Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A017SHI0

Protein Details
Accession A0A017SHI0    Localization Confidence Low Confidence Score 9.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
878-898QLEREKRQQEREARRKEKENABasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
864-895RRGHKPQGQKARREQLEREKRQQEREARRKEK
Subcellular Location(s) cyto 14, cyto_nucl 11.333, cyto_mito 8.833, nucl 7.5, mito 2.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR016024  ARM-type_fold  
IPR019451  Rtp1_C1  
IPR019414  Rtp1_C2  
IPR039600  TANGO6/Rtp1  
Pfam View protein in Pfam  
PF10363  RTP1_C1  
PF10304  RTP1_C2  
Amino Acid Sequences MGDPIGTKEAFAAANGFLKPVLQREEIQKSRGNSLLDILNSNLPEPALDDAVRNTVIGVALDILSRIHVAFTGEEEQSQVIPETEDVALEDAKRRRILHALLDLISLEGIYPSLSTGVGIPLQQRVITVLPAGVIAKQSDAPTSGKPHDELLLDRMLLTLSDITLDTRPSIQPVVRGRILSDIISGSLDLAFNSKSISAERRDYHQNAASRIIGDTPSSVLLPTLSAFLQSETAPWFKAKISSYISRIPLRHEGVLQTILFVTSQFAPSLGREAQNQASNGPHFTVQAIMHVSRLLSSVPQDMNPVAYFSAIAPQLLSLLDGDDPDLKKTASYVVGSGILGKRAYGAPGTIGHTIFVEPLFKTLTAELDALTRQRMTISGGSGGDYSKQALVDGSMLHLAVDRLKTLTLQHPNPGLVKRLVYPILVPLWGLASFAMEQQQATLNEKVMALLQTYFGVSVGVQPLKKLVDHLLWNGGPMWTYGVDAKGQISLKKSDSSHTDQFNVIQLMDSLQARTEMFVKLLGSDPSSEERTGDIFLYVSETWLVKDSSAQRPLDQLQLSSEKDESEVILQKLVSAKLAEKLLDNFKDTLSRRPLRVLELIKQIIDSESGRVSIRTKTKNASLASLTNIVKKDDEEKPESSSENDSNESLSTAFSLLSTVLASPEFAVSNETRPVLEIIKTQLDLLVPHLPSPLTKPSTTASMLLDIHLASPGHIRTNQASKNVSDLGIHRQALTNLTSDLPPVQAEGFSLLSDLIKKSSPVLDIPSTLTLLLSIIGNESESVANEEFIYLNAIKLIGTLASRHPRTIIKTLVDRYTDNSETATLDQRLKIGESILRTVQDLGEALTGETGKILGEAIISVAGRRGHKPQGQKARREQLEREKRQQEREARRKEKENAMPPGWNVTSASITEELGKHLQEHEDEDEDTESPEQNAHAANIISAWAAGSQSDEEPEDLRVRASALSILASAVQINFAGLGPEIASSAVDLALATLTLEPDAEFAILRRASVVLLLDILKALDTARETRGSTGLGFGFSLSEDPFRGANNPGKGSIGNLPRMLRTLHFVEGHETDSIVRGHIRVLIESFEAWTDKSLLWGIGARGRDEEQNEPRFELGDRIAGLSVDPLAGRSARPRIEEIE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.16
2 0.16
3 0.16
4 0.13
5 0.15
6 0.16
7 0.2
8 0.24
9 0.23
10 0.27
11 0.35
12 0.45
13 0.48
14 0.51
15 0.51
16 0.48
17 0.51
18 0.52
19 0.45
20 0.35
21 0.35
22 0.35
23 0.31
24 0.3
25 0.26
26 0.25
27 0.23
28 0.23
29 0.2
30 0.15
31 0.13
32 0.13
33 0.13
34 0.13
35 0.13
36 0.14
37 0.15
38 0.18
39 0.18
40 0.16
41 0.14
42 0.12
43 0.12
44 0.11
45 0.1
46 0.08
47 0.08
48 0.08
49 0.08
50 0.07
51 0.07
52 0.08
53 0.07
54 0.06
55 0.07
56 0.08
57 0.09
58 0.12
59 0.16
60 0.16
61 0.16
62 0.17
63 0.17
64 0.15
65 0.16
66 0.13
67 0.09
68 0.1
