FuNGI

A0A017SS90

Protein Details

Accession

A0A017SS90

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

14.5

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
357-381	TEADYKRKLKQKRQEKKDARRGDGG	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
362-392	KRKLKQKRQEKKDARRGDGGPARGRRGPPGP
443-468	GFRGGRGRGRGSDRGRGGRGRGGPRG

Subcellular Location(s)

nucl 19, cyto_nucl 15.5, cyto 8

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR038664 Gar1/Naf1_Cbf5-bd_sf IPR007504 H/ACA_rnp_Gar1/Naf1 IPR040309 Naf1 IPR009000 Transl_B-barrel_sf
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0005732 C:sno(s)RNA-containing ribonucleoprotein complex GO:0003723 F:RNA binding GO:0000493 P:box H/ACA snoRNP assembly GO:0001522 P:pseudouridine synthesis GO:0042254 P:ribosome biogenesis
Pfam	View protein in Pfam PF04410 Gar1

Amino Acid Sequences

MNETPPVAVTPGEDGSDFYNTPFNAGTPLSKDVNKEDVAKVSTAAEPTASQPAPLIPGLNLVNDNLHDLQSNSESIPAQTTEDTDMTEGNEVANAKSEPQHAVDQKDAQQKQEGATNELPDANSSIKTTANAAEAAPATEAAQNEEDEHPEWEVDSSPYESSSDDTTDSSDDDSDEDEDYPILSAEEQARILMQAELGSDDEGDGKGKSGGHIKTANEILEDAPPIPDVTVTPDMKVVHLGHVQTIVENNVLIEANVSGEYQVLEGGSLLCDEQRKIVGVVCETLGRVENPLYTVRYESIAAMEERGISKGQSIFYVEQHSSFVFTQPLKGMKGSDASNFHDEEIAEDEVEFSDDETEADYKRKLKQKRQEKKDARRGDGGPARGRRGPPGPSRLNQTELNYDDDAGEDGYTPLARPKNLHEIMGQGEAPVEGDGPSATRGSGFRGGRGRGRGSDRGRGGRGRGGPRGQGSYHDRRPYPHDSQAQSQPQQQPQPQPQHPYTQTPYQQNQPPAFGIPQQQPPFNFPQQQQQQQQPYPQAQSPIPFQFQMPYLQGIQQQANPYQQMPPNPQFNPQLVLAALHQQQAQRQLYQQQYLQQQPQVQQAPAQAQGSVGQPPAINFDQVRAQLNLLQQWGNGNQGQGSSRPPQ

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.14
2	0.15
3	0.18
4	0.18
5	0.15
6	0.19
7	0.18
8	0.2
9	0.19
10	0.17
11	0.17
12	0.18
13	0.2
14	0.19
15	0.24
16	0.25
17	0.27
18	0.3
19	0.31
20	0.36
21	0.36
22	0.36
23	0.34
24	0.36
25	0.36
26	0.33
27	0.3
28	0.26
29	0.26
30	0.22
31	0.2
32	0.15
33	0.14
34	0.16
35	0.23
36	0.2
37	0.18
38	0.18
39	0.18
40	0.2
41	0.2
42	0.19
43	0.11
44	0.16
45	0.17
46	0.18
47	0.17
48	0.15
49	0.16
50	0.15
51	0.19
52	0.15
53	0.15
54	0.14
55	0.14
56	0.16
57	0.17
58	0.18
59	0.14
60	0.15
61	0.15
62	0.15
63	0.17
64	0.15
65	0.15
66	0.14
67	0.16
68	0.17
69	0.17
70	0.17
71	0.14
72	0.14
73	0.13
74	0.14
75	0.12
76	0.09
77	0.1
78	0.1
79	0.1
80	0.13
81	0.12
82	0.13
83	0.16
84	0.18
85	0.18
86	0.21
87	0.29
88	0.29
89	0.32
90	0.35
91	0.36
92	0.42
93	0.49
94	0.47
95	0.42
96	0.43
97	0.41
98	0.39
99	0.4
100	0.34
101	0.31
102	0.32
103	0.31
104	0.27
105	0.26
106	0.25
107	0.2
108	0.2
109	0.15
110	0.14
111	0.13
112	0.13
113	0.13
114	0.13
115	0.15
116	0.15
117	0.15
118	0.14
119	0.13
120	0.15
121	0.14
122	0.14
123	0.12
124	0.1
125	0.1
126	0.11
127	0.11
128	0.11
129	0.12
130	0.12
131	0.14
132	0.15
133	0.16
134	0.15
135	0.16
136	0.13
137	0.12
138	0.12
139	0.1
140	0.11
141	0.1
142	0.1
143	0.11
144	0.11
145	0.12
146	0.12
147	0.12
148	0.12
149	0.13
150	0.12
151	0.11
152	0.11
153	0.12
154	0.12
155	0.12
156	0.11
157	0.1
158	0.09
159	0.08
160	0.09
161	0.09
162	0.09
163	0.09
164	0.09
165	0.08
166	0.08
167	0.08
168	0.07
169	0.06
170	0.05
171	0.06
172	0.08
173	0.09
174	0.09
175	0.09
176	0.09
177	0.09
178	0.1
179	0.08
180	0.07
181	0.06
182	0.06
183	0.07
184	0.07
185	0.07
186	0.06
187	0.05
188	0.06
189	0.06
190	0.07
191	0.06
192	0.06
193	0.08
194	0.08
195	0.09
196	0.15
197	0.16
198	0.2
199	0.24
200	0.24
201	0.26
202	0.28
203	0.26
204	0.2
205	0.2
206	0.16
207	0.13
208	0.13
209	0.1
210	0.08
211	0.08
212	0.08
213	0.07
214	0.06
215	0.05
216	0.1
217	0.16
218	0.16
219	0.16
220	0.19
221	0.19
222	0.19
223	0.22
224	0.17
225	0.14
226	0.16
227	0.16
228	0.14
229	0.15
230	0.15
231	0.12
232	0.12
233	0.09
234	0.07
235	0.07
236	0.06
237	0.06
238	0.06
239	0.05
240	0.05
241	0.04
242	0.05
243	0.05
244	0.05
245	0.04
246	0.04
247	0.05
248	0.04
249	0.04
250	0.04
251	0.03
252	0.03
253	0.04
254	0.03
255	0.03
256	0.03
257	0.04
258	0.05
259	0.06
260	0.07
261	0.07
262	0.08
263	0.08
264	0.1
265	0.11
266	0.1
267	0.11
268	0.1
269	0.1
270	0.09
271	0.09
272	0.08
273	0.07
274	0.07
275	0.07
276	0.07
277	0.08
278	0.1
279	0.1
280	0.1
281	0.11
282	0.1
283	0.11
284	0.11
285	0.1
286	0.09
287	0.09
288	0.09
289	0.08
290	0.08
291	0.07
292	0.07
293	0.08
294	0.07
295	0.06
296	0.08
297	0.09
298	0.09
299	0.09
300	0.11
301	0.12
302	0.13
303	0.16
304	0.15
305	0.13
306	0.14
307	0.13
308	0.13
309	0.12
310	0.11
311	0.11
312	0.11
313	0.11
314	0.13
315	0.15
316	0.13
317	0.13
318	0.13
319	0.11
320	0.14
321	0.14
322	0.15
323	0.16
324	0.18
325	0.2
326	0.2
327	0.19
328	0.17
329	0.16
330	0.13
331	0.14
332	0.11
333	0.09
334	0.08
335	0.08
336	0.07
337	0.08
338	0.07
339	0.04
340	0.04
341	0.04
342	0.04
343	0.05
344	0.06
345	0.06
346	0.08
347	0.1
348	0.12
349	0.19
350	0.27
351	0.34
352	0.43
353	0.53
354	0.63
355	0.72
356	0.78
357	0.83
358	0.86
359	0.89
360	0.9
361	0.88
362	0.8
363	0.76
364	0.68
365	0.65
366	0.59
367	0.53
368	0.49
369	0.44
370	0.43
371	0.4
372	0.39
373	0.35
374	0.34
375	0.36
376	0.36
377	0.41
378	0.43
379	0.42
380	0.48
381	0.47
382	0.46
383	0.42
384	0.38
385	0.34
386	0.31
387	0.33
388	0.26
389	0.24
390	0.2
391	0.17
392	0.15
393	0.1
394	0.09
395	0.05
396	0.05
397	0.05
398	0.05
399	0.05
400	0.09
401	0.11
402	0.12
403	0.14
404	0.18
405	0.28
406	0.29
407	0.3
408	0.26
409	0.26
410	0.27
411	0.28
412	0.23
413	0.13
414	0.12
415	0.1
416	0.1
417	0.08
418	0.06
419	0.04
420	0.04
421	0.04
422	0.05
423	0.06
424	0.06
425	0.06
426	0.06
427	0.07
428	0.1
429	0.18
430	0.18
431	0.22
432	0.27
433	0.3
434	0.33
435	0.37
436	0.36
437	0.34
438	0.4
439	0.44
440	0.42
441	0.48
442	0.49
443	0.49
444	0.5
445	0.48
446	0.44
447	0.42
448	0.45
449	0.42
450	0.43
451	0.41
452	0.41
453	0.41
454	0.42
455	0.36
456	0.35
457	0.38
458	0.41
459	0.46
460	0.48
461	0.47
462	0.46
463	0.53
464	0.54
465	0.53
466	0.52
467	0.52
468	0.5
469	0.55
470	0.61
471	0.62
472	0.56
473	0.57
474	0.55
475	0.54
476	0.57
477	0.56
478	0.56
479	0.57
480	0.65
481	0.62
482	0.63
483	0.59
484	0.62
485	0.6
486	0.58
487	0.54
488	0.53
489	0.54
490	0.55
491	0.56
492	0.55
493	0.58
494	0.58
495	0.55
496	0.49
497	0.44
498	0.38
499	0.36
500	0.31
501	0.3
502	0.28
503	0.36
504	0.36
505	0.38
506	0.37
507	0.41
508	0.45
509	0.45
510	0.46
511	0.38
512	0.46
513	0.52
514	0.59
515	0.6
516	0.62
517	0.65
518	0.62
519	0.67
520	0.62
521	0.59
522	0.54
523	0.5
524	0.46
525	0.39
526	0.38
527	0.38
528	0.37
529	0.34
530	0.3
531	0.28
532	0.27
533	0.27
534	0.28
535	0.23
536	0.21
537	0.2
538	0.22
539	0.25
540	0.26
541	0.26
542	0.26
543	0.28
544	0.28
545	0.31
546	0.3
547	0.28
548	0.3
549	0.32
550	0.35
551	0.39
552	0.43
553	0.47
554	0.46
555	0.51
556	0.5
557	0.48
558	0.45
559	0.37
560	0.32
561	0.24
562	0.24
563	0.19
564	0.21
565	0.21
566	0.2
567	0.21
568	0.21
569	0.24
570	0.32
571	0.34
572	0.3
573	0.32
574	0.38
575	0.41
576	0.45
577	0.44
578	0.42
579	0.47
580	0.52
581	0.53
582	0.49
583	0.48
584	0.47
585	0.53
586	0.51
587	0.44
588	0.4
589	0.39
590	0.38
591	0.37
592	0.34
593	0.25
594	0.21
595	0.23
596	0.22
597	0.2
598	0.17
599	0.15
600	0.15
601	0.15
602	0.21
603	0.2
604	0.21
605	0.19
606	0.21
607	0.25
608	0.27
609	0.31
610	0.25
611	0.26
612	0.27
613	0.3
614	0.31
615	0.28
616	0.26
617	0.23
618	0.26
619	0.25
620	0.26
621	0.24
622	0.21
623	0.19
624	0.21
625	0.22
626	0.2

A0A017SS90

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer