Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A017SSA3

Protein Details
Accession A0A017SSA3    Localization Confidence High Confidence Score 21.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
112-139EDTKTWLQQAKKRQKKIEKERARKLEEEHydrophilic
285-311MDISEVKIKKPKKKKTKTTKQRAVLDDHydrophilic
363-383SLTRQRRAAFKKRQKVKPEDLHydrophilic
630-652KGSGKMKTEKRLKKIDEEKQREABasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
122-135KKRQKKIEKERARK
291-303KIKKPKKKKTKTT
371-377AFKKRQK
636-641KTEKRL
Subcellular Location(s) nucl 22, cyto_nucl 13.333, mito_nucl 12.333
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR045347  HIND  
IPR005011  SNU66/SART1  
Gene Ontology GO:0046540  C:U4/U6 x U5 tri-snRNP complex  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF19252  HIND  
PF03343  SART-1  
Amino Acid Sequences MSDALSIEQNNKIRAALGLKPLPVPGADATAGPSFKEHDDSDSDTSSDEEDPASTLESRQAQAGENWKKLQDEAEAKQKREERNAAIKKAREQAQKNAKLEGSTLGETGGAEDTKTWLQQAKKRQKKIEKERARKLEEELEERERAAATEYTSADLAGLKVGHEAGEFDGEEEHILTLKDAAVDQEDEGDELEDLALRDSEKTAEKLELKKRKPVYDPTAENAGILAQYDEEIEGKKRKRFTLDATGSTAEDRDAQRQEVSEKLKKNAISLDLDLEPQAPVSDYMDISEVKIKKPKKKKTKTTKQRAVLDDEDTFPATESGNVPDGTSMEVDKNNKTPAPAPAPRKRISEDVSFADDDDLQASLTRQRRAAFKKRQKVKPEDLARQLREEESQTPMEVENAENEEEPGLIIDETSEFVSNLQRPTLPDRRESRKTATPVPAEAPSSPAEAPHVELEGDVDMGRTYSGIEDEEELKERIKQDEAKAQQGISGTGLEEETTLDQGLGATLSMLKQRGLVKQTDSASNNALFRERQRFLHEKQHLETEAEKRARQQRERDRTSGKLDRMSAREREEHARWENKQRDQHDSRHMADVFNREYKPDVQLKYVDEYGRLMNQKEAFKHLSHQFHGKGSGKMKTEKRLKKIDEEKQREAMSTLDSSQHTGMNNAMGATARKNRQAGVRLG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.26
2 0.27
3 0.26
4 0.31
5 0.33
6 0.34
7 0.35
8 0.34
9 0.32
10 0.27
11 0.24
12 0.17
13 0.16
14 0.15
15 0.14
16 0.17
17 0.2
18 0.2
19 0.17
20 0.17
21 0.16
22 0.17
23 0.22
24 0.19
25 0.2
26 0.24
27 0.29
28 0.32
29 0.31
30 0.29
31 0.25
32 0.25
33 0.23
34 0.19
35 0.15
36 0.11
37 0.1
38 0.11
39 0.11
40 0.13
41 0.11
42 0.11
43 0.16
44 0.19
45 0.19
46 0.2
47 0.21
48 0.21
49 0.25
50 0.34
51 0.37
52 0.38
53 0.4
54 0.4
55 0.4
56 0.39
57 0.37
58 0.35
59 0.35
60 0.35
61 0.43
62 0.48
63 0.48
64 0.54
65 0.58
66 0.56
67 0.57
68 0.59
69 0.57
70 0.62
71 0.69
72 0.7
73 0.71
74 0.69
75 0.67
76 0.68
77 0.68
78 0.66
79 0.63
80 0.65
81 0.69
82 0.74
83 0.69
84 0.65
85 0.58
86 0.49
87 0.45
88 0.38
89 0.31
90 0.23
91 0.22
92 0.17
93 0.16
94 0.15
95 0.15
96 0.13
97 0.08
98 0.07
99 0.08
100 0.1
101 0.11
102 0.12
103 0.12
104 0.16
105 0.23
106 0.29
107 0.4
108 0.49
109 0.57
110 0.66
111 0.75
112 0.8
113 0.85
