Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A017S6N7

Protein Details
Accession A0A017S6N7    Localization Confidence Low Confidence Score 9.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
138-162AASVVGKKNKGKNKRGARRDSDATEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
144-156KKNKGKNKRGARR
Subcellular Location(s) cyto 11.5, cyto_nucl 10.999, cyto_mito 10.166, nucl 9, mito_nucl 8.499, mito 6.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009072  Histone-fold  
IPR003195  TFIID_TAF13  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0046982  F:protein heterodimerization activity  
GO:0003743  F:translation initiation factor activity  
GO:0006366  P:transcription by RNA polymerase II  
Pfam View protein in Pfam  
PF02269  TFIID-18kDa  
CDD cd07978  TAF13  
Amino Acid Sequences MAEPRARVARHKGQMNFPSELRLLLLAYGDPSPHPSFPSEPLPETVRVLDEIVTDFILEMCHGAAQYASYSRRQKIKVDDFRFALRRDPNKLGRVQELLRMERELKEARKAFDQNDDQIANLKDAGKKGVDEHEDGDAASVVGKKNKGKNKRGARRDSDATEETISKKRKTAGQG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.69
2 0.68
3 0.62
4 0.52
5 0.48
6 0.4
7 0.36
8 0.27
9 0.2
10 0.15
11 0.12
12 0.12
13 0.08
14 0.09
15 0.09
16 0.08
17 0.08
18 0.13
19 0.15
20 0.15
21 0.17
22 0.18
23 0.2
24 0.24
25 0.31
26 0.29
27 0.28
28 0.3
29 0.32
30 0.3
31 0.29
32 0.26
33 0.19
34 0.17
35 0.15
36 0.13
37 0.1
38 0.1
39 0.09
40 0.09
41 0.08
42 0.07
43 0.06
44 0.06
45 0.05
46 0.04
47 0.04
48 0.04
49 0.04
50 0.04
51 0.04
52 0.04
53 0.05
54 0.08
55 0.09
56 0.16
57 0.2
58 0.23
59 0.3
60 0.32
61 0.36
62 0.42
63 0.51
64 0.55
65 0.56
66 0.56
67 0.51
68 0.53
69 0.52
70 0.43
71 0.37
72 0.33
73 0.33
74 0.35
75 0.39
76 0.4
77 0.41
78 0.43
79 0.4
80 0.36
81 0.35
82 0.31
83 0.3
84 0.28
85 0.26
86 0.23
87 0.23
88 0.21
89 0.19
90 0.22
91 0.22
92 0.2
93 0.26
94 0.28
95 0.28
96 0.33
97 0.34
98 0.32
99 0.36
100 0.37
101 0.31
102 0.33
103 0.31
104 0.26
105 0.28
106 0.27
107 0.19
108 0.17
109 0.17
110 0.15
111 0.16
112 0.18
113 0.14
114 0.14
115 0.16
116 0.21
117 0.21
118 0.21
119 0.21
120 0.21
121 0.2
122 0.2
123 0.18
124 0.12
125 0.09
126 0.09
127 0.09
128 0.09
129 0.13
130 0.18
131 0.23
132 0.32
133 0.41
134 0.5
135 0.58
136 0.67
137 0.74
138 0.81
139 0.86
140 0.87
141 0.85
142 0.83
143 0.81
144 0.74
145 0.7
146 0.61
147 0.54
148 0.46
149 0.41
150 0.36
151 0.38
152 0.4
153 0.35
154 0.37
155 0.39