69 0.1
70 0.12
71 0.11
72 0.11
73 0.1
74 0.11
75 0.12
76 0.12
77 0.19
78 0.21
79 0.26
80 0.31
81 0.32
82 0.33
83 0.39
84 0.43
85 0.43
86 0.46
87 0.44
88 0.4
89 0.39
90 0.36
91 0.29
92 0.24
93 0.16
94 0.08
95 0.05
96 0.04
97 0.04
98 0.04
99 0.04
100 0.05
101 0.05
102 0.05
103 0.06
104 0.08
105 0.09
106 0.11
107 0.12
108 0.14
109 0.15
110 0.15
111 0.14
112 0.15
113 0.15
114 0.14
115 0.13
116 0.11
117 0.1
118 0.11
119 0.11
120 0.09
121 0.09
122 0.09
123 0.1
124 0.12
125 0.12
126 0.13
127 0.15
128 0.17
129 0.19
130 0.25
131 0.27
132 0.28
133 0.28
134 0.29
135 0.29
136 0.29
137 0.27
138 0.24
139 0.23
140 0.2
141 0.19
142 0.18
143 0.14
144 0.12
145 0.12
146 0.08
147 0.06
148 0.07
149 0.07
150 0.09
151 0.1
152 0.11
153 0.11
154 0.13
155 0.14
156 0.15
157 0.19
158 0.18
159 0.24
160 0.3
161 0.36
162 0.36
163 0.35
164 0.34
165 0.35
166 0.35
167 0.28
168 0.23
169 0.16
170 0.14
171 0.14
172 0.13
173 0.09
174 0.08
175 0.08
176 0.06
177 0.08
178 0.07
179 0.07
180 0.08
181 0.08
182 0.09
183 0.12
184 0.17
185 0.2
186 0.27
187 0.29
188 0.33
189 0.41
190 0.43
191 0.46
192 0.47
193 0.47
194 0.42
195 0.43
196 0.4
197 0.32
198 0.3
199 0.25
200 0.19
201 0.16
202 0.14
203 0.11
204 0.11
205 0.1
206 0.1
207 0.08
208 0.08
209 0.08
210 0.07
211 0.08
212 0.07
213 0.08
214 0.08
215 0.08
216 0.1
217 0.09
218 0.1
219 0.11
220 0.13
221 0.13
222 0.13
223 0.14
224 0.13
225 0.19
226 0.19
227 0.22
228 0.27
229 0.31
230 0.35
231 0.41
232 0.45
233 0.45
234 0.44
235 0.43
236 0.45
237 0.43
238 0.4
239 0.35
240 0.31
241 0.29
242 0.31
243 0.25
244 0.18
245 0.15
246 0.14
247 0.12
248 0.11
249 0.1
250 0.08
251 0.09
252 0.08
253 0.09
254 0.09
255 0.1
256 0.14
257 0.14
258 0.15
259 0.15
260 0.19
261 0.23
262 0.26
263 0.26
264 0.23
265 0.25
266 0.24
267 0.24
268 0.21
269 0.17
270 0.14
271 0.14
272 0.16
273 0.12
274 0.14
275 0.15
276 0.14
277 0.14
278 0.14
279 0.14
280 0.11
281 0.11
282 0.09
283 0.07
284 0.09
285 0.13
286 0.13
287 0.14
288 0.15
289 0.15
290 0.16
291 0.16
292 0.15
293 0.1
294 0.09
295 0.09
296 0.08
297 0.12
298 0.1
299 0.1
300 0.09
301 0.08
302 0.09
303 0.09
304 0.09
305 0.04
306 0.05
307 0.05
308 0.05
309 0.06
310 0.1
311 0.11
312 0.12
313 0.13
314 0.12
315 0.12
316 0.12
317 0.14
318 0.13
319 0.13
320 0.12
321 0.12
322 0.13
323 0.13
324 0.16
325 0.13
326 0.13
327 0.12
328 0.11
329 0.12
330 0.11
331 0.12
332 0.09
333 0.09
334 0.09
335 0.11
336 0.14
