Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q5AXR1

Protein Details
Accession Q5AXR1    Localization Confidence High Confidence Score 16.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
10-36DEILVNRQPRNRRRTARRKAANAAAPVHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
18-37PRNRRRTARRKAANAAAPVG
41-41K
44-46KGA
166-200KPATNAKNANAARSGRGGRGRGRGGKARGNRPKPK
Subcellular Location(s) nucl 12, cyto 9, mito 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR025715  FoP_C  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003729  F:mRNA binding  
KEGG ani:AN6919.2  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF13865  FoP_duplication  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
Amino Acid Sequences MSTKLDKSLDEILVNRQPRNRRRTARRKAANAAAPVGGVQKITKGAKPAGKAVQNGHPAPTESKIMVSGLPADVNEANIKEYFSKSAGPVKRVMLTYNQNGTSRGIASIVFREPDTAAKAAKELNGLLVDGRPMKIEVVVDASHAPTVPAPKPLSDRVAQSKPQPKPATNAKNANAARSGRGGRGRGRGGKARGNRPKPKTAEELDAEMVDYFNASNENGASAEVNAAAGSAPQQPAAGEDLGMAEISVIPKKPSATWWHSEYRVDFARGQDTLFVAALQVNASFKYGVGLCVNGVFKDLNDLHIASARRATVTYPSAAQDCLCYLTDVMEEAPLSQPNSSPYMDAVGRCLFPPHFHLRVSHPNQNSSQVQVEDTMEKNQDGRAKDKNHHTGKDTEQFCCNDKFEVEDEGDEDEPAAQDAKTQFTHAITLVIASSYTLTVPWPSRVLLLPLKGGKSMF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.42
2 0.42
3 0.42
4 0.5
5 0.57
6 0.64
7 0.68
8 0.71
9 0.79
10 0.86
11 0.9
12 0.91
13 0.92
14 0.91
15 0.89
16 0.87
17 0.83
18 0.75
19 0.66
20 0.55
21 0.45
22 0.37
23 0.3
24 0.21
25 0.15
26 0.11
27 0.11
28 0.17
29 0.19
30 0.21
31 0.24
32 0.31
33 0.35
34 0.38
35 0.43
36 0.44
37 0.47
38 0.48
39 0.48
40 0.49
41 0.51
42 0.49
43 0.45
44 0.39
45 0.36
46 0.35
47 0.34
48 0.28
49 0.21
50 0.21
51 0.19
52 0.18
53 0.16
54 0.15
55 0.14
56 0.12
57 0.12
58 0.11
59 0.12
60 0.12
61 0.13
62 0.14
63 0.12
64 0.13
65 0.13
66 0.14
67 0.13
68 0.15
69 0.16
70 0.15
71 0.17
72 0.18
73 0.27
74 0.31
75 0.31
76 0.34
77 0.34
78 0.37
79 0.36
80 0.35
81 0.33
82 0.35
83 0.38
84 0.4
85 0.41
86 0.37
87 0.38
88 0.37
89 0.32
90 0.26
91 0.2
92 0.15
93 0.12
94 0.13
95 0.15
96 0.15
97 0.14
98 0.13
99 0.14
100 0.14
101 0.16
102 0.17
103 0.16
104 0.15
105 0.14
106 0.16
107 0.16
108 0.16
109 0.15
110 0.12
111 0.13
112 0.12
113 0.12
114 0.11
115 0.1
116 0.11
117 0.1
118 0.1
119 0.09
120 0.09
121 0.09
122 0.1
123 0.1
124 0.08
125 0.11
126 0.1
127 0.11
128 0.11
129 0.11
130 0.1
131 0.1
132 0.09
133 0.07
134 0.12
135 0.12
136 0.17
137 0.18
138 0.2
139 0.24
140 0.27
141 0.29
142 0.27
143 0.3
144 0.32
145 0.37
146 0.37
147 0.41
148 0.48
149 0.46
150 0.54
151 0.53
152 0.47
153 0.49
154 0.57
155 0.58
156 0.56
157 0.61
158 0.53
159 0.58
160 0.57
161 0.52
162 0.46
163 0.37
164 0.31
165 0.28
166 0.28
167 0.22
168 0.26
169 0.27
170 0.28
171 0.33
172 0.36
173 0.37
174 0.4
175 0.43
176 0.43
177 0.47
178 0.49
179 0.53
180 0.59
181 0.63
182 0.68
183 0.67
184 0.72
185 0.69
186 0.66
187 0.62
188 0.55
189 0.51
190 0.43
191 0.4
192 0.32
193 0.28
194 0.23
195 0.17
196 0.14
197 0.08
198 0.06
199 0.04
200 0.03
201 0.04
202 0.04
203 0.04
204 0.04
205 0.04
206 0.05
207 0.05
208 0.05
209 0.04
210 0.05
211 0.04
212 0.04
213 0.03
214 0.03
215 0.03
216 0.03
217 0.04
218 0.06
219 0.06
220 0.06
221 0.06
222 0.06
223 0.07
224 0.09
225 0.08
226 0.06
227 0.06
228 0.06
229 0.06
230 0.06
231 0.05
232 0.03
233 0.03
234 0.04
235 0.05
236 0.05
237 0.06
238 0.07
239 0.08
240 0.09
241 0.12
242 0.19
243 0.24
244 0.27
245 0.32
246 0.35
247 0.36
248 0.37
249 0.34
250 0.31
251 0.28
252 0.26
253 0.23
254 0.2
255 0.21
256 0.19
257 0.19
258 0.15
259 0.13
260 0.11
261 0.1
262 0.08
263 0.06
264 0.06
265 0.06
266 0.05
267 0.06
268 0.05
269 0.05
270 0.06
271 0.06
272 0.05
273 0.07
274 0.07
275 0.08
276 0.08
277 0.08
278 0.08
279 0.1
280 0.11
281 0.09
282 0.1
283 0.09
284 0.08
285 0.14
286 0.14
287 0.13
288 0.14
289 0.14
290 0.13
291 0.18
292 0.19
293 0.13
294 0.15
295 0.14
296 0.13
297 0.13
298 0.14
299 0.14
300 0.16
301 0.16
302 0.15
303 0.16
304 0.17
305 0.17
306 0.16
307 0.12
308 0.11
309 0.12
310 0.11
311 0.1
312 0.09
313 0.1
314 0.1
315 0.09
316 0.09
317 0.07
318 0.07
319 0.07
320 0.09
321 0.09
322 0.1
323 0.1
324 0.11
325 0.12
326 0.16
327 0.15
328 0.14
329 0.13
330 0.16
331 0.18
332 0.17
333 0.18
334 0.17
335 0.17
336 0.16
337 0.19
338 0.15
339 0.16
340 0.22
341 0.26
342 0.27
343 0.28
344 0.3
345 0.35
346 0.45
347 0.5
348 0.52
349 0.47
350 0.49
351 0.5
352 0.54
353 0.48
354 0.41
355 0.38
356 0.3
357 0.28
358 0.25
359 0.25
360 0.22
361 0.22
362 0.22
363 0.2
364 0.2
365 0.2
366 0.21
367 0.24
368 0.24
369 0.27
370 0.32
371 0.37
372 0.44
373 0.54
374 0.61
375 0.64
376 0.65
377 0.65
378 0.62
379 0.64
380 0.66
381 0.59
382 0.51
383 0.48
384 0.46
385 0.45
386 0.43
387 0.37
388 0.3
389 0.28
390 0.28
391 0.25
392 0.26
393 0.24
394 0.2
395 0.19
396 0.2
397 0.2
398 0.16
399 0.15
400 0.11
401 0.1
402 0.1
403 0.1
404 0.07
405 0.11
406 0.13
407 0.17
408 0.17
409 0.19
410 0.2
411 0.2
412 0.23
413 0.19
414 0.19
415 0.14
416 0.14
417 0.13
418 0.11
419 0.09
420 0.07
421 0.08
422 0.07
423 0.07
424 0.07
425 0.07
426 0.12
427 0.15
428 0.18
429 0.19
430 0.2
431 0.22
432 0.24
433 0.29
434 0.3
435 0.3
436 0.34
437 0.36
438 0.37