Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A017SB40

Protein Details
Accession A0A017SB40    Localization Confidence High Confidence Score 22.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
74-95EKRSRKDEEPGRFNRKRRRLAGBasic
262-285KAEGREQSRRHRRGRSPSRGSISEBasic
302-370DGKDQEKSSYRYHRRHRHRRRHDRSRDRSRRHHSHSHSHSHSHLHSRSRSRSRHHRQDHHENRNDDRRSBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
74-92EKRSRKDEEPGRFNRKRRR
259-280EALKAEGREQSRRHRRGRSPSR
312-374RYHRRHRHRRRHDRSRDRSRRHHSHSHSHSHSHLHSRSRSRSRHHRQDHHENRNDDRRSSRRP
Subcellular Location(s) nucl 20.5, cyto_nucl 12, mito 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR019339  CIR_N_dom  
IPR039875  LENG1-like  
Gene Ontology GO:0005681  C:spliceosomal complex  
GO:0008380  P:RNA splicing  
Pfam View protein in Pfam  
PF10197  Cir_N  
Amino Acid Sequences MPLHLLGKKSWNVYNPENVARVRRDEAQAKAREEEEERRMQEIDAERRLQILRGERPSTPPPPPASQPSAGQHEKRSRKDEEPGRFNRKRRRLAGEDDTDRDIRLAMEDAQLAGGKRAELTRLKTSDAPLEDGTGHINLFPSETGRAPVEKNAEAETEATEKKRRYEEQYTMRPSNAAGFSQSVGKAPWYSSSGREAPAPESMPGKDVWGNEDPMWKQREMTRMDANDPLAAMRKGVKQLRMVEQERNRWNEERRRELEALKAEGREQSRRHRRGRSPSRGSISENSLEGFKLNAPPDRQRDGKDQEKSSYRYHRRHRHRRRHDRSRDRSRRHHSHSHSHSHSHLHSRSRSRSRHHRQDHHENRNDDRRSSRRP
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.53
2 0.51
3 0.51
4 0.51
5 0.49
6 0.49
7 0.46
8 0.46
9 0.41
10 0.41
11 0.44
12 0.45
13 0.51
14 0.54
15 0.57
16 0.55
17 0.54
18 0.49
19 0.46
20 0.45
21 0.45
22 0.42
23 0.43
24 0.41
25 0.41
26 0.4
27 0.37
28 0.38
29 0.39
30 0.4
31 0.38
32 0.39
33 0.36
34 0.39
35 0.39
36 0.35
37 0.32
38 0.32
39 0.34
40 0.4
41 0.43
42 0.41
43 0.47
44 0.51
45 0.52
46 0.48
47 0.46
48 0.44
49 0.46
50 0.5
51 0.51
52 0.5
53 0.47
54 0.47
55 0.46
56 0.49
57 0.49
58 0.47
59 0.49
60 0.53
61 0.59
62 0.61
63 0.62
64 0.6
65 0.6
66 0.67
67 0.67
68 0.67
69 0.68
70 0.71
71 0.75
72 0.76
73 0.8
74 0.81
75 0.82
76 0.81
77 0.78
78 0.78
79 0.74
80 0.75
81 0.76
82 0.74
83 0.68
84 0.62
85 0.58
86 0.49
87 0.42
88 0.34
89 0.25
90 0.16
91 0.12
92 0.11
93 0.09
94 0.1
95 0.1
96 0.1
97 0.1
98 0.11
99 0.1
100 0.09
101 0.08
102 0.07
103 0.08
104 0.08
105 0.12
106 0.15
107 0.2
108 0.26
109 0.27
110 0.3
111 0.31
112 0.32
113 0.33
114 0.3
115 0.28
116 0.21
117 0.21
118 0.19
119 0.17
120 0.16
121 0.11
122 0.1
123 0.07
124 0.07
125 0.06
126 0.07
127 0.06
128 0.06
129 0.08
130 0.08
131 0.09
132 0.1
133 0.12
134 0.12
135 0.15
136 0.18
137 0.17
138 0.18
139 0.17
140 0.17
141 0.16
142 0.16
143 0.13
144 0.13
145 0.13
146 0.14
147 0.17
148 0.18
149 0.21
150 0.26
151 0.29
152 0.33
153 0.4
154 0.47
155 0.51
156 0.59
157 0.62
158 0.58
159 0.54
160 0.46
161 0.39
162 0.34
163 0.26
164 0.17
165 0.12
166 0.11
167 0.11
168 0.13
169 0.13
170 0.09
171 0.08
172 0.09
173 0.08
174 0.08
175 0.09
176 0.1
177 0.11
178 0.12
179 0.16
180 0.17
181 0.17
182 0.18
183 0.18
184 0.17
185 0.18
186 0.17
187 0.14
188 0.14
189 0.13
190 0.13
191 0.12
192 0.12
193 0.12
194 0.12
195 0.15
196 0.15
197 0.17
198 0.16
199 0.2
200 0.19
201 0.22
202 0.25
203 0.21
204 0.2
205 0.22
206 0.29
207 0.28
208 0.32
209 0.33
210 0.32
211 0.34
212 0.35
213 0.32
214 0.25
215 0.21
216 0.17
217 0.14
218 0.12
219 0.1
220 0.11
221 0.13
222 0.19
223 0.23
224 0.26
225 0.28
226 0.33
227 0.4
228 0.46
229 0.46
230 0.48
231 0.5
232 0.55
233 0.56
234 0.56
235 0.52
236 0.49
237 0.54
238 0.55
239 0.57
240 0.58
241 0.56
242 0.58
243 0.57
244 0.54
245 0.52
246 0.47
247 0.44
248 0.36
249 0.33
250 0.28
251 0.3
252 0.31
253 0.31
254 0.31
255 0.38
256 0.46
257 0.55
258 0.62
259 0.67
260 0.73
261 0.78
262 0.85
263 0.85
264 0.83
265 0.82
266 0.81
267 0.74
268 0.69
269 0.62
270 0.56
271 0.47
272 0.38
273 0.3
274 0.25
275 0.22
276 0.17
277 0.14
278 0.11
279 0.14
280 0.16
281 0.21
282 0.24
283 0.32
284 0.38
285 0.43
286 0.45
287 0.44
288 0.51
289 0.54
290 0.58
291 0.59
292 0.57
293 0.58
294 0.62
295 0.62
296 0.61
297 0.64
298 0.65
299 0.66
300 0.73
301 0.77
302 0.81
303 0.88
304 0.92
305 0.92
306 0.94
307 0.96
308 0.96
309 0.97
310 0.97
311 0.97
312 0.96
313 0.97
314 0.96
315 0.94
316 0.94
317 0.93
318 0.92
319 0.89
320 0.89
321 0.85
322 0.85
323 0.84
324 0.84
325 0.78
326 0.72
327 0.67
328 0.63
329 0.6
330 0.59
331 0.56
332 0.54
333 0.57
334 0.62
335 0.7
336 0.73
337 0.76
338 0.76
339 0.81
340 0.84
341 0.87
342 0.88
343 0.88
344 0.88
345 0.92
346 0.93
347 0.93
348 0.91
349 0.84
350 0.82
351 0.82
352 0.76
353 0.7
354 0.69