Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A017SEB3

Protein Details
Accession A0A017SEB3    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
147-173EEEAAKSKNSKKQNKRSKGKKSQEAEEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
139-167GGKKRKREEEEAAKSKNSKKQNKRSKGKK
Subcellular Location(s) nucl 21, cyto_nucl 13.5, cyto 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR010301  RRP1  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0030688  C:preribosome, small subunit precursor  
GO:0006364  P:rRNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF05997  Nop52  
Amino Acid Sequences MADVQRTPFVKDLASSDRKVRDKALDSLTLFLRSRTDLSLIDLLKLWKGLFFCFYHSDRPLTQQALARSLSYSLIPTLPRSTVHRFLRAFWITIGREFHAIDRLRLDKYMYLIRCYVGVAFEVFVKGKQKQPGQGMDDGGKKRKREEEEAAKSKNSKKQNKRSKGKKSQEAEEEQQSNGVSDGTTNDTQTSTTTTDSDAAKWTDLKSYLSIISEGPLNPLNFDPDQDTSINEKTDYVPMPHGPDGLRYHLLDLWLDELEKVLEFEQEDSKEGEEEKPRKVVSEVPMDLILGPIETLRVKGLHKPVRTRAGEALEDERLYEWGFKERKVVVDEDEESEEEWGGFD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.36
2 0.36
3 0.4
4 0.47
5 0.5
6 0.51
7 0.51
8 0.5
9 0.5
10 0.54
11 0.53
12 0.51
13 0.48
14 0.49
15 0.45
16 0.42
17 0.36
18 0.3
19 0.26
20 0.22
21 0.23
22 0.21
23 0.22
24 0.17
25 0.22
26 0.27
27 0.25
28 0.24
29 0.24
30 0.23
31 0.21
32 0.21
33 0.17
34 0.13
35 0.14
36 0.14
37 0.16
38 0.16
39 0.2
40 0.24
41 0.27
42 0.3
43 0.32
44 0.35
45 0.31
46 0.36
47 0.38
48 0.34
49 0.35
50 0.33
51 0.33
52 0.34
53 0.33
54 0.28
55 0.23
56 0.22
57 0.19
58 0.15
59 0.14
60 0.11
61 0.12
62 0.13
63 0.14
64 0.16
65 0.16
66 0.18
67 0.23
68 0.28
69 0.35
70 0.38
71 0.44
72 0.42
73 0.43
74 0.51
75 0.47
76 0.41
77 0.33
78 0.35
79 0.28
80 0.3
81 0.3
82 0.22
83 0.22
84 0.21
85 0.21
86 0.22
87 0.22
88 0.2
89 0.22
90 0.23
91 0.23
92 0.23
93 0.23
94 0.17
95 0.19
96 0.25
97 0.22
98 0.22
99 0.22
100 0.21
101 0.2
102 0.19
103 0.16
104 0.1
105 0.09
106 0.07
107 0.07
108 0.07
109 0.07
110 0.07
111 0.08
112 0.11
113 0.13
114 0.18
115 0.24
116 0.27
117 0.32
118 0.37
119 0.42
120 0.42
121 0.42
122 0.39
123 0.36
124 0.39
125 0.35
126 0.38
127 0.35
128 0.33
129 0.34
130 0.4
131 0.42
132 0.42
133 0.49
134 0.52
135 0.58
136 0.64
137 0.62
138 0.56
139 0.55
140 0.54
141 0.52
142 0.51
143 0.51
144 0.55
145 0.64
146 0.74
147 0.81
148 0.86
149 0.89
150 0.91
151 0.91
152 0.9
153 0.88
154 0.81
155 0.76
156 0.72
157 0.67
158 0.59
159 0.53
160 0.45
161 0.35
162 0.32
163 0.26
164 0.19
165 0.14
166 0.11
167 0.06
168 0.05
169 0.06
170 0.09
171 0.09
172 0.09
173 0.09
174 0.1
175 0.1
176 0.1
177 0.12
178 0.09
179 0.1
180 0.1
181 0.1
182 0.13
183 0.13
184 0.13
185 0.13
186 0.13
187 0.13
188 0.13
189 0.13
190 0.13
191 0.14
192 0.14
193 0.12
194 0.13
195 0.13
196 0.13
197 0.13
198 0.11
199 0.1
200 0.11
201 0.1
202 0.1
203 0.13
204 0.12
205 0.12
206 0.13
207 0.16
208 0.14
209 0.15
210 0.15
211 0.13
212 0.16
213 0.15
214 0.17
215 0.17
216 0.19
217 0.19
218 0.16
219 0.16
220 0.15
221 0.19
222 0.18
223 0.16
224 0.17
225 0.18
226 0.22
227 0.21
228 0.22
229 0.18
230 0.22
231 0.22
232 0.24
233 0.25
234 0.21
235 0.22
236 0.21
237 0.22
238 0.17
239 0.15
240 0.12
241 0.1
242 0.1
243 0.08
244 0.08
245 0.07
246 0.07
247 0.07
248 0.06
249 0.07
250 0.07
251 0.1
252 0.13
253 0.14
254 0.15
255 0.16
256 0.16
257 0.16
258 0.17
259 0.2
260 0.25
261 0.28
262 0.3
263 0.34
264 0.34
265 0.34
266 0.35
267 0.36
268 0.32
269 0.38
270 0.36
271 0.33
272 0.33
273 0.31
274 0.3
275 0.23
276 0.18
277 0.08
278 0.07
279 0.05
280 0.06
281 0.06
282 0.07
283 0.08
284 0.1
285 0.12
286 0.19
287 0.3
288 0.37
289 0.43
290 0.51
291 0.57
292 0.65
293 0.66
294 0.63
295 0.59
296 0.56
297 0.52
298 0.47
299 0.43
300 0.35
301 0.32
302 0.29
303 0.23
304 0.19
305 0.18
306 0.17
307 0.15
308 0.21
309 0.24
310 0.24
311 0.3
312 0.31
313 0.35
314 0.36
315 0.37
316 0.32
317 0.36
318 0.38
319 0.35
320 0.35
321 0.3
322 0.27
323 0.25
324 0.22