Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A017SM50

Protein Details
Accession A0A017SM50    Localization Confidence Low Confidence Score 5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
27-47NGPSCKYTPTKKLQEAHRQVAHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) cyto 17, cyto_mito 12.165, cyto_nucl 11.666, cyto_pero 10.665, mito 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR001597  ArAA_b-elim_lyase/Thr_aldolase  
IPR023603  Low_specificity_L-TA  
IPR015424  PyrdxlP-dep_Trfase  
IPR015421  PyrdxlP-dep_Trfase_major  
IPR015422  PyrdxlP-dep_Trfase_small  
Gene Ontology GO:0016829  F:lyase activity  
GO:0006520  P:amino acid metabolic process  
Pfam View protein in Pfam  
PF01212  Beta_elim_lyase  
Amino Acid Sequences MAPIFEDSVSNANANPNITKASLCQENGPSCKYTPTKKLQEAHRQVANDFRSDVVTVPTEEVMQAIIDATFQDDMYNEAGDPSVNALQDHIAALTGKEAGLWVLSGTMGNQICLRTHLTQPPHSVLLDSRAHVHNWESGALPVLSQATSTQVVPKNGVHLTVDDVRRNIIADGNIHFPPTRVVSLENTLSGTILPLEHAKQISQFVRNFPVSEGVKPIAMHLDGARLLDGVTAEGVDIKEYCSHFDTVSICMSKGLGAPMGSVIVGSKAFIERAKFLRKMFGGGTRQPGMMAAAAKAAMEYTLPLLPRVHALTKKTADSLREIGYTISLPVQTNMVVLDLEVDNIPAAAFVNYGKKHGLIFFPSARLVFHHQISEDAAGRAVEALRELYTDKKAGKMLEDYAVSGGYT
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.21
2 0.2
3 0.18
4 0.2
5 0.2
6 0.2
7 0.18
8 0.22
9 0.26
10 0.27
11 0.3
12 0.34
13 0.41
14 0.44
15 0.45
16 0.42
17 0.36
18 0.44
19 0.45
20 0.46
21 0.48
22 0.54
23 0.61
24 0.67
25 0.73
26 0.75
27 0.8
28 0.81
29 0.79
30 0.74
31 0.66
32 0.58
33 0.59
34 0.52
35 0.42
36 0.34
37 0.27
38 0.24
39 0.23
40 0.22
41 0.17
42 0.16
43 0.15
44 0.15
45 0.15
46 0.14
47 0.13
48 0.12
49 0.09
50 0.07
51 0.06
52 0.05
53 0.05
54 0.04
55 0.05
56 0.06
57 0.06
58 0.06
59 0.06
60 0.06
61 0.08
62 0.09
63 0.09
64 0.08
65 0.08
66 0.08
67 0.08
68 0.08
69 0.09
70 0.1
71 0.1
72 0.1
73 0.1
74 0.11
75 0.11
76 0.11
77 0.08
78 0.07
79 0.07
80 0.07
81 0.07
82 0.07
83 0.06
84 0.05
85 0.05
86 0.05
87 0.05
88 0.05
89 0.04
90 0.04
91 0.04
92 0.04
93 0.04
94 0.1
95 0.1
96 0.1
97 0.11
98 0.12
99 0.12
100 0.14
101 0.18
102 0.16
103 0.2
104 0.26
105 0.3
106 0.34
107 0.38
108 0.39
109 0.36
110 0.34
111 0.3
112 0.24
113 0.26
114 0.23
115 0.2
116 0.2
117 0.2
118 0.2
119 0.2
120 0.21
121 0.17
122 0.16
123 0.16
124 0.13
125 0.12
126 0.14
127 0.12
128 0.11
129 0.08
130 0.08
131 0.07
132 0.07
133 0.07
134 0.07
135 0.08
136 0.09
137 0.14
138 0.17
139 0.18
140 0.2
141 0.2
142 0.22
143 0.21
144 0.21
145 0.16
146 0.13
147 0.16
148 0.2
149 0.22
150 0.19
151 0.19
152 0.19
153 0.19
154 0.19
155 0.15
156 0.11
157 0.1
158 0.1
159 0.12
160 0.15
161 0.15
162 0.15
163 0.14
164 0.13
165 0.13
166 0.13
167 0.12
168 0.09
169 0.11
170 0.12
171 0.14
172 0.15
173 0.14
174 0.12
175 0.11
176 0.1
177 0.09
178 0.07
179 0.05
180 0.04
181 0.04
182 0.05
183 0.06
184 0.07
185 0.08
186 0.08
187 0.09
188 0.13
189 0.14
190 0.18
191 0.19
192 0.19
193 0.23
194 0.24
195 0.23
196 0.2
197 0.24
198 0.2
199 0.19
200 0.2
201 0.16
202 0.16
203 0.16
204 0.15
205 0.11
206 0.1
207 0.09
208 0.07
209 0.08
210 0.08
211 0.08
212 0.07
213 0.06
214 0.06
215 0.06
216 0.06
217 0.04
218 0.04
219 0.03
220 0.03
221 0.04
222 0.04
223 0.04
224 0.04
225 0.05
226 0.08
227 0.09
228 0.11
229 0.12
230 0.13
231 0.13
232 0.15
233 0.15
234 0.14
235 0.17
236 0.16
237 0.13
238 0.13
239 0.13
240 0.11
241 0.11
242 0.1
243 0.08
244 0.07
245 0.07
246 0.07
247 0.07
248 0.06
249 0.05
250 0.05
251 0.04
252 0.04
253 0.04
254 0.05
255 0.05
256 0.07
257 0.08
258 0.1
259 0.13
260 0.18
261 0.25
262 0.28
263 0.28
264 0.34
265 0.33
266 0.34
267 0.32
268 0.35
269 0.34
270 0.34
271 0.39
272 0.33
273 0.33
274 0.3
275 0.28
276 0.21
277 0.17
278 0.14
279 0.09
280 0.08
281 0.08
282 0.08
283 0.07
284 0.06
285 0.05
286 0.04
287 0.04
288 0.05
289 0.08
290 0.08
291 0.1
292 0.1
293 0.11
294 0.13
295 0.16
296 0.2
297 0.22
298 0.25
299 0.32
300 0.35
301 0.36
302 0.37
303 0.37
304 0.33
305 0.34
306 0.35
307 0.29
308 0.27
309 0.26
310 0.22
311 0.2
312 0.19
313 0.14
314 0.12
315 0.11
316 0.11
317 0.11
318 0.12
319 0.11
320 0.11
321 0.1
322 0.09
323 0.07
324 0.06
325 0.08
326 0.07
327 0.08
328 0.08
329 0.08
330 0.07
331 0.07
332 0.07
333 0.05
334 0.05
335 0.05
336 0.05
337 0.07
338 0.15
339 0.15
340 0.18
341 0.19
342 0.19
343 0.2
344 0.23
345 0.26
346 0.22
347 0.28
348 0.28
349 0.3
350 0.31
351 0.29
352 0.27
353 0.26
354 0.3
355 0.29
356 0.28
357 0.29
358 0.27
359 0.28
360 0.3
361 0.3
362 0.25
363 0.2
364 0.19
365 0.16
366 0.15
367 0.15
368 0.13
369 0.1
370 0.09
371 0.1
372 0.09
373 0.11
374 0.12
375 0.15
376 0.18
377 0.23
378 0.23
379 0.26
380 0.29
381 0.3
382 0.33
383 0.33
384 0.32
385 0.33
386 0.33
387 0.3
388 0.27