Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A017SE06

Protein Details
Accession A0A017SE06    Localization Confidence High Confidence Score 21.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
7-28KKASASKKSLSTKKNSPPPQLVHydrophilic
398-426LSVTRGKGFTKEKNKKKRGSYRGGPIDISHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
189-190KK
404-417KGFTKEKNKKKRGS
Subcellular Location(s) nucl 23, mito 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007718  Srp40_C  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
Pfam View protein in Pfam  
PF05022  SRP40_C  
Amino Acid Sequences MAAQKGKKASASKKSLSTKKNSPPPQLVASIATFLSENGFESTSKAFAKEQADKSISQTNSKKAPSLLEVFQNWTKKSEESSSSSSSSSSSSSSESGSDSSSDESSDSDVEMGDAQSKKSSRSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSDSDADDEDNAPAAGRKSTGVKRKAESSSSESDSSSSESEKEAPKAKKAKIESTKKDSSSSESSDSSSSESASSESESSENNSDPSSSSDSSDSDSDSSDSSDSDPDSDSSDSSSSEKSPAKKADKKALKTAVKTPLPASDSSSSDSSSDSSSSNEDSSEDESSDKKKKDDKSSESSKSSDTLQNSDSDEQKPVNKAAENTRESSSNASPVPGNNRAKKHIGARQTPLAALSELPHDHPSNTYMSYAYADNAYKDLSVTRGKGFTKEKNKKKRGSYRGGPIDISGGKSFKFED
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.75
2 0.78
3 0.77
4 0.76
5 0.76
6 0.77
7 0.82
8 0.82
9 0.8
10 0.79
11 0.76
12 0.73
13 0.65
14 0.56
15 0.49
16 0.41
17 0.34
18 0.26
19 0.2
20 0.15
21 0.13
22 0.13
23 0.1
24 0.1
25 0.1
26 0.12
27 0.11
28 0.14
29 0.15
30 0.17
31 0.17
32 0.18
33 0.17
34 0.22
35 0.29
36 0.36
37 0.38
38 0.43
39 0.45
40 0.44
41 0.46
42 0.49
43 0.43
44 0.43
45 0.44
46 0.43
47 0.48
48 0.49
49 0.48
50 0.41
51 0.43
52 0.39
53 0.39
54 0.36
55 0.34
56 0.34
57 0.36
58 0.4
59 0.41
60 0.37
61 0.34
62 0.33
63 0.29
64 0.31
65 0.32
66 0.32
67 0.33
68 0.38
69 0.39
70 0.39
71 0.38
72 0.34
73 0.28
74 0.24
75 0.2
76 0.15
77 0.13
78 0.13
79 0.14
80 0.14
81 0.14
82 0.14
83 0.14
84 0.13
85 0.13
86 0.12
87 0.13
88 0.12
89 0.11
90 0.1
91 0.1
92 0.1
93 0.1
94 0.09
95 0.07
96 0.07
97 0.07
98 0.07
99 0.07
100 0.11
101 0.11
102 0.12
103 0.16
104 0.17
105 0.19
106 0.23
107 0.27
108 0.26
109 0.31
110 0.36
111 0.37
112 0.41
113 0.41
114 0.38
115 0.36
116 0.33
117 0.29
118 0.25
119 0.2
120 0.17
121 0.16
122 0.15
123 0.15
124 0.15
125 0.15
126 0.14
127 0.15
128 0.14
129 0.14
130 0.14
131 0.13
132 0.12
133 0.12
134 0.11
135 0.1
136 0.1
137 0.09
138 0.08
139 0.08
140 0.07
141 0.07
142 0.07
143 0.07
144 0.07
145 0.08
146 0.14
147 0.21
148 0.29
149 0.35
150 0.39
151 0.4
152 0.46
153 0.49
154 0.45
155 0.43
156 0.4
157 0.38
158 0.37
159 0.36
160 0.29
161 0.27
162 0.25
163 0.22
164 0.17
165 0.13
166 0.1
167 0.1
168 0.13
169 0.15
170 0.17
171 0.24
172 0.25
173 0.31
174 0.38
175 0.4
176 0.43
177 0.45
178 0.51
179 0.53
180 0.62
181 0.62
182 0.62
183 0.65
184 0.6
185 0.59
186 0.5
187 0.45
188 0.39
189 0.35
190 0.29
191 0.24
192 0.24
193 0.22
194 0.22
195 0.18
196 0.14
197 0.11
198 0.09
199 0.08
200 0.08
201 0.08
202 0.08
203 0.07
204 0.07
205 0.07
206 0.07
207 0.09
208 0.09
209 0.09
210 0.09
211 0.09
212 0.09
213 0.09
214 0.11
215 0.14
216 0.13
217 0.14
218 0.14
219 0.15
220 0.16
221 0.16
222 0.14
223 0.1
224 0.1
225 0.09
226 0.09
227 0.09
228 0.07
229 0.07
230 0.07
231 0.08
232 0.07
233 0.08
234 0.08
235 0.08
236 0.1
237 0.1
238 0.09
239 0.1
240 0.1
241 0.1
242 0.11
243 0.11
244 0.1
245 0.14
246 0.18
247 0.2
248 0.26
249 0.33
250 0.41
251 0.47
252 0.52
253 0.58
254 0.63
255 0.64
256 0.66
257 0.67
258 0.63
259 0.59
260 0.61
261 0.6
262 0.53
263 0.5
264 0.43
265 0.38
266 0.35
267 0.32
268 0.3
269 0.23
270 0.23
271 0.24
272 0.24
273 0.2
274 0.18
275 0.18
276 0.14
277 0.12
278 0.12
279 0.1
280 0.1
281 0.11
282 0.12
283 0.12
284 0.11
285 0.11
286 0.11
287 0.13
288 0.13
289 0.12
290 0.12
291 0.14
292 0.19
293 0.26
294 0.26
295 0.28
296 0.34
297 0.42
298 0.52
299 0.6
300 0.63
301 0.64
302 0.72
303 0.74
304 0.7
305 0.64
306 0.54
307 0.45
308 0.41
309 0.38
310 0.3
311 0.27
312 0.24
313 0.25
314 0.28
315 0.29
316 0.28
317 0.25
318 0.25
319 0.24
320 0.27
321 0.27
322 0.26
323 0.27
324 0.26
325 0.28
326 0.35
327 0.42
328 0.41
329 0.41
330 0.41
331 0.38
332 0.37
333 0.39
334 0.31
335 0.26
336 0.24
337 0.22
338 0.22
339 0.23
340 0.29
341 0.33
342 0.4
343 0.43
344 0.47
345 0.51
346 0.54
347 0.56
348 0.57
349 0.55
350 0.57
351 0.56
352 0.58
353 0.59
354 0.56
355 0.51
356 0.43
357 0.38
358 0.29
359 0.22
360 0.17
361 0.16
362 0.15
363 0.17
364 0.2
365 0.2
366 0.2
367 0.21
368 0.22
369 0.21
370 0.21
371 0.2
372 0.16
373 0.16
374 0.17
375 0.16
376 0.15
377 0.15
378 0.15
379 0.15
380 0.16
381 0.15
382 0.13
383 0.13
384 0.13
385 0.14
386 0.19
387 0.2
388 0.23
389 0.29
390 0.3
391 0.37
392 0.44
393 0.49
394 0.56
395 0.64
396 0.71
397 0.76
398 0.85
399 0.87
400 0.9
401 0.91
402 0.9
403 0.9
404 0.89
405 0.88
406 0.88
407 0.83
408 0.72
409 0.62
410 0.57
411 0.48
412 0.43
413 0.34
414 0.26
415 0.23