Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A017SF00

Protein Details
Accession A0A017SF00    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-25MNDSVPFKTRKKRPRPENSSDEDKPHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
10-14RKKRP
Subcellular Location(s) nucl 19.5, cyto_nucl 12, cyto 3.5, mito 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013034  DNA_topo_DNA_db_N_dom1  
IPR013030  DNA_topo_DNA_db_N_dom2  
IPR008336  TopoI_DNA-bd_euk  
IPR036202  TopoI_DNA-bd_euk_N_sf  
Gene Ontology GO:0005694  C:chromosome  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0003917  F:DNA topoisomerase type I (single strand cut, ATP-independent) activity  
GO:0006265  P:DNA topological change  
Pfam View protein in Pfam  
PF02919  Topoisom_I_N  
Amino Acid Sequences MNDSVPFKTRKKRPRPENSSDEDKPLSIQLYRERGRNINHNRADLANGESLDTTITKPIRCEHSESDSDMPLMKRDTRSSEGHYSQGQEGDTAGNEWQKQPDKHDGTVKWATLEHNGVCKDEVRWDPEHTRAEAEEVACFFGEMLDATHYVDNVIKRTSGAWNLQGKVSQVKNMTKCDFSPIFEHFQIRKAQKKAEPLAQRNGQKAARDALEEPFRHCTWDGQQQKVGNFRIEPPGLFRGRGDHPKKEKTRALSEQVTLNIGKDADVLPPRRTPVERY
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.89
2 0.92
3 0.91
4 0.9
5 0.87
6 0.85
7 0.76
8 0.71
9 0.61
10 0.51
11 0.42
12 0.35
13 0.3
14 0.22
15 0.24
16 0.26
17 0.34
18 0.36
19 0.4
20 0.42
21 0.46
22 0.49
23 0.56
24 0.57
25 0.59
26 0.6
27 0.58
28 0.55
29 0.5
30 0.47
31 0.38
32 0.32
33 0.24
34 0.19
35 0.18
36 0.15
37 0.15
38 0.14
39 0.12
40 0.1
41 0.13
42 0.15
43 0.15
44 0.17
45 0.22
46 0.28
47 0.3
48 0.36
49 0.35
50 0.39
51 0.41
52 0.43
53 0.4
54 0.34
55 0.32
56 0.28
57 0.24
58 0.19
59 0.2
60 0.2
61 0.2
62 0.22
63 0.28
64 0.3
65 0.33
66 0.37
67 0.42
68 0.4
69 0.4
70 0.38
71 0.35
72 0.31
73 0.3
74 0.24
75 0.16
76 0.14
77 0.12
78 0.11
79 0.09
80 0.09
81 0.09
82 0.1
83 0.11
84 0.16
85 0.21
86 0.22
87 0.26
88 0.36
89 0.37
90 0.4
91 0.46
92 0.41
93 0.42
94 0.45
95 0.4
96 0.31
97 0.28
98 0.25
99 0.21
100 0.23
101 0.16
102 0.17
103 0.18
104 0.17
105 0.17
106 0.16
107 0.14
108 0.18
109 0.19
110 0.18
111 0.2
112 0.23
113 0.25
114 0.3
115 0.31
116 0.26
117 0.25
118 0.21
119 0.21
120 0.18
121 0.16
122 0.11
123 0.09
124 0.09
125 0.08
126 0.08
127 0.06
128 0.04
129 0.04
130 0.03
131 0.04
132 0.04
133 0.04
134 0.05
135 0.05
136 0.05
137 0.06
138 0.08
139 0.08
140 0.09
141 0.09
142 0.09
143 0.09
144 0.1
145 0.12
146 0.14
147 0.15
148 0.2
149 0.24
150 0.25
151 0.25
152 0.25
153 0.24
154 0.26
155 0.24
156 0.21
157 0.22
158 0.27
159 0.31
160 0.35
161 0.36
162 0.32
163 0.32
164 0.35
165 0.31
166 0.27
167 0.27
168 0.24
169 0.27
170 0.27
171 0.31
172 0.25
173 0.29
174 0.34
175 0.36
176 0.41
177 0.39
178 0.45
179 0.45
180 0.52
181 0.53
182 0.54
183 0.59
184 0.56
185 0.61
186 0.61
187 0.61
188 0.55
189 0.56
190 0.5
191 0.42
192 0.39
193 0.35
194 0.29
195 0.27
196 0.26
197 0.25
198 0.3
199 0.29
200 0.29
201 0.31
202 0.3
203 0.3
204 0.29
205 0.27
206 0.26
207 0.36
208 0.39
209 0.38
210 0.43
211 0.44
212 0.47
213 0.5
214 0.48
215 0.4
216 0.35
217 0.33
218 0.36
219 0.34
220 0.31
221 0.29
222 0.34
223 0.32
224 0.32
225 0.29
226 0.27
227 0.33
228 0.43
229 0.44
230 0.47
231 0.54
232 0.64
233 0.71
234 0.75
235 0.74
236 0.71
237 0.75
238 0.73
239 0.72
240 0.67
241 0.62
242 0.57
243 0.52
244 0.47
245 0.37
246 0.3
247 0.24
248 0.19
249 0.16
250 0.13
251 0.13
252 0.16
253 0.23
254 0.26
255 0.28
256 0.32
257 0.35
258 0.4