114 0.9
115 0.9
116 0.9
117 0.91
118 0.92
119 0.91
120 0.86
121 0.77
122 0.7
123 0.68
124 0.61
125 0.56
126 0.5
127 0.45
128 0.41
129 0.39
130 0.35
131 0.26
132 0.21
133 0.19
134 0.15
135 0.12
136 0.15
137 0.16
138 0.16
139 0.16
140 0.16
141 0.13
142 0.12
143 0.1
144 0.08
145 0.07
146 0.06
147 0.07
148 0.07
149 0.07
150 0.06
151 0.07
152 0.06
153 0.08
154 0.08
155 0.08
156 0.08
157 0.08
158 0.08
159 0.08
160 0.07
161 0.06
162 0.06
163 0.06
164 0.06
165 0.06
166 0.07
167 0.06
168 0.07
169 0.08
170 0.08
171 0.08
172 0.09
173 0.08
174 0.08
175 0.08
176 0.08
177 0.06
178 0.06
179 0.06
180 0.05
181 0.05
182 0.06
183 0.06
184 0.06
185 0.06
186 0.07
187 0.09
188 0.11
189 0.12
190 0.13
191 0.17
192 0.22
193 0.29
194 0.39
195 0.47
196 0.47
197 0.54
198 0.58
199 0.6
200 0.62
201 0.63
202 0.61
203 0.61
204 0.61
205 0.56
206 0.56
207 0.49
208 0.43
209 0.33
210 0.25
211 0.16
212 0.13
213 0.09
214 0.04
215 0.04
216 0.04
217 0.04
218 0.05
219 0.06
220 0.09
221 0.16
222 0.21
223 0.26
224 0.3
225 0.33
226 0.38
227 0.42
228 0.46
229 0.5
230 0.5
231 0.49
232 0.47
233 0.45
234 0.39
235 0.35
236 0.28
237 0.17
238 0.15
239 0.14
240 0.15
241 0.16
242 0.17
243 0.17
244 0.18
245 0.19
246 0.21
247 0.27
248 0.28
249 0.3
250 0.31
251 0.35
252 0.34
253 0.34
254 0.31
255 0.28
256 0.24
257 0.21
258 0.22
259 0.18
260 0.18
261 0.17
262 0.14
263 0.11
264 0.08
265 0.08
266 0.05
267 0.05
268 0.06
269 0.06
270 0.06
271 0.07
272 0.08
273 0.08
274 0.08
275 0.14
276 0.14
277 0.15
278 0.21
279 0.27
280 0.35
281 0.46
282 0.56
283 0.61
284 0.71
285 0.8
286 0.85
287 0.91
288 0.93
289 0.94
290 0.93
291 0.9
292 0.87
293 0.79
294 0.74
295 0.64
296 0.56
297 0.45
298 0.37
299 0.29
300 0.21
301 0.18
302 0.12
303 0.1
304 0.08
305 0.07
306 0.07
307 0.08
308 0.09
309 0.09
310 0.09
311 0.09
312 0.09
313 0.09
314 0.08
315 0.07
316 0.07
317 0.09
318 0.11
319 0.12
320 0.14
321 0.15
322 0.15
323 0.15
324 0.16
325 0.19
326 0.25
327 0.3
328 0.36
329 0.42
330 0.48
331 0.5
332 0.5
333 0.48
334 0.45
335 0.42
336 0.38
337 0.33
338 0.29
339 0.29
340 0.26
341 0.24
342 0.2
343 0.16
344 0.11
345 0.09
346 0.07
347 0.04
348 0.05
349 0.05
350 0.1
351 0.14
352 0.16
353 0.17
354 0.19
355 0.27
356 0.35
357 0.46
358 0.51
359 0.57
360 0.66
361 0.74
362 0.8
363 0.81
364 0.82
365 0.79
366 0.78
367 0.76
368 0.73
369 0.72
370 0.7
371 0.63
372 0.56
373 0.49
374 0.4
375 0.33
376 0.29
377 0.21
378 0.18
379 0.17
380 0.15
381 0.15
382 0.14
383 0.13
384 0.11
385 0.1
386 0.08
387 0.09
388 0.09
389 0.08
390 0.08
391 0.08
392 0.07
393 0.07
394 0.05
395 0.04
396 0.04
397 0.04
398 0.04
399 0.04
400 0.05
401 0.05
402 0.05
403 0.05
404 0.06
405 0.09
406 0.12
407 0.12
408 0.12
409 0.13
410 0.15
411 0.22
412 0.3
413 0.29
414 0.34
415 0.41
416 0.48
417 0.53
418 0.56
419 0.54
420 0.54
421 0.56
422 0.56
423 0.56
424 0.49
425 0.45
426 0.43
427 0.38
428 0.32
429 0.28
430 0.23
431 0.17
432 0.17
433 0.15
434 0.13
435 0.13
436 0.12
437 0.13
438 0.11
439 0.11
440 0.09
441 0.08
442 0.09
443 0.07
444 0.07
445 0.06
446 0.05
447 0.04
448 0.05
449 0.05
450 0.04
451 0.04
452 0.04
453 0.05
454 0.05
455 0.06
456 0.07
457 0.09
458 0.11
459 0.13
460 0.13
461 0.13
462 0.15
463 0.16
464 0.17
465 0.19
466 0.23
467 0.25
468 0.34
469 0.36
470 0.39
471 0.38
472 0.36
473 0.33
474 0.29
475 0.26
476 0.17
477 0.14
478 0.09
479 0.08
480 0.08
481 0.07
482 0.06
483 0.06
484 0.06
485 0.06
486 0.06
487 0.06
488 0.05
489 0.05
490 0.05
491 0.05
492 0.04
493 0.03
494 0.04
495 0.05
496 0.07
497 0.08
498 0.08
499 0.12
500 0.16
501 0.21
502 0.24
503 0.26
504 0.27
505 0.32
506 0.34
507 0.37
508 0.36
509 0.32
510 0.32
511 0.31
512 0.29
513 0.24
514 0.25
515 0.19
516 0.23
517 0.3
518 0.3
519 0.3
520 0.37
521 0.42
522 0.45
523 0.54
524 0.55
525 0.52
526 0.52
527 0.55
528 0.49
529 0.45
530 0.45
531 0.39
532 0.41
533 0.4
534 0.38
535 0.39
536 0.47
537 0.54
538 0.57
539 0.62
540 0.65
541 0.72
542 0.78
543 0.78
544 0.75
545 0.71
546 0.73
547 0.7
548 0.63
549 0.58
550 0.56
551 0.54
552 0.54
553 0.54
554 0.5
555 0.47
556 0.48
557 0.46
558 0.49
559 0.46
560 0.48
561 0.5
562 0.53
563 0.53
564 0.59
565 0.63
566 0.64
567 0.69
568 0.65
569 0.68
570 0.66
571 0.69
572 0.68
573 0.67
574 0.61
575 0.61
576 0.57
577 0.49
578 0.47
579 0.46
580 0.41
581 0.41
582 0.38
583 0.32
584 0.34
585 0.35
586 0.37
587 0.38
588 0.36
589 0.33
590 0.37
591 0.38
592 0.4
593 0.42
594 0.35
595 0.29
596 0.28
597 0.27
598 0.3
599 0.3
600 0.26
601 0.28
602 0.33
603 0.37
604 0.37
605 0.42
606 0.39
607 0.37
608 0.44
609 0.46
610 0.47
611 0.46
612 0.52
613 0.48
614 0.47
615 0.54
616 0.5
617 0.49
618 0.47
619 0.5
620 0.48
621 0.53
622 0.57
623 0.59
624 0.66
625 0.68
626 0.71
627 0.75
628 0.75
629 0.77
630 0.81
631 0.8
632 0.81
633 0.81
634 0.78
635 0.75
636 0.72
637 0.62
638 0.53
639 0.44
640 0.37
641 0.3
642 0.26
643 0.23
644 0.23
645 0.25
646 0.25
647 0.26
648 0.22
649 0.21
650 0.21
651 0.18
652 0.18
653 0.15
654 0.14
655 0.13
656 0.14
657 0.19
658 0.26
659 0.28
660 0.34
661 0.36
662 0.39
663 0.45