Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A017SM78

Protein Details
Accession A0A017SM78    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
691-711SASPNVSNKRRRQSAIKVEDDHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
733-739RVTKKQK
Subcellular Location(s) nucl 17.5, cyto_nucl 13, cyto 5.5, mito 2, extr 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR029005  LIM-bd/SEUSS  
Pfam View protein in Pfam  
PF01803  LIM_bind  
Amino Acid Sequences MMMAQSFAAHQGMQQHPGLPPGHPMAHAQHPNAMHPGAGMVQQVHPGVSAPGGPQVSQAGPMMGAMPPGAATAGPGGPVPNAHALSHLGPTQAHLFQQHQFPQNFANNPQLMQQHQQQQLLRQRMILHQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQHGALPVSLPNGTQGLNAAQIAAMQANPAMRPVIQQMHLQQMPHGQPQMQAPQQQQLLVLQAQQAQQAQAQAQQAGNAGQPGQPTPQQRAAAQPQNMHETQSVTPQPQPGPPPHQGSSTPQSNPPQPPSQPPAPQAATSQAQPTPNPPPQQLPQSQQPMQQPQHTPQPQPQPHPQQGPQGLQQGPQPTPAMTPQEAQLKAQQQQNLMLQQRMGMKSTTTLYLNAFAEQLSNFRSRDEAQDLLYWQEFVDRFYSPGGVLRQGVYNRQSGSKQFEISTPALARYYLTQFNSGIRHIQMLVEGVRETASPSGGHIVESAKTSFIYWFTNDSQLFTNGRLRAYFDANHKIEMLDIVVMNHTEYLPRPQLQALEQAEQQKQSPKVSKNTGKRGQQKQANTPSFSLPESMVTDHGVPIAVLSFLEVAETISHMQMLFHHSQQNPQMSATESLRNLVNTLQTQTLQTQQTPNLGFMPTPMNPALQPGQPPRGPPMNGPAQFASPGMHPLGLPQGSPHIAGSAHASPAPSHLAAPGMVPQGQVQHNAHSASASPNVSNKRRRQSAIKVEDDSGAPEVNGTGPQGGAKVKASPRVTKKQKGGA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.26
2 0.26
3 0.26
4 0.32
5 0.32
6 0.23
7 0.26
8 0.27
9 0.28
10 0.26
11 0.28
12 0.28
13 0.37
14 0.41
15 0.38
16 0.38
17 0.37
18 0.39
19 0.4
20 0.35
21 0.25
22 0.2
23 0.19
24 0.15
25 0.16
26 0.14
27 0.12
28 0.13
29 0.16
30 0.16
31 0.15
32 0.14
33 0.13
34 0.12
35 0.11
36 0.11
37 0.09
38 0.14
39 0.15
40 0.15
41 0.15
42 0.17
43 0.17
44 0.18
45 0.17
46 0.12
47 0.12
48 0.12
49 0.12
50 0.09
51 0.09
52 0.07
53 0.06
54 0.06
55 0.06
56 0.06
57 0.05
58 0.05
59 0.07
60 0.07
61 0.08
62 0.08
63 0.08
64 0.09
65 0.09
66 0.11
67 0.15
68 0.16
69 0.16
70 0.17
71 0.19
72 0.2
73 0.22
74 0.21
75 0.16
76 0.15
77 0.17
78 0.2
79 0.19
80 0.18
81 0.19
82 0.21
83 0.23
84 0.31
85 0.36
86 0.39
87 0.39
88 0.39
89 0.43
90 0.46
91 0.46
92 0.41
93 0.43
94 0.36
95 0.36
96 0.39
97 0.35
98 0.31
99 0.33
100 0.37
101 0.38
102 0.42
103 0.46
104 0.44
105 0.49
106 0.55
107 0.58
108 0.52
109 0.45
110 0.42
111 0.43
112 0.49
113 0.48
114 0.46
115 0.46
116 0.52
117 0.57
118 0.63
119 0.65
120 0.65
121 0.64
122 0.65
123 0.66
124 0.67
125 0.69
126 0.68
127 0.69
128 0.69
129 0.72
130 0.72
131 0.71
132 0.69
133 0.66
134 0.62
135 0.56
136 0.5
137 0.44
138 0.36
139 0.29
140 0.23
141 0.19
142 0.16
143 0.15
144 0.12
145 0.1
146 0.11
147 0.11
148 0.1
149 0.1
150 0.09
151 0.1
152 0.1
153 0.09
154 0.07
155 0.07
156 0.08
157 0.07
158 0.06
159 0.04
160 0.06
161 0.06
162 0.07
163 0.07
164 0.07
165 0.07
166 0.09
167 0.13
168 0.16
169 0.18
170 0.21
171 0.22
172 0.3
173 0.31
174 0.3
175 0.27
176 0.29
177 0.3
178 0.3
179 0.29
180 0.22
181 0.23
182 0.27
183 0.32
184 0.29
185 0.31
186 0.29
187 0.33
188 0.33
189 0.31
190 0.28
191 0.22
192 0.21
193 0.17
194 0.16
195 0.12
196 0.15
197 0.15
198 0.16
199 0.16
200 0.14
201 0.14
202 0.15
203 0.14
204 0.15
205 0.15
206 0.15
207 0.14
208 0.14
209 0.14
210 0.14
211 0.13
212 0.1
213 0.09
214 0.09
215 0.09
216 0.1
217 0.12
218 0.15
219 0.17
220 0.22
221 0.28
222 0.28
223 0.28
224 0.34
225 0.4
226 0.43
227 0.43
228 0.42
229 0.37
230 0.42
231 0.41
232 0.36
233 0.29
234 0.25
235 0.22
236 0.25
237 0.25
238 0.21
239 0.23
240 0.24
241 0.25
242 0.25
243 0.28
244 0.27
245 0.31
246 0.35
247 0.39
248 0.37
249 0.38
250 0.36
251 0.38
252 0.4
253 0.38
254 0.35
255 0.34
256 0.36
257 0.4
258 0.42
259 0.41
260 0.4
261 0.37
262 0.41
263 0.43
264 0.45
265 0.43
266 0.41
267 0.43
268 0.38
269 0.37
270 0.32
271 0.3
272 0.25
273 0.22
274 0.22
275 0.18
276 0.18
277 0.18
278 0.2
279 0.23
280 0.27
281 0.29
282 0.28
283 0.3
284 0.32
285 0.39
286 0.39
287 0.37
288 0.39
289 0.43
290 0.44
291 0.44
292 0.46
293 0.47
294 0.45
295 0.47
296 0.42
297 0.38
298 0.46
299 0.44
300 0.42
301 0.4
302 0.48
303 0.46
304 0.49
305 0.55
306 0.54
307 0.55
308 0.59
309 0.55
310 0.52
311 0.51
312 0.48
313 0.43
314 0.4
315 0.35
316 0.31
317 0.31
318 0.27
319 0.23
320 0.23
321 0.2
322 0.14
323 0.15
324 0.16
325 0.17
326 0.14
327 0.14
328 0.15
329 0.21
330 0.21
331 0.21
332 0.23
333 0.23
334 0.27
335 0.3
336 0.29
337 0.24
338 0.26
339 0.28
340 0.29
341 0.26
342 0.22
343 0.19
344 0.19
345 0.22
346 0.2
347 0.19
348 0.14
349 0.12
350 0.13
351 0.15
352 0.13
353 0.1
354 0.11
355 0.1
356 0.13
357 0.13
358 0.12
359 0.11
360 0.09
361 0.09
362 0.08
363 0.09
364 0.08
365 0.1
366 0.1
367 0.1
368 0.12
369 0.12
370 0.16
371 0.18
372 0.17
373 0.15
374 0.17
375 0.17
376 0.16
377 0.15
378 0.12
379 0.08
380 0.11
381 0.1
382 0.09
383 0.11
384 0.09
385 0.1
386 0.1
387 0.11
388 0.08
389 0.11
390 0.11
391 0.11
392 0.11
393 0.11
394 0.14
395 0.14
396 0.17
397 0.16
398 0.17
399 0.17
400 0.19
401 0.2
402 0.19
403 0.25
404 0.24
405 0.23
406 0.22
407 0.22
408 0.25
409 0.24
410 0.24
411 0.18
412 0.16
413 0.15
414 0.14
415 0.13
416 0.11
417 0.14
418 0.15
419 0.15
420 0.16
421 0.16
422 0.19
423 0.2
424 0.19
425 0.17
426 0.14
427 0.14
428 0.12
429 0.12
430 0.1
431 0.1
432 0.09
433 0.08
434 0.08
435 0.07
436 0.07