337 0.14
338 0.14
339 0.13
340 0.13
341 0.13
342 0.12
343 0.1
344 0.09
345 0.07
346 0.08
347 0.09
348 0.09
349 0.09
350 0.09
351 0.1
352 0.1
353 0.1
354 0.1
355 0.1
356 0.1
357 0.1
358 0.11
359 0.1
360 0.08
361 0.08
362 0.08
363 0.11
364 0.12
365 0.12
366 0.13
367 0.13
368 0.14
369 0.14
370 0.14
371 0.12
372 0.1
373 0.1
374 0.08
375 0.08
376 0.07
377 0.07
378 0.07
379 0.07
380 0.07
381 0.07
382 0.06
383 0.06
384 0.06
385 0.06
386 0.06
387 0.07
388 0.07
389 0.07
390 0.07
391 0.08
392 0.08
393 0.1
394 0.18
395 0.23
396 0.24
397 0.27
398 0.28
399 0.3
400 0.32
401 0.31
402 0.27
403 0.21
404 0.21
405 0.19
406 0.2
407 0.2
408 0.17
409 0.16
410 0.14
411 0.14
412 0.13
413 0.11
414 0.08
415 0.08
416 0.08
417 0.08
418 0.05
419 0.05
420 0.05
421 0.06
422 0.08
423 0.07
424 0.07
425 0.07
426 0.11
427 0.11
428 0.15
429 0.15
430 0.14
431 0.15
432 0.15
433 0.14
434 0.11
435 0.11
436 0.08
437 0.07
438 0.07
439 0.06
440 0.07
441 0.06
442 0.05
443 0.05
444 0.04
445 0.05
446 0.08
447 0.1
448 0.1
449 0.1
450 0.11
451 0.12
452 0.12
453 0.12
454 0.11
455 0.13
456 0.15
457 0.16
458 0.19
459 0.18
460 0.18
461 0.17
462 0.15
463 0.11
464 0.1
465 0.1
466 0.06
467 0.06
468 0.07
469 0.07
470 0.07
471 0.07
472 0.07
473 0.1
474 0.1
475 0.12
476 0.13
477 0.16
478 0.17
479 0.2
480 0.21
481 0.2
482 0.25
483 0.3
484 0.33
485 0.32
486 0.32
487 0.29
488 0.29
489 0.29
490 0.24
491 0.17
492 0.11
493 0.09
494 0.08
495 0.09
496 0.09
497 0.06
498 0.06
499 0.07
500 0.07
501 0.07
502 0.08
503 0.07
504 0.07
505 0.08
506 0.08
507 0.08
508 0.09
509 0.09
510 0.08
511 0.08
512 0.09
513 0.11
514 0.13
515 0.12
516 0.11
517 0.11
518 0.12
519 0.12
520 0.1
521 0.08
522 0.06
523 0.06
524 0.09
525 0.08
526 0.07
527 0.07
528 0.07
529 0.07
530 0.09
531 0.09
532 0.06
533 0.1
534 0.14
535 0.2
536 0.25
537 0.25
538 0.24
539 0.26
540 0.28
541 0.29
542 0.24
543 0.18
544 0.16
545 0.19
546 0.19
547 0.18
548 0.17
549 0.12
550 0.12
551 0.12
552 0.1
553 0.08
554 0.11
555 0.1
556 0.11
557 0.11
558 0.11
559 0.13
560 0.12
561 0.11
562 0.08
563 0.08
564 0.1
565 0.11
566 0.1
567 0.1
568 0.12
569 0.16
570 0.16
571 0.17
572 0.15
573 0.15
574 0.21
575 0.21
576 0.26
577 0.3
578 0.31
579 0.31
580 0.34
581 0.35
582 0.32
583 0.37
584 0.33
585 0.29
586 0.32
587 0.31
588 0.27
589 0.26
590 0.23
591 0.17
592 0.16
593 0.12
594 0.07
595 0.07
596 0.08
597 0.08
598 0.09
599 0.1
600 0.14
601 0.21
602 0.24
603 0.26
