Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A017SMN5

Protein Details
Accession A0A017SMN5    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
158-184NIILRKSKGRAPRNPRTSRRNSIRNNGHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
162-178RKSKGRAPRNPRTSRRN
Subcellular Location(s) nucl 16.5, cyto_nucl 12.5, cyto 5.5, pero 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR015940  UBA  
IPR009060  UBA-like_sf  
IPR013087  Znf_C2H2_type  
Pfam View protein in Pfam  
PF00627  UBA  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50030  UBA  
PS00028  ZINC_FINGER_C2H2_1  
PS50157  ZINC_FINGER_C2H2_2  
Amino Acid Sequences MASSDLDQLIEMGFDQERAQLAVSKGGGIQGALEWLEVNQDKSLEEIKAAAAEQESEEGPALQPGEVPRSLVCNECGKKFRSQAQAEFHASKSEHVDFAESTEEIAPLTEEQKKQKLEDLREKLAAKRAVQGEQEKADKKRNEVWNLLLLKLFIVFSNIILRKSKGRAPRNPRTSRRNSIRNNG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.07
2 0.08
3 0.09
4 0.1
5 0.1
6 0.11
7 0.13
8 0.14
9 0.17
10 0.17
11 0.16
12 0.15
13 0.16
14 0.15
15 0.1
16 0.1
17 0.06
18 0.07
19 0.06
20 0.06
21 0.05
22 0.05
23 0.09
24 0.1
25 0.11
26 0.11
27 0.11
28 0.11
29 0.13
30 0.15
31 0.11
32 0.11
33 0.1
34 0.09
35 0.1
36 0.1
37 0.09
38 0.06
39 0.07
40 0.07
41 0.07
42 0.07
43 0.07
44 0.07
45 0.07
46 0.07
47 0.07
48 0.07
49 0.06
50 0.07
51 0.07
52 0.11
53 0.1
54 0.11
55 0.1
56 0.13
57 0.14
58 0.14
59 0.15
60 0.2
61 0.22
62 0.25
63 0.29
64 0.28
65 0.32
66 0.34
67 0.39
68 0.4
69 0.42
70 0.44
71 0.45
72 0.48
73 0.47
74 0.44
75 0.37
76 0.31
77 0.28
78 0.23
79 0.21
80 0.17
81 0.14
82 0.12
83 0.13
84 0.1
85 0.11
86 0.11
87 0.08
88 0.08
89 0.07
90 0.07
91 0.06
92 0.06
93 0.05
94 0.05
95 0.07
96 0.11
97 0.13
98 0.17
99 0.23
100 0.24
101 0.25
102 0.31
103 0.35
104 0.39
105 0.47
106 0.5
107 0.48
108 0.51
109 0.52
110 0.48
111 0.49
112 0.44
113 0.35
114 0.34
115 0.33
116 0.32
117 0.35
118 0.36
119 0.33
120 0.33
121 0.37
122 0.36
123 0.38
124 0.43
125 0.41
126 0.42
127 0.48
128 0.52
129 0.53
130 0.51
131 0.51
132 0.49
133 0.49
134 0.45
135 0.36
136 0.27
137 0.22
138 0.19
139 0.16
140 0.08
141 0.09
142 0.08
143 0.09
144 0.17
145 0.19
146 0.21
147 0.23
148 0.25
149 0.29
150 0.33
151 0.39
152 0.4
153 0.49
154 0.57
155 0.64
156 0.73
157 0.79
158 0.85
159 0.88
160 0.88
161 0.87
162 0.88
163 0.88
164 0.88