Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A017SHV9

Protein Details
Accession A0A017SHV9    Localization Confidence High Confidence Score 23.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
29-52AEETKGRGMKRRRTEPKRGFLDASBasic
70-93DEKISRARKGKGKTKRKTDDDDEDBasic
122-146AEKPLKPKPLDKSKPPKKNKTGVIYHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
34-45GRGMKRRRTEPK
74-86SRARKGKGKTKRK
123-141EKPLKPKPLDKSKPPKKNK
260-271AKRRVEDARAKK
292-298KSEEKKR
Subcellular Location(s) nucl 23.5, cyto_nucl 14
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039119  ABT1/Esf2  
IPR034353  ABT1/ESF2_RRM  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0003676  F:nucleic acid binding  
CDD cd12263  RRM_ABT1_like  
Amino Acid Sequences MTTRKRNEFLDPISDEDEGSEAGYDSEAAEETKGRGMKRRRTEPKRGFLDASGDEDEERESDPGVSDDEDEKISRARKGKGKTKRKTDDDDEDQDDDDEYGEQRESEGDAKYLDATTTITKAEKPLKPKPLDKSKPPKKNKTGVIYFSSLPPYLRPFALKGLLEKYGFSPITRVFLNPSIPSASAPRRRSNKRKTYSDGWVEFASKKTAKLCAETLNANIVGGKKGGWYHDDVWNMKYLRGFKWADLMEQVQRERSEREAKRRVEDARAKKEEKVFVEGVEKGRVLDGMARKSEEKKRRMPEVDVPEEKVQERGNVDEGGKKGNVRRLFKQNEVKTPRDRIEKDDGAAALGEDTKRVLGKIF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.43
2 0.35
3 0.27
4 0.23
5 0.15
6 0.13
7 0.09
8 0.07
9 0.07
10 0.07
11 0.07
12 0.06
13 0.06
14 0.07
15 0.07
16 0.07
17 0.09
18 0.1
19 0.15
20 0.18
21 0.19
22 0.28
23 0.37
24 0.46
25 0.56
26 0.66
27 0.72
28 0.78
29 0.88
30 0.89
31 0.89
32 0.87
33 0.81
34 0.73
35 0.63
36 0.6
37 0.5
38 0.45
39 0.36
40 0.29
41 0.24
42 0.22
43 0.2
44 0.15
45 0.14
46 0.1
47 0.09
48 0.09
49 0.1
50 0.1
51 0.11
52 0.1
53 0.11
54 0.12
55 0.13
56 0.14
57 0.13
58 0.14
59 0.17
60 0.19
61 0.23
62 0.28
63 0.34
64 0.4
65 0.49
66 0.58
67 0.64
68 0.72
69 0.76
70 0.82
71 0.84
72 0.84
73 0.83
74 0.81
75 0.8
76 0.76
77 0.73
78 0.65
79 0.56
80 0.49
81 0.41
82 0.34
83 0.24
84 0.17
85 0.11
86 0.08
87 0.08
88 0.07
89 0.07
90 0.07
91 0.07
92 0.08
93 0.1
94 0.1
95 0.1
96 0.1
97 0.1
98 0.11
99 0.1
100 0.09
101 0.07
102 0.08
103 0.08
104 0.09
105 0.1
106 0.1
107 0.1
108 0.15
109 0.23
110 0.25
111 0.31
112 0.39
113 0.47
114 0.52
115 0.58
116 0.62
117 0.65
118 0.69
119 0.72
120 0.75
121 0.76
122 0.81
123 0.85
124 0.86
125 0.83
126 0.85
127 0.82
128 0.8
129 0.76
130 0.69
131 0.64
132 0.56
133 0.47
134 0.4
135 0.34
136 0.26
137 0.2
138 0.17
139 0.16
140 0.15
141 0.15
142 0.14
143 0.14
144 0.16
145 0.19
146 0.18
147 0.17
148 0.17
149 0.2
150 0.18
151 0.18
152 0.16
153 0.17
154 0.17
155 0.15
156 0.15
157 0.13
158 0.15
159 0.15
160 0.14
161 0.12
162 0.14
163 0.16
164 0.13
165 0.14
166 0.13
167 0.13
168 0.13
169 0.15
170 0.2
171 0.26
172 0.3
173 0.36
174 0.44
175 0.53
176 0.63
177 0.7
178 0.73
179 0.73
180 0.77
181 0.76
182 0.74
183 0.72
184 0.7
185 0.6
186 0.52
187 0.44
188 0.38
189 0.33
190 0.28
191 0.25
192 0.17
193 0.17
194 0.17
195 0.22
196 0.21
197 0.23
198 0.24
199 0.24
200 0.25
201 0.25
202 0.24
203 0.21
204 0.19
205 0.16
206 0.15
207 0.11
208 0.1
209 0.09
210 0.08
211 0.07
212 0.08
213 0.1
214 0.1
215 0.14
216 0.16
217 0.21
218 0.25
219 0.25
220 0.25
221 0.3
222 0.29
223 0.26
224 0.26
225 0.24
226 0.21
227 0.27
228 0.27
229 0.22
230 0.28
231 0.27
232 0.25
233 0.25
234 0.25
235 0.22
236 0.24
237 0.25
238 0.21
239 0.21
240 0.22
241 0.22
242 0.26
243 0.33
244 0.35
245 0.45
246 0.51
247 0.54
248 0.56
249 0.6
250 0.58
251 0.58
252 0.61
253 0.61
254 0.62
255 0.66
256 0.64
257 0.63
258 0.65
259 0.62
260 0.55
261 0.51
262 0.41
263 0.35
264 0.36
265 0.35
266 0.31
267 0.27
268 0.24
269 0.18
270 0.18
271 0.16
272 0.13
273 0.16
274 0.19
275 0.21
276 0.23
277 0.25
278 0.27
279 0.34
280 0.44
281 0.48
282 0.5
283 0.55
284 0.61
285 0.69
286 0.71
287 0.7
288 0.7
289 0.7
290 0.72
291 0.65
292 0.62
293 0.55
294 0.52
295 0.46
296 0.4
297 0.32
298 0.27
299 0.26
300 0.24
301 0.24
302 0.24
303 0.25
304 0.27
305 0.26
306 0.26
307 0.26
308 0.26
309 0.29
310 0.34
311 0.42
312 0.43
313 0.5
314 0.57
315 0.62
316 0.69
317 0.74
318 0.73
319 0.76
320 0.77
321 0.75
322 0.72
323 0.74
324 0.71
325 0.71
326 0.66
327 0.62
328 0.64
329 0.62
330 0.56
331 0.52
332 0.45
333 0.35
334 0.33
335 0.26
336 0.17
337 0.16
338 0.14
339 0.1
340 0.11
341 0.12
342 0.13