Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A017SHJ9

Protein Details
Accession A0A017SHJ9    Localization Confidence Low Confidence Score 5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
407-427SLATVRQQRNQKTQKTHWLSVHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) mito 19.5, cyto_mito 12.333, cyto 4, cyto_nucl 3.833
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR015943  WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf  
IPR001680  WD40_repeat  
IPR036322  WD40_repeat_dom_sf  
Pfam View protein in Pfam  
PF00400  WD40  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50082  WD_REPEATS_2  
Amino Acid Sequences MATPSNQQSPATPTYILRGHASPIHALHLFANNLRLISGDAEGWIIVWDMVSKRPVVSWKAHGGAVLEAKGFEFGGDGTAVYTHGRDHKLRVWRFGVKDEGFLDKTLPVDVKEGEAVQNQPWMLHSLPVNALNFCAFDMIFLEAPSPGDDVKQEGPSSDTQSPPSSTSQPPVLFAVPNALNSGAIDIFHLPLERRVSTIPADPATSTGMVMAVRLLLSSGELYATSAYEDGQVMVFVRRGQLTEPEISSSASGKGTAWKWEKLYASKPHTQPVLSIDIAPSKDYFLSSSADSVLVKHLIPDASLVGVGHAEEKALKMISTKHAGQQGLRIRSDGKIFATAGWDSRTRVYSCKTMKELAVLKWHKDGCYAVAFAEVFGNDSTASPTTDAGSKPGEKKETQFMRRNEGSLATVRQQRNQKTQKTHWLSVGSKDGKISLWDIY
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.3
2 0.33
3 0.32
4 0.29
5 0.26
6 0.27
7 0.29
8 0.3
9 0.28
10 0.25
11 0.28
12 0.25
13 0.25
14 0.23
15 0.25
16 0.25
17 0.22
18 0.25
19 0.21
20 0.21
21 0.2
22 0.18
23 0.14
24 0.14
25 0.13
26 0.1
27 0.09
28 0.1
29 0.09
30 0.09
31 0.08
32 0.07
33 0.05
34 0.05
35 0.07
36 0.08
37 0.12
38 0.13
39 0.14
40 0.14
41 0.17
42 0.23
43 0.25
44 0.3
45 0.33
46 0.38
47 0.4
48 0.39
49 0.37
50 0.33
51 0.31
52 0.28
53 0.23
54 0.17
55 0.14
56 0.14
57 0.14
58 0.12
59 0.08
60 0.06
61 0.05
62 0.06
63 0.06
64 0.06
65 0.06
66 0.06
67 0.07
68 0.07
69 0.07
70 0.08
71 0.14
72 0.19
73 0.21
74 0.25
75 0.32
76 0.41
77 0.44
78 0.49
79 0.49
80 0.52
81 0.53
82 0.52
83 0.54
84 0.44
85 0.44
86 0.39
87 0.38
88 0.32
89 0.29
90 0.26
91 0.18
92 0.18
93 0.16
94 0.15
95 0.11
96 0.12
97 0.12
98 0.12
99 0.12
100 0.13
101 0.13
102 0.14
103 0.15
104 0.14
105 0.16
106 0.15
107 0.14
108 0.14
109 0.15
110 0.13
111 0.14
112 0.14
113 0.14
114 0.16
115 0.19
116 0.2
117 0.17
118 0.16
119 0.14
120 0.14
121 0.11
122 0.1
123 0.06
124 0.05
125 0.06
126 0.08
127 0.08
128 0.07
129 0.08
130 0.07
131 0.08
132 0.08
133 0.08
134 0.06
135 0.06
136 0.07
137 0.1
138 0.12
139 0.14
140 0.13
141 0.13
142 0.15
143 0.17
144 0.22
145 0.21
146 0.2
147 0.2
148 0.22
149 0.23
150 0.23
151 0.24
152 0.24
153 0.22
154 0.23
155 0.27
156 0.25
157 0.25
158 0.24
159 0.22
160 0.18
161 0.16
162 0.19
163 0.14
164 0.14
165 0.13
166 0.11
167 0.1
168 0.1
169 0.11
170 0.06
171 0.05
172 0.05
173 0.05
174 0.06
175 0.06
176 0.07
177 0.06
178 0.09
179 0.12
180 0.12
181 0.12
182 0.13
183 0.14
184 0.15
185 0.18
186 0.16
187 0.14
188 0.15
189 0.14
190 0.14
191 0.13
192 0.12
193 0.09
194 0.07
195 0.07
196 0.06
197 0.06
198 0.05
199 0.04
200 0.03
201 0.03
202 0.03
203 0.03
204 0.03
205 0.03
206 0.03
207 0.03
208 0.03
209 0.03
210 0.04
211 0.04
212 0.04
213 0.04
214 0.04
215 0.04
216 0.04
217 0.04
218 0.04
219 0.04
220 0.05
221 0.05
222 0.06
223 0.06
224 0.07
225 0.07
226 0.07
227 0.08
228 0.11
229 0.13
230 0.14
231 0.14
232 0.15
233 0.15
234 0.15
235 0.14
236 0.12
237 0.1
238 0.08
239 0.09
240 0.08
241 0.12
242 0.12
243 0.2
244 0.22
245 0.23
246 0.25
247 0.28
248 0.31
249 0.3
250 0.37
251 0.37
252 0.4
253 0.45
254 0.46
255 0.46
256 0.45
257 0.41
258 0.35
259 0.3
260 0.28
261 0.21
262 0.2
263 0.17
264 0.18
265 0.18
266 0.17
267 0.14
268 0.1
269 0.1
270 0.1
271 0.11
272 0.09
273 0.11
274 0.1
275 0.11
276 0.1
277 0.11
278 0.1
279 0.1
280 0.1
281 0.1
282 0.09
283 0.09
284 0.1
285 0.1
286 0.1
287 0.1
288 0.08
289 0.07
290 0.08
291 0.07
292 0.05
293 0.05
294 0.05
295 0.05
296 0.05
297 0.05
298 0.05
299 0.05
300 0.07
301 0.07
302 0.07
303 0.08
304 0.12
305 0.16
306 0.21
307 0.22
308 0.25
309 0.3
310 0.31
311 0.3
312 0.35
313 0.38
314 0.39
315 0.38
316 0.34
317 0.31
318 0.32
319 0.34
320 0.28
321 0.21
322 0.19
323 0.19
324 0.19
325 0.2
326 0.18
327 0.17
328 0.18
329 0.18
330 0.16
331 0.19
332 0.22
333 0.21
334 0.25
335 0.27
336 0.33
337 0.37
338 0.43
339 0.43
340 0.42
341 0.42
342 0.45
343 0.46
344 0.4
345 0.46
346 0.42
347 0.4
348 0.44
349 0.45
350 0.38
351 0.36
352 0.33
353 0.26
354 0.27
355 0.25
356 0.18
357 0.19
358 0.19
359 0.16
360 0.17
361 0.13
362 0.11
363 0.1
364 0.11
365 0.08
366 0.08
367 0.11
368 0.11
369 0.12
370 0.11
371 0.11
372 0.12
373 0.16
374 0.16
375 0.16
376 0.21
377 0.25
378 0.3
379 0.37
380 0.41
381 0.39
382 0.43
383 0.51
384 0.56
385 0.59
386 0.63
387 0.6
388 0.64
389 0.65
390 0.63
391 0.54
392 0.46
393 0.4
394 0.36
395 0.36
396 0.33
397 0.39
398 0.4
399 0.45
400 0.52
401 0.57
402 0.63
403 0.69
404 0.71
405 0.73
406 0.79
407 0.83
408 0.83
409 0.8
410 0.75
411 0.73
412 0.66
413 0.62
414 0.64
415 0.55
416 0.48
417 0.44
418 0.39
419 0.32
420 0.32