437 0.07
438 0.07
439 0.06
440 0.07
441 0.06
442 0.06
443 0.09
444 0.09
445 0.09
446 0.09
447 0.1
448 0.1
449 0.11
450 0.11
451 0.09
452 0.09
453 0.09
454 0.09
455 0.1
456 0.11
457 0.1
458 0.14
459 0.15
460 0.21
461 0.2
462 0.21
463 0.21
464 0.22
465 0.22
466 0.2
467 0.24
468 0.2
469 0.21
470 0.2
471 0.2
472 0.2
473 0.23
474 0.24
475 0.24
476 0.31
477 0.31
478 0.31
479 0.29
480 0.27
481 0.24
482 0.2
483 0.15
484 0.07
485 0.07
486 0.06
487 0.06
488 0.06
489 0.06
490 0.06
491 0.06
492 0.06
493 0.07
494 0.12
495 0.15
496 0.16
497 0.18
498 0.18
499 0.2
500 0.21
501 0.28
502 0.25
503 0.24
504 0.25
505 0.29
506 0.3
507 0.29
508 0.29
509 0.28
510 0.28
511 0.32
512 0.37
513 0.38
514 0.44
515 0.53
516 0.6
517 0.63
518 0.71
519 0.72
520 0.74
521 0.78
522 0.8
523 0.8
524 0.78
525 0.75
526 0.74
527 0.77
528 0.73
529 0.66
530 0.58
531 0.51
532 0.46
533 0.4
534 0.31
535 0.21
536 0.18
537 0.17
538 0.16
539 0.14
540 0.13
541 0.13
542 0.12
543 0.12
544 0.1
545 0.07
546 0.07
547 0.06
548 0.05
549 0.04
550 0.04
551 0.04
552 0.04
553 0.04
554 0.04
555 0.04
556 0.05
557 0.06
558 0.06
559 0.06
560 0.07
561 0.07
562 0.07
563 0.08
564 0.14
565 0.16
566 0.17
567 0.24
568 0.24
569 0.29
570 0.35
571 0.39
572 0.34
573 0.32
574 0.31
575 0.27
576 0.31
577 0.28
578 0.27
579 0.22
580 0.22
581 0.23
582 0.22
583 0.2
584 0.18
585 0.19
586 0.16
587 0.18
588 0.18
589 0.18
590 0.19
591 0.2
592 0.25
593 0.23
594 0.24
595 0.25
596 0.25
597 0.31
598 0.3
599 0.3
600 0.25
601 0.23
602 0.21
603 0.19
604 0.22
605 0.17
606 0.19
607 0.19
608 0.18
609 0.17
610 0.22
611 0.23
612 0.2
613 0.26
614 0.28
615 0.34
616 0.35
617 0.37
618 0.39
619 0.43
620 0.42
621 0.38
622 0.4
623 0.43
624 0.43
625 0.45
626 0.4
627 0.34
628 0.33
629 0.32
630 0.25
631 0.16
632 0.17
633 0.15
634 0.14
635 0.12
636 0.12
637 0.19
638 0.18
639 0.17
640 0.15
641 0.19
642 0.19
643 0.2
644 0.19
645 0.13
646 0.13
647 0.14
648 0.18
649 0.16
650 0.16
651 0.16
652 0.16
653 0.15
654 0.18
655 0.21
656 0.16
657 0.14
658 0.14
659 0.14
660 0.14
661 0.15
662 0.16
663 0.15
664 0.15
665 0.15
666 0.15
667 0.2
668 0.22
669 0.27
670 0.24
671 0.26
672 0.29
673 0.29
674 0.29
675 0.23
676 0.23
677 0.2
678 0.24
679 0.21
680 0.19
681 0.25
682 0.34
683 0.42
684 0.5
685 0.56
686 0.62
687 0.68
688 0.73
689 0.75
690 0.77
691 0.8
692 0.8
693 0.78
694 0.71
695 0.65
696 0.61
697 0.52
698 0.44
699 0.34
700 0.25
701 0.17
702 0.14
703 0.12
704 0.11
705 0.11
706 0.1
707 0.09
708 0.09
709 0.1
710 0.12
711 0.13
712 0.14
713 0.15
714 0.22
715 0.25
716 0.34
717 0.39
718 0.46
719 0.54
720 0.63
721 0.71
722 0.73