Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A017SMC1

Protein Details
Accession A0A017SMC1    Localization Confidence High Confidence Score 15.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
213-236EKKEAKGKRGGGRKKKAKDNALDDBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
213-230EKKEAKGKRGGGRKKKAK
287-301ARKSSGGSKKKKTRA
Subcellular Location(s) nucl 22.5, cyto_nucl 13.5, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR001623  DnaJ_domain  
IPR018253  DnaJ_domain_CS  
IPR036869  J_dom_sf  
Pfam View protein in Pfam  
PF00226  DnaJ  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00636  DNAJ_1  
PS50076  DNAJ_2  
CDD cd06257  DnaJ  
Amino Acid Sequences MPDRNSPEIPREPPLETDLYDILGVSQDAKPEAIKSAYKKLALKHHPDKAPADSKDEANHKFQQIAFAYAILSDERRRKRFDLTGSTAEAVNEDEDFNWMDFYREQFSASVDVNALEKLKKEYQGSEEEKRDMLAAFEKSKGDMDKVYESVMLCNVLDDDERFRAIIDKAIADGEVENYEDYSEEPESKRQQRIEAAQKEAAEAEELSKEIEEKKEAKGKRGGGRKKKAKDNALDDNALVAMIKQRQANRAESFFDKLEEKYAPKGQKKRAAQMDEPPEEAFAATGARKSSGGSKKKKTRA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.43
2 0.37
3 0.3
4 0.3
5 0.25
6 0.22
7 0.2
8 0.17
9 0.13
10 0.11
11 0.1
12 0.09
13 0.1
14 0.1
15 0.11
16 0.12
17 0.13
18 0.13
19 0.16
20 0.17
21 0.22
22 0.25
23 0.33
24 0.38
25 0.42
26 0.44
27 0.47
28 0.54
29 0.57
30 0.63
31 0.63
32 0.67
33 0.66
34 0.67
35 0.65
36 0.63
37 0.63
38 0.54
39 0.51
40 0.45
41 0.42
42 0.44
43 0.47
44 0.42
45 0.39
46 0.42
47 0.37
48 0.38
49 0.36
50 0.38
51 0.32
52 0.32
53 0.26
54 0.21
55 0.2
56 0.17
57 0.17
58 0.11
59 0.11
60 0.13
61 0.21
62 0.29
63 0.33
64 0.39
65 0.4
66 0.47
67 0.52
68 0.55
69 0.56
70 0.54
71 0.54
72 0.51
73 0.5
74 0.43
75 0.35
76 0.28
77 0.19
78 0.12
79 0.09
80 0.07
81 0.06
82 0.07
83 0.08
84 0.08
85 0.08
86 0.07
87 0.08
88 0.09
89 0.11
90 0.13
91 0.12
92 0.13
93 0.13
94 0.14
95 0.15
96 0.15
97 0.13
98 0.1
99 0.1
100 0.1
101 0.1
102 0.1
103 0.08
104 0.08
105 0.12
106 0.14
107 0.18
108 0.18
109 0.2
110 0.23
111 0.31
112 0.36
113 0.37
114 0.37
115 0.35
116 0.34
117 0.32
118 0.28
119 0.2
120 0.15
121 0.12
122 0.12
123 0.12
124 0.14
125 0.13
126 0.13
127 0.15
128 0.14
129 0.12
130 0.11
131 0.12
132 0.13
133 0.13
134 0.13
135 0.13
136 0.12
137 0.11
138 0.11
139 0.09
140 0.06
141 0.06
142 0.05
143 0.05
144 0.05
145 0.05
146 0.07
147 0.07
148 0.07
149 0.07
150 0.07
151 0.09
152 0.1
153 0.12
154 0.1
155 0.1
156 0.1
157 0.1
158 0.1
159 0.08
160 0.08
161 0.06
162 0.05
163 0.06
164 0.05
165 0.05
166 0.05
167 0.05
168 0.05
169 0.07
170 0.07
171 0.09
172 0.1
173 0.15
174 0.23
175 0.28
176 0.33
177 0.32
178 0.35
179 0.39
180 0.46
181 0.51
182 0.49
183 0.47
184 0.45
185 0.43
186 0.4
187 0.35
188 0.27
189 0.17
190 0.12
191 0.09
192 0.07
193 0.07
194 0.07
195 0.07
196 0.08
197 0.09
198 0.1
199 0.13
200 0.14
201 0.2
202 0.27
203 0.29
204 0.34
205 0.39
206 0.45
207 0.49
208 0.58
209 0.63
210 0.66
211 0.75
212 0.79
213 0.81
214 0.83
215 0.85
216 0.83
217 0.81
218 0.78
219 0.78
220 0.72
221 0.65
222 0.54
223 0.46
224 0.37
225 0.28
226 0.2
227 0.1
228 0.1
229 0.11
230 0.14
231 0.17
232 0.2
233 0.27
234 0.31
235 0.37
236 0.38
237 0.38
238 0.39
239 0.38
240 0.39
241 0.34
242 0.33
243 0.28
244 0.24
245 0.25
246 0.24
247 0.24
248 0.26
249 0.33
250 0.4
251 0.47
252 0.56
253 0.61
254 0.68
255 0.73
256 0.77
257 0.79
258 0.77
259 0.73
260 0.73
261 0.74
262 0.67
263 0.62
264 0.52
265 0.43
266 0.35
267 0.3
268 0.2
269 0.11
270 0.1
271 0.09
272 0.11
273 0.12
274 0.13
275 0.13
276 0.15
277 0.24
278 0.32
279 0.41
280 0.49
281 0.59