FuNGI

A0A017SH42

Protein Details

Accession

A0A017SH42

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

13.3

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
21-52	LFRVVNTTAPPKKNRRPKTHRVVTKSAHKQEE	Hydrophilic
58-80	VTLKSTQKPKISRRELDRYVKSR	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
31-41	PKKNRRPKTHR

Subcellular Location(s)

nucl 10, mito 10, mito_nucl 10

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR043519 NT_sf IPR045862 Trf4-like
Gene Ontology	GO:0016020 C:membrane GO:0031499 C:TRAMP complex GO:0043631 P:RNA polyadenylation

Amino Acid Sequences

VFPDSLQRTLDAHRASNRASLFRVVNTTAPPKKNRRPKTHRVVTKSAHKQEEEEQKQVTLKSTQKPKISRRELDRYVKSRLRSDHKRPPEWVNQQLRWGMSVLQNRPEQWLWLNHYAGNNTSDATTHLDAEIRALDAYLMPTSDEQNQVNELVDTVSKLFQDIPYMPQLTGSWRTGVASSHSDVDFVLPVPDIGRLKDDIRKPSSTRPQVLEDYHSLLERVQQILWQTPTFKDKTFLVYNRIPVLSAIHGPTGIRVRFQCKEGLPSSIEYINDYLAEYPAVRPLYRTTRLILEVQELFGPLHSSIGTNALLMLLVAFCKMNHGRFQRPHGLGVQLLAFLRTYGIDVDLAANGVAVDPPGLFNEESTRSADERWSWPEETPAHIRGQCALMNLKRTAGFKGNGPIADHLCIQDPTNYMNDLGRLCTRTRDIQNVWAAAYARLKAASDDWDGSGGTVRQSILTHSLRANFEDFERKR