604 0.28
605 0.31
606 0.37
607 0.36
608 0.33
609 0.28
610 0.25
611 0.24
612 0.27
613 0.24
614 0.21
615 0.21
616 0.19
617 0.17
618 0.17
619 0.21
620 0.2
621 0.24
622 0.25
623 0.26
624 0.28
625 0.29
626 0.29
627 0.25
628 0.24
629 0.21
630 0.19
631 0.19
632 0.16
633 0.15
634 0.15
635 0.13
636 0.1
637 0.08
638 0.06
639 0.06
640 0.05
641 0.05
642 0.05
643 0.04
644 0.04
645 0.05
646 0.04
647 0.04
648 0.04
649 0.04
650 0.04
651 0.05
652 0.05
653 0.05
654 0.08
655 0.08
656 0.1
657 0.11
658 0.11
659 0.1
660 0.11
661 0.12
662 0.11
663 0.11
664 0.11
665 0.12
666 0.13
667 0.14
668 0.13
669 0.12
670 0.11
671 0.11
672 0.12
673 0.14
674 0.13
675 0.13
676 0.13
677 0.12
678 0.12
679 0.16
680 0.2
681 0.18
682 0.18
683 0.2
684 0.2
685 0.24
686 0.24
687 0.22
688 0.16
689 0.16
690 0.16
691 0.15
692 0.14
693 0.11
694 0.1
695 0.1
696 0.09
697 0.06
698 0.08
699 0.09
700 0.1
701 0.11
702 0.13
703 0.15
704 0.22
705 0.25
706 0.27
707 0.28
708 0.26
709 0.29
710 0.28
711 0.25
712 0.19
713 0.18
714 0.2
715 0.23
716 0.23
717 0.2
718 0.2
719 0.2
720 0.21
721 0.2
722 0.15
723 0.11
724 0.11
725 0.11
726 0.1
727 0.1
728 0.09
729 0.08
730 0.07
731 0.07
732 0.06
733 0.06
734 0.08
735 0.07
736 0.07
737 0.07
738 0.06
739 0.06
740 0.08
741 0.08
742 0.07
743 0.08
744 0.08
745 0.09
746 0.11
747 0.13
748 0.13
749 0.17
750 0.16
751 0.17
752 0.19
753 0.18
754 0.16
755 0.14
756 0.13
757 0.09
758 0.07
759 0.07
760 0.05
761 0.04
762 0.04
763 0.04
764 0.05
765 0.04
766 0.05
767 0.05
768 0.05
769 0.08
770 0.08
771 0.08
772 0.08
773 0.09
774 0.08
775 0.08
776 0.1
777 0.07
778 0.07
779 0.07
780 0.07
781 0.07
782 0.07
783 0.07
784 0.05
785 0.05
786 0.07
787 0.12
788 0.2
789 0.21
790 0.22
791 0.24
792 0.27
793 0.31
794 0.36
795 0.34
796 0.31
797 0.36
798 0.39
799 0.4
800 0.39
801 0.35
802 0.33
803 0.34
804 0.32
805 0.26
806 0.23
807 0.2
808 0.19
809 0.2
810 0.21
811 0.17
812 0.18
813 0.18
814 0.18
815 0.18
816 0.18
817 0.16
818 0.14
819 0.14
820 0.14
821 0.16
822 0.17
823 0.17
824 0.16
825 0.16
826 0.14
827 0.13
828 0.11
829 0.09
830 0.08
831 0.08
832 0.07
833 0.07
834 0.07
835 0.06
836 0.06
837 0.05
838 0.04
839 0.04
840 0.04
841 0.03
842 0.03
843 0.04
844 0.04
845 0.05
846 0.05
847 0.05
848 0.08
849 0.11
850 0.13
851 0.16
852 0.21
853 0.28
854 0.33
855 0.42
856 0.49
857 0.57
858 0.63
859 0.69
860 0.74
861 0.77
862 0.78
863 0.74
864 0.72
865 0.72
866 0.76
867 0.75
868 0.75
