17.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
348-372SPEPTEPERKLKRPRTRRPQELAALHydrophilic
603-629EEVQKAISSLRKKKTRRNLQHIYSIKDHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
338-342RKRKE
352-365TEPERKLKRPRTRR
Subcellular Location(s) nucl 22.5, cyto_nucl 13, cyto 2.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR047157  PHRF1-like  
IPR011011  Znf_FYVE_PHD  
IPR001965  Znf_PHD  
IPR019787  Znf_PHD-finger  
IPR001841  Znf_RING  
IPR013083  Znf_RING/FYVE/PHD  
Gene Ontology GO:0046872  F:metal ion binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00628  PHD  
PF13639  zf-RING_2  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50016  ZF_PHD_2  
PS50089  ZF_RING_2  
Amino Acid Sequences MSDTCIVCLGDLGESASSDPRTITPEPVPKPDLEGKDNSNDVIKADNIGDGIEDPGQIAQLLPCGHILHNNCLKPWVERANSCPICRRSFNVVQLSDRPGGSVQSSYAVEDRVQVPEIDPSMIVDYVDDDVAEFQPCPVCGDSDNEELLLLCDCCDVPSHTYCVGLDAVPSTPWFCNQCEEQGAVGVFADSSVISPRGQESRGRRTRAQLRRLQTRNHMNSLHWARVWQSVWDHLNLDLDFPFDDDRAAQRALQQQRREEANQREFRAWQRRFEVAERQGGSHRFRDTAALLDIDAPRPSRPRAPREPTPEPESLEEMRAWNAFERAREIENDPSAARKRKEPTMSPSPEPTEPERKLKRPRTRRPQELAALASQNGESSRAAGAQVSARINAESSNEPSFLQSLLKEVDESSTPGGSTIYYGPSGQITNVDHATSGPSSPSLSPAPSNQSSPCLSTTSPPPYARSRPISPLQLSSPAGPSSPPFSPDVSPSTSGNNDLPEPTPSRAGTGRSRSRIPRAAQELLKARSLSNSPTRPGPSLGVKSDIQRLVGKALKPYYHRDYVSKDEYTDINRSISRMLYERAGDSETLENDAKADLATVAKEEVQKAISSLRKKKTRRNLQHIYSIKDIFSSQARTDQ
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.09
2 0.1
3 0.13
4 0.13
5 0.13
6 0.14
7 0.14
8 0.2
9 0.21
10 0.25
11 0.3
12 0.39
13 0.43
14 0.48
15 0.5
16 0.44
17 0.49
18 0.52
19 0.5
20 0.45
21 0.46
22 0.44
23 0.47
24 0.48
25 0.42
26 0.37
27 0.31
28 0.27
29 0.25
30 0.21
31 0.17
32 0.16
33 0.16
34 0.13
35 0.12
36 0.12
37 0.1
38 0.11
39 0.09
40 0.09
41 0.08
42 0.08
43 0.08
44 0.08
45 0.08
46 0.06
47 0.1
48 0.1
49 0.11
50 0.12
51 0.14
52 0.14
53 0.2
54 0.23
55 0.28
56 0.36
57 0.37
58 0.36
59 0.38
60 0.39
61 0.35
62 0.39
63 0.39
64 0.37
65 0.39
66 0.43
67 0.5
68 0.54
69 0.53
70 0.55
71 0.51
72 0.52
73 0.52
74 0.52
75 0.5
76 0.53
77 0.59
78 0.58
79 0.56
80 0.53
81 0.55
82 0.55
83 0.48
84 0.4
85 0.33
86 0.25
87 0.24
88 0.21
89 0.17
90 0.13
91 0.14
92 0.14
93 0.15
94 0.15
95 0.15
96 0.14
97 0.16
98 0.17
99 0.15
100 0.16
101 0.15
102 0.14
103 0.17
104 0.17
105 0.15
106 0.13
107 0.12
108 0.13
109 0.13
110 0.12
111 0.08
112 0.08
113 0.09
114 0.09
115 0.07
116 0.06
117 0.07
118 0.08
119 0.09
120 0.08
121 0.08
122 0.1
123 0.1
124 0.13
125 0.12
126 0.12
127 0.13
128 0.17
129 0.21
130 0.22
131 0.22
132 0.19
133 0.18
134 0.17
135 0.17
136 0.13
137 0.09
138 0.06
139 0.07
140 0.06
141 0.07
142 0.09
143 0.1
144 0.13
145 0.15
146 0.18
147 0.18
148 0.19
149 0.18
150 0.19
151 0.17
152 0.13
153 0.12
154 0.09
155 0.1
156 0.09
157 0.1
158 0.1
159 0.09
160 0.12
161 0.15
162 0.15
163 0.17
164 0.19
165 0.22
166 0.21
167 0.22
168 0.19
169 0.19
170 0.18
171 0.14
172 0.13
173 0.09
174 0.07
175 0.06
176 0.06
177 0.03
178 0.04
179 0.05
180 0.07
181 0.07
182 0.07
183 0.1
184 0.13
185 0.14
186 0.2
187 0.26
188 0.36
189 0.44
190 0.49
191 0.49
192 0.55
193 0.64
194 0.68
195 0.7
196 0.66
197 0.66
198 0.71
199 0.73
200 0.69
201 0.68
202 0.69
203 0.65
204 0.62
205 0.56
206 0.46
207 0.51
208 0.5
209 0.43
210 0.33
211 0.28
212 0.25
213 0.28
214 0.28
215 0.21
216 0.18
217 0.21
218 0.22
219 0.23
220 0.21
221 0.17
222 0.19
223 0.17
224 0.17
225 0.11
226 0.1
227 0.09
228 0.09
229 0.09
230 0.06
231 0.06
232 0.06
233 0.08
234 0.1
235 0.11
236 0.1
237 0.14
238 0.22
239 0.31
240 0.37
241 0.39
242 0.39
243 0.42
244 0.46
245 0.45
246 0.45
247 0.47
248 0.5
249 0.52
250 0.51
251 0.49
252 0.46
253 0.51
254 0.54
255 0.46
256 0.41
257 0.39
258 0.41
259 0.42
260 0.43
261 0.44
262 0.36
263 0.4
264 0.36
265 0.34
266 0.34
267 0.35
268 0.35
269 0.29
270 0.27
271 0.21
272 0.21
273 0.22
274 0.19
275 0.17
276 0.15
277 0.12
278 0.11
279 0.12
280 0.12
281 0.11
282 0.11
283 0.1
284 0.1
285 0.13
286 0.14
287 0.2
288 0.26
289 0.34
290 0.43
291 0.49
292 0.56
293 0.62
294 0.67
295 0.64
296 0.63
297 0.56
298 0.48
299 0.42
300 0.37
301 0.29
302 0.23
303 0.2
304 0.14
305 0.13
306 0.12
307 0.11
308 0.09
309 0.1
310 0.1
311 0.1
312 0.12
313 0.13
314 0.14
315 0.15
316 0.17
317 0.18
318 0.17
319 0.18
320 0.15
321 0.17
322 0.21
323 0.25
324 0.24
325 0.27
326 0.3
327 0.36
328 0.41
329 0.42
330 0.46
331 0.5
332 0.54
333 0.5
334 0.49
335 0.45
336 0.41
337 0.39
338 0.36
339 0.35
340 0.33
341 0.4
342 0.43
343 0.48
344 0.57
345 0.64
346 0.7
347 0.72
348 0.81
349 0.83
350 0.87
351 0.89
352 0.85
353 0.82
354 0.75
355 0.67
356 0.58
357 0.48
358 0.39
359 0.3
360 0.23
361 0.16
362 0.12
363 0.09
364 0.09
365 0.07
366 0.07
367 0.07
368 0.07
369 0.07
370 0.07
371 0.08
372 0.08
373 0.11
374 0.1
375 0.1
376 0.11
377 0.1
378 0.11
379 0.1
380 0.11
381 0.1
382 0.13
383 0.14
384 0.14
385 0.14
386 0.14
387 0.15
388 0.13
389 0.12
390 0.09
391 0.09
392 0.1
393 0.1
394 0.09
395 0.09
396 0.1
397 0.09
398 0.11
399 0.1
400 0.09
401 0.08
402 0.08
403 0.08
404 0.07
405 0.08
406 0.08
407 0.08
408 0.08
409 0.09
410 0.09
411 0.1
412 0.1
413 0.09
414 0.11
415 0.11
416 0.13
417 0.13
418 0.13
419 0.12
420 0.12
421 0.14
422 0.11
423 0.1
424 0.08
425 0.08
426 0.09
427 0.09
428 0.13
429 0.12
430 0.13
431 0.14
432 0.16
433 0.22
434 0.22
435 0.25
436 0.22
437 0.25
438 0.25
439 0.25
440 0.24
441 0.2
442 0.19
443 0.2
444 0.25
445 0.28
446 0.33
447 0.32
448 0.35
449 0.39
450 0.44
451 0.49
452 0.48
453 0.46
454 0.46
455 0.5
456 0.53
457 0.48
458 0.46
459 0.41
460 0.39
461 0.37
462 0.32
463 0.29
464 0.23
465 0.21
466 0.18
467 0.17
468 0.16
469 0.16
470 0.16
471 0.16
472 0.18
473 0.19
474 0.21
475 0.24
476 0.23
477 0.24
478 0.23
479 0.25
480 0.24
481 0.25
482 0.23
483 0.21
484 0.19
485 0.18
486 0.19
487 0.19
488 0.21
489 0.2
490 0.23
491 0.21
492 0.23
493 0.24
494 0.28
495 0.32
496 0.39
497 0.45
498 0.46
499 0.53
500 0.55
501 0.61
502 0.64
503 0.59
504 0.59
505 0.57
506 0.6
507 0.55
508 0.56
509 0.55
510 0.5
511 0.5
512 0.41
513 0.35
514 0.32
515 0.32
516 0.32
517 0.33
518 0.35
519 0.34
520 0.39
521 0.42
522 0.41
523 0.41
524 0.39
525 0.38
526 0.39
527 0.38
528 0.37
529 0.35
530 0.35
531 0.4
532 0.37
533 0.32
534 0.29
535 0.29
536 0.3
537 0.34
538 0.33
539 0.32
540 0.35
541 0.38
542 0.39
543 0.45
544 0.46
545 0.49
546 0.49
547 0.48
548 0.49
549 0.53
550 0.55
551 0.49
552 0.43
553 0.38
554 0.38
555 0.38
556 0.37
557 0.3
558 0.27
559 0.27
560 0.27
561 0.26
562 0.25
563 0.24
564 0.22
565 0.23
566 0.23
567 0.24
568 0.24
569 0.25
570 0.25
571 0.22
572 0.21
573 0.22
574 0.19
575 0.22
576 0.21
577 0.19
578 0.17
579 0.17
580 0.15
581 0.11
582 0.11
583 0.07
584 0.08
585 0.09
586 0.09
587 0.1
588 0.13
589 0.16
590 0.16
591 0.17
592 0.18
593 0.17
594 0.18
595 0.24
596 0.28
597 0.36
598 0.44
599 0.52
600 0.61
601 0.69
602 0.78
603 0.82
604 0.86
605 0.88
606 0.89
607 0.9
608 0.87
609 0.89
610 0.85
611 0.8
612 0.75
613 0.65
614 0.54
615 0.45
616 0.38
617 0.31
618 0.3
619 0.29