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.39
2	0.39
3	0.43
4	0.42
5	0.38
6	0.37
7	0.37
8	0.33
9	0.32
10	0.35
11	0.31
12	0.31
13	0.32
14	0.39
15	0.43
16	0.48
17	0.54
18	0.6
19	0.68
20	0.76
21	0.82
22	0.84
23	0.86
24	0.89
25	0.92
26	0.92
27	0.91
28	0.89
29	0.88
30	0.84
31	0.85
32	0.85
33	0.82
34	0.77
35	0.68
36	0.63
37	0.63
38	0.66
39	0.61
40	0.54
41	0.47
42	0.43
43	0.45
44	0.43
45	0.37
46	0.33
47	0.35
48	0.39
49	0.49
50	0.53
51	0.59
52	0.67
53	0.73
54	0.77
55	0.79
56	0.79
57	0.78
58	0.81
59	0.82
60	0.83
61	0.83
62	0.76
63	0.76
64	0.72
65	0.67
66	0.64
67	0.64
68	0.64
69	0.64
70	0.69
71	0.71
72	0.76
73	0.78
74	0.76
75	0.76
76	0.76
77	0.74
78	0.74
79	0.73
80	0.65
81	0.64
82	0.62
83	0.54
84	0.45
85	0.37
86	0.3
87	0.26
88	0.32
89	0.3
90	0.33
91	0.35
92	0.34
93	0.38
94	0.36
95	0.31
96	0.27
97	0.31
98	0.31
99	0.34
100	0.35
101	0.32
102	0.34
103	0.33
104	0.31
105	0.26
106	0.2
107	0.15
108	0.14
109	0.12
110	0.11
111	0.15
112	0.14
113	0.13
114	0.13
115	0.13
116	0.13
117	0.14
118	0.13
119	0.09
120	0.08
121	0.07
122	0.07
123	0.06
124	0.07
125	0.07
126	0.06
127	0.06
128	0.07
129	0.09
130	0.11
131	0.14
132	0.14
133	0.15
134	0.15
135	0.16
136	0.15
137	0.13
138	0.11
139	0.08
140	0.08
141	0.07
142	0.07
143	0.08
144	0.07
145	0.08
146	0.08
147	0.08
148	0.11
149	0.12
150	0.14
151	0.17
152	0.18
153	0.17
154	0.17
155	0.17
156	0.18
157	0.21
158	0.19
159	0.16
160	0.15
161	0.15
162	0.15
163	0.16
164	0.15
165	0.13
166	0.13
167	0.15
168	0.15
169	0.14
170	0.13
171	0.13
172	0.11
173	0.08
174	0.08
175	0.05
176	0.05
177	0.06
178	0.09
179	0.08
180	0.08
181	0.1
182	0.11
183	0.13
184	0.19
185	0.23
186	0.28
187	0.31
188	0.35
189	0.36
190	0.44
191	0.52
192	0.52
193	0.51
194	0.47
195	0.47
196	0.47
197	0.46
198	0.4
199	0.31
200	0.28
201	0.25
202	0.22
203	0.17
204	0.14
205	0.16
206	0.14
207	0.13
208	0.1
209	0.11
210	0.12
211	0.14
212	0.16
213	0.13
214	0.13
215	0.13
216	0.18
217	0.18
218	0.18
219	0.17
220	0.16
221	0.21
222	0.25
223	0.25
224	0.27
225	0.28
226	0.29
227	0.29
228	0.28
229	0.23
230	0.17
231	0.17
232	0.12
233	0.11
234	0.1
235	0.08
236	0.08
237	0.08
238	0.1
239	0.13
240	0.12
241	0.13
242	0.14
243	0.19
244	0.2
245	0.22
246	0.25
247	0.2
248	0.26
249	0.25
250	0.26
251	0.22
252	0.21
253	0.22
254	0.19
255	0.18
256	0.14
257	0.13
258	0.11
259	0.1
260	0.09
261	0.07
262	0.06
263	0.06
264	0.06
265	0.06
266	0.09
267	0.1
268	0.1
269	0.1
270	0.15
271	0.22
272	0.25
273	0.26
274	0.23
275	0.25
276	0.28
277	0.28
278	0.25
279	0.21
280	0.18
281	0.17
282	0.16
283	0.13
284	0.11
285	0.09
286	0.1
287	0.06
288	0.07
289	0.06
290	0.06
291	0.06
292	0.09
293	0.09
294	0.07
295	0.07
296	0.07
297	0.06
298	0.06
299	0.05
300	0.03
301	0.03
302	0.03
303	0.04
304	0.03
305	0.09
306	0.11
307	0.13
308	0.21
309	0.26
310	0.35
311	0.39
312	0.46
313	0.51
314	0.5
315	0.5
316	0.45
317	0.41
318	0.33
319	0.29
320	0.23
321	0.14
322	0.13
323	0.11
324	0.09
325	0.07
326	0.07
327	0.06
328	0.06
329	0.05
330	0.06
331	0.06
332	0.06
333	0.07
334	0.07
335	0.07
336	0.06
337	0.05
338	0.04
339	0.05
340	0.04
341	0.03
342	0.04
343	0.04
344	0.04
345	0.05
346	0.07
347	0.07
348	0.08
349	0.12
350	0.15
351	0.16
352	0.18
353	0.2
354	0.19
355	0.2
356	0.22
357	0.22
358	0.24
359	0.27
360	0.3
361	0.29
362	0.28
363	0.33
364	0.32
365	0.33
366	0.34
367	0.31
368	0.32
369	0.32
370	0.32
371	0.28
372	0.3
373	0.26
374	0.24
375	0.28
376	0.26
377	0.3
378	0.3
379	0.3
380	0.3
381	0.3
382	0.32
383	0.31
384	0.29
385	0.28
386	0.34
387	0.35
388	0.33
389	0.34
390	0.33
391	0.29
392	0.3
393	0.27
394	0.21
395	0.2
396	0.2
397	0.19
398	0.19
399	0.18
400	0.18
401	0.2
402	0.2
403	0.18
404	0.18
405	0.2
406	0.17
407	0.19
408	0.21
409	0.21
410	0.21
411	0.26
412	0.29
413	0.35
414	0.39
415	0.45
416	0.44
417	0.49
418	0.54
419	0.5
420	0.46
421	0.41
422	0.36
423	0.31
424	0.31
425	0.23
426	0.19
427	0.18
428	0.18
429	0.17
430	0.18
431	0.19
432	0.2
433	0.21
434	0.2
435	0.21
436	0.2
437	0.19
438	0.21
439	0.17
440	0.14
441	0.14
442	0.14
443	0.14
444	0.15
445	0.18
446	0.22
447	0.24
448	0.26
449	0.28
450	0.34
451	0.34
452	0.37
453	0.36
454	0.29
455	0.31

A0A017SH42

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer