Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

A0A017S138

Protein Details
Accession A0A017S138    Localization Confidence High Confidence Score 22.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
10-29KLTLGKKKATEEKSKPQKAPHydrophilic
52-77QENNDEEKPKKKPSKKRPVEAPGLHEBasic
252-275GLTPPLRWARKRRFRNRVSTRTIEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
14-73GKKKATEEKSKPQKAPAPAPATPSSEPRKLTLKIARKPQENNDEEKPKKKPSKKRPVEAP
85-100SAGPKRLKLNPSKKPG
262-263KR
Subcellular Location(s) nucl 21.5, cyto_nucl 13, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR037817  TAF7  
IPR006751  TAFII55_prot_cons_reg  
Gene Ontology GO:0005669  C:transcription factor TFIID complex  
GO:0006367  P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter  
Pfam View protein in Pfam  
PF04658  TAFII55_N  
CDD cd08047  TAF7  
Amino Acid Sequences MSETPRPSLKLTLGKKKATEEKSKPQKAPAPAPATPSSEPRKLTLKIARKPQENNDEEKPKKKPSKKRPVEAPGLHEPTTAAPSSAGPKRLKLNPSKKPGVQSIRIKNKGLVPTRPVGVGYDSEASDNEVDPAIEEQFILRMLPGPDCDYLRKAVEERLFDRSEFCFKPLTREGRRAVIKIRDKQYAAALVDLPCIVEGMKSWDKRGWYKSADICQMLLVLGLVANDKEALEYPIPSEVEQLDEKTLRYPHGLTPPLRWARKRRFRNRVSTRTIEQVEKAVSDLIEQDEASVAPPRYELVDSASLNRAEGLVQSGDYYEDEYYDDEQDAEGEVDEDETTGAAAAAPQDRGVYEAGTPTVSKPQSPAAESSGDESEMSDGDEEDVPEEEMDEEQLEQQRQFQQRREEITELEALIRLETVKWEQMMNQILKNKLAKRIQDLKKDLSLRKVAIGEGDDMD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.64
2 0.64
3 0.68
4 0.7
5 0.69
6 0.71
7 0.69
8 0.72
9 0.78
10 0.84
11 0.79
12 0.77
13 0.77
14 0.74
15 0.75
16 0.73
17 0.7
18 0.63
19 0.66
20 0.61
21 0.59
22 0.52
23 0.51
24 0.48
25 0.46
26 0.45
27 0.43
28 0.46
29 0.42
30 0.49
31 0.51
32 0.54
33 0.56
34 0.65
35 0.7
36 0.7
37 0.75
38 0.75
39 0.76
40 0.7
41 0.7
42 0.68
43 0.7
44 0.68
45 0.69
46 0.66
47 0.66
48 0.72
49 0.76
50 0.78
51 0.79
52 0.85
53 0.88
54 0.91
55 0.91
56 0.9
57 0.9
58 0.84
59 0.79
60 0.78
61 0.72
62 0.62
63 0.51
64 0.43
65 0.34
66 0.32
67 0.25
68 0.16
69 0.11
70 0.13
71 0.19
72 0.23
73 0.28
74 0.26
75 0.3
76 0.36
77 0.43
78 0.5
79 0.54
80 0.6
81 0.63
82 0.7
83 0.74
84 0.71
85 0.7
86 0.71
87 0.68
88 0.66
89 0.67
90 0.68
91 0.71
92 0.73
93 0.69
94 0.63
95 0.61
96 0.6
97 0.56
98 0.51
99 0.45
100 0.43
101 0.43
102 0.4
103 0.34
104 0.27
105 0.23
106 0.18
107 0.15
108 0.14
109 0.13
110 0.13
111 0.13
112 0.13
113 0.12
114 0.11
115 0.1
116 0.08
117 0.07
118 0.07
119 0.08
120 0.07
121 0.07
122 0.07
123 0.06
124 0.06
125 0.07
126 0.06
127 0.05
128 0.08
129 0.09
130 0.1
131 0.11
132 0.13
133 0.14
134 0.16
135 0.18
136 0.17
137 0.18
138 0.18
139 0.19
140 0.18
141 0.22
142 0.24
143 0.27
144 0.27
145 0.31
146 0.31
147 0.29
148 0.3
149 0.26