869 0.73
870 0.73
871 0.75
872 0.76
873 0.75
874 0.75
875 0.78
876 0.79
877 0.79
878 0.8
879 0.81
880 0.79
881 0.79
882 0.77
883 0.76
884 0.73
885 0.67
886 0.62
887 0.55
888 0.54
889 0.44
890 0.35
891 0.27
892 0.2
893 0.18
894 0.16
895 0.18
896 0.12
897 0.12
898 0.14
899 0.14
900 0.15
901 0.16
902 0.16
903 0.14
904 0.15
905 0.17
906 0.15
907 0.19
908 0.19
909 0.19
910 0.19
911 0.19
912 0.19
913 0.17
914 0.17
915 0.15
916 0.12
917 0.1
918 0.11
919 0.1
920 0.1
921 0.1
922 0.1
923 0.11
924 0.1
925 0.1
926 0.09
927 0.1
928 0.08
929 0.07
930 0.07
931 0.05
932 0.05
933 0.05
934 0.06
935 0.07
936 0.07
937 0.09
938 0.1
939 0.1
940 0.11
941 0.14
942 0.15
943 0.14
944 0.13
945 0.12
946 0.13
947 0.12
948 0.12
949 0.11
950 0.09
951 0.09
952 0.09
953 0.09
954 0.08
955 0.08
956 0.08
957 0.06
958 0.06
959 0.05
960 0.05
961 0.06
962 0.05
963 0.06
964 0.05
965 0.06
966 0.05
967 0.06
968 0.06
969 0.05
970 0.05
971 0.05
972 0.05
973 0.05
974 0.05
975 0.04
976 0.04
977 0.04
978 0.04
979 0.04
980 0.04
981 0.05
982 0.05
983 0.05
984 0.05
985 0.05
986 0.06
987 0.06
988 0.06
989 0.06
990 0.13
991 0.13
992 0.13
993 0.13
994 0.13
995 0.13
996 0.14
997 0.15
998 0.08
999 0.1
1000 0.1
1001 0.1
1002 0.09
1003 0.09
1004 0.08
1005 0.07
1006 0.07
1007 0.07
1008 0.09
1009 0.12
1010 0.15
1011 0.19
1012 0.2
1013 0.21
1014 0.23
1015 0.22
1016 0.2
1017 0.21
1018 0.19
1019 0.16
1020 0.15
1021 0.13
1022 0.12
1023 0.11
1024 0.12
1025 0.09
1026 0.1
1027 0.1
1028 0.11
1029 0.12
1030 0.13
1031 0.15
1032 0.19
1033 0.25
1034 0.3
1035 0.32
1036 0.31
1037 0.32
1038 0.31
1039 0.32
1040 0.34
1041 0.33
1042 0.32
1043 0.33
1044 0.34
1045 0.33
1046 0.35
1047 0.34
1048 0.27
1049 0.26
1050 0.25
1051 0.27
1052 0.27
1053 0.27
1054 0.3
1055 0.3
1056 0.3
1057 0.25
1058 0.22
1059 0.17
1060 0.18
1061 0.17
1062 0.14
1063 0.14
1064 0.12
1065 0.13
1066 0.17
1067 0.17
1068 0.16
1069 0.17
1070 0.18
1071 0.18
1072 0.18
1073 0.17
1074 0.15
1075 0.15
1076 0.13
1077 0.14
1078 0.14
1079 0.13
1080 0.14
1081 0.15
1082 0.13
1083 0.14
1084 0.16
1085 0.17
1086 0.19
1087 0.21
1088 0.2
1089 0.21
1090 0.23
1091 0.27
1092 0.27
1093 0.34
1094 0.39
1095 0.45
1096 0.46
1097 0.45
1098 0.43
1099 0.4
1100 0.37
1101 0.33
1102 0.26
1103 0.22
1104 0.21
1105 0.21
1106 0.21
1107 0.19
1108 0.19
1109 0.15
1110 0.13
1111 0.09
1112 0.08
1113 0.08
1114 0.1
1115 0.11
1116 0.12
1117 0.18
1118 0.25
1119 0.28
1120 0.32