150 0.29
151 0.25
152 0.24
153 0.24
154 0.23
155 0.31
156 0.36
157 0.43
158 0.41
159 0.47
160 0.48
161 0.5
162 0.53
163 0.47
164 0.46
165 0.46
166 0.49
167 0.5
168 0.52
169 0.49
170 0.47
171 0.46
172 0.43
173 0.38
174 0.31
175 0.24
176 0.21
177 0.16
178 0.16
179 0.15
180 0.12
181 0.07
182 0.07
183 0.05
184 0.04
185 0.04
186 0.11
187 0.16
188 0.17
189 0.18
190 0.2
191 0.23
192 0.28
193 0.32
194 0.3
195 0.27
196 0.32
197 0.35
198 0.38
199 0.39
200 0.34
201 0.3
202 0.24
203 0.22
204 0.17
205 0.12
206 0.07
207 0.03
208 0.03
209 0.03
210 0.03
211 0.03
212 0.03
213 0.03
214 0.03
215 0.03
216 0.04
217 0.06
218 0.06
219 0.06
220 0.07
221 0.09
222 0.09
223 0.09
224 0.1
225 0.08
226 0.1
227 0.1
228 0.1
229 0.1
230 0.1
231 0.1
232 0.12
233 0.13
234 0.12
235 0.13
236 0.14
237 0.16
238 0.23
239 0.28
240 0.26
241 0.28
242 0.36
243 0.42
244 0.44
245 0.45
246 0.47
247 0.53
248 0.63
249 0.71
250 0.73
251 0.76
252 0.81
253 0.87
254 0.88
255 0.86
256 0.83
257 0.77
258 0.69
259 0.65
260 0.59
261 0.49
262 0.39
263 0.32
264 0.25
265 0.2
266 0.18
267 0.12
268 0.1
269 0.09
270 0.09
271 0.07
272 0.07
273 0.07
274 0.07
275 0.06
276 0.06
277 0.07
278 0.1
279 0.1
280 0.09
281 0.09
282 0.1
283 0.11
284 0.11
285 0.11
286 0.11
287 0.15
288 0.16
289 0.18
290 0.21
291 0.2
292 0.19
293 0.19
294 0.15
295 0.1
296 0.1
297 0.1
298 0.07
299 0.07
300 0.07
301 0.07
302 0.08
303 0.08
304 0.09
305 0.07
306 0.07
307 0.07
308 0.08
309 0.1
310 0.1
311 0.1
312 0.09
313 0.09
314 0.08
315 0.08
316 0.07
317 0.06
318 0.05
319 0.05
320 0.06
321 0.05
322 0.05
323 0.05
324 0.04
325 0.04
326 0.04
327 0.04
328 0.03
329 0.03
330 0.05
331 0.07
332 0.07
333 0.08
334 0.08
335 0.08
336 0.09
337 0.1
338 0.09
339 0.08
340 0.09
341 0.09
342 0.1
343 0.1
344 0.1
345 0.18
346 0.17
347 0.17
348 0.18
349 0.24
350 0.27
351 0.29
352 0.3
353 0.25
354 0.27
355 0.27
356 0.28
357 0.22
358 0.19
359 0.17
360 0.15
361 0.12
362 0.1
363 0.1
364 0.07
365 0.07
366 0.08
367 0.09
368 0.09
369 0.09
370 0.1
371 0.1
372 0.09
373 0.09
374 0.08
375 0.07
376 0.08
377 0.07
378 0.07
379 0.1
380 0.15
381 0.17
382 0.16
383 0.21
384 0.28
385 0.36
386 0.42
387 0.46
388 0.51
389 0.56
390 0.64
391 0.65
392 0.6
393 0.53
394 0.5
395 0.46
396 0.36
397 0.3
398 0.24
399 0.18
400 0.15
401 0.14
402 0.11
403 0.09
404 0.12
405 0.14
406 0.16
407 0.16
408 0.17
409 0.18
410 0.24
411 0.32
412 0.32
413 0.34
414 0.37
415 0.38
416 0.43
417 0.49
418 0.47
419 0.48
420 0.52
421 0.53
422 0.56
423 0.65
424 0.68
425 0.71
426 0.73
427 0.7
428 0.71
429 0.74
430 0.69
431 0.67
432 0.65
433 0.56
434 0.55
435 0.5
436 0.42
437 0.38
438 0.35